data_6OLN # _model_server_result.job_id OjSCbLOF1Lt0pOdG1xI0qA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 06:21:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6oln # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":100}' # _entry.id 6OLN # _exptl.entry_id 6OLN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 63.546 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'COPPER (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6OLN _cell.length_a 48.783 _cell.length_b 50.962 _cell.length_c 79.264 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6OLN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 2 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? trimeric 3 author_defined_assembly 1 ? trimeric 3 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,H,I,J,K,L,M,N,O,S,T,U 1 1 D,E,F,P,Q,R,V,W,X 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 G N N ? 2 J N N ? 2 M N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ACE 1 A ACE 0 1_555 A N GLN 2 A GLN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale2 A C LYS 21 A LYS 20 1_555 A N 7WJ 22 A 7WJ 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale3 A C 7WJ 22 A 7WJ 21 1_555 A N ALA 23 A ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale4 A C GLN 29 A GLN 28 1_555 A N NH2 30 A NH2 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 B C ACE 1 B ACE 0 1_555 B N GLN 2 B GLN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale6 B C LYS 21 B LYS 20 1_555 B N 7WJ 22 B 7WJ 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale7 B C 7WJ 22 B 7WJ 21 1_555 B N ALA 23 B ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale8 B C GLN 29 B GLN 28 1_555 B N NH2 30 B NH2 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale9 C C ACE 1 C ACE 0 1_555 C N GLN 2 C GLN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale10 C C LYS 21 C LYS 20 1_555 C N 7WJ 22 C 7WJ 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale11 C C 7WJ 22 C 7WJ 21 1_555 C N ALA 23 C ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale12 C C GLN 29 C GLN 28 1_555 C N NH2 30 C NH2 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale13 D C ACE 1 D ACE 0 1_555 D N GLN 2 D GLN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale14 D C LYS 21 D LYS 20 1_555 D N 7WJ 22 D 7WJ 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale15 D C 7WJ 22 D 7WJ 21 1_555 D N ALA 23 D ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale16 D C GLN 29 D GLN 28 1_555 D N NH2 30 D NH2 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale17 E C ACE 1 E ACE 0 1_555 E N GLN 2 E GLN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale18 E C LYS 21 E LYS 20 1_555 E N 7WJ 22 E 7WJ 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale19 E C 7WJ 22 E 7WJ 21 1_555 E N ALA 23 E ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale20 E C GLN 29 E GLN 28 1_555 E N NH2 30 E NH2 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale21 F C ACE 1 F ACE 0 1_555 F N GLN 2 F GLN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale22 F C LYS 21 F LYS 20 1_555 F N 7WJ 22 F 7WJ 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale23 F C 7WJ 22 F 7WJ 21 1_555 F N ALA 23 F ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale24 F C GLN 29 F GLN 28 1_555 F N NH2 30 F NH2 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? metalc ? metalc1 A NT2 7WJ 22 A 7WJ 21 1_555 G CU CU . A CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? metalc ? metalc2 A NU1 7WJ 22 A 7WJ 21 1_555 G CU CU . A CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc3 A NU3 7WJ 22 A 7WJ 21 1_555 G CU CU . A CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc4 B NT2 7WJ 22 B 7WJ 21 1_555 J CU CU . B CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? metalc ? metalc5 B NU1 7WJ 22 B 7WJ 21 1_555 J CU CU . B CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc6 B NU3 7WJ 22 B 7WJ 21 1_555 J CU CU . B CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc7 J CU CU . B CU 101 1_555 V O HOH . D HOH 203 3_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? metalc ? metalc8 C OE1 GLU 8 C GLU 7 1_555 M CU CU . C CU 101 3_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.895 ? metalc ? metalc9 C NT2 7WJ 22 C 7WJ 21 1_555 M CU CU . C CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? metalc ? metalc10 C NU1 7WJ 22 C 7WJ 21 1_555 M CU CU . C CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? metalc ? metalc11 C NU3 7WJ 22 C 7WJ 21 1_555 M CU CU . C CU 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc12 D NT2 7WJ 22 D 7WJ 21 1_555 P CU CU . D CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? metalc ? metalc13 D NU1 7WJ 22 D 7WJ 21 1_555 P CU CU . D CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc14 D NU3 7WJ 22 D 7WJ 21 1_555 P CU CU . D CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? metalc ? metalc15 P CU CU . D CU 100 3_645 E OE2 GLU 8 E GLU 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc16 E NT2 7WJ 22 E 7WJ 21 1_555 Q CU CU . E CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? metalc ? metalc17 E NU1 7WJ 22 E 7WJ 21 1_555 Q CU CU . E CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc18 E NU3 7WJ 22 E 7WJ 21 1_555 Q CU CU . E CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc19 F OE2 GLU 8 F GLU 7 1_555 R CU CU . F CU 100 3_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.902 ? metalc ? metalc20 F NT2 7WJ 22 F 7WJ 21 1_555 R CU CU . F CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.95 ? metalc ? metalc21 F NU1 7WJ 22 F 7WJ 21 1_555 R CU CU . F CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc22 F NU3 7WJ 22 F 7WJ 21 1_555 R CU CU . F CU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc23 R CU CU . F CU 100 1_555 X O HOH . F HOH 205 3_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? # _chem_comp.formula 'Cu 2' _chem_comp.formula_weight 63.546 _chem_comp.id CU _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'COPPER (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6OLN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.020499 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.019622 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012616 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 2 CU A 1 101 100 CU CU . H 3 CL A 1 102 1 CL CL . I 3 CL A 1 103 4 CL CL . J 2 CU B 1 101 100 CU CU . K 3 CL B 1 102 2 CL CL . L 3 CL B 1 103 6 CL CL . M 2 CU C 1 101 100 CU CU . N 3 CL C 1 102 3 CL CL . O 3 CL C 1 103 5 CL CL . P 2 CU D 1 100 100 CU CU . Q 2 CU E 1 100 100 CU CU . R 2 CU F 1 100 100 CU CU . S 4 HOH A 1 201 15 HOH HOH . S 4 HOH A 2 202 7 HOH HOH . S 4 HOH A 3 203 62 HOH HOH . S 4 HOH A 4 204 19 HOH HOH . S 4 HOH A 5 205 10 HOH HOH . S 4 HOH A 6 206 69 HOH HOH . S 4 HOH A 7 207 28 HOH HOH . S 4 HOH A 8 208 25 HOH HOH . S 4 HOH A 9 209 81 HOH HOH . S 4 HOH A 10 210 93 HOH HOH . S 4 HOH A 11 211 12 HOH HOH . S 4 HOH A 12 212 110 HOH HOH . S 4 HOH A 13 213 67 HOH HOH . S 4 HOH A 14 214 112 HOH HOH . S 4 HOH A 15 215 61 HOH HOH . S 4 HOH A 16 216 46 HOH HOH . S 4 HOH A 17 217 45 HOH HOH . S 4 HOH A 18 218 104 HOH HOH . S 4 HOH A 19 219 114 HOH HOH . S 4 HOH A 20 220 43 HOH HOH . S 4 HOH A 21 221 88 HOH HOH . S 4 HOH A 22 222 89 HOH HOH . S 4 HOH A 23 223 86 HOH HOH . S 4 HOH A 24 224 98 HOH HOH . S 4 HOH A 25 225 100 HOH HOH . T 4 HOH B 1 201 42 HOH HOH . T 4 HOH B 2 202 16 HOH HOH . T 4 HOH B 3 203 6 HOH HOH . T 4 HOH B 4 204 13 HOH HOH . T 4 HOH B 5 205 65 HOH HOH . T 4 HOH B 6 206 29 HOH HOH . T 4 HOH B 7 207 55 HOH HOH . T 4 HOH B 8 208 23 HOH HOH . T 4 HOH B 9 209 39 HOH HOH . T 4 HOH B 10 210 101 HOH HOH . T 4 HOH B 11 211 49 HOH HOH . T 4 HOH B 12 212 22 HOH HOH . T 4 HOH B 13 213 84 HOH HOH . T 4 HOH B 14 214 34 HOH HOH . T 4 HOH B 15 215 4 HOH HOH . U 4 HOH C 1 201 17 HOH HOH . U 4 HOH C 2 202 1 HOH HOH . U 4 HOH C 3 203 37 HOH HOH . U 4 HOH C 4 204 24 HOH HOH . U 4 HOH C 5 205 21 HOH HOH . U 4 HOH C 6 206 54 HOH HOH . U 4 HOH C 7 207 38 HOH HOH . U 4 HOH C 8 208 106 HOH HOH . U 4 HOH C 9 209 103 HOH HOH . U 4 HOH C 10 210 56 HOH HOH . U 4 HOH C 11 211 36 HOH HOH . U 4 HOH C 12 212 41 HOH HOH . U 4 HOH C 13 213 68 HOH HOH . U 4 HOH C 14 214 3 HOH HOH . U 4 HOH C 15 215 97 HOH HOH . U 4 HOH C 16 216 72 HOH HOH . U 4 HOH C 17 217 113 HOH HOH . U 4 HOH C 18 218 8 HOH HOH . U 4 HOH C 19 219 31 HOH HOH . U 4 HOH C 20 220 73 HOH HOH . U 4 HOH C 21 221 2 HOH HOH . U 4 HOH C 22 222 82 HOH HOH . U 4 HOH C 23 223 119 HOH HOH . V 4 HOH D 1 201 14 HOH HOH . V 4 HOH D 2 202 109 HOH HOH . V 4 HOH D 3 203 107 HOH HOH . V 4 HOH D 4 204 63 HOH HOH . V 4 HOH D 5 205 50 HOH HOH . V 4 HOH D 6 206 5 HOH HOH . V 4 HOH D 7 207 78 HOH HOH . V 4 HOH D 8 208 92 HOH HOH . V 4 HOH D 9 209 94 HOH HOH . V 4 HOH D 10 210 90 HOH HOH . V 4 HOH D 11 211 70 HOH HOH . W 4 HOH E 1 201 47 HOH HOH . W 4 HOH E 2 202 51 HOH HOH . W 4 HOH E 3 203 59 HOH HOH . W 4 HOH E 4 204 40 HOH HOH . W 4 HOH E 5 205 35 HOH HOH . W 4 HOH E 6 206 11 HOH HOH . W 4 HOH E 7 207 91 HOH HOH . W 4 HOH E 8 208 9 HOH HOH . W 4 HOH E 9 209 80 HOH HOH . W 4 HOH E 10 210 95 HOH HOH . W 4 HOH E 11 211 66 HOH HOH . W 4 HOH E 12 212 96 HOH HOH . W 4 HOH E 13 213 76 HOH HOH . W 4 HOH E 14 214 99 HOH HOH . W 4 HOH E 15 215 105 HOH HOH . X 4 HOH F 1 201 79 HOH HOH . X 4 HOH F 2 202 32 HOH HOH . X 4 HOH F 3 203 33 HOH HOH . X 4 HOH F 4 204 75 HOH HOH . X 4 HOH F 5 205 27 HOH HOH . X 4 HOH F 6 206 74 HOH HOH . X 4 HOH F 7 207 20 HOH HOH . X 4 HOH F 8 208 71 HOH HOH . X 4 HOH F 9 209 18 HOH HOH . X 4 HOH F 10 210 108 HOH HOH . X 4 HOH F 11 211 87 HOH HOH . X 4 HOH F 12 212 57 HOH HOH . X 4 HOH F 13 213 116 HOH HOH . X 4 HOH F 14 214 77 HOH HOH . X 4 HOH F 15 215 102 HOH HOH . X 4 HOH F 16 216 30 HOH HOH . X 4 HOH F 17 217 115 HOH HOH . X 4 HOH F 18 218 48 HOH HOH . X 4 HOH F 19 219 58 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CU _atom_site.label_atom_id CU _atom_site.label_comp_id CU _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id R _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -2.327 _atom_site.Cartn_y 4.644 _atom_site.Cartn_z 28.732 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 68.15 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CU _atom_site.auth_comp_id CU _atom_site.auth_seq_id 100 _atom_site.auth_asym_id F _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 55 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 1 #