data_6KDK # _model_server_result.job_id Yu8zFyUtyFm7ECgro60oHg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-07 08:55:01' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6kdk # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":702}' # _entry.id 6KDK # _exptl.entry_id 6KDK _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6KDK _cell.length_a 284.852 _cell.length_b 284.852 _cell.length_c 95.926 _cell.Z_PDB 18 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6KDK _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 146 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,H,I,J,K,P,Q,R 1 1 D,E,F,L,M,N,O,S,T,U 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 J N N ? 7 K N N ? 7 M N N ? 7 O N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 GLC _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 FRU _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n G GLC 1 G 1 GLC B 701 SUC 4 n G FRU 2 G 2 FRU B 701 SUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 C O3' DC 6 E DC 1 1_555 C P OMC 7 E OMC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? covale ? covale2 C O3' OMC 7 E OMC 2 1_555 C P DC 8 E DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? covale ? covale3 C O3' DC 8 E DC 3 1_555 C P OMC 9 E OMC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? covale ? covale4 C O3' OMC 9 E OMC 4 1_555 C P DC 10 E DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? covale ? covale5 F O3' DC 6 F DC 1 1_555 F P OMC 7 F OMC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? covale ? covale6 F O3' OMC 7 F OMC 2 1_555 F P DC 8 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? covale ? covale7 F O3' DC 8 F DC 3 1_555 F P OMC 9 F OMC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? covale ? covale8 F O3' OMC 9 F OMC 4 1_555 F P DC 10 F DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? covale ? covale9 G C1 GLC . G GLC 1 1_555 G O2 FRU . G FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 sing metalc ? metalc1 A OD1 ASP 112 A ASP 110 1_555 I MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc2 A O VAL 113 A VAL 111 1_555 I MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.955 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 187 A ASP 185 1_555 I MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc4 H O2A DCP . A DCP 601 1_555 I MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc5 H O1B DCP . A DCP 601 1_555 I MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.964 ? metalc ? metalc6 H O1G DCP . A DCP 601 1_555 I MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc7 D OD2 ASP 112 C ASP 110 1_555 N MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc8 D O VAL 113 C VAL 111 1_555 N MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc9 D OD2 ASP 187 C ASP 185 1_555 N MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc10 L O2A DCP . C DCP 601 1_555 N MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc11 L O2B DCP . C DCP 601 1_555 N MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc12 L O2G DCP . C DCP 601 1_555 N MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N3 DC 6 E DC 1 1_555 C N1 DG 38 E DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N4 DC 6 E DC 1 1_555 C O6 DG 38 E DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C O2 DC 6 E DC 1 1_555 C N2 DG 38 E DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N3 OMC 7 E OMC 2 1_555 C N1 DG 37 E DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N4 OMC 7 E OMC 2 1_555 C O6 DG 37 E DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C O2 OMC 7 E OMC 2 1_555 C N2 DG 37 E DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C N3 DC 8 E DC 3 1_555 C N1 DG 36 E DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N4 DC 8 E DC 3 1_555 C O6 DG 36 E DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C O2 DC 8 E DC 3 1_555 C N2 DG 36 E DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N3 OMC 9 E OMC 4 1_555 C N1 DG 35 E DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N4 OMC 9 E OMC 4 1_555 C O6 DG 35 E DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C O2 OMC 9 E OMC 4 1_555 C N2 DG 35 E DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N3 DC 10 E DC 5 1_555 C N1 DG 34 E DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C N4 DC 10 E DC 5 1_555 C O6 DG 34 E DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C O2 DC 10 E DC 5 1_555 C N2 DG 34 E DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N3 DC 11 E DC 6 1_555 C N1 DG 33 E DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N4 DC 11 E DC 6 1_555 C O6 DG 33 E DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C O2 DC 11 E DC 6 1_555 C N2 DG 33 E DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N3 DC 12 E DC 7 1_555 C N1 DG 32 E DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N4 DC 12 E DC 7 1_555 C O6 DG 32 E DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C O2 DC 12 E DC 7 1_555 C N2 DG 32 E DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N3 DT 13 E DT 8 1_555 C N1 DA 31 E DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C O4 DT 13 E DT 8 1_555 C N6 DA 31 E DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N3 DT 14 E DT 9 1_555 C N1 DA 30 E DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C O4 DT 14 E DT 9 1_555 C N6 DA 30 E DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N3 DC 15 E DC 10 1_555 C N1 DG 29 E DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N4 DC 15 E DC 10 1_555 C O6 DG 29 E DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C O2 DC 15 E DC 10 1_555 C N2 DG 29 E DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N1 DG 16 E DG 11 1_555 C N3 DC 28 E DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N2 DG 16 E DG 11 1_555 C O2 DC 28 E DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C O6 DG 16 E DG 11 1_555 C N4 DC 28 E DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N1 DG 17 E DG 12 1_555 C N3 DC 27 E DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N2 DG 17 E DG 12 1_555 C O2 DC 27 E DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C O6 DG 17 E DG 12 1_555 C N4 DC 27 E DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N3 DT 18 E DT 13 1_555 C N1 DA 26 E DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C O4 DT 18 E DT 13 1_555 C N6 DA 26 E DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N1 DG 19 E DG 14 1_555 C N3 DC 25 E DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C N2 DG 19 E DG 14 1_555 C O2 DC 25 E DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C O6 DG 19 E DG 14 1_555 C N4 DC 25 E DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N3 DC 20 E DC 15 1_555 C N1 DG 24 E DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C N4 DC 20 E DC 15 1_555 C O6 DG 24 E DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C O2 DC 20 E DC 15 1_555 C N2 DG 24 E DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 F N3 DC 6 F DC 1 1_555 F N1 DG 38 F DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 F N4 DC 6 F DC 1 1_555 F O6 DG 38 F DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 F O2 DC 6 F DC 1 1_555 F N2 DG 38 F DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 F N3 OMC 7 F OMC 2 1_555 F N1 DG 37 F DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 F N4 OMC 7 F OMC 2 1_555 F O6 DG 37 F DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 F O2 OMC 7 F OMC 2 1_555 F N2 DG 37 F DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 F N3 DC 8 F DC 3 1_555 F N1 DG 36 F DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 F N4 DC 8 F DC 3 1_555 F O6 DG 36 F DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 F O2 DC 8 F DC 3 1_555 F N2 DG 36 F DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 F N3 OMC 9 F OMC 4 1_555 F N1 DG 35 F DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 F N4 OMC 9 F OMC 4 1_555 F O6 DG 35 F DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 F O2 OMC 9 F OMC 4 1_555 F N2 DG 35 F DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 F N3 DC 10 F DC 5 1_555 F N1 DG 34 F DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 F N4 DC 10 F DC 5 1_555 F O6 DG 34 F DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 F O2 DC 10 F DC 5 1_555 F N2 DG 34 F DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 F N3 DC 11 F DC 6 1_555 F N1 DG 33 F DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 F N4 DC 11 F DC 6 1_555 F O6 DG 33 F DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 F O2 DC 11 F DC 6 1_555 F N2 DG 33 F DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 F N3 DC 12 F DC 7 1_555 F N1 DG 32 F DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 F N4 DC 12 F DC 7 1_555 F O6 DG 32 F DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 F O2 DC 12 F DC 7 1_555 F N2 DG 32 F DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 F N3 DT 13 F DT 8 1_555 F N1 DA 31 F DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 F O4 DT 13 F DT 8 1_555 F N6 DA 31 F DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 F N3 DT 14 F DT 9 1_555 F N1 DA 30 F DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 F O4 DT 14 F DT 9 1_555 F N6 DA 30 F DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 F N3 DC 15 F DC 10 1_555 F N1 DG 29 F DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 F N4 DC 15 F DC 10 1_555 F O6 DG 29 F DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 F O2 DC 15 F DC 10 1_555 F N2 DG 29 F DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 F N1 DG 16 F DG 11 1_555 F N3 DC 28 F DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 F N2 DG 16 F DG 11 1_555 F O2 DC 28 F DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 F O6 DG 16 F DG 11 1_555 F N4 DC 28 F DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 F N1 DG 17 F DG 12 1_555 F N3 DC 27 F DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 F N2 DG 17 F DG 12 1_555 F O2 DC 27 F DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 F O6 DG 17 F DG 12 1_555 F N4 DC 27 F DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 F N3 DT 18 F DT 13 1_555 F N1 DA 26 F DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 F O4 DT 18 F DT 13 1_555 F N6 DA 26 F DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 F N1 DG 19 F DG 14 1_555 F N3 DC 25 F DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 F N2 DG 19 F DG 14 1_555 F O2 DC 25 F DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 F O6 DG 19 F DG 14 1_555 F N4 DC 25 F DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 F N3 DC 20 F DC 15 1_555 F N1 DG 24 F DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 F N4 DC 20 F DC 15 1_555 F O6 DG 24 F DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 F O2 DC 20 F DC 15 1_555 F N2 DG 24 F DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 371 n n C1 C2 GOL sing 372 n n C1 H11 GOL sing 373 n n C1 H12 GOL sing 374 n n O1 HO1 GOL sing 375 n n C2 O2 GOL sing 376 n n C2 C3 GOL sing 377 n n C2 H2 GOL sing 378 n n O2 HO2 GOL sing 379 n n C3 O3 GOL sing 380 n n C3 H31 GOL sing 381 n n C3 H32 GOL sing 382 n n O3 HO3 GOL sing 383 n n # _atom_sites.entry_id 6KDK _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.003511 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.002027 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004054 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010425 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code H 5 DCP A 1 601 601 DCP DCP . I 6 MG A 1 602 1 MG MG . J 7 GOL B 1 701 701 GOL GOL . K 7 GOL B 1 702 501 GOL GOL . L 5 DCP C 1 601 601 DCP DCP . M 7 GOL C 1 602 701 GOL GOL . N 6 MG C 1 603 2 MG MG . O 7 GOL D 1 501 501 GOL GOL . P 8 HOH A 1 701 836 HOH HOH . P 8 HOH A 2 702 802 HOH HOH . P 8 HOH A 3 703 614 HOH HOH . P 8 HOH A 4 704 101 HOH HOH . P 8 HOH A 5 705 45 HOH HOH . P 8 HOH A 6 706 44 HOH HOH . P 8 HOH A 7 707 43 HOH HOH . P 8 HOH A 8 708 808 HOH HOH . P 8 HOH A 9 709 804 HOH HOH . P 8 HOH A 10 710 29 HOH HOH . P 8 HOH A 11 711 28 HOH HOH . P 8 HOH A 12 712 805 HOH HOH . P 8 HOH A 13 713 811 HOH HOH . P 8 HOH A 14 714 25 HOH HOH . P 8 HOH A 15 715 816 HOH HOH . P 8 HOH A 16 716 40 HOH HOH . P 8 HOH A 17 717 814 HOH HOH . P 8 HOH A 18 718 818 HOH HOH . P 8 HOH A 19 719 807 HOH HOH . P 8 HOH A 20 720 826 HOH HOH . P 8 HOH A 21 721 803 HOH HOH . P 8 HOH A 22 722 828 HOH HOH . P 8 HOH A 23 723 812 HOH HOH . P 8 HOH A 24 724 31 HOH HOH . P 8 HOH A 25 725 32 HOH HOH . P 8 HOH A 26 726 819 HOH HOH . P 8 HOH A 27 727 822 HOH HOH . P 8 HOH A 28 728 34 HOH HOH . P 8 HOH A 29 729 806 HOH HOH . P 8 HOH A 30 730 20 HOH HOH . P 8 HOH A 31 731 817 HOH HOH . P 8 HOH A 32 732 30 HOH HOH . P 8 HOH A 33 733 825 HOH HOH . P 8 HOH A 34 734 26 HOH HOH . P 8 HOH A 35 735 33 HOH HOH . P 8 HOH A 36 736 46 HOH HOH . P 8 HOH A 37 737 821 HOH HOH . P 8 HOH A 38 738 24 HOH HOH . P 8 HOH A 39 739 21 HOH HOH . P 8 HOH A 40 740 815 HOH HOH . P 8 HOH A 41 741 827 HOH HOH . P 8 HOH A 42 742 841 HOH HOH . P 8 HOH A 43 743 27 HOH HOH . P 8 HOH A 44 744 22 HOH HOH . P 8 HOH A 45 745 41 HOH HOH . P 8 HOH A 46 746 813 HOH HOH . P 8 HOH A 47 747 810 HOH HOH . P 8 HOH A 48 748 54 HOH HOH . P 8 HOH A 49 749 823 HOH HOH . P 8 HOH A 50 750 832 HOH HOH . P 8 HOH A 51 751 23 HOH HOH . P 8 HOH A 52 752 838 HOH HOH . P 8 HOH A 53 753 837 HOH HOH . P 8 HOH A 54 754 42 HOH HOH . P 8 HOH A 55 755 835 HOH HOH . P 8 HOH A 56 756 831 HOH HOH . P 8 HOH A 57 757 839 HOH HOH . P 8 HOH A 58 758 840 HOH HOH . P 8 HOH A 59 759 47 HOH HOH . P 8 HOH A 60 760 834 HOH HOH . P 8 HOH A 61 761 843 HOH HOH . P 8 HOH A 62 762 824 HOH HOH . P 8 HOH A 63 763 100 HOH HOH . P 8 HOH A 64 764 2 HOH HOH . Q 8 HOH B 1 801 610 HOH HOH . Q 8 HOH B 2 802 48 HOH HOH . Q 8 HOH B 3 803 605 HOH HOH . Q 8 HOH B 4 804 618 HOH HOH . Q 8 HOH B 5 805 604 HOH HOH . Q 8 HOH B 6 806 625 HOH HOH . Q 8 HOH B 7 807 621 HOH HOH . Q 8 HOH B 8 808 601 HOH HOH . Q 8 HOH B 9 809 53 HOH HOH . Q 8 HOH B 10 810 608 HOH HOH . Q 8 HOH B 11 811 602 HOH HOH . Q 8 HOH B 12 812 613 HOH HOH . Q 8 HOH B 13 813 624 HOH HOH . Q 8 HOH B 14 814 607 HOH HOH . Q 8 HOH B 15 815 603 HOH HOH . Q 8 HOH B 16 816 49 HOH HOH . Q 8 HOH B 17 817 611 HOH HOH . Q 8 HOH B 18 818 7 HOH HOH . Q 8 HOH B 19 819 606 HOH HOH . Q 8 HOH B 20 820 52 HOH HOH . Q 8 HOH B 21 821 620 HOH HOH . Q 8 HOH B 22 822 617 HOH HOH . Q 8 HOH B 23 823 616 HOH HOH . Q 8 HOH B 24 824 615 HOH HOH . Q 8 HOH B 25 825 5 HOH HOH . Q 8 HOH B 26 826 612 HOH HOH . Q 8 HOH B 27 827 609 HOH HOH . Q 8 HOH B 28 828 626 HOH HOH . Q 8 HOH B 29 829 622 HOH HOH . Q 8 HOH B 30 830 8 HOH HOH . Q 8 HOH B 31 831 627 HOH HOH . Q 8 HOH B 32 832 629 HOH HOH . Q 8 HOH B 33 833 6 HOH HOH . R 8 HOH E 1 101 104 HOH HOH . R 8 HOH E 2 102 105 HOH HOH . R 8 HOH E 3 103 101 HOH HOH . R 8 HOH E 4 104 106 HOH HOH . R 8 HOH E 5 105 801 HOH HOH . R 8 HOH E 6 106 103 HOH HOH . R 8 HOH E 7 107 110 HOH HOH . R 8 HOH E 8 108 107 HOH HOH . R 8 HOH E 9 109 56 HOH HOH . R 8 HOH E 10 110 9 HOH HOH . R 8 HOH E 11 111 102 HOH HOH . R 8 HOH E 12 112 60 HOH HOH . R 8 HOH E 13 113 108 HOH HOH . R 8 HOH E 14 114 38 HOH HOH . R 8 HOH E 15 115 103 HOH HOH . R 8 HOH E 16 116 112 HOH HOH . R 8 HOH E 17 117 104 HOH HOH . R 8 HOH E 18 118 109 HOH HOH . R 8 HOH E 19 119 93 HOH HOH . R 8 HOH E 20 120 108 HOH HOH . R 8 HOH E 21 121 57 HOH HOH . R 8 HOH E 22 122 39 HOH HOH . R 8 HOH E 23 123 55 HOH HOH . R 8 HOH E 24 124 61 HOH HOH . R 8 HOH E 25 125 111 HOH HOH . R 8 HOH E 26 126 58 HOH HOH . R 8 HOH E 27 127 35 HOH HOH . R 8 HOH E 28 128 102 HOH HOH . R 8 HOH E 29 129 842 HOH HOH . R 8 HOH E 30 130 628 HOH HOH . S 8 HOH C 1 701 64 HOH HOH . S 8 HOH C 2 702 803 HOH HOH . S 8 HOH C 3 703 81 HOH HOH . S 8 HOH C 4 704 74 HOH HOH . S 8 HOH C 5 705 14 HOH HOH . S 8 HOH C 6 706 76 HOH HOH . S 8 HOH C 7 707 807 HOH HOH . S 8 HOH C 8 708 811 HOH HOH . S 8 HOH C 9 709 10 HOH HOH . S 8 HOH C 10 710 808 HOH HOH . S 8 HOH C 11 711 68 HOH HOH . S 8 HOH C 12 712 810 HOH HOH . S 8 HOH C 13 713 73 HOH HOH . S 8 HOH C 14 714 816 HOH HOH . S 8 HOH C 15 715 801 HOH HOH . S 8 HOH C 16 716 69 HOH HOH . S 8 HOH C 17 717 18 HOH HOH . S 8 HOH C 18 718 3 HOH HOH . S 8 HOH C 19 719 802 HOH HOH . S 8 HOH C 20 720 107 HOH HOH . S 8 HOH C 21 721 813 HOH HOH . S 8 HOH C 22 722 809 HOH HOH . S 8 HOH C 23 723 95 HOH HOH . S 8 HOH C 24 724 609 HOH HOH . S 8 HOH C 25 725 11 HOH HOH . S 8 HOH C 26 726 819 HOH HOH . S 8 HOH C 27 727 804 HOH HOH . S 8 HOH C 28 728 62 HOH HOH . S 8 HOH C 29 729 67 HOH HOH . S 8 HOH C 30 730 825 HOH HOH . S 8 HOH C 31 731 809 HOH HOH . S 8 HOH C 32 732 72 HOH HOH . S 8 HOH C 33 733 63 HOH HOH . S 8 HOH C 34 734 812 HOH HOH . S 8 HOH C 35 735 610 HOH HOH . S 8 HOH C 36 736 817 HOH HOH . S 8 HOH C 37 737 75 HOH HOH . S 8 HOH C 38 738 70 HOH HOH . S 8 HOH C 39 739 823 HOH HOH . S 8 HOH C 40 740 820 HOH HOH . S 8 HOH C 41 741 13 HOH HOH . S 8 HOH C 42 742 106 HOH HOH . S 8 HOH C 43 743 1 HOH HOH . S 8 HOH C 44 744 12 HOH HOH . S 8 HOH C 45 745 815 HOH HOH . S 8 HOH C 46 746 826 HOH HOH . S 8 HOH C 47 747 814 HOH HOH . S 8 HOH C 48 748 827 HOH HOH . S 8 HOH C 49 749 96 HOH HOH . S 8 HOH C 50 750 94 HOH HOH . T 8 HOH D 1 601 601 HOH HOH . T 8 HOH D 2 602 603 HOH HOH . T 8 HOH D 3 603 614 HOH HOH . T 8 HOH D 4 604 99 HOH HOH . T 8 HOH D 5 605 602 HOH HOH . T 8 HOH D 6 606 15 HOH HOH . T 8 HOH D 7 607 606 HOH HOH . T 8 HOH D 8 608 105 HOH HOH . T 8 HOH D 9 609 607 HOH HOH . T 8 HOH D 10 610 605 HOH HOH . T 8 HOH D 11 611 616 HOH HOH . T 8 HOH D 12 612 98 HOH HOH . T 8 HOH D 13 613 106 HOH HOH . T 8 HOH D 14 614 619 HOH HOH . T 8 HOH D 15 615 83 HOH HOH . T 8 HOH D 16 616 19 HOH HOH . T 8 HOH D 17 617 97 HOH HOH . T 8 HOH D 18 618 65 HOH HOH . T 8 HOH D 19 619 615 HOH HOH . T 8 HOH D 20 620 82 HOH HOH . T 8 HOH D 21 621 79 HOH HOH . T 8 HOH D 22 622 80 HOH HOH . T 8 HOH D 23 623 613 HOH HOH . T 8 HOH D 24 624 625 HOH HOH . T 8 HOH D 25 625 608 HOH HOH . T 8 HOH D 26 626 611 HOH HOH . T 8 HOH D 27 627 66 HOH HOH . T 8 HOH D 28 628 17 HOH HOH . T 8 HOH D 29 629 622 HOH HOH . T 8 HOH D 30 630 77 HOH HOH . T 8 HOH D 31 631 78 HOH HOH . T 8 HOH D 32 632 621 HOH HOH . T 8 HOH D 33 633 84 HOH HOH . T 8 HOH D 34 634 618 HOH HOH . T 8 HOH D 35 635 617 HOH HOH . T 8 HOH D 36 636 624 HOH HOH . T 8 HOH D 37 637 620 HOH HOH . T 8 HOH D 38 638 604 HOH HOH . T 8 HOH D 39 639 623 HOH HOH . T 8 HOH D 40 640 16 HOH HOH . U 8 HOH F 1 101 101 HOH HOH . U 8 HOH F 2 102 806 HOH HOH . U 8 HOH F 3 103 103 HOH HOH . U 8 HOH F 4 104 86 HOH HOH . U 8 HOH F 5 105 89 HOH HOH . U 8 HOH F 6 106 91 HOH HOH . U 8 HOH F 7 107 87 HOH HOH . U 8 HOH F 8 108 102 HOH HOH . U 8 HOH F 9 109 107 HOH HOH . U 8 HOH F 10 110 104 HOH HOH . U 8 HOH F 11 111 85 HOH HOH . U 8 HOH F 12 112 109 HOH HOH . U 8 HOH F 13 113 88 HOH HOH . U 8 HOH F 14 114 108 HOH HOH . U 8 HOH F 15 115 105 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . K 7 169.915 282.383 -140.764 1 61.39 ? C1 GOL 702 B 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . K 7 170.98 283.274 -140.853 1 57.78 ? O1 GOL 702 B 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . K 7 168.635 283.226 -140.596 1 60.13 ? C2 GOL 702 B 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . K 7 168.861 284.576 -140.823 1 69.69 ? O2 GOL 702 B 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . K 7 167.636 282.622 -141.592 1 55.21 ? C3 GOL 702 B 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . K 7 167.318 281.346 -141.141 1 52.5 ? O3 GOL 702 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 39 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 44 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 6 #