data_6KS6 # _model_server_result.job_id I3CTRWJsx2F9-3_YzDhfHw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 22:34:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ks6 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":602}' # _entry.id 6KS6 # _exptl.entry_id 6KS6 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 10 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 16 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6KS6 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6KS6 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 10 R N N ? 10 U N N ? 10 X N N ? 10 AA N N ? 10 DA N N ? 10 GA N N ? 10 JA N N ? 10 MA N N ? 10 PA N N ? 10 SA N N ? 10 VA N N ? 10 YA N N ? 10 BB N N ? 10 CB N N ? 10 FB N N ? 10 IB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 96 a ASP 96 1_555 R MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 96 a ASP 96 1_555 R MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.949 ? metalc ? metalc3 Q O1B ADP . a ADP 601 1_555 R MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc4 Q O2A ADP . a ADP 601 1_555 R MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc5 Q O3A ADP . a ADP 601 1_555 R MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc6 Q O1B ADP . a ADP 601 1_555 S AL AF3 . a AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc7 T O1A ADP . A ADP 601 1_555 U MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc8 T O3A ADP . A ADP 601 1_555 U MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc9 T O1B ADP . A ADP 601 1_555 V AL AF3 . A AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? metalc ? metalc10 C OD1 ASP 90 b ASP 90 1_555 X MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc11 W O1B ADP . b ADP 601 1_555 X MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc12 W O1A ADP . b ADP 601 1_555 X MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? metalc ? metalc13 W O2A ADP . b ADP 601 1_555 X MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? metalc ? metalc14 W O3A ADP . b ADP 601 1_555 X MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc15 W O1B ADP . b ADP 601 1_555 Y AL AF3 . b AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc16 D OD1 ASP 90 B ASP 90 1_555 AA MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? metalc ? metalc17 Z O2B ADP . B ADP 601 1_555 AA MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc18 Z O2A ADP . B ADP 601 1_555 AA MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc19 E OD1 ASP 91 d ASP 91 1_555 DA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? metalc ? metalc20 E O SER 157 d SER 157 1_555 DA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc21 CA O1B ADP . d ADP 601 1_555 DA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? metalc ? metalc22 CA O2A ADP . d ADP 601 1_555 DA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc23 CA O1B ADP . d ADP 601 1_555 EA AL AF3 . d AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc24 F OD1 ASP 60 D ASP 60 1_555 HA AL AF3 . D AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc25 F OD1 ASP 91 D ASP 91 1_555 GA MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? metalc ? metalc26 F OG SER 157 D SER 157 1_555 GA MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc27 FA O2B ADP . D ADP 601 1_555 GA MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc28 FA O2A ADP . D ADP 601 1_555 GA MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc29 FA O1B ADP . D ADP 601 1_555 HA AL AF3 . D AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc30 G OD1 ASP 117 e ASP 117 1_555 JA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc31 IA O3A ADP . e ADP 601 1_555 JA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc32 IA O1B ADP . e ADP 601 1_555 KA AL AF3 . e AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc33 H OD1 ASP 117 E ASP 117 1_555 MA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? metalc ? metalc34 LA O1B ADP . E ADP 601 1_555 MA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc35 LA O3A ADP . E ADP 601 1_555 MA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? metalc ? metalc36 LA O1B ADP . E ADP 601 1_555 NA AL AF3 . E AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc37 I OD1 ASP 91 g ASP 91 1_555 PA MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? metalc ? metalc38 OA O1A ADP . g ADP 601 1_555 PA MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc39 OA O3A ADP . g ADP 601 1_555 PA MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc40 J OD1 ASP 60 G ASP 60 1_555 TA AL AF3 . G AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? metalc ? metalc41 J OD1 ASP 91 G ASP 91 1_555 SA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc42 RA O1A ADP . G ADP 601 1_555 SA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc43 RA O3A ADP . G ADP 601 1_555 SA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc44 RA O1B ADP . G ADP 601 1_555 TA AL AF3 . G AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc45 RA O3B ADP . G ADP 601 1_555 TA AL AF3 . G AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc46 K OD1 ASP 96 h ASP 96 1_555 VA MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc47 UA O1B ADP . h ADP 601 1_555 VA MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc48 UA O3A ADP . h ADP 601 1_555 VA MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? metalc ? metalc49 UA O1B ADP . h ADP 601 1_555 WA AL AF3 . h AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? metalc ? metalc50 L OD1 ASP 96 H ASP 96 1_555 YA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? metalc ? metalc51 XA O2B ADP . H ADP 601 1_555 YA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? metalc ? metalc52 XA O1A ADP . H ADP 601 1_555 YA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc53 XA O3A ADP . H ADP 601 1_555 YA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc54 XA O2B ADP . H ADP 601 1_555 ZA AL AF3 . H AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc55 AB O3B ADP . q ADP 601 1_555 BB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc56 CB MG MG . Q MG 601 1_555 DB O3A ADP . Q ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc57 CB MG MG . Q MG 601 1_555 DB O1B ADP . Q ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc58 CB MG MG . Q MG 601 1_555 DB O3B ADP . Q ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? metalc ? metalc59 O OD1 ASP 89 z ASP 89 1_555 FB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc60 O OD2 ASP 89 z ASP 89 1_555 FB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? metalc ? metalc61 EB O1A ADP . z ADP 601 1_555 FB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc62 EB O3A ADP . z ADP 601 1_555 FB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc63 EB O3B ADP . z ADP 601 1_555 GB AL AF3 . z AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc64 P OD1 ASP 89 Z ASP 89 1_555 IB MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? metalc ? metalc65 P OD2 ASP 89 Z ASP 89 1_555 IB MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? metalc ? metalc66 HB O1A ADP . Z ADP 601 1_555 IB MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc67 HB O3A ADP . Z ADP 601 1_555 IB MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc68 HB O2B ADP . Z ADP 601 1_555 JB AL AF3 . Z AF3 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6KS6 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 9 ADP a 1 601 551 ADP ADP . R 10 MG a 1 602 552 MG MG . S 11 AF3 a 1 603 554 AF3 AF3 . T 9 ADP A 1 601 1530 ADP ADP . U 10 MG A 1 602 1418 MG MG . V 11 AF3 A 1 603 700 AF3 AF3 . W 9 ADP b 1 601 531 ADP ADP . X 10 MG b 1 602 1419 MG MG . Y 11 AF3 b 1 603 700 AF3 AF3 . Z 9 ADP B 1 601 1532 ADP ADP . AA 10 MG B 1 602 1420 MG MG . BA 11 AF3 B 1 603 700 AF3 AF3 . CA 9 ADP d 1 601 1535 ADP ADP . DA 10 MG d 1 602 1423 MG MG . EA 11 AF3 d 1 603 700 AF3 AF3 . FA 9 ADP D 1 601 1536 ADP ADP . GA 10 MG D 1 602 1424 MG MG . HA 11 AF3 D 1 603 700 AF3 AF3 . IA 9 ADP e 1 601 1538 ADP ADP . JA 10 MG e 1 602 1425 MG MG . KA 11 AF3 e 1 603 700 AF3 AF3 . LA 9 ADP E 1 601 1549 ADP ADP . MA 10 MG E 1 602 1426 MG MG . NA 11 AF3 E 1 603 700 AF3 AF3 . OA 9 ADP g 1 601 1533 ADP ADP . PA 10 MG g 1 602 1421 MG MG . QA 11 AF3 g 1 603 700 AF3 AF3 . RA 9 ADP G 1 601 1534 ADP ADP . SA 10 MG G 1 602 1422 MG MG . TA 11 AF3 G 1 603 700 AF3 AF3 . UA 9 ADP h 1 601 1542 ADP ADP . VA 10 MG h 1 602 1429 MG MG . WA 11 AF3 h 1 603 700 AF3 AF3 . XA 9 ADP H 1 601 1543 ADP ADP . YA 10 MG H 1 602 1430 MG MG . ZA 11 AF3 H 1 603 700 AF3 AF3 . AB 9 ADP q 1 601 1544 ADP ADP . BB 10 MG q 1 602 1422 MG MG . CB 10 MG Q 1 601 1423 MG MG . DB 9 ADP Q 1 602 1545 ADP ADP . EB 9 ADP z 1 601 1540 ADP ADP . FB 10 MG z 1 602 1427 MG MG . GB 11 AF3 z 1 603 700 AF3 AF3 . HB 9 ADP Z 1 601 1541 ADP ADP . IB 10 MG Z 1 602 1428 MG MG . JB 11 AF3 Z 1 603 700 AF3 AF3 . KB 12 HOH a 1 701 553 HOH HOH . LB 12 HOH A 1 701 2214 HOH HOH . MB 12 HOH b 1 701 2215 HOH HOH . NB 12 HOH B 1 701 2216 HOH HOH . OB 12 HOH d 1 701 2219 HOH HOH . PB 12 HOH D 1 701 2220 HOH HOH . QB 12 HOH e 1 701 2221 HOH HOH . RB 12 HOH E 1 701 2222 HOH HOH . SB 12 HOH g 1 701 2217 HOH HOH . TB 12 HOH G 1 701 2218 HOH HOH . UB 12 HOH h 1 701 2225 HOH HOH . VB 12 HOH H 1 701 2226 HOH HOH . WB 12 HOH z 1 701 2223 HOH HOH . XB 12 HOH Z 1 701 2224 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id MA _atom_site.label_entity_id 10 _atom_site.Cartn_x 102.922 _atom_site.Cartn_y 153.374 _atom_site.Cartn_z 173.077 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 78.88 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 602 _atom_site.auth_asym_id E _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 28 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 340 _model_server_stats.query_time_ms 261 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #