data_6HQB
#
_model_server_result.job_id            WmtF4-Ud7nkKWCcO3T5LTw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 13:31:31' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6hqb 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":1112}' 
#
_entry.id    6HQB 
#
_exptl.entry_id    6HQB 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              893.489 
_entity.id                          12 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLOROPHYLL A' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    93 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6HQB 
_cell.length_a            124.322 
_cell.length_b            178.658 
_cell.length_c            181.446 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6HQB 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    undecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      11 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 12 L N N 
? 12 M N N 
? 12 N N N 
? 12 O N N 
? 12 P N N 
? 12 Q N N 
? 12 R N N 
? 12 S N N 
? 12 T N N 
? 12 U N N 
? 12 V N N 
? 12 W N N 
? 12 X N N 
? 12 Y N N 
? 12 Z N N 
? 12 AA N N 
? 12 BA N N 
? 12 CA N N 
? 12 DA N N 
? 12 EA N N 
? 12 FA N N 
? 12 GA N N 
? 12 HA N N 
? 12 IA N N 
? 12 JA N N 
? 12 KA N N 
? 12 LA N N 
? 12 MA N N 
? 12 NA N N 
? 12 OA N N 
? 12 PA N N 
? 12 QA N N 
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? 12 SA N N 
? 12 TA N N 
? 12 UA N N 
? 12 VA N N 
? 12 WA N N 
? 12 XA N N 
? 12 YA N N 
? 12 ZA N N 
? 12 IB N N 
? 12 KB N N 
? 12 LB N N 
? 12 MB N N 
? 12 PB N N 
? 12 QB N N 
? 12 RB N N 
? 12 SB N N 
? 12 TB N N 
? 12 UB N N 
? 12 VB N N 
? 12 WB N N 
? 12 XB N N 
? 12 YB N N 
? 12 ZB N N 
? 12 AC N N 
? 12 BC N N 
? 12 CC N N 
? 12 DC N N 
? 12 EC N N 
? 12 FC N N 
? 12 GC N N 
? 12 HC N N 
? 12 IC N N 
? 12 JC N N 
? 12 KC N N 
? 12 LC N N 
? 12 MC N N 
? 12 NC N N 
? 12 OC N N 
? 12 PC N N 
? 12 QC N N 
? 12 RC N N 
? 12 SC N N 
? 12 TC N N 
? 12 UC N N 
? 12 VC N N 
? 12 WC N N 
? 12 XC N N 
? 12 YC N N 
? 12 ZC N N 
? 12 AD N N 
? 12 BD N N 
? 12 CD N N 
? 12 QD N N 
? 12 UD N N 
? 12 VD N N 
? 12 CE N N 
? 12 DE N N 
? 12 FE N N 
? 12 GE N N 
? 12 JE N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 T MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 469 A ASP 469 1_555 IE CA CA . L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.152 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 497 A THR 497 1_555 SA MG CLA . A CLA 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? 
metalc ? metalc4 B OE2 GLU 134 B GLU 134 1_555 PD CA CA . B CA 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
metalc ? metalc5 B OE1 GLU 201 B GLU 201 1_555 PD CA CA . B CA 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
covale ? covale1 B CA SER 481 B SER 481 1_555 ND C1 LHG . B LHG 5006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? 
covale ? covale2 B N ILE 482 B ILE 482 1_555 ND O2 LHG . B LHG 5006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? 
metalc ? metalc6 H OE2 GLU 28 J GLU 28 1_555 DE MG CLA . J CLA 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? 
covale ? covale3 J N PRO 49 L PRO 70 1_555 LB O1D CLA . A CLA 1132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.303 ? 
metalc ? metalc7 J O PRO 49 L PRO 70 1_555 IE CA CA . L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc8 J OD1 ASP 52 L ASP 73 1_555 IE CA CA . L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? 
metalc ? metalc9 O O1A CLA . A CLA 1102 1_555 V MG CLA . A CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.961 ? 
covale ? covale4 J CG2 ILE 130 L ILE 151 1_555 CE CMB CLA . J CLA 1303 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? 
covale ? covale5 J CD ARG 132 L ARG 153 1_555 VD C3 CLA . F CLA 1302 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? 
#
_chem_comp.formula           'C55 H72 Mg N4 O5 2' 
_chem_comp.formula_weight    893.489 
_chem_comp.id                CLA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLOROPHYLL A' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6HQB 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008044 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.005597 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005511 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
L 12 CLA A 1 1011 1011 CLA CLA . 
M 12 CLA A 1 1012 1012 CLA CLA . 
N 12 CLA A 1 1013 1013 CLA CLA . 
O 12 CLA A 1 1102 1102 CLA CLA . 
P 12 CLA A 1 1103 1103 CLA CLA . 
Q 12 CLA A 1 1104 1104 CLA CLA . 
R 12 CLA A 1 1105 1105 CLA CLA . 
S 12 CLA A 1 1106 1106 CLA CLA . 
T 12 CLA A 1 1107 1107 CLA CLA . 
U 12 CLA A 1 1108 1108 CLA CLA . 
V 12 CLA A 1 1109 1109 CLA CLA . 
W 12 CLA A 1 1110 1110 CLA CLA . 
X 12 CLA A 1 1111 1111 CLA CLA . 
Y 12 CLA A 1 1112 1112 CLA CLA . 
Z 12 CLA A 1 1113 1113 CLA CLA . 
AA 12 CLA A 1 1114 1114 CLA CLA . 
BA 12 CLA A 1 1115 1115 CLA CLA . 
CA 12 CLA A 1 1116 1116 CLA CLA . 
DA 12 CLA A 1 1117 1117 CLA CLA . 
EA 12 CLA A 1 1118 1118 CLA CLA . 
FA 12 CLA A 1 1119 1119 CLA CLA . 
GA 12 CLA A 1 1120 1120 CLA CLA . 
HA 12 CLA A 1 1121 1121 CLA CLA . 
IA 12 CLA A 1 1122 1122 CLA CLA . 
JA 12 CLA A 1 1123 1123 CLA CLA . 
KA 12 CLA A 1 1124 1124 CLA CLA . 
LA 12 CLA A 1 1125 1125 CLA CLA . 
MA 12 CLA A 1 1126 1126 CLA CLA . 
NA 12 CLA A 1 1127 1127 CLA CLA . 
OA 12 CLA A 1 1128 1128 CLA CLA . 
PA 12 CLA A 1 1129 1129 CLA CLA . 
QA 12 CLA A 1 1131 1131 CLA CLA . 
RA 12 CLA A 1 1133 1133 CLA CLA . 
SA 12 CLA A 1 1134 1134 CLA CLA . 
TA 12 CLA A 1 1135 1135 CLA CLA . 
UA 12 CLA A 1 1136 1136 CLA CLA . 
VA 12 CLA A 1 1137 1137 CLA CLA . 
WA 12 CLA A 1 1138 1138 CLA CLA . 
XA 12 CLA A 1 1139 1139 CLA CLA . 
YA 12 CLA A 1 1140 1140 CLA CLA . 
ZA 12 CLA A 1 1141 1141 CLA CLA . 
AB 13 PQN A 1 2001 2001 PQN PQN . 
BB 14 SF4 A 1 3001 3001 SF4 SF4 . 
CB 15 BCR A 1 4001 4001 BCR BCR . 
DB 15 BCR A 1 4003 4003 BCR BCR . 
EB 15 BCR A 1 4007 4007 BCR BCR . 
FB 15 BCR A 1 4008 4008 BCR BCR . 
GB 16 LHG A 1 5001 5001 LHG LHG . 
HB 16 LHG A 1 5003 5003 LHG LHG . 
IB 12 CLA A 1 1101 1101 CLA CLA . 
JB 15 BCR A 1 4012 4012 BCR BCR . 
KB 12 CLA A 1 1130 1130 CLA CLA . 
LB 12 CLA A 1 1132 1132 CLA CLA . 
MB 12 CLA B 1 1237 1237 CLA CLA . 
NB 17 45D B 1 4011 4011 45D 45D . 
OB 18 CL B 1 6000 6000 CL CL . 
PB 12 CLA B 1 1021 1021 CLA CLA . 
QB 12 CLA B 1 1022 1022 CLA CLA . 
RB 12 CLA B 1 1023 1023 CLA CLA . 
SB 12 CLA B 1 1201 1201 CLA CLA . 
TB 12 CLA B 1 1202 1202 CLA CLA . 
UB 12 CLA B 1 1203 1203 CLA CLA . 
VB 12 CLA B 1 1204 1204 CLA CLA . 
WB 12 CLA B 1 1205 1205 CLA CLA . 
XB 12 CLA B 1 1206 1206 CLA CLA . 
YB 12 CLA B 1 1207 1207 CLA CLA . 
ZB 12 CLA B 1 1208 1208 CLA CLA . 
AC 12 CLA B 1 1209 1209 CLA CLA . 
BC 12 CLA B 1 1210 1210 CLA CLA . 
CC 12 CLA B 1 1211 1211 CLA CLA . 
DC 12 CLA B 1 1212 1212 CLA CLA . 
EC 12 CLA B 1 1213 1213 CLA CLA . 
FC 12 CLA B 1 1214 1214 CLA CLA . 
GC 12 CLA B 1 1215 1215 CLA CLA . 
HC 12 CLA B 1 1216 1216 CLA CLA . 
IC 12 CLA B 1 1217 1217 CLA CLA . 
JC 12 CLA B 1 1218 1218 CLA CLA . 
KC 12 CLA B 1 1219 1219 CLA CLA . 
LC 12 CLA B 1 1220 1220 CLA CLA . 
MC 12 CLA B 1 1221 1221 CLA CLA . 
NC 12 CLA B 1 1222 1222 CLA CLA . 
OC 12 CLA B 1 1223 1223 CLA CLA . 
PC 12 CLA B 1 1224 1224 CLA CLA . 
QC 12 CLA B 1 1225 1225 CLA CLA . 
RC 12 CLA B 1 1226 1226 CLA CLA . 
SC 12 CLA B 1 1227 1227 CLA CLA . 
TC 12 CLA B 1 1228 1228 CLA CLA . 
UC 12 CLA B 1 1229 1229 CLA CLA . 
VC 12 CLA B 1 1230 1230 CLA CLA . 
WC 12 CLA B 1 1231 1231 CLA CLA . 
XC 12 CLA B 1 1232 1232 CLA CLA . 
YC 12 CLA B 1 1234 1234 CLA CLA . 
ZC 12 CLA B 1 1235 1235 CLA CLA . 
AD 12 CLA B 1 1236 1236 CLA CLA . 
BD 12 CLA B 1 1239 1239 CLA CLA . 
CD 12 CLA B 1 1240 1240 CLA CLA . 
DD 13 PQN B 1 2002 2002 PQN PQN . 
ED 15 BCR B 1 4004 4004 BCR BCR . 
FD 15 BCR B 1 4005 4005 BCR BCR . 
GD 19 ECH B 1 4006 4006 ECH ECH . 
HD 15 BCR B 1 4010 4010 BCR BCR . 
ID 15 BCR B 1 4017 4017 BCR BCR . 
JD 15 BCR B 1 4018 4018 BCR BCR . 
KD 20 LMG B 1 5002 5002 LMG LMG . 
LD 16 LHG B 1 5004 5004 LHG LHG . 
MD 20 LMG B 1 5005 5005 LMG LMG . 
ND 16 LHG B 1 5006 5006 LHG LHG . 
OD 21 SQD B 1 5008 5008 SQD SQD . 
PD 22 CA B 1 6001 6001 CA CA . 
QD 12 CLA B 1 1238 1238 CLA CLA . 
RD 14 SF4 C 1 3002 3002 SF4 SF4 . 
SD 14 SF4 C 1 3003 3003 SF4 SF4 . 
TD 21 SQD F 1 5001 5001 SQD SQD . 
UD 12 CLA F 1 1301 1301 CLA CLA . 
VD 12 CLA F 1 1302 1302 CLA CLA . 
WD 15 BCR F 1 4014 4014 BCR BCR . 
XD 23 C7Z F 1 4016 4016 C7Z C7Z . 
YD 24 LMT F 1 6001 6001 LMT LMT . 
ZD 15 BCR I 1 4018 4018 BCR BCR . 
AE 25 EQ3 I 1 4020 4020 EQ3 EQ3 . 
BE 23 C7Z J 1 4015 4015 C7Z C7Z . 
CE 12 CLA J 1 1303 1303 CLA CLA . 
DE 12 CLA J 1 1302 1302 CLA CLA . 
EE 15 BCR J 1 4013 4013 BCR BCR . 
FE 12 CLA K 1 1401 1401 CLA CLA . 
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