data_6KQO # _model_server_result.job_id u48Za6bLTntciLnw0WRxPQ _model_server_result.datetime_utc '2025-07-19 20:57:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6kqo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"YA","auth_seq_id":402}' # _entry.id 6KQO # _exptl.entry_id 6KQO _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 665.441 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6KQO _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6KQO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 O N N ? 3 S N N ? 3 W N N ? 3 AA N N ? 3 EA N N ? 3 IA N N ? 3 MA N N ? 3 QA N N ? 3 UA N N ? 3 YA N N ? 3 CB N N ? 3 GB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 191 A ASP 191 1_555 M MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 191 A ASP 191 1_555 N MG MG . A MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 195 A GLU 195 1_555 M MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc4 M MG MG . A MG 401 1_555 P O06 9TY . A 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc5 M MG MG . A MG 401 1_555 P O05 9TY . A 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.883 ? metalc ? metalc6 N MG MG . A MG 402 1_555 P O01 9TY . A 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc7 N MG MG . A MG 402 1_555 P O09 9TY . A 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc8 Q MG MG . A MG 405 1_555 B OD1 ASP 191 B ASP 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc9 Q MG MG . A MG 405 1_555 T O09 9TY . B 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc10 Q MG MG . A MG 405 1_555 T O01 9TY . B 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc11 B OD2 ASP 191 B ASP 191 1_555 R MG MG . B MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc12 B OE2 GLU 195 B GLU 195 1_555 R MG MG . B MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc13 R MG MG . B MG 401 1_555 T O06 9TY . B 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.883 ? metalc ? metalc14 R MG MG . B MG 401 1_555 T O05 9TY . B 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc15 C OD2 ASP 191 C ASP 191 1_555 U MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc16 C OD1 ASP 191 C ASP 191 1_555 V MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc17 C OE2 GLU 195 C GLU 195 1_555 U MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc18 U MG MG . C MG 401 1_555 X O05 9TY . C 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc19 U MG MG . C MG 401 1_555 X O06 9TY . C 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc20 V MG MG . C MG 402 1_555 X O01 9TY . C 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc21 V MG MG . C MG 402 1_555 X O09 9TY . C 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc22 Y MG MG . C MG 405 1_555 D OD1 ASP 191 D ASP 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc23 Y MG MG . C MG 405 1_555 BA O01 9TY . D 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc24 Y MG MG . C MG 405 1_555 BA O09 9TY . D 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc25 D OD2 ASP 191 D ASP 191 1_555 Z MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc26 D OE2 GLU 195 D GLU 195 