data_6J2P # _model_server_result.job_id YQGkgfkzjTfUW_SkQ1U1eA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 05:43:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6j2p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":201}' # _entry.id 6J2P # _exptl.entry_id 6J2P _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6J2P _cell.length_a 81.81 _cell.length_b 106.17 _cell.length_c 139.83 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6J2P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,I,J,K 1 1 B,F,L,M,N 2 1 C,H,O,P,Q 3 1 D,G,R,S,T 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 28 A CYS 25 1_555 K ZN ZN . A ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 30 A CYS 27 1_555 K ZN ZN . A ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 42 A CYS 39 1_555 I ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 45 A CYS 42 1_555 I ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 50 A HIS 47 1_555 K ZN ZN . A ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 53 A CYS 50 1_555 K ZN ZN . A ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 69 A CYS 66 1_555 I ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 72 A CYS 69 1_555 I ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc9 A SG CYS 96 A CYS 93 1_555 J ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc10 A SG CYS 101 A CYS 98 1_555 J ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc11 A SG CYS 112 A CYS 109 1_555 J ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc12 A ND1 HIS 116 A HIS 113 1_555 J ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 28 B CYS 25 1_555 L ZN ZN . B ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 30 B CYS 27 1_555 L ZN ZN . B ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 42 B CYS 39 1_555 M ZN ZN . B ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 45 B CYS 42 1_555 M ZN ZN . B ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc17 B ND1 HIS 50 B HIS 47 1_555 L ZN ZN . B ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc18 B SG CYS 53 B CYS 50 1_555 L ZN ZN . B ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc19 B SG CYS 69 B CYS 66 1_555 M ZN ZN . B ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc20 B SG CYS 72 B CYS 69 1_555 M ZN ZN . B ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc21 B SG CYS 96 B CYS 93 1_555 N ZN ZN . B ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc22 B SG CYS 101 B CYS 98 1_555 N ZN ZN . B ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc23 B SG CYS 112 B CYS 109 1_555 N ZN ZN . B ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc24 B ND1 HIS 116 B HIS 113 1_555 N ZN ZN . B ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc25 C SG CYS 28 C CYS 25 1_555 O ZN ZN . C ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc26 C SG CYS 30 C CYS 27 1_555 O ZN ZN . C ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc27 C SG CYS 42 C CYS 39 1_555 P ZN ZN . C ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc28 C SG CYS 45 C CYS 42 1_555 P ZN ZN . C ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc29 C ND1 HIS 50 C HIS 47 1_555 O ZN ZN . C ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc ? metalc30 C SG CYS 53 C CYS 50 1_555 O ZN ZN . C ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc31 C SG CYS 69 C CYS 66 1_555 P ZN ZN . C ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc32 C SG CYS 72 C CYS 69 1_555 P ZN ZN . C ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc33 C SG CYS 96 C CYS 93 1_555 Q ZN ZN . C ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc34 C SG CYS 101 C CYS 98 1_555 Q ZN ZN . C ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc35 C SG CYS 112 C CYS 109 1_555 Q ZN ZN . C ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc36 C ND1 HIS 116 C HIS 113 1_555 Q ZN ZN . C ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc37 D SG CYS 28 D CYS 25 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc38 D SG CYS 30 D CYS 27 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc39 D SG CYS 42 D CYS 39 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc40 D SG CYS 45 D CYS 42 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc41 D ND1 HIS 50 D HIS 47 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc42 D SG CYS 53 D CYS 50 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc43 D SG CYS 69 D CYS 66 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc44 D SG CYS 72 D CYS 69 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc45 D SG CYS 96 D CYS 93 1_555 T ZN ZN . D ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc46 D SG CYS 101 D CYS 98 1_555 T ZN ZN . D ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc47 D SG CYS 112 D CYS 109 1_555 T ZN ZN . D ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? covale ? covale1 E C THR 3 E THR 3 1_555 E N M3L 4 E M3L 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale2 E C M3L 4 E M3L 4 1_555 E N GLN 5 E GLN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale3 F C THR 3 F THR 3 1_555 F N M3L 4 F M3L 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale4 F C M3L 4 F M3L 4 1_555 F N GLN 5 F GLN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale5 G C THR 3 G THR 3 1_555 G N M3L 4 G M3L 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale6 G C M3L 4 G M3L 4 1_555 G N GLN 5 G GLN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale7 H C THR 3 H THR 3 1_555 H N M3L 4 H M3L 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale8 H C M3L 4 H M3L 4 1_555 H N GLN 5 H GLN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6J2P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012223 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009419 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007152 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 ZN A 1 201 18 ZN ZN . J 3 ZN A 1 202 19 ZN ZN . K 3 ZN A 1 203 20 ZN ZN . L 3 ZN B 1 201 15 ZN ZN . M 3 ZN B 1 202 16 ZN ZN . N 3 ZN B 1 203 17 ZN ZN . O 3 ZN C 1 201 13 ZN ZN . P 3 ZN C 1 202 14 ZN ZN . Q 3 ZN C 1 203 22 ZN ZN . R 3 ZN D 1 201 11 ZN ZN . S 3 ZN D 1 202 12 ZN ZN . T 3 ZN D 1 203 21 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id R _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 12.46 _atom_site.Cartn_y -24.734 _atom_site.Cartn_z 24.48 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 50.46 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 46 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 360 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #