data_6II0
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_model_server_result.job_id            i9MvpAgeypHEWVR8YENMSg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-01 10:40:58' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6ii0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":3601}' 
#
_entry.id    6II0 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            6II0 
_cell.length_a            78.64 
_cell.length_b            78.64 
_cell.length_c            450.008 
_cell.Z_PDB               24 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6II0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        169 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F 1 1 
B,G 2 1 
C,H 3 1 
D,I 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             E 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C ASP 54 A ASP 3269 1_555 A N MSE 55 A MSE 3270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale2 A C MSE 55 A MSE 3270 1_555 A N SER 56 A SER 3271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale3 A C LEU 122 A LEU 3337 1_555 A N MSE 123 A MSE 3338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale4 A C MSE 123 A MSE 3338 1_555 A N LEU 124 A LEU 3339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale5 A C LYS 164 A LYS 3379 1_555 A N MSE 165 A MSE 3380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale6 A C MSE 165 A MSE 3380 1_555 A N TYR 166 A TYR 3381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale7 A C PRO 201 A PRO 3416 1_555 A N MSE 202 A MSE 3417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale8 A C MSE 202 A MSE 3417 1_555 A N HIS 203 A HIS 3418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale9 A C SER 206 A SER 3421 1_555 A N MSE 207 A MSE 3422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale10 A C MSE 207 A MSE 3422 1_555 A N LYS 208 A LYS 3423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale11 A C ALA 249 A ALA 3464 1_555 A N MSE 250 A MSE 3465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale12 A C MSE 250 A MSE 3465 1_555 A N ALA 251 A ALA 3466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale13 A C ASN 295 A ASN 3510 1_555 A N MSE 296 A MSE 3511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale14 A C MSE 296 A MSE 3511 1_555 A N ALA 297 A ALA 3512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale15 A C VAL 317 A VAL 3532 1_555 A N MSE 318 A MSE 3533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale16 A C MSE 318 A MSE 3533 1_555 A N ASP 319 A ASP 3534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale17 A C THR 335 A THR 3550 1_555 A N MSE 336 A MSE 3551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale18 A C MSE 336 A MSE 3551 1_555 A N GLN 337 A GLN 3552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale19 B C ASP 54 B ASP 3269 1_555 B N MSE 55 B MSE 3270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale20 B C MSE 55 B MSE 3270 1_555 B N SER 56 B SER 3271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale21 B C LEU 122 B LEU 3337 1_555 B N MSE 123 B MSE 3338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale22 B C MSE 123 B MSE 3338 1_555 B N LEU 124 B LEU 3339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale23 B C LYS 164 B LYS 3379 1_555 B N MSE 165 B MSE 3380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale24 B C MSE 165 B MSE 3380 1_555 B N TYR 166 B TYR 3381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale25 B C PRO 201 B PRO 3416 1_555 B N MSE 202 B MSE 3417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale26 B C MSE 202 B MSE 3417 1_555 B N HIS 203 B HIS 3418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale27 B C SER 206 B SER 3421 1_555 B N MSE 207 B MSE 3422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? 
covale ? covale28 B C MSE 207 B MSE 3422 1_555 B N LYS 208 B LYS 3423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale29 B C ALA 249 B ALA 3464 1_555 B N MSE 250 B MSE 3465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale30 B C MSE 250 B MSE 3465 1_555 B N ALA 251 B ALA 3466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale31 B C ASN 295 B ASN 3510 1_555 B N MSE 296 B MSE 3511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? 
covale ? covale32 B C MSE 296 B MSE 3511 1_555 B N ALA 297 B ALA 3512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale33 B C VAL 317 B VAL 3532 1_555 B N MSE 318 B MSE 3533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale34 B C MSE 318 B MSE 3533 1_555 B N ASP 319 B ASP 3534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale35 B C THR 335 B THR 3550 1_555 B N MSE 336 B MSE 3551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale36 B C MSE 336 B MSE 3551 1_555 B N GLN 337 B GLN 3552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale37 C C ASP 54 C ASP 3269 1_555 C N MSE 55 C MSE 3270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale38 C C MSE 55 C MSE 3270 1_555 C N SER 56 C SER 3271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale39 C C LEU 122 C LEU 3337 1_555 C N MSE 123 C MSE 3338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale40 C C MSE 123 C MSE 3338 1_555 C N LEU 124 C LEU 3339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? 
covale ? covale41 C C LYS 164 C LYS 3379 1_555 C N MSE 165 C MSE 3380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.3 ? 
covale ? covale42 C C MSE 165 C MSE 3380 1_555 C N TYR 166 C TYR 3381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale43 C C PRO 201 C PRO 3416 1_555 C N MSE 202 C MSE 3417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale44 C C MSE 202 C MSE 3417 1_555 C N HIS 203 C HIS 3418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale45 C C SER 206 C SER 3421 1_555 C N MSE 207 C MSE 3422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale46 C C MSE 207 C MSE 3422 1_555 C N LYS 208 C LYS 3423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale47 C C ALA 249 C ALA 3464 1_555 C N MSE 250 C MSE 3465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale48 C C MSE 250 C MSE 3465 1_555 C N ALA 251 C ALA 3466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale49 C C ASN 295 C ASN 3510 1_555 C N MSE 296 C MSE 3511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale50 C C MSE 296 C MSE 3511 1_555 C N ALA 297 C ALA 3512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale51 C C VAL 317 C VAL 3532 1_555 C N MSE 318 C MSE 3533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale52 C C MSE 318 C MSE 3533 1_555 C N ASP 319 C ASP 3534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale53 C C THR 335 C THR 3550 1_555 C N MSE 336 C MSE 3551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale54 C C MSE 336 C MSE 3551 1_555 C N GLN 337 C GLN 3552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale55 D C ASP 54 D ASP 3269 1_555 D N MSE 55 D MSE 3270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale56 D C MSE 55 D MSE 3270 1_555 D N SER 56 D SER 3271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale57 D C LEU 122 D LEU 3337 1_555 D N MSE 123 D MSE 3338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale58 D C MSE 123 D MSE 3338 1_555 D N LEU 124 D LEU 3339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale59 D C LYS 164 D LYS 3379 1_555 D N MSE 165 D MSE 3380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.31 ? 
covale ? covale60 D C MSE 165 D MSE 3380 1_555 D N TYR 166 D TYR 3381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? 
covale ? covale61 D C PRO 201 D PRO 3416 1_555 D N MSE 202 D MSE 3417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale62 D C MSE 202 D MSE 3417 1_555 D N HIS 203 D HIS 3418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale63 D C SER 206 D SER 3421 1_555 D N MSE 207 D MSE 3422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale64 D C MSE 207 D MSE 3422 1_555 D N LYS 208 D LYS 3423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? 
covale ? covale65 D C ALA 249 D ALA 3464 1_555 D N MSE 250 D MSE 3465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale66 D C MSE 250 D MSE 3465 1_555 D N ALA 251 D ALA 3466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale67 D C ASN 295 D ASN 3510 1_555 D N MSE 296 D MSE 3511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale68 D C MSE 296 D MSE 3511 1_555 D N ALA 297 D ALA 3512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale69 D C VAL 317 D VAL 3532 1_555 D N MSE 318 D MSE 3533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale70 D C MSE 318 D MSE 3533 1_555 D N ASP 319 D ASP 3534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale71 D C THR 335 D THR 3550 1_555 D N MSE 336 D MSE 3551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale72 D C MSE 336 D MSE 3551 1_555 D N GLN 337 D GLN 3552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 116 n n 
C1 C2 GOL sing 117 n n 
C1 H11 GOL sing 118 n n 
C1 H12 GOL sing 119 n n 
O1 HO1 GOL sing 120 n n 
C2 O2 GOL sing 121 n n 
C2 C3 GOL sing 122 n n 
C2 H2 GOL sing 123 n n 
O2 HO2 GOL sing 124 n n 
C3 O3 GOL sing 125 n n 
C3 H31 GOL sing 126 n n 
C3 H32 GOL sing 127 n n 
O3 HO3 GOL sing 128 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6II0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012716 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.007342 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.014683 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.002222 
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