data_6K4M
#
_model_server_result.job_id            -QlRH886RWjQ828Pp5X3sA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-09 23:19:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6k4m 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    6K4M 
#
_exptl.entry_id    6K4M 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              55.845 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'FE (II) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    24 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6K4M 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6K4M 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    24-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      24 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 Y N N 
? 2 AA N N 
? 2 BA N N 
? 2 DA N N 
? 2 EA N N 
? 2 GA N N 
? 2 HA N N 
? 2 IA N N 
? 2 KA N N 
? 2 LA N N 
? 2 NA N N 
? 2 OA N N 
? 2 QA N N 
? 2 RA N N 
? 2 SA N N 
? 2 TA N N 
? 2 VA N N 
? 2 XA N N 
? 2 YA N N 
? 2 AB N N 
? 2 BB N N 
? 2 DB N N 
? 2 EB N N 
? 2 HB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE1 GLU 51 A GLU 51 1_555 Y FE FE2 . A FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 127 A GLU 127 1_555 Y FE FE2 . A FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? 
metalc ? metalc3 C OE1 GLU 51 C GLU 51 1_555 BA FE FE2 . C FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? 
metalc ? metalc4 D OE1 GLU 51 D GLU 51 1_555 DA FE FE2 . D FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc5 E OE1 GLU 51 F GLU 51 1_555 EA FE FE2 . F FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? 
metalc ? metalc6 F OE1 GLU 51 E GLU 51 1_555 GA FE FE2 . E FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? 
metalc ? metalc7 F OE2 GLU 51 E GLU 51 1_555 GA FE FE2 . E FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc8 F OE2 GLU 127 E GLU 127 1_555 GA FE FE2 . E FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc9 G OE1 GLU 51 G GLU 51 1_555 HA FE FE2 . G FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? 
metalc ? metalc10 H OE1 GLU 51 H GLU 51 1_555 IA FE FE2 . H FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? 
metalc ? metalc11 H OE2 GLU 127 H GLU 127 1_555 IA FE FE2 . H FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? 
metalc ? metalc12 I OE1 GLU 51 I GLU 51 1_555 KA FE FE2 . I FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? 
metalc ? metalc13 K OE1 GLU 51 K GLU 51 1_555 NA FE FE2 . K FE2 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc14 M OE1 GLU 51 M GLU 51 1_555 QA FE FE2 . M FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? 
metalc ? metalc15 N OE1 GLU 51 N GLU 51 1_555 RA FE FE2 . N FE2 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? 
metalc ? metalc16 O SD MET 52 O MET 52 1_555 UA FE HEM . P HEM 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? 
metalc ? metalc17 R OE1 GLU 51 R GLU 51 1_555 XA FE FE2 . R FE2 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc18 S OE1 GLU 51 S GLU 51 1_555 YA FE FE2 . S FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? 
metalc ? metalc19 X OE1 GLU 51 X GLU 51 1_555 HB FE FE2 . X FE2 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe 2' 
_chem_comp.formula_weight    55.845 
_chem_comp.id                FE2 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'FE (II) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6K4M 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.003754 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.003754 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.003754 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Y 2 FE2 A 1 201 201 FE2 FE2 . 
Z 3 HEM A 1 202 301 HEM HEM . 
AA 2 FE2 B 1 200 200 FE2 FE2 . 
BA 2 FE2 C 1 201 201 FE2 FE2 . 
CA 3 HEM C 1 202 301 HEM HEM . 
DA 2 FE2 D 1 201 201 FE2 FE2 . 
EA 2 FE2 F 1 201 200 FE2 FE2 . 
FA 3 HEM F 1 202 301 HEM HEM . 
GA 2 FE2 E 1 201 201 FE2 FE2 . 
HA 2 FE2 G 1 201 201 FE2 FE2 . 
IA 2 FE2 H 1 201 201 FE2 FE2 . 
JA 3 HEM H 1 202 301 HEM HEM . 
KA 2 FE2 I 1 201 201 FE2 FE2 . 
LA 2 FE2 J 1 201 201 FE2 FE2 . 
MA 3 HEM K 1 301 301 HEM HEM . 
NA 2 FE2 K 1 302 200 FE2 FE2 . 
OA 2 FE2 L 1 201 201 FE2 FE2 . 
PA 3 HEM L 1 202 301 HEM HEM . 
QA 2 FE2 M 1 201 201 FE2 FE2 . 
RA 2 FE2 N 1 200 200 FE2 FE2 . 
SA 2 FE2 O 1 201 201 FE2 FE2 . 
TA 2 FE2 P 1 201 200 FE2 FE2 . 
UA 3 HEM P 1 202 301 HEM HEM . 
VA 2 FE2 Q 1 201 201 FE2 FE2 . 
WA 3 HEM R 1 301 301 HEM HEM . 
XA 2 FE2 R 1 302 201 FE2 FE2 . 
YA 2 FE2 S 1 201 200 FE2 FE2 . 
ZA 3 HEM S 1 202 301 HEM HEM . 
AB 2 FE2 T 1 201 201 FE2 FE2 . 
BB 2 FE2 U 1 201 200 FE2 FE2 . 
CB 3 HEM U 1 202 301 HEM HEM . 
DB 2 FE2 V 1 201 201 FE2 FE2 . 
EB 2 FE2 W 1 201 201 FE2 FE2 . 
FB 3 HEM W 1 202 301 HEM HEM . 
GB 3 HEM X 1 301 301 HEM HEM . 
HB 2 FE2 X 1 302 200 FE2 FE2 . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           FE 
_atom_site.label_atom_id         FE 
_atom_site.label_comp_id         FE2 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         DA 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               145.972 
_atom_site.Cartn_y               96.364 
_atom_site.Cartn_z               103.447 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        547.05 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          FE 
_atom_site.auth_comp_id          FE2 
_atom_site.auth_seq_id           201 
_atom_site.auth_asym_id          D 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              17 
_model_server_stats.parse_time_ms           26 
_model_server_stats.create_model_time_ms    35 
_model_server_stats.query_time_ms           281 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#