data_6MSU # _model_server_result.job_id w-DXMchddUd64CEclQGNbQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 23:34:14' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6msu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":702}' # _entry.id 6MSU # _exptl.entry_id 6MSU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method nat _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6MSU _cell.length_a 129.894 _cell.length_b 129.894 _cell.length_c 305.843 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6MSU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 M N N ? 8 N N N ? 8 O N N ? 8 U N N ? 8 V N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 6 4 3 BMA BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 8 ? 6 5 4 MAN BMA C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 6 6 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 10 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 11 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n D NAG 1 D 1 NAG A 1001 NAG 4 n D NAG 2 D 2 NAG A 1002 NAG 4 n D BMA 3 D 3 BMA A 1003 BMA 4 n D MAN 4 D 4 MAN A 1004 MAN 5 n E NAG 1 E 1 NAG A 1005 NAG 5 n E NAG 2 E 2 NAG A 1006 NAG 6 n F NAG 1 F 1 NAG A 1007 NAG 6 n F NAG 2 F 2 NAG A 1008 NAG 6 n F BMA 3 F 3 BMA A 1009 BMA 6 n F BMA 4 F 4 BMA A 1011 BMA 6 n F MAN 5 F 5 MAN A 1012 MAN 6 n F MAN 6 F 6 MAN A 1010 MAN 4 n G NAG 1 G 1 NAG A 1013 NAG 4 n G NAG 2 G 2 NAG A 1014 NAG 4 n G BMA 3 G 3 BMA A 1015 BMA 4 n G MAN 4 G 4 MAN A 1016 MAN 5 n H NAG 1 H 1 NAG A 1018 NAG 5 n H NAG 2 H 2 NAG A 1019 NAG 5 n I NAG 1 I 1 NAG A 1022 NAG 5 n I NAG 2 I 2 NAG A 1023 NAG 7 n J NAG 1 J 1 NAG A 1024 NAG 7 n J NAG 2 J 2 NAG A 1025 NAG 7 n J BMA 3 J 3 BMA A 1026 BMA 5 n K NAG 1 K 1 NAG B 703 NAG 5 n K NAG 2 K 2 NAG B 704 NAG 7 n L NAG 1 L 1 NAG B 705 NAG 7 n L NAG 2 L 2 NAG B 706 NAG 7 n L BMA 3 L 3 BMA B 707 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 108 A CYS 108 1_555 A SG CYS 128 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 142 A CYS 142 1_555 A SG CYS 155 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 461 A CYS 461 1_555 A SG CYS 472 A CYS 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 478 A CYS 478 1_555 A SG CYS 535 A CYS 535 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 596 A CYS 596 1_555 A SG CYS 602 A CYS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 668 A CYS 668 1_555 A SG CYS 681 A CYS 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 822 A CYS 822 1_555 A SG CYS 884 A CYS 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 874 A CYS 874 1_555 A SG CYS 879 A CYS 879 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 5 B CYS 5 1_555 B SG CYS 23 B CYS 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 13 B CYS 13 1_555 B SG CYS 435 B CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 16 B CYS 16 1_555 B SG CYS 38 B CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 26 B CYS 26 1_555 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 177 B CYS 177 1_555 B SG CYS 184 B CYS 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 232 B CYS 232 1_555 B SG CYS 273 B CYS 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 374 B CYS 374 1_555 B SG CYS 386 B CYS 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 406 B CYS 406 1_555 B SG CYS 433 B CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 437 B CYS 437 1_555 B SG CYS 457 B CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 448 B CYS 448 1_555 B SG CYS 460 B CYS 460 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 462 B CYS 462 1_555 B SG CYS 471 B CYS 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 486 B CYS 486 1_555 B SG CYS 501 B CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 495 B CYS 495 1_555 B SG CYS 506 B CYS 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 508 B CYS 508 1_555 B SG CYS 521 B CYS 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 523 B CYS 523 1_555 B SG CYS 544 B CYS 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 528 B CYS 528 1_555 B SG CYS 542 B CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 536 B CYS 536 1_555 B SG CYS 547 B CYS 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 549 B CYS 549 1_555 B SG CYS 558 B CYS 558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 560 B CYS 560 1_555 B SG CYS 583 B CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 567 B CYS 567 1_555 B SG CYS 581 B CYS 581 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 575 B CYS 575 1_555 B SG CYS 586 B CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 588 B CYS 588 1_555 B SG CYS 598 B CYS 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 601 B CYS 601 1_555 B SG CYS 604 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 608 B CYS 608 1_555 B SG CYS 655 B CYS 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 614 B CYS 614 1_555 B SG CYS 635 B CYS 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 631 B CYS 631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 663 B CYS 663 1_555 B SG CYS 687 B CYS 687 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 1 C CYS 2 1_555 C SG CYS 23 C CYS 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 13 C CYS 14 1_555 C SG CYS 25 C CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 19 C CYS 20 1_555 C SG CYS 31 C CYS 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 44 A ASN 44 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 260 A ASN 260 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 266 A ASN 266 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 458 A ASN 458 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 524 A ASN 524 1_555 M C1 NAG . A NAG 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 585 A ASN 585 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 674 A ASN 674 1_555 N C1 NAG . A NAG 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 821 A ASN 821 1_555 O C1 NAG . A NAG 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 943 A ASN 943 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 950 A ASN 950 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 99 B ASN 99 1_555 U C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 320 B ASN 320 1_555 V C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 371 B ASN 371 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 559 B ASN 559 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale15 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale16 D O4 NAG . D NAG 2 1_555 D C1 BMA . D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale17 D O3 BMA . D BMA 3 1_555 D C1 MAN . D MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale18 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale19 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale20 F O4 NAG . F NAG 2 1_555 F C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale21 F O6 BMA . F BMA 3 1_555 F C1 BMA . F BMA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale22 F O3 BMA . F BMA 3 1_555 F C1 MAN . F MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale23 F O4 BMA . F BMA 4 1_555 F C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale24 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale25 G O4 NAG . G NAG 2 1_555 G C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale26 G O3 BMA . G BMA 3 1_555 G C1 MAN . G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale27 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale28 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale29 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale30 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale31 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale32 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 L O4 NAG . L NAG 2 1_555 L C1 BMA . L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 230 A ASP 230 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 230 A ASP 230 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASN 232 A ASN 232 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc5 A O ILE 236 A ILE 236 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 238 A ASP 238 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 238 A ASP 238 1_555 P MN MN . A MN 1027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 286 A ASN 286 1_555 Q MN MN . A MN 1028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 288 A ASP 288 1_555 Q MN MN . A MN 1028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc10 A O TYR 290 A TYR 290 1_555 Q MN MN . A MN 1028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 292 A ASP 292 1_555 Q MN MN . A MN 1028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 292 A ASP 292 1_555 Q MN MN . A MN 1028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASP 349 A ASP 349 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 351 A ASP 351 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 351 A ASP 351 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 353 A ASP 353 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 353 A ASP 353 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc18 A O PHE 355 A PHE 355 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 357 A ASP 357 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc20 A OD2 ASP 357 A ASP 357 1_555 R MN MN . A MN 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 415 A ASP 415 1_555 S MN MN . A MN 1030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? metalc ? metalc22 A OD1 ASN 417 A ASN 417 1_555 S MN MN . A MN 1030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc23 A O TYR 419 A TYR 419 1_555 S MN MN . A MN 1030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 421 A ASP 421 1_555 S MN MN . A MN 1030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc25 A OD2 ASP 421 A ASP 421 1_555 S MN MN . A MN 1030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc26 A O CYS 596 A CYS 596 1_555 T MN MN . A MN 1031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc27 A OD1 ASP 599 A ASP 599 1_555 T MN MN . A MN 1031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? metalc ? metalc28 A OD2 ASP 599 A ASP 599 1_555 T MN MN . A MN 1031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc29 A O VAL 601 A VAL 601 1_555 T MN MN . A MN 1031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc30 A OE1 GLU 636 A GLU 636 1_555 T MN MN . A MN 1031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc31 A OE2 GLU 636 A GLU 636 1_555 T MN MN . A MN 1031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc32 B OG SER 121 B SER 121 1_555 W MN MN . B MN 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc33 B OG SER 123 B SER 123 1_555 W MN MN . B MN 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc ? metalc34 B O SER 123 B SER 123 1_555 X MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 126 B ASP 126 1_555 X MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc36 B OD2 ASP 127 B ASP 127 1_555 X MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? metalc ? metalc37 B OD2 ASP 158 B ASP 158 1_555 Y MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc ? metalc38 B OD1 ASN 215 B ASN 215 1_555 Y MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc39 B O ASP 217 B ASP 217 1_555 Y MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? metalc ? metalc40 B OD1 ASP 217 B ASP 217 1_555 Y MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc41 B O PRO 219 B PRO 219 1_555 Y MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc ? metalc42 B OE1 GLU 220 B GLU 220 1_555 W MN MN . B MN 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc43 B OE2 GLU 220 B GLU 220 1_555 Y MN MN . B MN 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc44 B OD1 ASP 251 B ASP 251 1_555 X MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc45 B OD2 ASP 251 B ASP 251 1_555 X MN MN . B MN 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc46 W MN MN . B MN 708 1_555 BA O HOH . B HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc47 W MN MN . B MN 708 1_555 BA O HOH . B HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? metalc ? metalc48 W MN MN . B MN 708 1_555 C OD1 ASP 7 C ASP 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 285 n n C1 O1 NAG sing 286 n n C1 O5 NAG sing 287 n n C1 H1 NAG sing 288 n n C2 C3 NAG sing 289 n n C2 N2 NAG sing 290 n n C2 H2 NAG sing 291 n n C3 C4 NAG sing 292 n n C3 O3 NAG sing 293 n n C3 H3 NAG sing 294 n n C4 C5 NAG sing 295 n n C4 O4 NAG sing 296 n n C4 H4 NAG sing 297 n n C5 C6 NAG sing 298 n n C5 O5 NAG sing 299 n n C5 H5 NAG sing 300 n n C6 O6 NAG sing 301 n n C6 H61 NAG sing 302 n n C6 H62 NAG sing 303 n n C7 C8 NAG sing 304 n n C7 N2 NAG sing 305 n n C7 O7 NAG doub 306 n n C8 H81 NAG sing 307 n n C8 H82 NAG sing 308 n n C8 H83 NAG sing 309 n n N2 HN2 NAG sing 310 n n O1 HO1 NAG sing 311 n n O3 HO3 NAG sing 312 n n O4 HO4 NAG sing 313 n n O6 HO6 NAG sing 314 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6MSU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007699 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004445 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00889 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00327 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 8 NAG A 1 1017 1017 NAG NAG . N 8 NAG A 1 1020 1020 NAG NAG . O 8 NAG A 1 1021 1021 NAG NAG . P 9 MN A 1 1027 1027 MN MN . Q 9 MN A 1 1028 1028 MN MN . R 9 MN A 1 1029 1029 MN MN . S 9 MN A 1 1030 1030 MN MN . T 9 MN A 1 1031 1031 MN MN . U 8 NAG B 1 701 701 NAG NAG . V 8 NAG B 1 702 702 NAG NAG . W 9 MN B 1 708 708 MN MN . X 9 MN B 1 709 709 MN MN . Y 9 MN B 1 710 710 MN MN . Z 10 CL C 1 101 803 CL CL . AA 11 HOH A 1 1101 1032 HOH HOH . BA 11 HOH B 1 801 801 HOH HOH . BA 11 HOH B 2 802 802 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . V 8 -1.419 36.641 44.823 1 51.4 ? C1 NAG 702 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . V 8 -0.844 38.031 45.153 1 62.36 ? C2 NAG 702 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . V 8 -1.555 38.639 46.364 1 58.51 ? C3 NAG 702 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . V 8 -3.06 38.67 46.128 1 63.57 ? C4 NAG 702 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . V 8 -3.548 37.249 45.854 1 67.33 ? C5 NAG 702 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . V 8 -5.028 37.17 45.545 1 78.52 ? C6 NAG 702 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . V 8 1.494 37.884 44.388 1 64.17 ? C7 NAG 702 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . V 8 2.933 37.836 44.807 1 51.89 ? C8 NAG 702 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . V 8 0.594 37.97 45.378 1 63.25 ? N2 NAG 702 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . V 8 -1.051 39.95 46.597 1 51.86 ? O3 NAG 702 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . V 8 -3.757 39.234 47.237 1 58.72 ? O4 NAG 702 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . V 8 -2.859 36.716 44.712 1 59.92 ? O5 NAG 702 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . V 8 -5.366 35.933 44.931 1 77.2 ? O6 NAG 702 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . V 8 1.162 37.851 43.208 1 73.8 ? O7 NAG 702 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 281 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #