data_6H6U # _model_server_result.job_id I0SfIDh9204YrmfrlhP5Bw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 19:31:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6h6u # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":203}' # _entry.id 6H6U # _exptl.entry_id 6H6U _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6H6U _cell.length_a 124.682 _cell.length_b 124.682 _cell.length_c 188.674 _cell.Z_PDB 48 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6H6U _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 79 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 4' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 0 0 0 3 'crystal symmetry operation' 3_555 -y,x,z 0 -1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 4 'crystal symmetry operation' 4_555 y,-x,z 0 1 0 -1 0 0 0 0 1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 N N N ? 4 Q N N ? 4 T N N ? 4 U N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 28 A GLU 27 1_555 G FE FE . A FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLN 59 A GLN 58 1_555 H FE FE . A FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 62 A GLU 61 1_555 H FE FE . A FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 62 A GLU 61 1_555 I FE FE . A FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 63 A GLU 62 1_555 G FE FE . A FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 132 A ASP 131 1_555 N CA CA . B CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 132 A ASP 131 1_555 Q CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.09 ? metalc ? metalc8 A OE1 GLU 135 A GLU 134 1_555 Q CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc9 G FE FE . A FE 201 1_555 AA O HOH . A HOH 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc10 G FE FE . A FE 201 1_555 AA O HOH . A HOH 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc11 H FE FE . A FE 202 1_555 AA O HOH . A HOH 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? metalc ? metalc12 B OE1 GLU 28 B GLU 27 1_555 K FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? metalc ? metalc13 B OE1 GLN 59 B GLN 58 1_555 L FE FE . B FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc14 B OE2 GLU 62 B GLU 61 1_555 L FE FE . B FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc15 B OE1 GLU 62 B GLU 61 1_555 M FE FE . B FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc ? metalc16 B OE1 GLU 63 B GLU 62 1_555 K FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? metalc ? metalc17 B ND1 HIS 66 B HIS 65 1_555 K FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc18 B OD1 ASP 132 B ASP 131 1_555 N CA CA . B CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? metalc ? metalc19 B OD2 ASP 132 B ASP 131 1_555 N CA CA . B CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.127 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASP 132 B ASP 131 1_555 Q CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc21 B OE2 GLU 135 B GLU 134 1_555 Q CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? metalc ? metalc22 N CA CA . B CA 204 1_555 C OD1 ASP 132 C ASP 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc ? metalc23 C OE1 GLU 28 C GLU 27 1_555 O FE FE . C FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc24 C OE1 GLN 59 C GLN 58 1_555 P FE FE . C FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc25 C OE1 GLU 63 C GLU 62 1_555 O FE FE . C FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.955 ? metalc ? metalc26 C OD1 ASP 132 C ASP 131 1_555 Q CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? metalc ? metalc27 C OE1 GLU 135 C GLU 134 1_555 Q CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc28 D OE1 GLU 28 D GLU 27 1_555 R FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc29 D OE1 GLN 59 D GLN 58 1_555 S FE FE . D FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc30 D OE2 GLU 62 D GLU 61 1_555 S FE FE . D FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc31 D OE1 GLU 63 D GLU 62 1_555 R FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? metalc ? metalc32 D OE2 GLU 63 D GLU 62 1_555 S FE FE . D FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc33 D ND1 HIS 66 D HIS 65 1_555 R FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.597 ? metalc ? metalc34 D OD1 ASP 132 D ASP 131 1_555 T CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc35 D OD1 ASP 132 D ASP 131 1_555 U CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc36 D OE1 GLU 135 D GLU 134 1_555 T CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc37 T CA CA . D CA 203 1_555 E OD1 ASP 132 E ASP 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc38 T CA CA . D CA 203 1_555 E OE1 GLU 135 E GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc39 T CA CA . D CA 203 1_555 F OD1 ASP 132 F ASP 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? metalc ? metalc40 T CA CA . D CA 203 1_555 F OE1 GLU 135 F GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc41 U CA CA . D CA 204 1_555 E OD1 ASP 132 E ASP 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? metalc ? metalc42 U CA CA . D CA 204 1_555 F OD1 ASP 132 F ASP 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc43 E OE1 GLU 28 E GLU 27 1_555 V FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? metalc ? metalc44 E OE1 GLN 59 E GLN 58 1_555 W FE FE . E FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? metalc ? metalc45 E OE2 GLU 62 E GLU 61 1_555 W FE FE . E FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc46 E OE1 GLU 62 E GLU 61 1_555 X FE FE . E FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc47 E OE1 GLU 63 E GLU 62 1_555 V FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? metalc ? metalc48 E ND1 HIS 66 E HIS 65 1_555 V FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc49 V FE FE . E FE 201 1_555 EA O HOH . E HOH 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc50 F OE1 GLU 28 F GLU 27 1_555 Y FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc51 F OE1 GLN 59 F GLN 58 1_555 Z FE FE . F FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc52 F OE2 GLU 62 F GLU 61 1_555 Z FE FE . F FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc53 F OE1 GLU 63 F GLU 62 1_555 Y FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc54 F ND1 HIS 66 F HIS 65 1_555 Y FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc55 Y FE FE . F FE 201 1_555 FA O HOH . F HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc56 Y FE FE . F FE 201 1_555 FA O HOH . F HOH 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6H6U _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00802 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00802 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.0053 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 2 FE A 1 201 1 FE FE . H 2 FE A 1 202 19 FE FE . I 2 FE A 1 203 25 FE FE . J 3 GOL A 1 204 2 GOL GOL . K 2 FE B 1 201 8 FE FE . L 2 FE B 1 202 23 FE FE . M 2 FE B 1 203 24 FE FE . N 4 CA B 1 204 6 CA CA . O 2 FE C 1 201 2 FE FE . P 2 FE C 1 202 22 FE FE . Q 4 CA C 1 203 2 CA CA . R 2 FE D 1 201 4 FE FE . S 2 FE D 1 202 20 FE FE . T 4 CA D 1 203 1 CA CA . U 4 CA D 1 204 7 CA CA . V 2 FE E 1 201 18 FE FE . W 2 FE E 1 202 21 FE FE . X 2 FE E 1 203 26 FE FE . Y 2 FE F 1 201 10 FE FE . Z 2 FE F 1 202 14 FE FE . AA 5 HOH A 1 301 53 HOH HOH . AA 5 HOH A 2 302 79 HOH HOH . AA 5 HOH A 3 303 51 HOH HOH . AA 5 HOH A 4 304 6 HOH HOH . AA 5 HOH A 5 305 64 HOH HOH . AA 5 HOH A 6 306 52 HOH HOH . AA 5 HOH A 7 307 9 HOH HOH . AA 5 HOH A 8 308 10 HOH HOH . AA 5 HOH A 9 309 69 HOH HOH . AA 5 HOH A 10 310 75 HOH HOH . AA 5 HOH A 11 311 24 HOH HOH . AA 5 HOH A 12 312 65 HOH HOH . AA 5 HOH A 13 313 86 HOH HOH . AA 5 HOH A 14 314 29 HOH HOH . AA 5 HOH A 15 315 84 HOH HOH . AA 5 HOH A 16 316 30 HOH HOH . AA 5 HOH A 17 317 45 HOH HOH . AA 5 HOH A 18 318 21 HOH HOH . AA 5 HOH A 19 319 41 HOH HOH . BA 5 HOH B 1 301 48 HOH HOH . BA 5 HOH B 2 302 78 HOH HOH . BA 5 HOH B 3 303 46 HOH HOH . BA 5 HOH B 4 304 19 HOH HOH . BA 5 HOH B 5 305 25 HOH HOH . BA 5 HOH B 6 306 44 HOH HOH . BA 5 HOH B 7 307 33 HOH HOH . BA 5 HOH B 8 308 4 HOH HOH . BA 5 HOH B 9 309 70 HOH HOH . BA 5 HOH B 10 310 82 HOH HOH . BA 5 HOH B 11 311 73 HOH HOH . BA 5 HOH B 12 312 42 HOH HOH . BA 5 HOH B 13 313 89 HOH HOH . CA 5 HOH C 1 301 35 HOH HOH . CA 5 HOH C 2 302 71 HOH HOH . CA 5 HOH C 3 303 54 HOH HOH . CA 5 HOH C 4 304 13 HOH HOH . CA 5 HOH C 5 305 76 HOH HOH . CA 5 HOH C 6 306 31 HOH HOH . CA 5 HOH C 7 307 61 HOH HOH . CA 5 HOH C 8 308 88 HOH HOH . CA 5 HOH C 9 309 14 HOH HOH . CA 5 HOH C 10 310 12 HOH HOH . DA 5 HOH D 1 301 63 HOH HOH . DA 5 HOH D 2 302 34 HOH HOH . DA 5 HOH D 3 303 59 HOH HOH . DA 5 HOH D 4 304 16 HOH HOH . DA 5 HOH D 5 305 81 HOH HOH . DA 5 HOH D 6 306 7 HOH HOH . DA 5 HOH D 7 307 26 HOH HOH . DA 5 HOH D 8 308 56 HOH HOH . DA 5 HOH D 9 309 38 HOH HOH . DA 5 HOH D 10 310 80 HOH HOH . DA 5 HOH D 11 311 8 HOH HOH . DA 5 HOH D 12 312 22 HOH HOH . DA 5 HOH D 13 313 36 HOH HOH . DA 5 HOH D 14 314 18 HOH HOH . DA 5 HOH D 15 315 5 HOH HOH . DA 5 HOH D 16 316 28 HOH HOH . DA 5 HOH D 17 317 57 HOH HOH . DA 5 HOH D 18 318 11 HOH HOH . DA 5 HOH D 19 319 55 HOH HOH . DA 5 HOH D 20 320 77 HOH HOH . DA 5 HOH D 21 321 23 HOH HOH . DA 5 HOH D 22 322 47 HOH HOH . EA 5 HOH E 1 301 60 HOH HOH . EA 5 HOH E 2 302 49 HOH HOH . EA 5 HOH E 3 303 40 HOH HOH . EA 5 HOH E 4 304 50 HOH HOH . EA 5 HOH E 5 305 74 HOH HOH . EA 5 HOH E 6 306 68 HOH HOH . EA 5 HOH E 7 307 20 HOH HOH . EA 5 HOH E 8 308 15 HOH HOH . EA 5 HOH E 9 309 62 HOH HOH . EA 5 HOH E 10 310 37 HOH HOH . EA 5 HOH E 11 311 83 HOH HOH . FA 5 HOH F 1 301 67 HOH HOH . FA 5 HOH F 2 302 32 HOH HOH . FA 5 HOH F 3 303 72 HOH HOH . FA 5 HOH F 4 304 66 HOH HOH . FA 5 HOH F 5 305 27 HOH HOH . FA 5 HOH F 6 306 85 HOH HOH . FA 5 HOH F 7 307 39 HOH HOH . FA 5 HOH F 8 308 2 HOH HOH . FA 5 HOH F 9 309 1 HOH HOH . FA 5 HOH F 10 310 58 HOH HOH . FA 5 HOH F 11 311 17 HOH HOH . FA 5 HOH F 12 312 3 HOH HOH . FA 5 HOH F 13 313 87 HOH HOH . FA 5 HOH F 14 314 43 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id T _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -14.029 _atom_site.Cartn_y 39.238 _atom_site.Cartn_z -29.538 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 62.63 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 203 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 163 _model_server_stats.parse_time_ms 129 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 340 _model_server_stats.encode_time_ms 14 _model_server_stats.element_count 1 #