1_555 Z MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc27 Z MG MG . D MG 401 1_555 BA O06 9TY . D 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc28 Z MG MG . D MG 401 1_555 BA O05 9TY . D 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc29 E OD2 ASP 191 E ASP 191 1_555 CA MG MG . E MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc30 E OD1 ASP 191 E ASP 191 1_555 DA MG MG . E MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc31 E OE2 GLU 195 E GLU 195 1_555 CA MG MG . E MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc32 CA MG MG . E MG 401 1_555 FA O05 9TY . E 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc33 CA MG MG . E MG 401 1_555 FA O06 9TY . E 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc34 DA MG MG . E MG 402 1_555 FA O01 9TY . E 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc35 DA MG MG . E MG 402 1_555 FA O09 9TY . E 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc36 GA MG MG . E MG 405 1_555 F OD1 ASP 191 F ASP 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc37 GA MG MG . E MG 405 1_555 JA O01 9TY . F 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc38 GA MG MG . E MG 405 1_555 JA O09 9TY . F 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc39 F OD2 ASP 191 F ASP 191 1_555 HA MG MG . F MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? metalc ? metalc40 F OE2 GLU 195 F GLU 195 1_555 HA MG MG . F MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc41 HA MG MG . F MG 401 1_555 JA O06 9TY . F 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc42 HA MG MG . F MG 401 1_555 JA O05 9TY . F 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc43 G OD2 ASP 191 G ASP 191 1_555 KA MG MG . G MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc44 G OD1 ASP 191 G ASP 191 1_555 LA MG MG . G MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc45 G OE2 GLU 195 G GLU 195 1_555 KA MG MG . G MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc46 KA MG MG . G MG 401 1_555 NA O06 9TY . G 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.883 ? metalc ? metalc47 KA MG MG . G MG 401 1_555 NA O05 9TY . G 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc48 LA MG MG . G MG 402 1_555 NA O01 9TY . G 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc49 LA MG MG . G MG 402 1_555 NA O09 9TY . G 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc50 OA MG MG . G MG 405 1_555 H OD1 ASP 191 H ASP 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc51 OA MG MG . G MG 405 1_555 RA O01 9TY . H 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc52 OA MG MG . G MG 405 1_555 RA O09 9TY . H 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc53 H OD2 ASP 191 H ASP 191 1_555 PA MG MG . H MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc54 H OE2 GLU 195 H GLU 195 1_555 PA MG MG . H MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc55 PA MG MG . H MG 401 1_555 RA O05 9TY . H 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc56 PA MG MG . H MG 401 1_555 RA O06 9TY . H 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc57 I OD2 ASP 191 I ASP 191 1_555 SA MG MG . I MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc58 I OD1 ASP 191 I ASP 191 1_555 TA MG MG . I MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc59 I OE2 GLU 195 I GLU 195 1_555 SA MG MG . I MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc60 SA MG MG . I MG 401 1_555 VA O05 9TY . I 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc61 SA MG MG . I MG 401 1_555 VA O06 9TY . I 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc62 TA MG MG . I MG 402 1_555 VA O01 9TY . I 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc63 TA MG MG . I MG 402 1_555 VA O09 9TY . I 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc64 WA MG MG . I MG 405 1_555 J OD1 ASP 191 J ASP 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc65 WA MG MG . I MG 405 1_555 ZA O01 9TY . J 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc66 WA MG MG . I MG 405 1_555 ZA O09 9TY . J 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc67 J OD2 ASP 191 J ASP 191 1_555 XA MG MG . J MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc68 J OE2 GLU 195 J GLU 195 1_555 XA MG MG . J MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc69 XA MG MG . J MG 401 1_555 ZA O06 9TY . J 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc70 XA MG MG . J MG 401 1_555 ZA O05 9TY . J 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc71 K OD2 ASP 191 K ASP 191 1_555 AB MG MG . K MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc72 K OD1 ASP 191 K ASP 191 1_555 BB MG MG . K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc73 K OE2 GLU 195 K GLU 195 1_555 AB MG MG . K MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc74 AB MG MG . K MG 401 1_555 DB O06 9TY . K 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc75 AB MG MG . K MG 401 1_555 DB O05 9TY . K 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc76 BB MG MG . K MG 402 1_555 DB O09 9TY . K 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc77 BB MG MG . K MG 402 1_555 DB O01 9TY . K 9TY 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc78 EB MG MG . K MG 405 1_555 L OD1 ASP 191 L ASP 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc79 EB MG MG . K MG 405 1_555 HB O01 9TY . L 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc80 EB MG MG . K MG 405 1_555 HB O09 9TY . L 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc81 L OD2 ASP 191 L ASP 191 1_555 FB MG MG . L MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc82 L OE2 GLU 195 L GLU 195 1_555 FB MG MG . L MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc83 FB MG MG . L MG 401 1_555 HB O06 9TY . L 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc84 FB MG MG . L MG 401 1_555 HB O05 9TY . L 9TY 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? # _chem_comp.formula 'C21 H29 N7 O14 P2' _chem_comp.formula_weight 665.441 _chem_comp.id NAI _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms NADH # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A NAI doub 250 n n PA O2A NAI sing 251 n n PA O5B NAI sing 252 n n PA O3 NAI sing 253 n n O2A HOA2 NAI sing 254 n n O5B C5B NAI sing 255 n n C5B C4B NAI sing 256 n n C5B H51A NAI sing 257 n n C5B H52A NAI sing 258 n n C4B O4B NAI sing 259 n n C4B C3B NAI sing 260 n n C4B H4B NAI sing 261 n n O4B C1B NAI sing 262 n n C3B O3B NAI sing 263 n n C3B C2B NAI sing 264 n n C3B H3B NAI sing 265 n n O3B HO3A NAI sing 266 n n C2B O2B NAI sing 267 n n C2B C1B NAI sing 268 n n C2B H2B NAI sing 269 n n O2B HO2A NAI sing 270 n n C1B N9A NAI sing 271 n n C1B H1B NAI sing 272 n n N9A C8A NAI sing 273 n y N9A C4A NAI sing 274 n y C8A N7A NAI doub 275 n y C8A H8A NAI sing 276 n n N7A C5A NAI sing 277 n y C5A C6A NAI sing 278 n y C5A C4A NAI doub 279 n y C6A N6A NAI sing 280 n n C6A N1A NAI doub 281 n y N6A H61A NAI sing 282 n n N6A H62A NAI sing 283 n n N1A C2A NAI sing 284 n y C2A N3A NAI doub 285 n y C2A H2A NAI sing 286 n n N3A C4A NAI sing 287 n y O3 PN NAI sing 288 n n PN O1N NAI sing 289 n n PN O2N NAI doub 290 n n PN O5D NAI sing 291 n n O1N HO1N NAI sing 292 n n O5D C5D NAI sing 293 n n C5D C4D NAI sing 294 n n C5D H51N NAI sing 295 n n C5D H52N NAI sing 296 n n C4D O4D NAI sing 297 n n C4D C3D NAI sing 298 n n C4D H4D NAI sing 299 n n O4D C1D NAI sing 300 n n C3D O3D NAI sing 301 n n C3D C2D NAI sing 302 n n C3D H3D NAI sing 303 n n O3D HO3N NAI sing 304 n n C2D O2D NAI sing 305 n n C2D C1D NAI sing 306 n n C2D H2D NAI sing 307 n n O2D HO2N NAI sing 308 n n C1D N1N NAI sing 309 n n C1D H1D NAI sing 310 n n N1N C2N NAI sing 311 n n N1N C6N NAI sing 312 n n C2N C3N NAI doub 313 n n C2N H2N NAI sing 314 n n C3N C7N NAI sing 315 n n C3N C4N NAI sing 316 n n C7N O7N NAI doub 317 n n C7N N7N NAI sing 318 n n N7N H71N NAI sing 319 n n N7N H72N NAI sing 320 n n C4N C5N NAI sing 321 n n C4N H4N NAI sing 322 n n C4N H42N NAI sing 323 n n C5N C6N NAI doub 324 n n C5N H5N NAI sing 325 n n C6N H6N NAI sing 326 n n # _atom_sites.entry_id 6KQO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 2 MG A 1 401 401 MG MG . N 2 MG A 1 402 402 MG MG . O 3 NAI A 1 403 501 NAI NAI . P 4 9TY A 1 404 601 9TY 9TY . Q 2 MG A 1 405 402 MG MG . R 2 MG B 1 401 401 MG MG . S 3 NAI B 1 402 501 NAI NAI . T 4 9TY B 1 403 601 9TY 9TY . U 2 MG C 1 401 401 MG MG . V 2 MG C 1 402 402 MG MG . W 3 NAI C 1 403 501 NAI NAI . X 4 9TY C 1 404 601 9TY 9TY . Y 2 MG C 1 405 402 MG MG . Z 2 MG D 1 401 401 MG MG . AA 3 NAI D 1 402 501 NAI NAI . BA 4 9TY D 1 403 601 9TY 9TY . CA 2 MG E 1 401 401 MG MG . DA 2 MG E 1 402 402 MG MG . EA 3 NAI E 1 403 501 NAI NAI . FA 4 9TY E 1 404 601 9TY 9TY . GA 2 MG E 1 405 402 MG MG . HA 2 MG F 1 401 401 MG MG . IA 3 NAI F 1 402 501 NAI NAI . JA 4 9TY F 1 403 601 9TY 9TY . KA 2 MG G 1 401 401 MG MG . LA 2 MG G 1 402 402 MG MG . MA 3 NAI G 1 403 501 NAI NAI . NA 4 9TY G 1 404 601 9TY 9TY . OA 2 MG G 1 405 402 MG MG . PA 2 MG H 1 401 401 MG MG . QA 3 NAI H 1 402 501 NAI NAI . RA 4 9TY H 1 403 601 9TY 9TY . SA 2 MG I 1 401 401 MG MG . TA 2 MG I 1 402 402 MG MG . UA 3 NAI I 1 403 501 NAI NAI . VA 4 9TY I 1 404 601 9TY 9TY . WA 2 MG I 1 405 402 MG MG . XA 2 MG J 1 401 401 MG MG . YA 3 NAI J 1 402 501 NAI NAI . ZA 4 9TY J 1 403 601 9TY 9TY . AB 2 MG K 1 401 401 MG MG . BB 2 MG K 1 402 402 MG MG . CB 3 NAI K 1 403 501 NAI NAI . DB 4 9TY K 1 404 601 9TY 9TY . EB 2 MG K 1 405 402 MG MG . FB 2 MG L 1 401 401 MG MG . GB 3 NAI L 1 402 501 NAI NAI . HB 4 9TY L 1 403 601 9TY 9TY . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PA NAI . A . YA 3 133.674 130.347 101.297 0.49 119.21 ? PA NAI 402 J 1 HETATM 2 P PA NAI . B . YA 3 131.102 131.961 104.848 0.51 109.26 ? PA NAI 402 J 1 HETATM 3 O O1A NAI . A . YA 3 132.998 131.271 100.231 0.49 118.69 ? O1A NAI 402 J 1 HETATM 4 O O1A NAI . B . YA 3 131.277 132.81 103.55 0.51 112.07 ? O1A NAI 402 J 1 HETATM 5 O O2A NAI . A . YA 3 133.519 130.955 102.667 0.49 116.12 ? O2A NAI 402 J 1 HETATM 6 O O2A NAI . B . YA 3 130.313 132.741 105.864 0.51 109.63 ? O2A NAI 402 J 1 HETATM 7 O O5B NAI . A . YA 3 132.964 128.854 101.273 0.49 114.11 ? O5B NAI 402 J 1 HETATM 8 O O5B NAI . B . YA 3 130.308 130.563 104.477 0.51 112.9 ? O5B NAI 402 J 1 HETATM 9 C C5B NAI . A . YA 3 131.875 128.655 100.429 0.49 115.84 ? C5B NAI 402 J 1 HETATM 10 C C5B NAI . B . YA 3 129.307 130.614 103.51 0.51 112.81 ? C5B NAI 402 J 1 HETATM 11 C C4B NAI . A . YA 3 131.705 127.129 100.11 0.49 115.39 ? C4B NAI 402 J 1 HETATM 12 C C4B NAI . B . YA 3 129.076 129.178 102.934 0.51 112.44 ? C4B NAI 402 J 1 HETATM 13 O O4B NAI . A . YA 3 131.222 126.484 101.148 0.49 116.05 ? O4B NAI 402 J 1 HETATM 14 O O4B NAI . B . YA 3 128.801 128.356 103.922 0.51 113.66 ? O4B NAI 402 J 1 HETATM 15 C C3B NAI . A . YA 3 130.67 126.965 99.016 0.49 114.9 ? C3B NAI 402 J 1 HETATM 16 C C3B NAI . B . YA 3 127.875 129.155 102 0.51 111.98 ? C3B NAI 402 J 1 HETATM 17 O O3B NAI . A . YA 3 131.269 126.65 97.827 0.49 120.86 ? O3B NAI 402 J 1 HETATM 18 O O3B NAI . B . YA 3 128.238 128.676 100.769 0.51 114.31 ? O3B NAI 402 J 1 HETATM 19 C C2B NAI . A . YA 3 129.732 125.802 99.448 0.49 113.94 ? C2B NAI 402 J 1 HETATM 20 C C2B NAI . B . YA 3 126.841 128.18 102.64 0.51 112.75 ? C2B NAI 402 J 1 HETATM 21 O O2B NAI . A . YA 3 129.878 124.688 98.503 0.49 117.84 ? O2B NAI 402 J 1 HETATM 22 O O2B NAI . B . YA 3 126.31 127.277 101.611 0.51 113.17 ? O2B NAI 402 J 1 HETATM 23 C C1B NAI . A . YA 3 130.122 125.42 100.607 0.49 113.47 ? C1B NAI 402 J 1 HETATM 24 C C1B NAI . B . YA 3 127.496 127.494 103.505 0.51 113.91 ? C1B NAI 402 J 1 HETATM 25 N N9A NAI . A . YA 3 128.996 125.392 101.541 0.49 114.74 ? N9A NAI 402 J 1 HETATM 26 N N9A NAI . B . YA 3 126.677 127.273 104.691 0.51 113.9 ? N9A NAI 402 J 1 HETATM 27 C C8A NAI . A . YA 3 128.552 126.466 102.167 0.49 114.32 ? C8A NAI 402 J 1 HETATM 28 C C8A NAI . B . YA 3 126.406 128.219 105.565 0.51 113.39 ? C8A NAI 402 J 1 HETATM 29 N N7A NAI . A . YA 3 127.533 126.111 102.95 0.49 114 ? N7A NAI 402 J 1 HETATM 30 N N7A NAI . B . YA 3 125.645 127.7 106.526 0.51 111.96 ? N7A NAI 402 J 1 HETATM 31 C C5A NAI . A . YA 3 127.354 124.801 102.802 0.49 113.15 ? C5A NAI 402 J 1 HETATM 32 C C5A NAI . B . YA 3 125.455 126.416 106.233 0.51 111.4 ? C5A NAI 402 J 1 HETATM 33 C C6A NAI . A . YA 3 126.449 123.927 103.37 0.49 112.3 ? C6A NAI 402 J 1 HETATM 34 C C6A NAI . B . YA 3 124.755 125.42 106.881 0.51 112.24 ? C6A NAI 402 J 1 HETATM 35 N N6A NAI . A . YA 3 125.401 124.106 104.305 0.49 113.89 ? N6A NAI 402 J 1 HETATM 36 N N6A NAI . B . YA 3 123.994 125.404 108.076 0.51 112.02 ? N6A NAI 402 J 1 HETATM 37 N N1A NAI . A . YA 3 126.475 122.66 103.058 0.49 112.16 ? N1A NAI 402 J 1 HETATM 38 N N1A NAI . B . YA 3 124.72 124.215 106.378 0.51 114.1 ? N1A NAI 402 J 1 HETATM 39 C C2A NAI . A . YA 3 127.389 122.202 102.177 0.49 113.81 ? C2A NAI 402 J 1 HETATM 40 C C2A NAI . B . YA 3 125.371 123.946 105.225 0.51 114.33 ? C2A NAI 402 J 1 HETATM 41 N N3A NAI . A . YA 3 128.276 123.051 101.621 0.49 113.96 ? N3A NAI 402 J 1 HETATM 42 N N3A NAI . B . YA 3 126.055 124.914 104.59 0.51 113.4 ? N3A NAI 402 J 1 HETATM 43 C C4A NAI . A . YA 3 128.248 124.352 101.942 0.49 113.9 ? C4A NAI 402 J 1 HETATM 44 C C4A NAI . B . YA 3 126.087 126.148 105.108 0.51 113.07 ? C4A NAI 402 J 1 HETATM 45 O O3 NAI . A . YA 3 135.314 130.181 100.945 0.49 116.39 ? O3 NAI 402 J 1 HETATM 46 O O3 NAI . B . YA 3 132.622 131.595 105.47 0.51 109.83 ? O3 NAI 402 J 1 HETATM 47 P PN NAI . A . YA 3 136.003 128.732 100.445 0.49 118.36 ? PN NAI 402 J 1 HETATM 48 P PN NAI . B . YA 3 133.994 131.612 104.504 0.51 109.22 ? PN NAI 402 J 1 HETATM 49 O O1N NAI . A . YA 3 136.658 128.927 99.111 0.49 124.67 ? O1N NAI 402 J 1 HETATM 50 O O1N NAI . B . YA 3 134.562 132.997 104.462 0.51 109.22 ? O1N NAI 402 J 1 HETATM 51 O O2N NAI . A . YA 3 134.898 127.644 100.315 0.49 119.18 ? O2N NAI 402 J 1 HETATM 52 O O2N NAI . B . YA 3 133.595 131.172 103.066 0.51 115.48 ? O2N NAI 402 J 1 HETATM 53 O O5D NAI . A . YA 3 137.116 128.232 101.586 0.49 116.45 ? O5D NAI 402 J 1 HETATM 54 O O5D NAI . B . YA 3 135.125 130.543 105.099 0.51 110.42 ? O5D NAI 402 J 1 HETATM 55 C C5D NAI . A . YA 3 136.63 127.794 102.779 0.49 115.26 ? C5D NAI 402 J 1 HETATM 56 C C5D NAI . B . YA 3 135.274 129.381 104.411 0.51 112.65 ? C5D NAI 402 J 1 HETATM 57 C C4D NAI . A . YA 3 137.655 126.853 103.493 0.49 114.02 ? C4D NAI 402 J 1 HETATM 58 C C4D NAI . B . YA 3 136.362 128.457 105.056 0.51 113.19 ? C4D NAI 402 J 1 HETATM 59 O O4D NAI . A . YA 3 138.876 127.166 103.189 0.49 113.25 ? O4D NAI 402 J 1 HETATM 60 O O4D NAI . B . YA 3 137.517 128.669 104.507 0.51 114.92 ? O4D NAI 402 J 1 HETATM 61 C C3D NAI . A . YA 3 137.575 127.056 105.036 0.49 113.71 ? C3D NAI 402 J 1 HETATM 62 C C3D NAI . B . YA 3 136.525 128.728 106.584 0.51 111.62 ? C3D NAI 402 J 1 HETATM 63 O O3D NAI . A . YA 3 138.069 125.986 105.673 0.49 112.54 ? O3D NAI 402 J 1 HETATM 64 O O3D NAI . B . YA 3 136.436 127.568 107.241 0.51 111.62 ? O3D NAI 402 J 1 HETATM 65 C C2D NAI . A . YA 3 138.479 128.261 105.261 0.49 114.55 ? C2D NAI 402 J 1 HETATM 66 C C2D NAI . B . YA 3 137.927 129.296 106.788 0.51 112.48 ? C2D NAI 402 J 1 HETATM 67 O O2D NAI . A . YA 3 138.93 128.3 106.675 0.49 114.4 ? O2D NAI 402 J 1 HETATM 68 O O2D NAI . B . YA 3 138.614 128.519 107.85 0.51 112.98 ? O2D NAI 402 J 1 HETATM 69 C C1D NAI . A . YA 3 139.48 128.034 104.424 0.49 114.15 ? C1D NAI 402 J 1 HETATM 70 C C1D NAI . B . YA 3 138.564 129.163 105.642 0.51 114.23 ? C1D NAI 402 J 1 HETATM 71 N N1N NAI . A . YA 3 140.044 129.237 103.87 0.49 115.63 ? N1N NAI 402 J 1 HETATM 72 N N1N NAI . B . YA 3 139.1 130.424 105.214 0.51 112.65 ? N1N NAI 402 J 1 HETATM 73 C C2N NAI . A . YA 3 139.191 130.167 103.17 0.49 116.36 ? C2N NAI 402 J 1 HETATM 74 C C2N NAI . B . YA 3 138.194 131.499 104.891 0.51 111.98 ? C2N NAI 402 J 1 HETATM 75 C C3N NAI . A . YA 3 139.697 131.563 102.782 0.49 115.92 ? C3N NAI 402 J 1 HETATM 76 C C3N NAI . B . YA 3 138.724 132.926 104.693 0.51 110.36 ? C3N NAI 402 J 1 HETATM 77 C C7N NAI . A . YA 3 138.645 132.666 102.475 0.49 116.77 ? C7N NAI 402 J 1 HETATM 78 C C7N NAI . B . YA 3 137.726 134.119 104.676 0.51 109.22 ? C7N NAI 402 J 1 HETATM 79 O O7N NAI . A . YA 3 137.488 132.468 102.7 0.49 117.18 ? O7N NAI 402 J 1 HETATM 80 O O7N NAI . B . YA 3 136.798 134.148 105.432 0.51 109.22 ? O7N NAI 402 J 1 HETATM 81 N N7N NAI . A . YA 3 139.066 133.921 101.913 0.49 117.96 ? N7N NAI 402 J 1 HETATM 82 N N7N NAI . B . YA 3 137.928 135.188 103.735 0.51 109.22 ? N7N NAI 402 J 1 HETATM 83 C C4N NAI . A . YA 3 141.161 131.93 102.953 0.49 116.74 ? C4N NAI 402 J 1 HETATM 84 C C4N NAI . B . YA 3 140.214 133.188 104.578 0.51 112.99 ? C4N NAI 402 J 1 HETATM 85 C C5N NAI . A . YA 3 142.068 130.747 103.339 0.49 115.65 ? C5N NAI 402 J 1 HETATM 86 C C5N NAI . B . YA 3 141.092 131.926 104.571 0.51 113.33 ? C5N NAI 402 J 1 HETATM 87 C C6N NAI . A . YA 3 141.473 129.489 103.983 0.49 114.99 ? C6N NAI 402 J 1 HETATM 88 C C6N NAI . B . YA 3 140.537 130.597 105.088 0.51 113.38 ? C6N NAI 402 J 1 HETATM 89 H H51A NAI . A . YA 3 132.018 129.141 99.604 0.49 139.01 ? H51A NAI 402 J 1 HETATM 90 H H51A NAI . B . YA 3 129.58 131.211 102.799 0.51 135.38 ? H51A NAI 402 J 1 HETATM 91 H H52A NAI . A . YA 3 131.073 128.985 100.86 0.49 139.01 ? H52A NAI 402 J 1 HETATM 92 H H52A NAI . B . YA 3 128.488 130.935 103.913 0.51 135.38 ? H52A NAI 402 J 1 HETATM 93 H H4B NAI . A . YA 3 132.546 126.741 99.834 0.49 138.47 ? H4B NAI 402 J 1 HETATM 94 H H4B NAI . B . YA 3 129.864 128.878 102.461 0.51 134.93 ? H4B NAI 402 J 1 HETATM 95 H H3B NAI . A . YA 3 130.156 127.773 98.941 0.49 137.88 ? H3B NAI 402 J 1 HETATM 96 H H3B NAI . B . YA 3 127.493 130.04 101.924 0.51 134.38 ? H3B NAI 402 J 1 HETATM 97 H HO3A NAI . A . YA 3 130.695 126.274 97.329 0.49 145.03 ? HO3A NAI 402 J 1 HETATM 98 H HO3A NAI . B . YA 3 127.724 128.032 100.563 0.51 137.17 ? HO3A NAI 402 J 1 HETATM 99 H H2B NAI . A . YA 3 128.815 126.107 99.483 0.49 136.73 ? H2B NAI 402 J 1 HETATM 100 H H2B NAI . B . YA 3 126.126 128.678 103.057 0.51 135.3 ? H2B NAI 402 J 1 HETATM 101 H HO2A NAI . A . YA 3 129.121 124.322 98.393 0.49 141.4 ? HO2A NAI 402 J 1 HETATM 102 H HO2A NAI . B . YA 3 125.91 127.736 101.019 0.51 135.8 ? HO2A NAI 402 J 1 HETATM 103 H H1B NAI . A . YA 3 130.52 124.541 100.531 0.49 136.17 ? H1B NAI 402 J 1 HETATM 104 H H1B NAI . B . YA 3 127.763 126.646 103.118 0.51 136.7 ? H1B NAI 402 J 1 HETATM 105 H H8A NAI . A . YA 3 128.586 127.379 102.347 0.49 137.19 ? H8A NAI 402 J 1 HETATM 106 H H8A NAI . B . YA 3 126.474 129.096 105.86 0.51 136.07 ? H8A NAI 402 J 1 HETATM 107 H H61A NAI . A . YA 3 125.31 124.86 104.707 0.49 136.67 ? H61A NAI 402 J 1 HETATM 108 H H61A NAI . B . YA 3 123.866 126.134 108.511 0.51 134.42 ? H61A NAI 402 J 1 HETATM 109 H H62A NAI . A . YA 3 124.864 123.458 104.475 0.49 136.67 ? H62A NAI 402 J 1 HETATM 110 H H62A NAI . B . YA 3 123.662 124.666 108.364 0.51 134.42 ? H62A NAI 402 J 1 HETATM 111 H H2A NAI . A . YA 3 127.407 121.3 101.955 0.49 136.57 ? H2A NAI 402 J 1 HETATM 112 H H2A NAI . B . YA 3 125.347 123.09 104.867 0.51 137.19 ? H2A NAI 402 J 1 HETATM 113 H H51N NAI . A . YA 3 135.809 127.304 102.621 0.49 138.31 ? H51N NAI 402 J 1 HETATM 114 H H51N NAI . B . YA 3 135.528 129.587 103.498 0.51 135.18 ? H51N NAI 402 J 1 HETATM 115 H H52N NAI . A . YA 3 136.442 128.557 103.349 0.49 138.31 ? H52N NAI 402 J 1 HETATM 116 H H52N NAI . B . YA 3 134.426 128.916 104.405 0.51 135.18 ? H52N NAI 402 J 1 HETATM 117 H H4D NAI . A . YA 3 137.487 125.928 103.263 0.49 136.82 ? H4D NAI 402 J 1 HETATM 118 H H4D NAI . B . YA 3 136.121 127.529 104.926 0.51 135.82 ? H4D NAI 402 J 1 HETATM 119 H H3D NAI . A . YA 3 136.671 127.257 105.32 0.49 136.45 ? H3D NAI 402 J 1 HETATM 120 H H3D NAI . B . YA 3 135.862 129.353 106.904 0.51 133.94 ? H3D NAI 402 J 1 HETATM 121 H HO3N NAI . A . YA 3 138.821 126.184 106.015 0.49 135.05 ? HO3N NAI 402 J 1 HETATM 122 H HO3N NAI . B . YA 3 137.214 127.236 107.316 0.51 133.94 ? HO3N NAI 402 J 1 HETATM 123 H H2D NAI . A . YA 3 137.991 129.069 105.057 0.49 137.46 ? H2D NAI 402 J 1 HETATM 124 H H2D NAI . B . YA 3 137.873 130.222 107.059 0.51 134.97 ? H2D NAI 402 J 1 HETATM 125 H HO2N NAI . A . YA 3 138.248 128.393 107.175 0.49 137.28 ? HO2N NAI 402 J 1 HETATM 126 H HO2N NAI . B . YA 3 138.387 128.831 108.607 0.51 135.58 ? HO2N NAI 402 J 1 HETATM 127 H H1D NAI . A . YA 3 140.169 127.516 104.869 0.49 136.98 ? H1D NAI 402 J 1 HETATM 128 H H1D NAI . B . YA 3 139.272 128.511 105.735 0.51 137.07 ? H1D NAI 402 J 1 HETATM 129 H H2N NAI . A . YA 3 138.276 130.009 103.162 0.49 139.63 ? H2N NAI 402 J 1 HETATM 130 H H2N NAI . B . YA 3 137.288 131.377 105.05 0.51 134.37 ? H2N NAI 402 J 1 HETATM 131 H H71N NAI . A . YA 3 139.899 134.059 101.751 0.49 141.56 ? H71N NAI 402 J 1 HETATM 132 H H71N NAI . B . YA 3 137.383 135.852 103.715 0.51 131.07 ? H71N NAI 402 J 1 HETATM 133 H H72N NAI . A . YA 3 138.486 134.533 101.742 0.49 141.56 ? H72N NAI 402 J 1 HETATM 134 H H72N NAI . B . YA 3 138.596 135.158 103.195 0.51 131.07 ? H72N NAI 402 J 1 HETATM 135 H H4N NAI . A . YA 3 141.475 132.293 102.111 0.49 140.09 ? H4N NAI 402 J 1 HETATM 136 H H4N NAI . B . YA 3 140.365 133.667 103.751 0.51 135.59 ? H4N NAI 402 J 1 HETATM 137 H H42N NAI . A . YA 3 141.225 132.61 103.64 0.49 140.09 ? H42N NAI 402 J 1 HETATM 138 H H42N NAI . B . YA 3 140.482 133.742 105.323 0.51 135.59 ? H42N NAI 402 J 1 HETATM 139 H H5N NAI . A . YA 3 142.983 130.79 103.178 0.49 138.78 ? H5N NAI 402 J 1 HETATM 140 H H5N NAI . B . YA 3 142.009 132.013 104.454 0.51 136 ? H5N NAI 402 J 1 HETATM 141 H H6N NAI . A . YA 3 142.036 128.775 104.169 0.49 137.99 ? H6N NAI 402 J 1 HETATM 142 H H6N NAI . B . YA 3 141.078 129.844 105.062 0.51 136.06 ? H6N NAI 402 J 1 # _model_server_stats.io_time_ms 26 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 65 _model_server_stats.query_time_ms 224 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 142 #