data_6KLW # _model_server_result.job_id VKVJV9FhqM0mM47pabZiHg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 09:56:32' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6klw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 6KLW # _exptl.entry_id 6KLW _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6KLW _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6KLW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 10 A ASP 219 1_555 J CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 12 A ASP 221 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 12 A ASP 221 1_555 J CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 12 A ASP 221 1_555 J CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 14 A ASP 223 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 14 A ASP 223 1_555 J CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc7 A O ILE 16 A ILE 225 1_555 J CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc8 A OE1 GLU 21 A GLU 230 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? metalc ? metalc9 A OE2 GLU 21 A GLU 230 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc10 A OE1 GLU 21 A GLU 230 1_555 J CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc ? metalc11 A O SER 50 A SER 259 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc12 A O GLU 53 A GLU 262 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 63 A ASP 272 1_555 I CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc14 B OD1 ASP 10 B ASP 219 1_555 L CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc15 B OD2 ASP 12 B ASP 221 1_555 K CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc16 B OD1 ASP 12 B ASP 221 1_555 L CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc17 B OD2 ASP 14 B ASP 223 1_555 K CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc18 B OD1 ASP 14 B ASP 223 1_555 L CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc19 B O ILE 16 B ILE 225 1_555 L CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc20 B OE1 GLU 21 B GLU 230 1_555 K CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc21 B OE2 GLU 21 B GLU 230 1_555 L CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc22 B O SER 50 B SER 259 1_555 K CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc23 B O GLU 53 B GLU 262 1_555 K CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc24 B OD2 ASP 63 B ASP 272 1_555 K CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc25 C OD1 ASP 10 C ASP 219 1_555 N CA CA . C CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc26 C OD2 ASP 12 C ASP 221 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc27 C OD1 ASP 12 C ASP 221 1_555 N CA CA . C CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc28 C OD2 ASP 14 C ASP 223 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 ? metalc ? metalc29 C OD1 ASP 14 C ASP 223 1_555 N CA CA . C CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc30 C O ILE 16 C ILE 225 1_555 N CA CA . C CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc31 C OE1 GLU 21 C GLU 230 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc32 C OE2 GLU 21 C GLU 230 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc33 C OE2 GLU 21 C GLU 230 1_555 N CA CA . C CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc34 C O SER 50 C SER 259 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? metalc ? metalc35 C O GLU 53 C GLU 262 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc36 C OD2 ASP 63 C ASP 272 1_555 M CA CA . C CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc37 D OD1 ASP 10 D ASP 219 1_555 P CA CA . D CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc38 D OD2 ASP 12 D ASP 221 1_555 O CA CA . D CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc39 D OD1 ASP 12 D ASP 221 1_555 P CA CA . D CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc40 D OD2 ASP 12 D ASP 221 1_555 P CA CA . D CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.043 ? metalc ? metalc41 D OD1 ASP 14 D ASP 223 1_555 P CA CA . D CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? metalc ? metalc42 D O ILE 16 D ILE 225 1_555 P CA CA . D CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc43 D OE2 GLU 21 D GLU 230 1_555 O CA CA . D CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc44 D OE1 GLU 21 D GLU 230 1_555 P CA CA . D CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc45 D O SER 50 D SER 259 1_555 O CA CA . D CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc46 D O GLU 53 D GLU 262 1_555 O CA CA . D CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? metalc ? metalc47 D OD2 ASP 63 D ASP 272 1_555 O CA CA . D CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc48 E OD1 ASP 10 E ASP 219 1_555 Q CA CA . E CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc49 E OD1 ASP 12 E ASP 221 1_555 Q CA CA . E CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc50 E OD2 ASP 12 E ASP 221 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc51 E OD1 ASP 14 E ASP 223 1_555 Q CA CA . E CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc52 E OD2 ASP 14 E ASP 223 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc53 E O ILE 16 E ILE 225 1_555 Q CA CA . E CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc54 E OE2 GLU 21 E GLU 230 1_555 Q CA CA . E CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc55 E OE1 GLU 21 E GLU 230 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc ? metalc56 E OE2 GLU 21 E GLU 230 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.97 ? metalc ? metalc57 E O SER 50 E SER 259 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc58 E O GLU 53 E GLU 262 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc59 E OD2 ASP 63 E ASP 272 1_555 R CA CA . E CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc60 F OD1 ASP 10 F ASP 219 1_555 T CA CA . F CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc61 F OD2 ASP 12 F ASP 221 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc62 F OD1 ASP 12 F ASP 221 1_555 T CA CA . F CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc63 F OD2 ASP 14 F ASP 223 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? metalc ? metalc64 F OD1 ASP 14 F ASP 223 1_555 T CA CA . F CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc65 F O ILE 16 F ILE 225 1_555 T CA CA . F CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc66 F OE1 GLU 21 F GLU 230 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc67 F OE2 GLU 21 F GLU 230 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc68 F OE2 GLU 21 F GLU 230 1_555 T CA CA . F CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc69 F O SER 50 F SER 259 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc70 F O GLU 53 F GLU 262 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc71 F OD2 ASP 63 F ASP 272 1_555 S CA CA . F CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc72 G OD1 ASP 10 G ASP 219 1_555 U CA CA . G CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc73 G OD1 ASP 12 G ASP 221 1_555 U CA CA . G CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc74 G OD2 ASP 12 G ASP 221 1_555 U CA CA . G CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.191 ? metalc ? metalc75 G OD2 ASP 12 G ASP 221 1_555 V CA CA . G CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc76 G OD1 ASP 14 G ASP 223 1_555 U CA CA . G CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc ? metalc77 G OD2 ASP 14 G ASP 223 1_555 V CA CA . G CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc78 G O ILE 16 G ILE 225 1_555 U CA CA . G CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc79 G OE1 GLU 21 G GLU 230 1_555 U CA CA . G CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc80 G OE2 GLU 21 G GLU 230 1_555 V CA CA . G CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc81 G O SER 50 G SER 259 1_555 V CA CA . G CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc82 G O GLU 53 G GLU 262 1_555 V CA CA . G CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc83 G OD2 ASP 63 G ASP 272 1_555 V CA CA . G CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6KLW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 CA A 1 1001 1001 CA CA . J 3 CA A 1 1002 1002 CA CA . K 3 CA B 1 1001 1001 CA CA . L 3 CA B 1 1002 1002 CA CA . M 3 CA C 1 1001 1001 CA CA . N 3 CA C 1 1002 1002 CA CA . O 3 CA D 1 1001 1001 CA CA . P 3 CA D 1 1002 1002 CA CA . Q 3 CA E 1 1001 1001 CA CA . R 3 CA E 1 1002 1002 CA CA . S 3 CA F 1 1001 1001 CA CA . T 3 CA F 1 1002 1002 CA CA . U 3 CA G 1 1001 1001 CA CA . V 3 CA G 1 1002 1002 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id S _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 151.511 _atom_site.Cartn_y 195.356 _atom_site.Cartn_z 210.443 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 29.11 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id F _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 268 _model_server_stats.encode_time_ms 16 _model_server_stats.element_count 1 #