data_6LAH
#
_model_server_result.job_id            P_Tfzr1acNsYLUhWP5rcAg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 01:25:54' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6lah 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":312}' 
#
_entry.id    6LAH 
#
_exptl.entry_id    6LAH 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  nat 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    31 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.904 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6LAH 
_cell.length_a            251.438 
_cell.length_b            46.443 
_cell.length_c            84.928 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6LAH 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    'C 2y' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? dimeric 2 author_defined_assembly 1 
? dimeric 2 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,RA,SA 1 1 
C,D,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,TA,UA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 F N N 
? 4 G N N 
? 4 H N N 
? 4 I N N 
? 4 J N N 
? 4 K N N 
? 4 L N N 
? 4 N N N 
? 4 O N N 
? 4 P N N 
? 4 Q N N 
? 4 R N N 
? 4 X N N 
? 4 Y N N 
? 4 Z N N 
? 4 AA N N 
? 4 BA N N 
? 4 CA N N 
? 4 DA N N 
? 4 EA N N 
? 4 FA N N 
? 4 GA N N 
? 4 HA N N 
? 4 IA N N 
? 4 JA N N 
? 4 KA N N 
? 4 LA N N 
? 4 NA N N 
? 4 OA N N 
? 4 PA N N 
? 4 QA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 102 A CYS 101 1_555 A SG CYS 165 A CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 204 A CYS 203 1_555 A SG CYS 260 A CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 26 B CYS 25 1_555 B SG CYS 81 B CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf4 C SG CYS 102 C CYS 101 1_555 C SG CYS 165 C CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 204 C CYS 203 1_555 C SG CYS 260 C CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf6 D SG CYS 26 D CYS 25 1_555 D SG CYS 81 D CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
metalc ? metalc1 A N ALA 1 A ALA 0 1_555 V ZN ZN . C ZN 304 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc2 A O ALA 1 A ALA 0 1_555 V ZN ZN . C ZN 304 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? 
metalc ? metalc3 A NE2 HIS 4 A HIS 3 1_555 V ZN ZN . C ZN 304 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc4 A OE2 GLU 59 A GLU 58 1_555 E ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc5 A OE1 GLU 62 A GLU 61 1_555 E ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc6 A OE1 GLU 62 A GLU 61 1_555 E ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 139 A GLU 138 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_544 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
metalc ? metalc8 A NE2 HIS 192 A HIS 191 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 2_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
metalc ? metalc9 A OE2 GLU 255 A GLU 254 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 2_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? 
metalc ? metalc10 E ZN ZN . A ZN 301 4_554 C NE2 HIS 192 C HIS 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc11 C N ALA 1 C ALA 0 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? 
metalc ? metalc12 C O ALA 1 C ALA 0 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
metalc ? metalc13 C NE2 HIS 4 C HIS 3 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? 
metalc ? metalc14 C OE2 GLU 59 C GLU 58 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.957 ? 
metalc ? metalc15 C OE2 GLU 62 C GLU 61 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? 
metalc ? metalc16 C OE1 GLU 139 C GLU 138 1_555 V ZN ZN . C ZN 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? 
metalc ? metalc17 C OE2 GLU 139 C GLU 138 1_555 V ZN ZN . C ZN 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc18 C OE1 GLN 181 C GLN 180 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc19 C ND1 HIS 193 C HIS 192 1_555 W ZN ZN . C ZN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? 
metalc ? metalc20 C NE2 HIS 198 C HIS 197 1_555 U ZN ZN . C ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc21 U ZN ZN . C ZN 303 1_555 TA O HOH . C HOH 437 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc22 U ZN ZN . C ZN 303 4_544 D OE1 GLU 37 D GLU 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? 
metalc ? metalc23 U ZN ZN . C ZN 303 4_544 D OE2 GLU 37 D GLU 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 83 n n 
C1 C2 EDO sing 84 n n 
C1 H11 EDO sing 85 n n 
C1 H12 EDO sing 86 n n 
O1 HO1 EDO sing 87 n n 
C2 O2 EDO sing 88 n n 
C2 H21 EDO sing 89 n n 
C2 H22 EDO sing 90 n n 
O2 HO2 EDO sing 91 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6LAH 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.003977 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000063 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.021532 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.011776 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 ZN A 1 301 2 ZN ZN . 
F 4 EDO A 1 302 4 EDO EDO . 
G 4 EDO A 1 303 8 EDO EDO . 
H 4 EDO A 1 304 13 EDO EDO . 
I 4 EDO A 1 305 15 EDO EDO . 
J 4 EDO A 1 306 16 EDO EDO . 
K 4 EDO A 1 307 25 EDO EDO . 
L 4 EDO A 1 308 26 EDO EDO . 
M 5 EKG A 1 309 1 EKG EKG . 
N 4 EDO B 1 101 1 EDO EDO . 
O 4 EDO B 1 102 3 EDO EDO . 
P 4 EDO B 1 103 5 EDO EDO . 
Q 4 EDO B 1 104 27 EDO EDO . 
R 4 EDO B 1 105 28 EDO EDO . 
S 3 ZN C 1 301 1 ZN ZN . 
T 3 ZN C 1 302 3 ZN ZN . 
U 3 ZN C 1 303 4 ZN ZN . 
V 3 ZN C 1 304 5 ZN ZN . 
W 3 ZN C 1 305 6 ZN ZN . 
X 4 EDO C 1 306 9 EDO EDO . 
Y 4 EDO C 1 307 10 EDO EDO . 
Z 4 EDO C 1 308 11 EDO EDO . 
AA 4 EDO C 1 309 12 EDO EDO . 
BA 4 EDO C 1 310 14 EDO EDO . 
CA 4 EDO C 1 311 17 EDO EDO . 
DA 4 EDO C 1 312 18 EDO EDO . 
EA 4 EDO C 1 313 19 EDO EDO . 
FA 4 EDO C 1 314 21 EDO EDO . 
GA 4 EDO C 1 315 22 EDO EDO . 
HA 4 EDO C 1 316 23 EDO EDO . 
IA 4 EDO C 1 317 24 EDO EDO . 
JA 4 EDO C 1 318 29 EDO EDO . 
KA 4 EDO C 1 319 30 EDO EDO . 
LA 4 EDO C 1 320 31 EDO EDO . 
MA 5 EKG C 1 321 2 EKG EKG . 
NA 4 EDO D 1 101 2 EDO EDO . 
OA 4 EDO D 1 102 6 EDO EDO . 
PA 4 EDO D 1 103 7 EDO EDO . 
QA 4 EDO D 1 104 20 EDO EDO . 
RA 6 HOH A 1 401 396 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 2 402 409 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 3 403 406 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 4 404 81 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 5 405 59 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 6 406 404 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 7 407 298 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 8 408 68 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 9 409 134 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 10 410 338 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 11 411 369 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 12 412 213 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 13 413 261 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 14 414 106 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 15 415 168 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 16 416 152 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 17 417 199 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 18 418 342 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 19 419 47 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 20 420 40 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 21 421 258 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 22 422 232 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 23 423 234 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 24 424 270 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 25 425 4 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 26 426 257 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 27 427 66 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 28 428 115 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 29 429 239 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 30 430 98 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 31 431 18 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 32 432 24 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 33 433 14 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 34 434 214 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 35 435 398 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 36 436 357 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 37 437 187 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 38 438 6 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 39 439 248 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 40 440 156 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 41 441 223 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 42 442 74 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 43 443 130 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 44 444 78 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 45 445 5 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 46 446 259 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 47 447 194 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 48 448 33 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 49 449 67 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 50 450 235 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 51 451 129 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 52 452 135 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 53 453 2 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 54 454 304 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 55 455 390 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 56 456 294 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 57 457 17 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 58 458 60 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 59 459 360 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 60 460 244 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 61 461 203 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 62 462 252 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 63 463 322 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 64 464 104 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 65 465 242 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 66 466 212 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 67 467 171 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 68 468 312 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 69 469 95 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 70 470 36 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 71 471 69 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 72 472 266 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 73 473 83 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 74 474 90 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 75 475 8 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 76 476 20 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 77 477 52 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 78 478 186 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 79 479 403 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 80 480 28 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 81 481 182 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 82 482 285 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 83 483 359 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 84 484 303 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 85 485 377 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 86 486 164 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 87 487 109 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 88 488 144 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 90 490 178 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 91 491 209 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 125 525 118 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 127 527 386 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 130 530 148 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 131 531 392 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 132 532 287 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 133 533 388 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 134 534 23 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 135 535 315 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 139 539 114 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 140 540 268 HOH HOH . 
RA 6 HOH A 141 541 314 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 143 543 331 HOH HOH . 
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RA 6 HOH A 150 550 158 HOH HOH . 
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SA 6 HOH B 1 201 180 HOH HOH . 
SA 6 HOH B 2 202 26 HOH HOH . 
SA 6 HOH B 3 203 228 HOH HOH . 
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SA 6 HOH B 5 205 10 HOH HOH . 
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SA 6 HOH B 10 210 336 HOH HOH . 
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TA 6 HOH C 154 554 317 HOH HOH . 
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TA 6 HOH C 158 558 340 HOH HOH . 
UA 6 HOH D 1 201 296 HOH HOH . 
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UA 6 HOH D 12 212 11 HOH HOH . 
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