data_6MZG
#
_model_server_result.job_id            5nf736a_1BlVDCVB2WzOyw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-03 03:28:52' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6mzg 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":600}' 
#
_entry.id    6MZG 
#
_exptl.entry_id    6MZG 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.19 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6MZG 
_cell.length_a            115.13 
_cell.length_b            194.99 
_cell.length_c            149.57 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6MZG 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? hexameric 6 author_defined_assembly 1 
? hexameric 6 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,M,N,O,P,Q,R,S,T 1 1 
G,H,I,J,K,L,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 M N N 
? 5 Q N N 
? 5 U N N 
? 5 Y N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 M O1G GTP . A GTP 600 1_555 N MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc2 M O1B GTP . A GTP 600 1_555 N MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc3 B OE1 GLN 11 B GLN 11 1_555 P MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc4 O O1A GDP . B GDP 600 1_555 P MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? 
metalc ? metalc5 Q O1G GTP . C GTP 600 1_555 R MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc6 Q O1B GTP . C GTP 600 1_555 R MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc7 S O1A GDP . D GDP 600 1_555 T MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc8 U O3G GTP . G GTP 600 1_555 V MG MG . G MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? 
metalc ? metalc9 U O2B GTP . G GTP 600 1_555 V MG MG . G MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? 
metalc ? metalc10 H OD2 ASP 177 H ASP 179 1_555 X MG MG . H MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.884 ? 
metalc ? metalc11 W O2A GDP . H GDP 600 1_555 X MG MG . H MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? 
metalc ? metalc12 Y O3G GTP . I GTP 600 1_555 Z MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? 
metalc ? metalc13 Y O2B GTP . I GTP 600 1_555 Z MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? 
metalc ? metalc14 J OE1 GLN 11 J GLN 11 1_555 BA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? 
metalc ? metalc15 AA O2A GDP . J GDP 600 1_555 BA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 174 n n 
PG O2G GTP sing 175 n n 
PG O3G GTP sing 176 n n 
PG O3B GTP sing 177 n n 
O2G HOG2 GTP sing 178 n n 
O3G HOG3 GTP sing 179 n n 
O3B PB GTP sing 180 n n 
PB O1B GTP doub 181 n n 
PB O2B GTP sing 182 n n 
PB O3A GTP sing 183 n n 
O2B HOB2 GTP sing 184 n n 
O3A PA GTP sing 185 n n 
PA O1A GTP doub 186 n n 
PA O2A GTP sing 187 n n 
PA O5' GTP sing 188 n n 
O2A HOA2 GTP sing 189 n n 
O5' C5' GTP sing 190 n n 
C5' C4' GTP sing 191 n n 
C5' H5' GTP sing 192 n n 
C5' "H5''" GTP sing 193 n n 
C4' O4' GTP sing 194 n n 
C4' C3' GTP sing 195 n n 
C4' H4' GTP sing 196 n n 
O4' C1' GTP sing 197 n n 
C3' O3' GTP sing 198 n n 
C3' C2' GTP sing 199 n n 
C3' H3' GTP sing 200 n n 
O3' HO3' GTP sing 201 n n 
C2' O2' GTP sing 202 n n 
C2' C1' GTP sing 203 n n 
C2' H2' GTP sing 204 n n 
O2' HO2' GTP sing 205 n n 
C1' N9 GTP sing 206 n n 
C1' H1' GTP sing 207 n n 
N9 C8 GTP sing 208 n y 
N9 C4 GTP sing 209 n y 
C8 N7 GTP doub 210 n y 
C8 H8 GTP sing 211 n n 
N7 C5 GTP sing 212 n y 
C5 C6 GTP sing 213 n n 
C5 C4 GTP doub 214 n y 
C6 O6 GTP doub 215 n n 
C6 N1 GTP sing 216 n n 
N1 C2 GTP sing 217 n n 
N1 HN1 GTP sing 218 n n 
C2 N2 GTP sing 219 n n 
C2 N3 GTP doub 220 n n 
N2 HN21 GTP sing 221 n n 
N2 HN22 GTP sing 222 n n 
N3 C4 GTP sing 223 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6MZG 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008686 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000029 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.005128 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006686 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 5 GTP A 1 600 600 GTP GTP . 
N 6 MG A 1 601 601 MG MG . 
O 7 GDP B 1 600 600 GDP GDP . 
P 6 MG B 1 601 601 MG MG . 
Q 5 GTP C 1 600 600 GTP GTP . 
R 6 MG C 1 601 601 MG MG . 
S 7 GDP D 1 600 600 GDP GDP . 
T 6 MG D 1 601 601 MG MG . 
U 5 GTP G 1 600 600 GTP GTP . 
V 6 MG G 1 601 601 MG MG . 
W 7 GDP H 1 600 600 GDP GDP . 
X 6 MG H 1 601 601 MG MG . 
Y 5 GTP I 1 600 600 GTP GTP . 
Z 6 MG I 1 601 601 MG MG . 
AA 7 GDP J 1 600 600 GDP GDP . 
BA 6 MG J 1 601 601 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . U 5 -53.546 -45.133 -66.098 1 31.78 ? PG GTP 600 G 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . U 5 -54.402 -44.136 -66.842 1 14.24 ? O1G GTP 600 G 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . U 5 -52.277 -44.457 -65.64 1 18.43 ? O2G GTP 600 G 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . U 5 -54.297 -45.693 -64.911 1 34.96 ? O3G GTP 600 G 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . U 5 -53.168 -46.338 -67.093 1 38.93 ? O3B GTP 600 G 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . U 5 -54.008 -47.708 -67.082 1 47.77 ? PB GTP 600 G 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . U 5 -53.54 -48.582 -68.22 1 56.88 ? O1B GTP 600 G 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . U 5 -53.836 -48.384 -65.742 1 52.87 ? O2B GTP 600 G 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . U 5 -55.545 -47.268 -67.29 1 57.61 ? O3A GTP 600 G 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . U 5 -56.661 -48.271 -67.89 1 60.27 ? PA GTP 600 G 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . U 5 -56.074 -49.589 -68.344 1 29.14 ? O1A GTP 600 G 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . U 5 -57.741 -48.47 -66.851 1 40.89 ? O2A GTP 600 G 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . U 5 -57.278 -47.474 -69.146 1 56.26 ? O5' GTP 600 G 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . U 5 -58.641 -47.116 -69.219 1 44.19 ? C5' GTP 600 G 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . U 5 -59.336 -47.92 -70.312 1 30.87 ? C4' GTP 600 G 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . U 5 -59.046 -49.29 -70.135 1 27.03 ? O4' GTP 600 G 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . U 5 -60.845 -47.764 -70.248 1 35.54 ? C3' GTP 600 G 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . U 5 -61.332 -47.447 -71.531 1 48.16 ? O3' GTP 600 G 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . U 5 -61.367 -49.126 -69.845 1 24.19 ? C2' GTP 600 G 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . U 5 -62.54 -49.439 -70.562 1 15.93 ? O2' GTP 600 G 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . U 5 -60.221 -50.074 -70.166 1 15.79 ? C1' GTP 600 G 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . U 5 -60.107 -51.116 -69.133 1 8.71 ? N9 GTP 600 G 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . U 5 -59.556 -50.964 -67.89 1 16.44 ? C8 GTP 600 G 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . U 5 -59.627 -52.149 -67.243 1 26.64 ? N7 GTP 600 G 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . U 5 -60.206 -53.057 -68.059 1 31.53 ? C5 GTP 600 G 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . U 5 -60.515 -54.403 -67.899 1 45.58 ? C6 GTP 600 G 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . U 5 -60.254 -54.983 -66.847 1 58.86 ? O6 GTP 600 G 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . U 5 -61.119 -55.094 -68.928 1 34.47 ? N1 GTP 600 G 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . U 5 -61.413 -54.444 -70.108 1 33.9 ? C2 GTP 600 G 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . U 5 -61.995 -55.111 -71.099 1 25.6 ? N2 GTP 600 G 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . U 5 -61.103 -53.106 -70.262 1 38.68 ? N3 GTP 600 G 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . U 5 -60.509 -52.421 -69.254 1 20.61 ? C4 GTP 600 G 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              75 
_model_server_stats.parse_time_ms           23 
_model_server_stats.create_model_time_ms    218 
_model_server_stats.query_time_ms           544 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           32 
#