data_6KOQ # _model_server_result.job_id wSAgm782Ynpq0dqKzhJdMQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 23:32:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6koq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":2001}' # _entry.id 6KOQ # _exptl.entry_id 6KOQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 117.44 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6KOQ _cell.length_a 126.846 _cell.length_b 161.097 _cell.length_c 129.551 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6KOQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 J N N ? 9 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 D SG CYS 61 D CYS 60 1_555 K ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc2 D SG CYS 63 D CYS 62 1_555 K ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc3 D SG CYS 76 D CYS 75 1_555 K ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc4 D SG CYS 79 D CYS 78 1_555 K ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc5 D OD1 ASP 536 D ASP 535 1_555 L MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.843 ? metalc ? metalc6 D OD2 ASP 536 D ASP 535 1_555 L MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc7 D OD1 ASP 538 D ASP 537 1_555 L MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? metalc ? metalc8 D OD2 ASP 538 D ASP 537 1_555 L MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.917 ? metalc ? metalc9 D OD1 ASP 540 D ASP 539 1_555 L MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc10 D SG CYS 892 D CYS 891 1_555 J ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc11 D SG CYS 969 D CYS 968 1_555 J ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc12 D SG CYS 976 D CYS 975 1_555 J ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc13 D SG CYS 979 D CYS 978 1_555 J ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc14 L MG MG . D MG 2003 1_555 I O3' A 10 I A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc15 L MG MG . D MG 2003 1_555 I O2' A 10 I A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.99 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 G N3 DT 13 G DT 13 1_555 H N1 DA 11 H DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 G O4 DT 13 G DT 13 1_555 H N6 DA 11 H DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 G N3 DC 14 G DC 14 1_555 H N1 DG 10 H DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 G N4 DC 14 G DC 14 1_555 H O6 DG 10 H DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 G O2 DC 14 G DC 14 1_555 H N2 DG 10 H DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 G N1 DA 15 G DA 15 1_555 H N3 DT 9 H DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 G N6 DA 15 G DA 15 1_555 H O4 DT 9 H DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 G N3 DC 16 G DC 16 1_555 H N1 DG 8 H DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 G N4 DC 16 G DC 16 1_555 H O6 DG 8 H DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 G O2 DC 16 G DC 16 1_555 H N2 DG 8 H DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 G N1 DG 17 G DG 17 1_555 H N3 DC 7 H DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 G N2 DG 17 G DG 17 1_555 H O2 DC 7 H DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 G O6 DG 17 G DG 17 1_555 H N4 DC 7 H DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog14 G N2 DG 18 G DG 18 1_555 H N3 DC 6 H DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G N1 DA 19 G DA 19 1_555 H N3 DT 5 H DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 G N6 DA 19 G DA 19 1_555 H O4 DT 5 H DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 G N3 DT 20 G DT 20 1_555 H N1 DA 4 H DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 G O4 DT 20 G DT 20 1_555 H N6 DA 4 H DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog19 G N2 DG 21 G DG 21 1_555 H N3 DC 3 H DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog20 G N4 DC 22 G DC 22 1_555 H O6 DG 2 H DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 G N1 DA 23 G DA 23 1_555 H N3 DT 1 H DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 G N6 DA 23 G DA 23 1_555 H O4 DT 1 H DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 H N3 DT 13 H DT 13 1_555 I N1 A 10 I A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 H O4 DT 13 H DT 13 1_555 I N6 A 10 I A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 H N3 DC 14 H DC 14 1_555 I N1 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 H N4 DC 14 H DC 14 1_555 I O6 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 H O2 DC 14 H DC 14 1_555 I N2 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 H N1 DG 15 H DG 15 1_555 I N3 C 8 I C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 H N2 DG 15 H DG 15 1_555 I O2 C 8 I C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 H O6 DG 15 H DG 15 1_555 I N4 C 8 I C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 H N1 DA 16 H DA 16 1_555 I N3 U 7 I U 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 H N6 DA 16 H DA 16 1_555 I O4 U 7 I U 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 H N1 DG 17 H DG 17 1_555 I N3 C 6 I C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 H N2 DG 17 H DG 17 1_555 I O2 C 6 I C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 H O6 DG 17 H DG 17 1_555 I N4 C 6 I C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 H N1 DG 18 H DG 18 1_555 I N3 C 5 I C 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 H N2 DG 18 H DG 18 1_555 I O2 C 5 I C 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 H O6 DG 18 H DG 18 1_555 I N4 C 5 I C 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 H N1 DG 19 H DG 19 1_555 I N3 C 4 I C 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 H N2 DG 19 H DG 19 1_555 I O2 C 4 I C 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 H O6 DG 19 H DG 19 1_555 I N4 C 4 I C 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 H N3 DT 20 H DT 20 1_555 I N1 A 3 I A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 H O4 DT 20 H DT 20 1_555 I N6 A 3 I A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 H N1 DG 21 H DG 21 1_555 I N3 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 H N2 DG 21 H DG 21 1_555 I O2 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 H O6 DG 21 H DG 21 1_555 I N4 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6KOQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007884 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.004093 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006207 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008697 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 9 ZN D 1 2001 2001 ZN ZN . K 9 ZN D 1 2002 2002 ZN ZN . L 10 MG D 1 2003 2003 MG MG . M 11 HOH A 1 401 6 HOH HOH . M 11 HOH A 2 402 25 HOH HOH . N 11 HOH B 1 401 14 HOH HOH . O 11 HOH C 1 1201 8 HOH HOH . O 11 HOH C 2 1202 22 HOH HOH . O 11 HOH C 3 1203 16 HOH HOH . O 11 HOH C 4 1204 12 HOH HOH . O 11 HOH C 5 1205 23 HOH HOH . O 11 HOH C 6 1206 2 HOH HOH . O 11 HOH C 7 1207 17 HOH HOH . P 11 HOH D 1 2101 24 HOH HOH . P 11 HOH D 2 2102 9 HOH HOH . P 11 HOH D 3 2103 19 HOH HOH . P 11 HOH D 4 2104 5 HOH HOH . P 11 HOH D 5 2105 4 HOH HOH . P 11 HOH D 6 2106 21 HOH HOH . P 11 HOH D 7 2107 20 HOH HOH . Q 11 HOH E 1 201 11 HOH HOH . R 11 HOH G 1 101 10 HOH HOH . S 11 HOH H 1 101 1 HOH HOH . S 11 HOH H 2 102 18 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id J _atom_site.label_entity_id 9 _atom_site.Cartn_x 114.981 _atom_site.Cartn_y 13.57 _atom_site.Cartn_z 270.614 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 109.75 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 2001 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 30 _model_server_stats.query_time_ms 261 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #