data_6O2Q # _model_server_result.job_id 9Y6tWe92wkzRai_f-kXGbw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 22:36:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6o2q # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":502}' # _entry.id 6O2Q # _exptl.entry_id 6O2Q _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6O2Q _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6O2Q _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 N N N ? 4 Q N N ? 4 T N N ? 4 Z N N ? 4 BA N N ? 4 DA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE2 GLU 71 A GLU 71 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc2 M O3G GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc3 M O1B GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc4 M O3A GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc5 C OE2 GLU 71 C GLU 71 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc6 P O3G GTP . C GTP 501 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc7 P O1B GTP . C GTP 501 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? metalc ? metalc8 P O3A GTP . C GTP 501 1_555 Q MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc9 E OE2 GLU 71 E GLU 71 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc10 S O3G GTP . E GTP 501 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc11 S O1B GTP . E GTP 501 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? metalc ? metalc12 S O3A GTP . E GTP 501 1_555 T MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc13 J OE2 GLU 71 J GLU 71 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc ? metalc14 Y O3G GTP . J GTP 501 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc15 Y O1B GTP . J GTP 501 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc16 Y O3A GTP . J GTP 501 1_555 Z MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? metalc ? metalc17 K OE2 GLU 71 K GLU 71 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc ? metalc18 AA O3G GTP . K GTP 501 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? metalc ? metalc19 AA O1B GTP . K GTP 501 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc20 AA O3A GTP . K GTP 501 1_555 BA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc21 L OE2 GLU 71 L GLU 71 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc22 CA O3G GTP . L GTP 501 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc23 CA O1B GTP . L GTP 501 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc24 CA O3A GTP . L GTP 501 1_555 DA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6O2Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 3 GTP A 1 501 501 GTP GTP . N 4 MG A 1 502 502 MG MG . O 5 GDP B 1 501 501 GDP GDP . P 3 GTP C 1 501 501 GTP GTP . Q 4 MG C 1 502 502 MG MG . R 5 GDP D 1 501 501 GDP GDP . S 3 GTP E 1 501 501 GTP GTP . T 4 MG E 1 502 502 MG MG . U 5 GDP F 1 501 501 GDP GDP . V 5 GDP G 1 501 501 GDP GDP . W 5 GDP H 1 501 501 GDP GDP . X 5 GDP I 1 501 501 GDP GDP . Y 3 GTP J 1 501 501 GTP GTP . Z 4 MG J 1 502 502 MG MG . AA 3 GTP K 1 501 501 GTP GTP . BA 4 MG K 1 502 502 MG MG . CA 3 GTP L 1 501 501 GTP GTP . DA 4 MG L 1 502 502 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id N _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 73.985 _atom_site.Cartn_y 56.457 _atom_site.Cartn_z 66.518 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 105.58 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 61 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #