data_6MZF
#
_model_server_result.job_id            5ktfW_mpHJbhaV9B4DWuoA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 18:52:54' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6mzf 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"HA","auth_seq_id":601}' 
#
_entry.id    6MZF 
#
_exptl.entry_id    6MZF 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    16 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.38 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6MZF 
_cell.length_a            218.8 
_cell.length_b            107.65 
_cell.length_c            282.74 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6MZF 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? tetradecameric 14 author_defined_assembly 1 
? tetradecameric 14 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA 1 1 
O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 DA N N 
? 6 FA N N 
? 6 HA N N 
? 6 JA N N 
? 6 LA N N 
? 6 NA N N 
? 6 PA N N 
? 6 RA N N 
? 6 TA N N 
? 6 VA N N 
? 6 XA N N 
? 6 ZA N N 
? 6 BB N N 
? 6 DB N N 
? 6 FB N N 
? 6 HB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 CA O2G GTP . A GTP 600 1_555 DA MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc2 CA O2B GTP . A GTP 600 1_555 DA MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? 
metalc ? metalc3 EA O2B GDP . B GDP 600 1_555 FA MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc4 GA O2G GTP . C GTP 600 1_555 HA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? 
metalc ? metalc5 GA O1B GTP . C GTP 600 1_555 HA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc6 IA O1B GDP . D GDP 600 1_555 JA MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? 
metalc ? metalc7 H OE1 GLU 71 H GLU 71 1_555 LA MG MG . H MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? 
metalc ? metalc8 KA O1G GTP . H GTP 600 1_555 LA MG MG . H MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc9 KA O1B GTP . H GTP 600 1_555 LA MG MG . H MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? 
metalc ? metalc10 MA O1B GDP . I GDP 600 1_555 NA MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc11 OA O2G GTP . J GTP 600 1_555 PA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? 
metalc ? metalc12 OA O2B GTP . J GTP 600 1_555 PA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? 
metalc ? metalc13 QA O2B GDP . K GDP 600 1_555 RA MG MG . K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc14 SA O2G GTP . O GTP 600 1_555 TA MG MG . O MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? 
metalc ? metalc15 SA O2B GTP . O GTP 600 1_555 TA MG MG . O MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? 
metalc ? metalc16 UA O2B GDP . P GDP 600 1_555 VA MG MG . P MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc17 WA O2G GTP . Q GTP 600 1_555 XA MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc18 WA O1B GTP . Q GTP 600 1_555 XA MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc19 R OD2 ASP 67 R ASP 69 1_555 ZA MG MG . R MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? 
metalc ? metalc20 YA O1B GDP . R GDP 600 1_555 ZA MG MG . R MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? 
metalc ? metalc21 V OE1 GLU 71 V GLU 71 1_555 BB MG MG . V MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? 
metalc ? metalc22 AB O1G GTP . V GTP 600 1_555 BB MG MG . V MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc23 AB O1B GTP . V GTP 600 1_555 BB MG MG . V MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? 
metalc ? metalc24 W OD1 ASP 67 W ASP 69 1_555 DB MG MG . W MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? 
metalc ? metalc25 X OE1 GLU 71 X GLU 71 1_555 FB MG MG . X MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? 
metalc ? metalc26 EB O2G GTP . X GTP 600 1_555 FB MG MG . X MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? 
metalc ? metalc27 EB O2B GTP . X GTP 600 1_555 FB MG MG . X MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? 
metalc ? metalc28 Y OE1 GLN 11 Y GLN 11 1_555 HB MG MG . Y MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? 
metalc ? metalc29 GB O2B GDP . Y GDP 600 1_555 HB MG MG . Y MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6MZF 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.00457 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.00003 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009289 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.003537 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
CA 5 GTP A 1 600 600 GTP GTP . 
DA 6 MG A 1 601 601 MG MG . 
EA 7 GDP B 1 600 600 GDP GDP . 
FA 6 MG B 1 601 601 MG MG . 
GA 5 GTP C 1 600 600 GTP GTP . 
HA 6 MG C 1 601 601 MG MG . 
IA 7 GDP D 1 600 600 GDP GDP . 
JA 6 MG D 1 601 601 MG MG . 
KA 5 GTP H 1 600 600 GTP GTP . 
LA 6 MG H 1 601 601 MG MG . 
MA 7 GDP I 1 600 600 GDP GDP . 
NA 6 MG I 1 601 601 MG MG . 
OA 5 GTP J 1 600 600 GTP GTP . 
PA 6 MG J 1 601 601 MG MG . 
QA 7 GDP K 1 600 600 GDP GDP . 
RA 6 MG K 1 601 601 MG MG . 
SA 5 GTP O 1 600 600 GTP GTP . 
TA 6 MG O 1 601 601 MG MG . 
UA 7 GDP P 1 600 600 GDP GDP . 
VA 6 MG P 1 601 601 MG MG . 
WA 5 GTP Q 1 600 600 GTP GTP . 
XA 6 MG Q 1 601 601 MG MG . 
YA 7 GDP R 1 600 600 GDP GDP . 
ZA 6 MG R 1 601 601 MG MG . 
AB 5 GTP V 1 600 600 GTP GTP . 
BB 6 MG V 1 601 601 MG MG . 
CB 7 GDP W 1 600 600 GDP GDP . 
DB 6 MG W 1 601 601 MG MG . 
EB 5 GTP X 1 600 600 GTP GTP . 
FB 6 MG X 1 601 601 MG MG . 
GB 7 GDP Y 1 600 600 GDP GDP . 
HB 6 MG Y 1 601 601 MG MG . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         HA 
_atom_site.label_entity_id       6 
_atom_site.Cartn_x               70.261 
_atom_site.Cartn_y               -11.288 
_atom_site.Cartn_z               195.179 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        46.78 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           601 
_atom_site.auth_asym_id          C 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              37 
_model_server_stats.parse_time_ms           22 
_model_server_stats.create_model_time_ms    176 
_model_server_stats.query_time_ms           310 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           1 
#