data_6NAJ # _model_server_result.job_id 53khZpTIXlHT3hAO-vUDrg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 11:01:50' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6naj # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 6NAJ # _exptl.entry_id 6NAJ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6NAJ _cell.length_a 129.713 _cell.length_b 129.713 _cell.length_c 308.198 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6NAJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 K N N ? 7 L N N ? 7 M N N ? 7 N N N ? 7 O N N ? 7 U N N ? 7 V N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 3 BMA BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 5 5 4 MAN BMA C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 5 6 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n D NAG 1 D 1 NAG D 1 NAG 4 n D NAG 2 D 2 NAG D 2 NAG 5 n E NAG 1 E 1 NAG E 1 NAG 5 n E NAG 2 E 2 NAG E 2 NAG 5 n E BMA 3 E 3 BMA E 3 BMA 5 n E BMA 4 E 4 BMA E 4 BMA 5 n E MAN 5 E 5 MAN E 5 MAN 5 n E MAN 6 E 6 MAN E 6 MAN 4 n F NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 4 n F NAG 2 F 2 NAG F 2 NAG 4 n G NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 4 n G NAG 2 G 2 NAG G 2 NAG 4 n H NAG 1 H 1 NAG H 1 NAG 4 n H NAG 2 H 2 NAG H 2 NAG 6 n I NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 6 n I NAG 2 I 2 NAG I 2 NAG 6 n I BMA 3 I 3 BMA I 3 BMA 4 n J NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG J 2 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 108 A CYS 108 1_555 A SG CYS 128 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 142 A CYS 142 1_555 A SG CYS 155 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 478 A CYS 478 1_555 A SG CYS 535 A CYS 535 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 596 A CYS 596 1_555 A SG CYS 602 A CYS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 668 A CYS 668 1_555 A SG CYS 681 A CYS 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 822 A CYS 822 1_555 A SG CYS 884 A CYS 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 874 A CYS 874 1_555 A SG CYS 879 A CYS 879 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 5 B CYS 5 1_555 B SG CYS 23 B CYS 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 13 B CYS 13 1_555 B SG CYS 435 B CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 16 B CYS 16 1_555 B SG CYS 38 B CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 26 B CYS 26 1_555 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 177 B CYS 177 1_555 B SG CYS 184 B CYS 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 232 B CYS 232 1_555 B SG CYS 273 B CYS 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 374 B CYS 374 1_555 B SG CYS 386 B CYS 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 406 B CYS 406 1_555 B SG CYS 433 B CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 437 B CYS 437 1_555 B SG CYS 457 B CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 448 B CYS 448 1_555 B SG CYS 460 B CYS 460 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 462 B CYS 462 1_555 B SG CYS 471 B CYS 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 473 B CYS 473 1_555 B SG CYS 503 B CYS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 486 B CYS 486 1_555 B SG CYS 501 B CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 495 B CYS 495 1_555 B SG CYS 506 B CYS 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 508 B CYS 508 1_555 B SG CYS 521 B CYS 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 523 B CYS 523 1_555 B SG CYS 544 B CYS 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 528 B CYS 528 1_555 B SG CYS 542 B CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 536 B CYS 536 1_555 B SG CYS 547 B CYS 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 549 B CYS 549 1_555 B SG CYS 558 B CYS 558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 560 B CYS 560 1_555 B SG CYS 583 B CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 567 B CYS 567 1_555 B SG CYS 581 B CYS 581 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 575 B CYS 575 1_555 B SG CYS 586 B CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 588 B CYS 588 1_555 B SG CYS 598 B CYS 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 601 B CYS 601 1_555 B SG CYS 604 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 608 B CYS 608 1_555 B SG CYS 655 B CYS 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 614 B CYS 614 1_555 B SG CYS 635 B CYS 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 631 B CYS 631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 663 B CYS 663 1_555 B SG CYS 687 B CYS 687 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 44 A ASN 44 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 260 A ASN 260 1_555 K C1 NAG . A NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 266 A ASN 266 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 458 A ASN 458 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 585 A ASN 585 1_555 L C1 NAG . A NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 805 A ASN 805 1_555 M C1 NAG . A NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 821 A ASN 821 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 943 A ASN 943 1_555 N C1 NAG . A NAG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 950 A ASN 950 1_555 O C1 NAG . A NAG 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 99 B ASN 99 1_555 U C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 320 B ASN 320 1_555 V C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 371 B ASN 371 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 559 B ASN 559 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 654 B ASN 654 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale15 C C PRO 76 C PRO 1492 1_555 C N HRG 77 C HRG 1493 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale16 C C HRG 77 C HRG 1493 1_555 C N GLY 78 C GLY 1494 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale17 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale18 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale19 E O4 NAG . E NAG 2 1_555 E C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale20 E O6 BMA . E BMA 3 1_555 E C1 BMA . E BMA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 E O3 BMA . E BMA 3 1_555 E C1 MAN . E MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 E O4 BMA . E BMA 4 1_555 E C1 MAN . E MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale24 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale25 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale26 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 I O4 NAG . I NAG 2 1_555 I C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale28 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 230 A ASP 230 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 232 A ASN 232 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 234 A ASP 234 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc5 A O ILE 236 A ILE 236 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 238 A ASP 238 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 238 A ASP 238 1_555 P MN MN . A MN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 286 A ASN 286 1_555 Q MN MN . A MN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 288 A ASP 288 1_555 Q MN MN . A MN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 288 A ASP 288 1_555 Q MN MN . A MN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc11 A O TYR 290 A TYR 290 1_555 Q MN MN . A MN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 292 A ASP 292 1_555 Q MN MN . A MN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 292 A ASP 292 1_555 Q MN MN . A MN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 349 A ASP 349 1_555 R MN MN . A MN 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 351 A ASP 351 1_555 R MN MN . A MN 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 353 A ASP 353 1_555 R MN MN . A MN 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc17 A O PHE 355 A PHE 355 1_555 R MN MN . A MN 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 357 A ASP 357 1_555 R MN MN . A MN 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc19 A OD2 ASP 357 A ASP 357 1_555 R MN MN . A MN 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 413 A ASP 413 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 415 A ASP 415 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc22 A OD1 ASN 417 A ASN 417 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc23 A ND2 ASN 417 A ASN 417 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc24 A O TYR 419 A TYR 419 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc25 A OD1 ASP 421 A ASP 421 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc26 A OD2 ASP 421 A ASP 421 1_555 S MN MN . A MN 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc27 A O CYS 596 A CYS 596 1_555 T MN MN . A MN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc28 A OD1 ASP 599 A ASP 599 1_555 T MN MN . A MN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc29 A OD2 ASP 599 A ASP 599 1_555 T MN MN . A MN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc30 A O VAL 601 A VAL 601 1_555 T MN MN . A MN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? metalc ? metalc31 A OE1 GLU 636 A GLU 636 1_555 T MN MN . A MN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc32 A OE2 GLU 636 A GLU 636 1_555 T MN MN . A MN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc33 B OG SER 121 B SER 121 1_555 W MN MN . B MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc34 B O SER 123 B SER 123 1_555 X MN MN . B MN 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 126 B ASP 126 1_555 X MN MN . B MN 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc36 B OD2 ASP 126 B ASP 126 1_555 X MN MN . B MN 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc37 B OD1 ASP 127 B ASP 127 1_555 X MN MN . B MN 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc38 B OD2 ASP 158 B ASP 158 1_555 Y MN MN . B MN 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? metalc ? metalc39 B OD1 ASN 215 B ASN 215 1_555 Y MN MN . B MN 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc40 B O ASP 217 B ASP 217 1_555 Y MN MN . B MN 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc41 B OD1 ASP 217 B ASP 217 1_555 Y MN MN . B MN 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc42 B O PRO 219 B PRO 219 1_555 Y MN MN . B MN 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc43 B OE2 GLU 220 B GLU 220 1_555 W MN MN . B MN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc44 B OE1 GLU 220 B GLU 220 1_555 Y MN MN . B MN 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc45 B O MET 335 B MET 335 1_555 X MN MN . B MN 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc46 W MN MN . B MN 703 1_555 AA O HOH . B HOH 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc47 W MN MN . B MN 703 1_555 AA O HOH . B HOH 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc48 W MN MN . B MN 703 1_555 AA O HOH . B HOH 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? metalc ? metalc49 W MN MN . B MN 703 1_555 C OD1 ASP 79 C ASP 1495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 313 n n C1 O1 NAG sing 314 n n C1 O5 NAG sing 315 n n C1 H1 NAG sing 316 n n C2 C3 NAG sing 317 n n C2 N2 NAG sing 318 n n C2 H2 NAG sing 319 n n C3 C4 NAG sing 320 n n C3 O3 NAG sing 321 n n C3 H3 NAG sing 322 n n C4 C5 NAG sing 323 n n C4 O4 NAG sing 324 n n C4 H4 NAG sing 325 n n C5 C6 NAG sing 326 n n C5 O5 NAG sing 327 n n C5 H5 NAG sing 328 n n C6 O6 NAG sing 329 n n C6 H61 NAG sing 330 n n C6 H62 NAG sing 331 n n C7 C8 NAG sing 332 n n C7 N2 NAG sing 333 n n C7 O7 NAG doub 334 n n C8 H81 NAG sing 335 n n C8 H82 NAG sing 336 n n C8 H83 NAG sing 337 n n N2 HN2 NAG sing 338 n n O1 HO1 NAG sing 339 n n O3 HO3 NAG sing 340 n n O4 HO4 NAG sing 341 n n O6 HO6 NAG sing 342 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6NAJ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007709 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004451 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008902 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003245 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code K 7 NAG A 1 1001 1003 NAG NAG . L 7 NAG A 1 1002 1012 NAG NAG . M 7 NAG A 1 1003 1013 NAG NAG . N 7 NAG A 1 1004 1016 NAG NAG . O 7 NAG A 1 1005 1017 NAG NAG . P 8 MN A 1 1006 1018 MN MN . Q 8 MN A 1 1007 1019 MN MN . R 8 MN A 1 1008 1020 MN MN . S 8 MN A 1 1009 1021 MN MN . T 8 MN A 1 1010 1022 MN MN . U 7 NAG B 1 701 701 NAG NAG . V 7 NAG B 1 702 702 NAG NAG . W 8 MN B 1 703 708 MN MN . X 8 MN B 1 704 709 MN MN . Y 8 MN B 1 705 710 MN MN . Z 9 HOH A 1 1101 1101 HOH HOH . Z 9 HOH A 2 1102 1102 HOH HOH . AA 9 HOH B 1 1701 1701 HOH HOH . AA 9 HOH B 2 1702 801 HOH HOH . AA 9 HOH B 3 1703 802 HOH HOH . BA 9 HOH C 1 1601 1702 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . K 7 -2.149 68.825 41.05 1 81.16 ? C1 NAG 1001 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . K 7 -2.458 69.365 42.446 1 75.61 ? C2 NAG 1001 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . K 7 -3.959 69.5 42.633 1 80.32 ? C3 NAG 1001 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . K 7 -4.493 70.556 41.68 1 77.67 ? C4 NAG 1001 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . K 7 -4.069 70.243 40.246 1 92.99 ? C5 NAG 1001 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . K 7 -3.222 71.327 39.618 1 97.54 ? C6 NAG 1001 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . K 7 -0.581 68.453 43.741 1 81.92 ? C7 NAG 1001 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . K 7 -0.173 67.514 44.837 1 80.92 ? C8 NAG 1001 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . K 7 -1.89 68.508 43.475 1 76.19 ? N2 NAG 1001 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . K 7 -4.241 69.873 43.978 1 74.24 ? O3 NAG 1001 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . K 7 -5.914 70.599 41.75 1 67.78 ? O4 NAG 1001 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . K 7 -3.321 69.014 40.163 1 87.72 ? O5 NAG 1001 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . K 7 -3.805 71.81 38.415 1 93.58 ? O6 NAG 1001 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . K 7 0.239 69.13 43.126 1 74.55 ? O7 NAG 1001 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 32 _model_server_stats.parse_time_ms 23 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #