data_6O2Q
#
_model_server_result.job_id            lb1khggAb59XedbjYXbU0Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 22:17:18' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6o2q 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    6O2Q 
#
_exptl.entry_id    6O2Q 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6O2Q 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6O2Q 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dodecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      12 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 M N N 
? 3 P N N 
? 3 S N N 
? 3 Y N N 
? 3 AA N N 
? 3 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 71 A GLU 71 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? 
metalc ? metalc2 M O3G GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc3 M O1B GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc4 M O3A GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc5 C OE2 GLU 71 C GLU 71 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? 
metalc ? metalc6 P O3G GTP . C GTP 501 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc7 P O1B GTP . C GTP 501 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc8 P O3A GTP . C GTP 501 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc9 E OE2 GLU 71 E GLU 71 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? 
metalc ? metalc10 S O3G GTP . E GTP 501 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc11 S O1B GTP . E GTP 501 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc12 S O3A GTP . E GTP 501 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc13 J OE2 GLU 71 J GLU 71 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? 
metalc ? metalc14 Y O3G GTP . J GTP 501 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc15 Y O1B GTP . J GTP 501 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc16 Y O3A GTP . J GTP 501 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? 
metalc ? metalc17 K OE2 GLU 71 K GLU 71 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? 
metalc ? metalc18 AA O3G GTP . K GTP 501 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc19 AA O1B GTP . K GTP 501 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc20 AA O3A GTP . K GTP 501 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc21 L OE2 GLU 71 L GLU 71 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? 
metalc ? metalc22 CA O3G GTP . L GTP 501 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc23 CA O1B GTP . L GTP 501 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc24 CA O3A GTP . L GTP 501 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 174 n n 
PG O2G GTP sing 175 n n 
PG O3G GTP sing 176 n n 
PG O3B GTP sing 177 n n 
O2G HOG2 GTP sing 178 n n 
O3G HOG3 GTP sing 179 n n 
O3B PB GTP sing 180 n n 
PB O1B GTP doub 181 n n 
PB O2B GTP sing 182 n n 
PB O3A GTP sing 183 n n 
O2B HOB2 GTP sing 184 n n 
O3A PA GTP sing 185 n n 
PA O1A GTP doub 186 n n 
PA O2A GTP sing 187 n n 
PA O5' GTP sing 188 n n 
O2A HOA2 GTP sing 189 n n 
O5' C5' GTP sing 190 n n 
C5' C4' GTP sing 191 n n 
C5' H5' GTP sing 192 n n 
C5' "H5''" GTP sing 193 n n 
C4' O4' GTP sing 194 n n 
C4' C3' GTP sing 195 n n 
C4' H4' GTP sing 196 n n 
O4' C1' GTP sing 197 n n 
C3' O3' GTP sing 198 n n 
C3' C2' GTP sing 199 n n 
C3' H3' GTP sing 200 n n 
O3' HO3' GTP sing 201 n n 
C2' O2' GTP sing 202 n n 
C2' C1' GTP sing 203 n n 
C2' H2' GTP sing 204 n n 
O2' HO2' GTP sing 205 n n 
C1' N9 GTP sing 206 n n 
C1' H1' GTP sing 207 n n 
N9 C8 GTP sing 208 n y 
N9 C4 GTP sing 209 n y 
C8 N7 GTP doub 210 n y 
C8 H8 GTP sing 211 n n 
N7 C5 GTP sing 212 n y 
C5 C6 GTP sing 213 n n 
C5 C4 GTP doub 214 n y 
C6 O6 GTP doub 215 n n 
C6 N1 GTP sing 216 n n 
N1 C2 GTP sing 217 n n 
N1 HN1 GTP sing 218 n n 
C2 N2 GTP sing 219 n n 
C2 N3 GTP doub 220 n n 
N2 HN21 GTP sing 221 n n 
N2 HN22 GTP sing 222 n n 
N3 C4 GTP sing 223 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6O2Q 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 3 GTP A 1 501 501 GTP GTP . 
N 4 MG A 1 502 502 MG MG . 
O 5 GDP B 1 501 501 GDP GDP . 
P 3 GTP C 1 501 501 GTP GTP . 
Q 4 MG C 1 502 502 MG MG . 
R 5 GDP D 1 501 501 GDP GDP . 
S 3 GTP E 1 501 501 GTP GTP . 
T 4 MG E 1 502 502 MG MG . 
U 5 GDP F 1 501 501 GDP GDP . 
V 5 GDP G 1 501 501 GDP GDP . 
W 5 GDP H 1 501 501 GDP GDP . 
X 5 GDP I 1 501 501 GDP GDP . 
Y 3 GTP J 1 501 501 GTP GTP . 
Z 4 MG J 1 502 502 MG MG . 
AA 3 GTP K 1 501 501 GTP GTP . 
BA 4 MG K 1 502 502 MG MG . 
CA 3 GTP L 1 501 501 GTP GTP . 
DA 4 MG L 1 502 502 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . CA 3 126.23 59.553 155.506 1 136.76 ? PG GTP 501 L 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . CA 3 127.475 60.098 154.854 1 136.76 ? O1G GTP 501 L 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . CA 3 125.04 60.382 155.094 1 136.76 ? O2G GTP 501 L 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . CA 3 126.034 58.113 155.109 1 136.76 ? O3G GTP 501 L 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . CA 3 126.406 59.676 157.092 1 136.76 ? O3B GTP 501 L 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . CA 3 126.623 58.359 157.978 1 136.76 ? PB GTP 501 L 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . CA 3 125.438 57.437 157.852 1 136.76 ? O1B GTP 501 L 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . CA 3 126.857 58.773 159.406 1 136.76 ? O2B GTP 501 L 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . CA 3 127.914 57.643 157.358 1 136.76 ? O3A GTP 501 L 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . CA 3 128.812 56.684 158.281 1 136.76 ? PA GTP 501 L 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . CA 3 129.305 55.531 157.45 1 136.76 ? O1A GTP 501 L 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . CA 3 128.056 56.185 159.485 1 136.76 ? O2A GTP 501 L 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . CA 3 130.049 57.594 158.738 1 136.76 ? O5' GTP 501 L 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . CA 3 131.343 57.326 158.261 1 136.76 ? C5' GTP 501 L 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . CA 3 132.17 56.749 159.396 1 136.76 ? C4' GTP 501 L 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . CA 3 131.515 55.662 160.001 1 136.76 ? O4' GTP 501 L 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . CA 3 133.487 56.191 158.908 1 136.76 ? C3' GTP 501 L 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . CA 3 134.511 57.121 159.154 1 136.76 ? O3' GTP 501 L 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . CA 3 133.729 54.951 159.732 1 136.76 ? C2' GTP 501 L 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . CA 3 134.852 55.157 160.548 1 136.76 ? O2' GTP 501 L 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . CA 3 132.492 54.834 160.593 1 136.76 ? C1' GTP 501 L 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . CA 3 132.003 53.455 160.673 1 136.76 ? N9 GTP 501 L 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . CA 3 131.204 52.811 159.782 1 136.76 ? C8 GTP 501 L 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . CA 3 130.972 51.565 160.248 1 136.76 ? N7 GTP 501 L 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . CA 3 131.599 51.416 161.428 1 136.76 ? C5 GTP 501 L 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . CA 3 131.688 50.361 162.318 1 136.76 ? C6 GTP 501 L 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . CA 3 131.12 49.302 162.086 1 136.76 ? O6 GTP 501 L 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . CA 3 132.415 50.499 163.472 1 136.76 ? N1 GTP 501 L 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . CA 3 133.052 51.69 163.728 1 136.76 ? C2 GTP 501 L 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . CA 3 133.761 51.839 164.839 1 136.76 ? N2 GTP 501 L 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . CA 3 132.96 52.735 162.84 1 136.76 ? N3 GTP 501 L 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . CA 3 132.244 52.6 161.707 1 136.76 ? C4 GTP 501 L 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              17 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    37 
_model_server_stats.query_time_ms           261 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           32 
#