data_6MK0 # _model_server_result.job_id cViZu4PSY7tEy8RGf1Hqog _model_server_result.datetime_utc '2025-02-17 09:02:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6mk0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":712}' # _entry.id 6MK0 # _exptl.entry_id 6MK0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 491.562 _entity.id 8 _entity.src_method nat _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '(2S)-2-[(1,3-benzothiazole-2-carbonyl)amino]-4-{[5-(1,8-naphthyridin-2-yl)pentanoyl]amino}butanoic acid' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6MK0 _cell.length_a 129.406 _cell.length_b 129.406 _cell.length_c 305.535 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6MK0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 8 _struct_asym.id Y _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 4 4 3 BMA BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 4 5 4 MAN BMA C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 4 6 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n C NAG 1 C 1 NAG A 1001 NAG 3 n C NAG 2 C 2 NAG A 1002 NAG 4 n D NAG 1 D 1 NAG A 1004 NAG 4 n D NAG 2 D 2 NAG A 1005 NAG 4 n D BMA 3 D 3 BMA A 1006 BMA 4 n D BMA 4 D 4 BMA A 1008 BMA 4 n D MAN 5 D 5 MAN A 1009 MAN 4 n D MAN 6 D 6 MAN A 1007 MAN 3 n E NAG 1 E 1 NAG A 1010 NAG 3 n E NAG 2 E 2 NAG A 1011 NAG 3 n F NAG 1 F 1 NAG A 1014 NAG 3 n F NAG 2 F 2 NAG A 1015 NAG 3 n G NAG 1 G 1 NAG B 703 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG B 704 NAG 5 n H NAG 1 H 1 NAG B 705 NAG 5 n H NAG 2 H 2 NAG B 706 NAG 5 n H BMA 3 H 3 BMA B 707 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 108 A CYS 108 1_555 A SG CYS 128 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 142 A CYS 142 1_555 A SG CYS 155 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 461 A CYS 461 1_555 A SG CYS 472 A CYS 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 478 A CYS 478 1_555 A SG CYS 535 A CYS 535 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 596 A CYS 596 1_555 A SG CYS 602 A CYS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 668 A CYS 668 1_555 A SG CYS 681 A CYS 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 822 A CYS 822 1_555 A SG CYS 884 A CYS 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 874 A CYS 874 1_555 A SG CYS 879 A CYS 879 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 2 B CYS 5 1_555 B SG CYS 20 B CYS 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 10 B CYS 13 1_555 B SG CYS 432 B CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 13 B CYS 16 1_555 B SG CYS 35 B CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 23 B CYS 26 1_555 B SG CYS 46 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 174 B CYS 177 1_555 B SG CYS 181 B CYS 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 229 B CYS 232 1_555 B SG CYS 270 B CYS 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 371 B CYS 374 1_555 B SG CYS 383 B CYS 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 403 B CYS 406 1_555 B SG CYS 430 B CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 434 B CYS 437 1_555 B SG CYS 454 B CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 445 B CYS 448 1_555 B SG CYS 457 B CYS 460 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 459 B CYS 462 1_555 B SG CYS 468 B CYS 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 470 B CYS 473 1_555 B SG CYS 500 B CYS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 483 B CYS 486 1_555 B SG CYS 498 B CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 492 B CYS 495 1_555 B SG CYS 503 B CYS 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 505 B CYS 508 1_555 B SG CYS 518 B CYS 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 520 B CYS 523 1_555 B SG CYS 541 B CYS 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 525 B CYS 528 1_555 B SG CYS 539 B CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 533 B CYS 536 1_555 B SG CYS 544 B CYS 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 546 B CYS 549 1_555 B SG CYS 555 B CYS 558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 557 B CYS 560 1_555 B SG CYS 580 B CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 564 B CYS 567 1_555 B SG CYS 578 B CYS 581 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 572 B CYS 575 1_555 B SG CYS 583 B CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 585 B CYS 588 1_555 B SG CYS 595 B CYS 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 598 B CYS 601 1_555 B SG CYS 601 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 605 B CYS 608 1_555 B SG CYS 652 B CYS 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 611 B CYS 614 1_555 B SG CYS 632 B CYS 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 614 B CYS 617 1_555 B SG CYS 628 B CYS 631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf37 B SG CYS 660 B CYS 663 1_555 B SG CYS 684 B CYS 687 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 44 A ASN 44 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 260 A ASN 260 1_555 I C1 NAG . A NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 266 A ASN 266 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 458 A ASN 458 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 585 A ASN 585 1_555 J C1 NAG . A NAG 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 805 A ASN 805 1_555 K C1 NAG . A NAG 1013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 821 A ASN 821 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 943 A ASN 943 1_555 L C1 NAG . A NAG 1016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 950 A ASN 950 1_555 M C1 NAG . A NAG 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 96 B ASN 99 1_555 S C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 317 B ASN 320 1_555 T C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 368 B ASN 371 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 556 B ASN 559 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 651 B ASN 654 1_555 X C1 NAG . B NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale15 C O4 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale16 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale17 D O4 NAG . D NAG 2 1_555 D C1 BMA . D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale18 D O6 BMA . D BMA 3 1_555 D C1 BMA . D BMA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale19 D O3 BMA . D BMA 3 1_555 D C1 MAN . D MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale20 D O4 BMA . D BMA 4 1_555 D C1 MAN . D MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale21 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale22 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale23 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale24 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale25 H O4 NAG . H NAG 2 1_555 H C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 230 A ASP 230 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 232 A ASN 232 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 234 A ASP 234 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc5 A O ILE 236 A ILE 236 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 238 A ASP 238 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 238 A ASP 238 1_555 N MN MN . A MN 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 284 A ASP 284 1_555 O MN MN . A MN 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 286 A ASN 286 1_555 O MN MN . A MN 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 288 A ASP 288 1_555 O MN MN . A MN 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc11 A O TYR 290 A TYR 290 1_555 O MN MN . A MN 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 292 A ASP 292 1_555 O MN MN . A MN 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 292 A ASP 292 1_555 O MN MN . A MN 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 349 A ASP 349 1_555 P MN MN . A MN 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 351 A ASP 351 1_555 P MN MN . A MN 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 353 A ASP 353 1_555 P MN MN . A MN 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc17 A O PHE 355 A PHE 355 1_555 P MN MN . A MN 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 357 A ASP 357 1_555 P MN MN . A MN 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc19 A OD2 ASP 357 A ASP 357 1_555 P MN MN . A MN 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 413 A ASP 413 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 415 A ASP 415 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc22 A OD1 ASN 417 A ASN 417 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc ? metalc23 A ND2 ASN 417 A ASN 417 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc24 A O TYR 419 A TYR 419 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc25 A OD1 ASP 421 A ASP 421 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc26 A OD2 ASP 421 A ASP 421 1_555 Q MN MN . A MN 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? metalc ? metalc27 A O CYS 596 A CYS 596 1_555 R MN MN . A MN 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc28 A OD1 ASP 599 A ASP 599 1_555 R MN MN . A MN 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc29 A OD2 ASP 599 A ASP 599 1_555 R MN MN . A MN 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? metalc ? metalc30 A O VAL 601 A VAL 601 1_555 R MN MN . A MN 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc31 A OE1 GLU 636 A GLU 636 1_555 R MN MN . A MN 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? metalc ? metalc32 A OE2 GLU 636 A GLU 636 1_555 R MN MN . A MN 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc33 B OG SER 118 B SER 121 1_555 U MN MN . B MN 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc34 B O SER 120 B SER 123 1_555 V MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 123 B ASP 126 1_555 V MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc36 B OD2 ASP 123 B ASP 126 1_555 V MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc37 B OD1 ASP 124 B ASP 127 1_555 V MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc38 B OD2 ASP 155 B ASP 158 1_555 W MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? metalc ? metalc39 B OD1 ASN 212 B ASN 215 1_555 W MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? metalc ? metalc40 B O ASP 214 B ASP 217 1_555 W MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc41 B OD1 ASP 214 B ASP 217 1_555 W MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc ? metalc42 B O PRO 216 B PRO 219 1_555 W MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc43 B OE1 GLU 217 B GLU 220 1_555 U MN MN . B MN 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc44 B OE2 GLU 217 B GLU 220 1_555 W MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc45 B O MET 332 B MET 335 1_555 V MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc46 U MN MN . B MN 708 1_555 Y O03 JUY . B JUY 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? metalc ? metalc47 U MN MN . B MN 708 1_555 Z O HOH . B HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc48 U MN MN . B MN 708 1_555 Z O HOH . B HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc49 U MN MN . B MN 708 1_555 Z O HOH . B HOH 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc50 V MN MN . B MN 709 1_555 Z O HOH . B HOH 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? # _chem_comp.formula 'C25 H25 N5 O4 S' _chem_comp.formula_weight 491.562 _chem_comp.id JUY _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '(2S)-2-[(1,3-benzothiazole-2-carbonyl)amino]-4-{[5-(1,8-naphthyridin-2-yl)pentanoyl]amino}butanoic acid' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O01 C02 JUY doub 197 n n O03 C02 JUY sing 198 n n C02 C04 JUY sing 199 n n O09 C08 JUY doub 200 n n C05 C04 JUY sing 201 n n C05 C06 JUY sing 202 n n N07 C08 JUY sing 203 n n N07 C06 JUY sing 204 n n C04 N24 JUY sing 205 n n C08 C10 JUY sing 206 n n N24 C25 JUY sing 207 n n C11 C10 JUY sing 208 n n C11 C12 JUY sing 209 n n N28 C29 JUY sing 210 n y N28 C27 JUY doub 211 n y C35 C29 JUY doub 212 n y C35 C34 JUY sing 213 n y C25 C27 JUY sing 214 n n C25 O26 JUY doub 215 n n C12 C13 JUY sing 216 n n C20 N21 JUY doub 217 n y C20 C19 JUY sing 218 n y N21 C22 JUY sing 219 n y C29 C30 JUY sing 220 n y C19 C18 JUY doub 221 n y C27 S31 JUY sing 222 n y C22 N23 JUY doub 223 n y C22 C17 JUY sing 224 n y C18 C17 JUY sing 225 n y C34 C33 JUY doub 226 n y N23 C14 JUY sing 227 n y C17 C16 JUY doub 228 n y C14 C13 JUY sing 229 n n C14 C15 JUY doub 230 n y C16 C15 JUY sing 231 n y C30 S31 JUY sing 232 n y C30 C32 JUY doub 233 n y C33 C32 JUY sing 234 n y C10 H1 JUY sing 235 n n C10 H2 JUY sing 236 n n C13 H3 JUY sing 237 n n C13 H4 JUY sing 238 n n C15 H5 JUY sing 239 n n C20 H6 JUY sing 240 n n C04 H7 JUY sing 241 n n C05 H8 JUY sing 242 n n C05 H9 JUY sing 243 n n C06 H10 JUY sing 244 n n C06 H11 JUY sing 245 n n C11 H12 JUY sing 246 n n C11 H13 JUY sing 247 n n C12 H14 JUY sing 248 n n C12 H15 JUY sing 249 n n C16 H16 JUY sing 250 n n C18 H17 JUY sing 251 n n C19 H18 JUY sing 252 n n C32 H19 JUY sing 253 n n C33 H20 JUY sing 254 n n C34 H21 JUY sing 255 n n C35 H22 JUY sing 256 n n N07 H23 JUY sing 257 n n N24 H24 JUY sing 258 n n O03 H25 JUY sing 259 n n # _atom_sites.entry_id 6MK0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007728 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004462 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008923 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003273 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 6 NAG A 1 1003 1003 NAG NAG . J 6 NAG A 1 1012 1012 NAG NAG . K 6 NAG A 1 1013 1013 NAG NAG . L 6 NAG A 1 1016 1016 NAG NAG . M 6 NAG A 1 1017 1017 NAG NAG . N 7 MN A 1 1018 1018 MN MN . O 7 MN A 1 1019 1019 MN MN . P 7 MN A 1 1020 1020 MN MN . Q 7 MN A 1 1021 1021 MN MN . R 7 MN A 1 1022 1022 MN MN . S 6 NAG B 1 701 701 NAG NAG . T 6 NAG B 1 702 702 NAG NAG . U 7 MN B 1 708 708 MN MN . V 7 MN B 1 709 709 MN MN . W 7 MN B 1 710 710 MN MN . X 6 NAG B 1 711 711 NAG NAG . Y 8 JUY B 1 712 1 JUY LIG . Z 9 HOH B 1 801 803 HOH HOH . Z 9 HOH B 2 802 802 HOH HOH . Z 9 HOH B 3 803 804 HOH HOH . Z 9 HOH B 4 804 801 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C10 JUY . . . Y 8 17.518 43.244 40.338 1 48.48 ? C10 JUY 712 B 1 HETATM 2 C C13 JUY . . . Y 8 16.805 45.483 43.513 1 44.62 ? C13 JUY 712 B 1 HETATM 3 C C15 JUY . . . Y 8 18.115 47.66 43.573 1 49.28 ? C15 JUY 712 B 1 HETATM 4 C C17 JUY . . . Y 8 17.096 49.816 42.974 1 49.41 ? C17 JUY 712 B 1 HETATM 5 C C20 JUY . . . Y 8 14.582 51.188 42.635 1 66.22 ? C20 JUY 712 B 1 HETATM 6 C C22 JUY . . . Y 8 15.901 49.09 42.739 1 50.89 ? C22 JUY 712 B 1 HETATM 7 C C02 JUY . . . Y 8 21.183 37.049 38.974 1 30.98 ? C02 JUY 712 B 1 HETATM 8 C C04 JUY . . . Y 8 21.119 38.121 40.116 1 26.85 ? C04 JUY 712 B 1 HETATM 9 C C05 JUY . . . Y 8 20.487 39.392 39.557 1 27.02 ? C05 JUY 712 B 1 HETATM 10 C C06 JUY . . . Y 8 19.533 39.989 40.581 1 26.29 ? C06 JUY 712 B 1 HETATM 11 C C08 JUY . . . Y 8 17.939 41.855 40.68 1 31.19 ? C08 JUY 712 B 1 HETATM 12 C C11 JUY . . . Y 8 16.783 43.926 41.509 1 45.56 ? C11 JUY 712 B 1 HETATM 13 C C12 JUY . . . Y 8 17.653 44.674 42.51 1 42.22 ? C12 JUY 712 B 1 HETATM 14 C C14 JUY . . . Y 8 16.886 47.018 43.321 1 46.19 ? C14 JUY 712 B 1 HETATM 15 C C16 JUY . . . Y 8 18.217 49.058 43.402 1 53.75 ? C16 JUY 712 B 1 HETATM 16 C C18 JUY . . . Y 8 17.187 51.301 42.783 1 39.91 ? C18 JUY 712 B 1 HETATM 17 C C19 JUY . . . Y 8 15.858 52.042 42.417 1 52.8 ? C19 JUY 712 B 1 HETATM 18 C C25 JUY . . . Y 8 22.647 38.824 41.987 1 55.98 ? C25 JUY 712 B 1 HETATM 19 C C27 JUY . . . Y 8 24.079 38.979 42.528 1 78.24 ? C27 JUY 712 B 1 HETATM 20 C C29 JUY . . . Y 8 26.418 38.958 42.516 1 62.18 ? C29 JUY 712 B 1 HETATM 21 C C30 JUY . . . Y 8 26.304 39.313 43.869 1 90.71 ? C30 JUY 712 B 1 HETATM 22 C C32 JUY . . . Y 8 27.456 39.52 44.652 1 68.4 ? C32 JUY 712 B 1 HETATM 23 C C33 JUY . . . Y 8 28.738 39.37 44.076 1 55.84 ? C33 JUY 712 B 1 HETATM 24 C C34 JUY . . . Y 8 28.869 39.01 42.712 1 37.13 ? C34 JUY 712 B 1 HETATM 25 C C35 JUY . . . Y 8 27.713 38.806 41.94 1 55.8 ? C35 JUY 712 B 1 HETATM 26 N N07 JUY . . . Y 8 19.145 41.313 40.222 1 15.37 ? N07 JUY 712 B 1 HETATM 27 N N21 JUY . . . Y 8 14.696 49.769 42.289 1 54.75 ? N21 JUY 712 B 1 HETATM 28 N N23 JUY . . . Y 8 15.819 47.727 42.907 1 56.41 ? N23 JUY 712 B 1 HETATM 29 N N24 JUY . . . Y 8 22.454 38.329 40.698 1 40.39 ? N24 JUY 712 B 1 HETATM 30 N N28 JUY . . . Y 8 25.193 38.771 41.809 1 56.69 ? N28 JUY 712 B 1 HETATM 31 O O01 JUY . . . Y 8 22.338 36.709 38.534 1 24.22 -1 O01 JUY 712 B 1 HETATM 32 O O03 JUY . . . Y 8 20.101 36.545 38.499 1 45.07 ? O03 JUY 712 B 1 HETATM 33 O O09 JUY . . . Y 8 17.218 41.155 41.413 1 51.95 ? O09 JUY 712 B 1 HETATM 34 O O26 JUY . . . Y 8 21.737 39.196 42.733 1 50.18 ? O26 JUY 712 B 1 HETATM 35 S S31 JUY . . . Y 8 24.551 39.406 44.231 1 146.79 ? S31 JUY 712 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 34 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 34 _model_server_stats.query_time_ms 287 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 35 #