data_6N5S # _model_server_result.job_id n5rj_i_0X5mZw7sOxCHsow _model_server_result.datetime_utc '2024-12-12 15:36:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6n5s # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":201}' # _entry.id 6N5S # _exptl.entry_id 6N5S _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 363.221 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6N5S _cell.length_a 114.56 _cell.length_b 114.56 _cell.length_c 115.06 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6N5S _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 152 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A O3' GTP 1 A GTP 1 1_555 A P G 2 A G 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.562 ? metalc ? metalc1 A O2' GTP 1 A GTP 1 1_555 G K K . A K 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.484 ? metalc ? metalc2 A OP2 G 8 A G 8 1_555 I MG MG . A MG 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc ? metalc3 A OP1 A 27 A A 27 1_555 F MG MG . A MG 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.948 ? metalc ? metalc4 A OP2 G 29 A G 29 1_555 E MG MG . A MG 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc5 A OP1 G 96 A G 96 1_555 E MG MG . A MG 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc6 A OP2 G 96 A G 96 1_555 H MG MG . A MG 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc7 A OP2 C 97 A C 97 1_555 E MG MG . A MG 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc8 A O4 U 98 A U 98 1_555 E MG MG . A MG 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc9 K MG MG . A MG 210 1_555 L O HOH . A HOH 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 U 4 A U 4 1_555 A N1 A 111 A A 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A O4 U 4 A U 4 1_555 A N6 A 111 A A 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A N1 G 5 A G 5 1_555 A N3 C 110 A C 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N2 G 5 A G 5 1_555 A O2 C 110 A C 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A O6 G 5 A G 5 1_555 A N4 C 110 A C 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N3 C 6 A C 6 1_555 A N1 G 109 A G 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N4 C 6 A C 6 1_555 A O6 G 109 A G 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O2 C 6 A C 6 1_555 A N2 G 109 A G 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N3 C 7 A C 7 1_555 A N1 G 108 A G 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N4 C 7 A C 7 1_555 A O6 G 108 A G 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O2 C 7 A C 7 1_555 A N2 G 108 A G 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog12 A N2 G 8 A G 8 1_555 A N7 A 107 A A 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog13 A N3 G 8 A G 8 1_555 A N6 A 107 A A 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog14 A N3 A 9 A A 9 1_555 A N2 G 105 A G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog15 A N3 U 11 A U 11 1_555 A O2 U 22 A U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog16 A O4 U 11 A U 11 1_555 A N3 U 22 A U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N3 C 12 A C 12 1_555 A N1 G 21 A G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N4 C 12 A C 12 1_555 A O6 G 21 A G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O2 C 12 A C 12 1_555 A N2 G 21 A G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N3 C 13 A C 13 1_555 A N1 G 20 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N4 C 13 A C 13 1_555 A O6 G 20 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O2 C 13 A C 13 1_555 A N2 G 20 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N1 A 14 A A 14 1_555 A N3 U 19 A U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N6 A 14 A A 14 1_555 A O4 U 19 A U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog25 A N6 A 23 A A 23 1_555 A N3 G 106 A G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog26 A N7 A 23 A A 23 1_555 A N2 G 106 A G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N3 C 24 A C 24 1_555 A N1 G 105 A G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N4 C 24 A C 24 1_555 A O6 G 105 A G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A O2 C 24 A C 24 1_555 A N2 G 105 A G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N1 G 25 A G 25 1_555 A N3 C 104 A C 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N2 G 25 A G 25 1_555 A O2 C 104 A C 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A O6 G 25 A G 25 1_555 A N4 C 104 A C 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N1 G 26 A G 26 1_555 A N3 C 103 A C 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A N2 G 26 A G 26 1_555 A O2 C 103 A C 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A O6 G 26 A G 26 1_555 A N4 C 103 A C 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N1 A 27 A A 27 1_555 A N3 U 102 A U 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N6 A 27 A A 27 1_555 A O4 U 102 A U 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N1 G 28 A G 28 1_555 A N3 C 101 A C 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N2 G 28 A G 28 1_555 A O2 C 101 A C 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A O6 G 28 A G 28 1_555 A N4 C 101 A C 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog41 A N2 G 29 A G 29 1_555 A N7 A 100 A A 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog42 A N3 G 29 A G 29 1_555 A N6 A 100 A A 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog43 A N4 C 32 A C 32 1_555 A O2 C 97 A C 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A N3 C 33 A C 33 1_555 A N1 G 96 A G 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N4 C 33 A C 33 1_555 A O6 G 96 A G 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A O2 C 33 A C 33 1_555 A N2 G 96 A G 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N3 U 39 A U 39 1_555 A N1 A 93 A A 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A O4 U 39 A U 39 1_555 A N6 A 93 A A 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog49 A O6 G 41 A G 41 1_555 A N2 G 92 A G 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A N1 G 41 A G 41 1_555 A N3 C 94 A C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A N2 G 41 A G 41 1_555 A O2 C 94 A C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A O6 G 41 A G 41 1_555 A N4 C 94 A C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A N1 G 42 A G 42 1_555 A N3 C 91 A C 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A N2 G 42 A G 42 1_555 A O2 C 91 A C 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 A O6 G 42 A G 42 1_555 A N4 C 91 A C 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog56 A N2 G 42 A G 42 1_555 A N1 A 95 A A 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 A N1 G 43 A G 43 1_555 A N3 C 90 A C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A N2 G 43 A G 43 1_555 A O2 C 90 A C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 A O6 G 43 A G 43 1_555 A N4 C 90 A C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A N1 G 44 A G 44 1_555 A N3 C 89 A C 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N2 G 44 A G 44 1_555 A O2 C 89 A C 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A O6 G 44 A G 44 1_555 A N4 C 89 A C 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 A N3 U 45 A U 45 1_555 A N1 A 88 A A 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A O4 U 45 A U 45 1_555 A N6 A 88 A A 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-C MISPAIR' hydrog65 A O2 U 46 A U 46 1_555 A N4 C 87 A C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog66 A N3 A 47 A A 47 1_555 A N2 G 69 A G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog67 A N3 U 49 A U 49 1_555 A O2 U 67 A U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog68 A O4 U 49 A U 49 1_555 A N3 U 67 A U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 A N3 C 50 A C 50 1_555 A N1 G 66 A G 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A N4 C 50 A C 50 1_555 A O6 G 66 A G 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A O2 C 50 A C 50 1_555 A N2 G 66 A G 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A N3 U 51 A U 51 1_555 A N1 A 65 A A 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 A O4 U 51 A U 51 1_555 A N6 A 65 A A 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog74 A O6 G 52 A G 52 1_555 A N4 C 64 A C 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N3 C 53 A C 53 1_555 A N1 G 63 A G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 A N4 C 53 A C 53 1_555 A O6 G 63 A G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 A O2 C 53 A C 53 1_555 A N2 G 63 A G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 A N1 A 54 A A 54 1_555 A N3 U 62 A U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 A N6 A 54 A A 54 1_555 A O4 U 62 A U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 A N1 G 55 A G 55 1_555 A N3 C 61 A C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 A N2 G 55 A G 55 1_555 A O2 C 61 A C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 A O6 G 55 A G 55 1_555 A N4 C 61 A C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog83 A O2 U 56 A U 56 1_555 A N6 A 59 A A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog84 A N6 A 68 A A 68 1_555 A N3 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog85 A N7 A 68 A A 68 1_555 A N2 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 A N1 G 69 A G 69 1_555 A N3 C 85 A C 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 A N2 G 69 A G 69 1_555 A O2 C 85 A C 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 A O6 G 69 A G 69 1_555 A N4 C 85 A C 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 A N1 G 70 A G 70 1_555 A N3 C 84 A C 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 A N2 G 70 A G 70 1_555 A O2 C 84 A C 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 A O6 G 70 A G 70 1_555 A N4 C 84 A C 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 A N1 G 71 A G 71 1_555 A N3 C 83 A C 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 A N2 G 71 A G 71 1_555 A O2 C 83 A C 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 A O6 G 71 A G 71 1_555 A N4 C 83 A C 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 A N1 A 72 A A 72 1_555 A N3 U 82 A U 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 A N6 A 72 A A 72 1_555 A O4 U 82 A U 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog97 A N3 U 73 A U 73 1_555 A O6 G 81 A G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog98 A O2 U 73 A U 73 1_555 A N1 G 81 A G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 A N3 C 75 A C 75 1_555 A N1 G 122 A G 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 A N4 C 75 A C 75 1_555 A O6 G 122 A G 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 A O2 C 75 A C 75 1_555 A N2 G 122 A G 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 A N3 C 76 A C 76 1_555 A N1 G 121 A G 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 A N4 C 76 A C 76 1_555 A O6 G 121 A G 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 A O2 C 76 A C 76 1_555 A N2 G 121 A G 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 A N3 U 77 A U 77 1_555 A N1 A 120 A A 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 A O4 U 77 A U 77 1_555 A N6 A 120 A A 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 A N3 U 78 A U 78 1_555 A N1 A 119 A A 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 A O4 U 78 A U 78 1_555 A N6 A 119 A A 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 A N3 C 79 A C 79 1_555 A N1 G 118 A G 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 A N4 C 79 A C 79 1_555 A O6 G 118 A G 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 A O2 C 79 A C 79 1_555 A N2 G 118 A G 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog112 A N3 U 80 A U 80 1_555 A O6 G 117 A G 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog113 A O2 U 80 A U 80 1_555 A N1 G 117 A G 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog114 A N2 G 81 A G 81 1_555 A N3 A 115 A A 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog115 A O2 C 91 A C 91 1_555 A N6 A 95 A A 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog116 A N3 G 92 A G 92 1_555 A N4 C 94 A C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H14 N5 O8 P' _chem_comp.formula_weight 363.221 _chem_comp.id 5GP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O1P 5GP doub 75 n n P O2P 5GP sing 76 n n P O3P 5GP sing 77 n n P O5' 5GP sing 78 n n O2P HOP2 5GP sing 79 n n O3P HOP3 5GP sing 80 n n O5' C5' 5GP sing 81 n n C5' C4' 5GP sing 82 n n C5' "H5'1" 5GP sing 83 n n C5' "H5'2" 5GP sing 84 n n C4' O4' 5GP sing 85 n n C4' C3' 5GP sing 86 n n C4' H4' 5GP sing 87 n n O4' C1' 5GP sing 88 n n C3' O3' 5GP sing 89 n n C3' C2' 5GP sing 90 n n C3' H3' 5GP sing 91 n n O3' HO3' 5GP sing 92 n n C2' O2' 5GP sing 93 n n C2' C1' 5GP sing 94 n n C2' H2' 5GP sing 95 n n O2' HO2' 5GP sing 96 n n C1' N9 5GP sing 97 n n C1' H1' 5GP sing 98 n n N9 C8 5GP sing 99 n y N9 C4 5GP sing 100 n y C8 N7 5GP doub 101 n y C8 H8 5GP sing 102 n n N7 C5 5GP sing 103 n y C5 C6 5GP sing 104 n n C5 C4 5GP doub 105 n y C6 O6 5GP doub 106 n n C6 N1 5GP sing 107 n n N1 C2 5GP sing 108 n n N1 HN1 5GP sing 109 n n C2 N2 5GP sing 110 n n C2 N3 5GP doub 111 n n N2 HN21 5GP sing 112 n n N2 HN22 5GP sing 113 n n N3 C4 5GP sing 114 n n # _atom_sites.entry_id 6N5S _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008729 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.00504 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010079 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008691 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 5GP A 1 201 124 5GP G . C 3 2BA A 1 202 201 2BA 2BA . D 3 2BA A 1 203 202 2BA 2BA . E 4 MG A 1 204 203 MG MG . F 4 MG A 1 205 204 MG MG . G 5 K A 1 206 205 K K . H 4 MG A 1 207 206 MG MG . I 4 MG A 1 208 207 MG MG . J 6 SO4 A 1 209 208 SO4 SO4 . K 4 MG A 1 210 1 MG MG . L 7 HOH A 1 301 2 HOH HOH . L 7 HOH A 2 302 401 HOH HOH . L 7 HOH A 3 303 403 HOH HOH . L 7 HOH A 4 304 402 HOH HOH . L 7 HOH A 5 305 1 HOH HOH . L 7 HOH A 6 306 404 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P 5GP . . . B 2 -59.594 -9.819 -43.023 1 118.75 ? P 5GP 201 A 1 HETATM 2 O O1P 5GP . . . B 2 -60.076 -9.497 -41.659 1 116.76 ? O1P 5GP 201 A 1 HETATM 3 O O3P 5GP . . . B 2 -58.197 -10.212 -43.243 1 120.64 ? O3P 5GP 201 A 1 HETATM 4 O O5' 5GP . . . B 2 -59.83 -8.531 -43.931 1 139.89 ? O5' 5GP 201 A 1 HETATM 5 C C5' 5GP . . . B 2 -61.023 -7.76 -43.815 1 141.46 ? C5' 5GP 201 A 1 HETATM 6 C C4' 5GP . . . B 2 -61.269 -6.903 -45.037 1 141.55 ? C4' 5GP 201 A 1 HETATM 7 O O4' 5GP . . . B 2 -60.018 -6.305 -45.477 1 139.05 ? O4' 5GP 201 A 1 HETATM 8 C C3' 5GP . . . B 2 -61.785 -7.621 -46.28 1 144.06 ? C3' 5GP 201 A 1 HETATM 9 O O3' 5GP . . . B 2 -63.181 -7.87 -46.256 1 141.49 ? O3' 5GP 201 A 1 HETATM 10 C C2' 5GP . . . B 2 -61.337 -6.691 -47.402 1 144.57 ? C2' 5GP 201 A 1 HETATM 11 O O2' 5GP . . . B 2 -62.149 -5.524 -47.46 1 150.71 ? O2' 5GP 201 A 1 HETATM 12 C C1' 5GP . . . B 2 -59.968 -6.267 -46.891 1 133.29 ? C1' 5GP 201 A 1 HETATM 13 N N9 5GP . . . B 2 -58.915 -7.196 -47.339 1 119.22 ? N9 5GP 201 A 1 HETATM 14 C C8 5GP . . . B 2 -58.44 -8.305 -46.67 1 122.27 ? C8 5GP 201 A 1 HETATM 15 N N7 5GP . . . B 2 -57.489 -8.941 -47.301 1 113.26 ? N7 5GP 201 A 1 HETATM 16 C C5 5GP . . . B 2 -57.334 -8.209 -48.465 1 123.21 ? C5 5GP 201 A 1 HETATM 17 C C6 5GP . . . B 2 -56.444 -8.428 -49.546 1 129.05 ? C6 5GP 201 A 1 HETATM 18 O O6 5GP . . . B 2 -55.604 -9.337 -49.683 1 124.82 ? O6 5GP 201 A 1 HETATM 19 N N1 5GP . . . B 2 -56.612 -7.446 -50.527 1 135.46 ? N1 5GP 201 A 1 HETATM 20 C C2 5GP . . . B 2 -57.513 -6.397 -50.473 1 137.06 ? C2 5GP 201 A 1 HETATM 21 N N2 5GP . . . B 2 -57.51 -5.558 -51.526 1 139.19 ? N2 5GP 201 A 1 HETATM 22 N N3 5GP . . . B 2 -58.352 -6.189 -49.461 1 126.73 ? N3 5GP 201 A 1 HETATM 23 C C4 5GP . . . B 2 -58.204 -7.131 -48.505 1 117.75 ? C4 5GP 201 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 322 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 23 #