data_6JDV # _model_server_result.job_id iHHW7xTc6u3O9feJDg1GCw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-02 19:48:07' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6jdv # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1101}' # _entry.id 6JDV # _exptl.entry_id 6JDV _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6JDV _cell.length_a 130.541 _cell.length_b 158.34 _cell.length_c 118.253 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6JDV _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 5 _struct_asym.id E _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 588 A ASP 587 1_555 E MG MG . A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 612 A ASN 611 1_555 E MG MG . A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.966 ? metalc ? metalc3 E MG MG . A MG 1101 1_555 C O3' DA 14 C DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? metalc ? metalc4 E MG MG . A MG 1101 1_555 C OP1 DA 15 C DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 G 1 B G 1 1_555 C N3 DC 35 C DC 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 G 1 B G 1 1_555 C O2 DC 35 C DC 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 G 1 B G 1 1_555 C N4 DC 35 C DC 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N1 G 2 B G 2 1_555 C N3 DC 34 C DC 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N2 G 2 B G 2 1_555 C O2 DC 34 C DC 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O6 G 2 B G 2 1_555 C N4 DC 34 C DC 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N3 U 3 B U 3 1_555 C N1 DA 33 C DA 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B O4 U 3 B U 3 1_555 C N6 DA 33 C DA 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N3 C 4 B C 4 1_555 C N1 DG 32 C DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N4 C 4 B C 4 1_555 C O6 DG 32 C DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B O2 C 4 B C 4 1_555 C N2 DG 32 C DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N1 A 5 B A 5 1_555 C N3 DT 31 C DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N6 A 5 B A 5 1_555 C O4 DT 31 C DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N3 C 6 B C 6 1_555 C N1 DG 30 C DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N4 C 6 B C 6 1_555 C O6 DG 30 C DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B O2 C 6 B C 6 1_555 C N2 DG 30 C DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N3 U 7 B U 7 1_555 C N1 DA 29 C DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B O4 U 7 B U 7 1_555 C N6 DA 29 C DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N3 C 8 B C 8 1_555 C N1 DG 28 C DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N4 C 8 B C 8 1_555 C O6 DG 28 C DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B O2 C 8 B C 8 1_555 C N2 DG 28 C DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N3 U 9 B U 9 1_555 C N1 DA 27 C DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O4 U 9 B U 9 1_555 C N6 DA 27 C DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N1 G 10 B G 10 1_555 C N3 DC 26 C DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N2 G 10 B G 10 1_555 C O2 DC 26 C DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B O6 G 10 B G 10 1_555 C N4 DC 26 C DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N3 C 11 B C 11 1_555 C N1 DG 25 C DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N4 C 11 B C 11 1_555 C O6 DG 25 C DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B O2 C 11 B C 11 1_555 C N2 DG 25 C DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N3 U 12 B U 12 1_555 C N1 DA 24 C DA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B O4 U 12 B U 12 1_555 C N6 DA 24 C DA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B N1 A 13 B A 13 1_555 C N3 DT 23 C DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N6 A 13 B A 13 1_555 C O4 DT 23 C DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N3 U 14 B U 14 1_555 C N1 DA 22 C DA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B O4 U 14 B U 14 1_555 C N6 DA 22 C DA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N3 U 15 B U 15 1_555 C N1 DA 21 C DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B O4 U 15 B U 15 1_555 C N6 DA 21 C DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B N3 U 16 B U 16 1_555 C N1 DA 20 C DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B O4 U 16 B U 16 1_555 C N6 DA 20 C DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N1 A 17 B A 17 1_555 C N3 DT 19 C DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B N6 A 17 B A 17 1_555 C O4 DT 19 C DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N1 A 18 B A 18 1_555 C N3 DT 18 C DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N6 A 18 B A 18 1_555 C O4 DT 18 C DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B N3 C 19 B C 19 1_555 C N1 DG 17 C DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N4 C 19 B C 19 1_555 C O6 DG 17 C DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B O2 C 19 B C 19 1_555 C N2 DG 17 C DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B N3 U 20 B U 20 1_555 C N1 DA 16 C DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B O4 U 20 B U 20 1_555 C N6 DA 16 C DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B N3 U 21 B U 21 1_555 C N1 DA 15 C DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B O4 U 21 B U 21 1_555 C N6 DA 15 C DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B N3 U 22 B U 22 1_555 C N1 DA 14 C DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B O4 U 22 B U 22 1_555 C N6 DA 14 C DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 B N1 A 23 B A 23 1_555 C N3 DT 13 C DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 B N6 A 23 B A 23 1_555 C O4 DT 13 C DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 B N3 C 24 B C 24 1_555 C N1 DG 12 C DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N4 C 24 B C 24 1_555 C O6 DG 12 C DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B O2 C 24 B C 24 1_555 C N2 DG 12 C DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog58 B N1 G 25 B G 25 1_555 B O2 U 76 B U 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog59 B O6 G 25 B G 25 1_555 B N3 U 76 B U 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B N3 U 26 B U 26 1_555 B N1 A 75 B A 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 B O4 U 26 B U 26 1_555 B N6 A 75 B A 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B N3 U 27 B U 27 1_555 B N1 A 74 B A 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B O4 U 27 B U 27 1_555 B N6 A 74 B A 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 B N1 G 28 B G 28 1_555 B N3 C 73 B C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 B N2 G 28 B G 28 1_555 B O2 C 73 B C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 B O6 G 28 B G 28 1_555 B N4 C 73 B C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 B N3 U 29 B U 29 1_555 B N1 A 72 B A 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 B O4 U 29 B U 29 1_555 B N6 A 72 B A 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 B N1 A 30 B A 30 1_555 B N3 U 71 B U 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 B N6 A 30 B A 30 1_555 B O4 U 71 B U 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 B N1 G 31 B G 31 1_555 B N3 C 70 B C 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 B N2 G 31 B G 31 1_555 B O2 C 70 B C 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 B O6 G 31 B G 31 1_555 B N4 C 70 B C 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 B N3 C 32 B C 32 1_555 B N1 G 69 B G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 B N4 C 32 B C 32 1_555 B O6 G 69 B G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 B O2 C 32 B C 32 1_555 B N2 G 69 B G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog77 B N3 U 33 B U 33 1_555 B O4 U 68 B U 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog78 B O2 U 33 B U 33 1_555 B N3 U 68 B U 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog79 B N4 C 34 B C 34 1_555 B O2 U 67 B U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 B N3 C 35 B C 35 1_555 B N1 G 66 B G 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 B N4 C 35 B C 35 1_555 B O6 G 66 B G 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 B O2 C 35 B C 35 1_555 B N2 G 66 B G 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-C MISPAIR' hydrog83 B O4 U 37 B U 37 1_555 B N4 C 64 B C 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 B N3 U 38 B U 38 1_555 B N1 A 63 B A 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 B O4 U 38 B U 38 1_555 B N6 A 63 B A 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 B N3 U 39 B U 39 1_555 B N1 A 62 B A 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 B O4 U 39 B U 39 1_555 B N6 A 62 B A 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 B N3 C 40 B C 40 1_555 B N1 G 61 B G 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 B N4 C 40 B C 40 1_555 B O6 G 61 B G 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 B O2 C 40 B C 40 1_555 B N2 G 61 B G 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 B N3 U 41 B U 41 1_555 B N1 A 60 B A 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 B O4 U 41 B U 41 1_555 B N6 A 60 B A 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 B N3 C 42 B C 42 1_555 B N1 G 59 B G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 B N4 C 42 B C 42 1_555 B O6 G 59 B G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 B O2 C 42 B C 42 1_555 B N2 G 59 B G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 B N1 A 43 B A 43 1_555 B N3 U 58 B U 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 B N6 A 43 B A 43 1_555 B O4 U 58 B U 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 B N3 U 44 B U 44 1_555 B N1 A 57 B A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 B O4 U 44 B U 44 1_555 B N6 A 57 B A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 B N3 U 45 B U 45 1_555 B N1 A 56 B A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 B O4 U 45 B U 45 1_555 B N6 A 56 B A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 B N3 U 46 B U 46 1_555 B N1 A 55 B A 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 B O4 U 46 B U 46 1_555 B N6 A 55 B A 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 B N3 C 47 B C 47 1_555 B N1 G 54 B G 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 B N4 C 47 B C 47 1_555 B O6 G 54 B G 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 B O2 C 47 B C 47 1_555 B N2 G 54 B G 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 B N1 G 48 B G 48 1_555 B N3 C 53 B C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 B N2 G 48 B G 48 1_555 B O2 C 53 B C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 B O6 G 48 B G 48 1_555 B N4 C 53 B C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog110 B N2 G 49 B G 49 1_555 B N7 A 52 B A 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog111 B N7 A 78 B A 78 1_555 B N2 G 100 B G 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 B N1 G 79 B G 79 1_555 B N3 C 99 B C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 B N2 G 79 B G 79 1_555 B O2 C 99 B C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog114 B O6 G 79 B G 79 1_555 B N4 C 99 B C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog115 B N1 G 80 B G 80 1_555 B N3 C 98 B C 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog116 B N2 G 80 B G 80 1_555 B O2 C 98 B C 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog117 B O6 G 80 B G 80 1_555 B N4 C 98 B C 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog118 B N3 C 81 B C 81 1_555 B N1 G 97 B G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog119 B N4 C 81 B C 81 1_555 B O6 G 97 B G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog120 B O2 C 81 B C 81 1_555 B N2 G 97 B G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog121 B N3 C 82 B C 82 1_555 B N1 G 95 B G 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog122 B N4 C 82 B C 82 1_555 B O6 G 95 B G 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog123 B O2 C 82 B C 82 1_555 B N2 G 95 B G 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog124 B N1 G 83 B G 83 1_555 B O2 U 94 B U 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog125 B O6 G 83 B G 83 1_555 B N3 U 94 B U 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog126 B N3 U 84 B U 84 1_555 B N1 A 93 B A 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog127 B O4 U 84 B U 84 1_555 B N6 A 93 B A 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog128 B N3 C 85 B C 85 1_555 B N1 G 92 B G 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog129 B N4 C 85 B C 85 1_555 B O6 G 92 B G 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog130 B O2 C 85 B C 85 1_555 B N2 G 92 B G 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog131 B N3 U 86 B U 86 1_555 B N1 A 91 B A 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog132 B O4 U 86 B U 86 1_555 B N6 A 91 B A 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog133 B N2 G 87 B G 87 1_555 B N7 A 90 B A 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog134 B N3 G 87 B G 87 1_555 B N6 A 90 B A 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog135 B N1 A 102 B A 102 1_555 B N3 U 143 B U 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog136 B N6 A 102 B A 102 1_555 B O4 U 143 B U 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog137 B N1 A 103 B A 103 1_555 B N3 U 142 B U 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog138 B N6 A 103 B A 103 1_555 B O4 U 142 B U 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog139 B N3 C 104 B C 104 1_555 B N1 G 141 B G 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog140 B N4 C 104 B C 104 1_555 B O6 G 141 B G 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog141 B O2 C 104 B C 104 1_555 B N2 G 141 B G 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog142 B N2 G 105 B G 105 1_555 B O4 U 107 B U 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog143 B N1 G 105 B G 105 1_555 B N3 C 140 B C 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog144 B N2 G 105 B G 105 1_555 B O2 C 140 B C 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog145 B O6 G 105 B G 105 1_555 B N4 C 140 B C 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_25_PAIR hydrog146 B N3 C 106 B C 106 1_555 B N6 A 138 B A 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_25_PAIR hydrog147 B N4 C 106 B C 106 1_555 B N7 A 138 B A 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog148 B N4 C 108 B C 108 1_555 B O2 C 140 B C 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog149 B N3 U 109 B U 109 1_555 B N1 A 138 B A 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog150 B O4 U 109 B U 109 1_555 B N6 A 138 B A 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog151 B N1 G 110 B G 110 1_555 B N3 C 137 B C 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog152 B N2 G 110 B G 110 1_555 B O2 C 137 B C 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog153 B O6 G 110 B G 110 1_555 B N4 C 137 B C 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog154 B N3 C 111 B C 111 1_555 B N1 G 136 B G 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog155 B N4 C 111 B C 111 1_555 B O6 G 136 B G 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog156 B O2 C 111 B C 111 1_555 B N2 G 136 B G 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog157 B N3 C 112 B C 112 1_555 B N1 G 135 B G 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog158 B N4 C 112 B C 112 1_555 B O6 G 135 B G 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog159 B O2 C 112 B C 112 1_555 B N2 G 135 B G 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog160 B N3 C 113 B C 113 1_555 B N1 G 134 B G 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog161 B N4 C 113 B C 113 1_555 B O6 G 134 B G 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog162 B O2 C 113 B C 113 1_555 B N2 G 134 B G 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog163 B N3 C 114 B C 114 1_555 B N1 G 133 B G 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog164 B N4 C 114 B C 114 1_555 B O6 G 133 B G 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog165 B O2 C 114 B C 114 1_555 B N2 G 133 B G 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog166 B N3 U 115 B U 115 1_555 B N1 A 132 B A 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog167 B O4 U 115 B U 115 1_555 B N6 A 132 B A 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog168 B N3 U 116 B U 116 1_555 B N1 A 131 B A 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog169 B O4 U 116 B U 116 1_555 B N6 A 131 B A 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog170 B N1 A 117 B A 117 1_555 B N3 U 130 B U 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog171 B N6 A 117 B A 117 1_555 B O4 U 130 B U 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog172 B N1 A 118 B A 118 1_555 B N3 U 129 B U 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog173 B N6 A 118 B A 118 1_555 B O4 U 129 B U 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog174 B N1 A 119 B A 119 1_555 B N3 U 128 B U 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog175 B N6 A 119 B A 119 1_555 B O4 U 128 B U 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog176 B N1 G 120 B G 120 1_555 B N3 C 127 B C 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog177 B N2 G 120 B G 120 1_555 B O2 C 127 B C 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog178 B O6 G 120 B G 120 1_555 B N4 C 127 B C 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog179 B N3 C 121 B C 121 1_555 B N1 G 126 B G 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog180 B N4 C 121 B C 121 1_555 B O6 G 126 B G 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog181 B O2 C 121 B C 121 1_555 B N2 G 126 B G 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog182 C N3 DT 1 C DT 1 1_555 D N1 DA 11 D DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog183 C O4 DT 1 C DT 1 1_555 D N6 DA 11 D DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog184 C N1 DA 2 C DA 2 1_555 D N3 DT 10 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog185 C N6 DA 2 C DA 2 1_555 D O4 DT 10 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog186 C N1 DA 3 C DA 3 1_555 D N3 DT 9 D DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog187 C N6 DA 3 C DA 3 1_555 D O4 DT 9 D DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog188 C N1 DA 4 C DA 4 1_555 D N3 DT 8 D DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog189 C N6 DA 4 C DA 4 1_555 D O4 DT 8 D DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog190 C N1 DA 5 C DA 5 1_555 D N3 DT 7 D DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog191 C N6 DA 5 C DA 5 1_555 D O4 DT 7 D DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog192 C N3 DT 6 C DT 6 1_555 D N1 DA 6 D DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog193 C O4 DT 6 C DT 6 1_555 D N6 DA 6 D DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog194 C N3 DC 7 C DC 7 1_555 D N1 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog195 C N4 DC 7 C DC 7 1_555 D O6 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog196 C O2 DC 7 C DC 7 1_555 D N2 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog197 C N1 DA 8 C DA 8 1_555 D N3 DT 4 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog198 C N6 DA 8 C DA 8 1_555 D O4 DT 4 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog199 C N3 DT 9 C DT 9 1_555 D N1 DA 3 D DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog200 C O4 DT 9 C DT 9 1_555 D N6 DA 3 D DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog201 C N1 DA 10 C DA 10 1_555 D N3 DT 2 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog202 C N6 DA 10 C DA 10 1_555 D O4 DT 2 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog203 C N3 DT 11 C DT 11 1_555 D N1 DA 1 D DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog204 C O4 DT 11 C DT 11 1_555 D N6 DA 1 D DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6JDV _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00766 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006316 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008456 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 MG A 1 1101 1 MG MG . F 6 EDO B 1 201 1 EDO EDO . G 7 HOH A 1 1201 13 HOH HOH . G 7 HOH A 2 1202 11 HOH HOH . G 7 HOH A 3 1203 10 HOH HOH . G 7 HOH A 4 1204 2 HOH HOH . G 7 HOH A 5 1205 1 HOH HOH . H 7 HOH B 1 301 8 HOH HOH . H 7 HOH B 2 302 12 HOH HOH . H 7 HOH B 3 303 3 HOH HOH . H 7 HOH B 4 304 4 HOH HOH . H 7 HOH B 5 305 5 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 15.801 _atom_site.Cartn_y 32.481 _atom_site.Cartn_z 33.152 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 50.59 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1101 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 62 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 419 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #