data_6OPQ # _model_server_result.job_id BT2dZFkZzP5JxLINkYL9-w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-21 14:26:52' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6opq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"WA","auth_seq_id":601}' # _entry.id 6OPQ # _exptl.entry_id 6OPQ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 7 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 6 n P NAG 1 P 1 NAG A 1241 NAG 6 n P NAG 2 P 2 NAG A 1242 NAG 7 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1262 NAG 7 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1263 NAG 7 n Q BMA 3 Q 3 BMA A 1264 BMA 7 n Q MAN 4 Q 4 MAN A 1265 MAN 7 n Q MAN 5 Q 5 MAN A 1266 MAN 6 n R NAG 1 R 1 NAG A 1276 NAG 6 n R NAG 2 R 2 NAG A 1277 NAG 6 n S NAG 1 S 1 NAG A 1295 NAG 6 n S NAG 2 S 2 NAG A 1296 NAG 6 n T NAG 1 T 1 NAG A 1332 NAG 6 n T NAG 2 T 2 NAG A 1333 NAG 6 n U NAG 1 U 1 NAG A 1362 NAG 6 n U NAG 2 U 2 NAG A 1363 NAG 6 n V NAG 1 V 1 NAG A 1386 NAG 6 n V NAG 2 V 2 NAG A 1387 NAG 6 n W NAG 1 W 1 NAG A 1392 NAG 6 n W NAG 2 W 2 NAG A 1393 NAG 6 n X NAG 1 X 1 NAG A 1413 NAG 6 n X NAG 2 X 2 NAG A 1414 NAG 6 n Y NAG 1 Y 1 NAG D 1241 NAG 6 n Y NAG 2 Y 2 NAG D 1242 NAG 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG D 1262 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG D 1263 NAG 7 n Z BMA 3 Z 3 BMA D 1264 BMA 7 n Z MAN 4 Z 4 MAN D 1265 MAN 7 n Z MAN 5 Z 5 MAN D 1266 MAN 6 n AA NAG 1 a 1 NAG D 1276 NAG 6 n AA NAG 2 a 2 NAG D 1277 NAG 6 n BA NAG 1 b 1 NAG D 1295 NAG 6 n BA NAG 2 b 2 NAG D 1296 NAG 6 n CA NAG 1 c 1 NAG D 1332 NAG 6 n CA NAG 2 c 2 NAG D 1333 NAG 6 n DA NAG 1 d 1 NAG D 1362 NAG 6 n DA NAG 2 d 2 NAG D 1363 NAG 6 n EA NAG 1 e 1 NAG D 1386 NAG 6 n EA NAG 2 e 2 NAG D 1387 NAG 6 n FA NAG 1 f 1 NAG D 1392 NAG 6 n FA NAG 2 f 2 NAG D 1393 NAG 6 n GA NAG 1 g 1 NAG D 1413 NAG 6 n GA NAG 2 g 2 NAG D 1414 NAG 6 n HA NAG 1 h 1 NAG E 1241 NAG 6 n HA NAG 2 h 2 NAG E 1242 NAG 7 n IA NAG 1 i 1 NAG E 1262 NAG 7 n IA NAG 2 i 2 NAG E 1263 NAG 7 n IA BMA 3 i 3 BMA E 1264 BMA 7 n IA MAN 4 i 4 MAN E 1265 MAN 7 n IA MAN 5 i 5 MAN E 1266 MAN 6 n JA NAG 1 j 1 NAG E 1276 NAG 6 n JA NAG 2 j 2 NAG E 1277 NAG 6 n KA NAG 1 k 1 NAG E 1295 NAG 6 n KA NAG 2 k 2 NAG E 1296 NAG 6 n LA NAG 1 l 1 NAG E 1332 NAG 6 n LA NAG 2 l 2 NAG E 1333 NAG 6 n MA NAG 1 m 1 NAG E 1362 NAG 6 n MA NAG 2 m 2 NAG E 1363 NAG 6 n NA NAG 1 n 1 NAG E 1386 NAG 6 n NA NAG 2 n 2 NAG E 1387 NAG 6 n OA NAG 1 o 1 NAG E 1392 NAG 6 n OA NAG 2 o 2 NAG E 1393 NAG 6 n PA NAG 1 p 1 NAG E 1413 NAG 6 n PA NAG 2 p 2 NAG E 1414 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 54 1_555 A SG CYS 79 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 124 A CYS 119 1_555 A SG CYS 221 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 131 A CYS 126 1_555 A SG CYS 212 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 234 A CYS 218 1_555 A SG CYS 263 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 244 A CYS 228 1_555 A SG CYS 255 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 312 A CYS 296 1_555 A SG CYS 346 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 392 A CYS 378 1_555 A SG CYS 456 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 399 A CYS 385 1_555 A SG CYS 429 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 512 A CYS 501 1_555 C SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 23 L CYS 23 1_555 B SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 87 B CYS 598 1_555 C SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 36 C CYS 16 1_555 D SG CYS 104 C CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 22 H CYS 22 1_555 E SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 F SG CYS 59 D CYS 54 1_555 F SG CYS 79 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf15 F SG CYS 124 D CYS 119 1_555 F SG CYS 221 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 131 D CYS 126 1_555 F SG CYS 212 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf17 F SG CYS 234 D CYS 218 1_555 F SG CYS 263 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 244 D CYS 228 1_555 F SG CYS 255 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf19 F SG CYS 312 D CYS 296 1_555 F SG CYS 346 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 392 D CYS 378 1_555 F SG CYS 456 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 399 D CYS 385 1_555 F SG CYS 429 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 512 D CYS 501 1_555 H SG CYS 94 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 23 N CYS 23 1_555 G SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf24 H SG CYS 87 F CYS 598 1_555 H SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 36 I CYS 16 1_555 I SG CYS 104 I CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf26 J SG CYS 22 K CYS 22 1_555 J SG CYS 96 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 K SG CYS 59 E CYS 54 1_555 K SG CYS 79 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf28 K SG CYS 124 E CYS 119 1_555 K SG CYS 221 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf29 K SG CYS 131 E CYS 126 1_555 K SG CYS 212 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf30 K SG CYS 234 E CYS 218 1_555 K SG CYS 263 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 244 E CYS 228 1_555 K SG CYS 255 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 312 E CYS 296 1_555 K SG CYS 346 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 392 E CYS 378 1_555 K SG CYS 456 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 399 E CYS 385 1_555 K SG CYS 429 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 512 E CYS 501 1_555 M SG CYS 94 G CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? disulf ? disulf36 L SG CYS 23 O CYS 23 1_555 L SG CYS 88 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf37 M SG CYS 87 G CYS 598 1_555 M SG CYS 93 G CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf38 N SG CYS 36 J CYS 16 1_555 N SG CYS 104 J CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf39 O SG CYS 22 M CYS 22 1_555 O SG CYS 96 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 250 A ASN 234 1_555 QA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 257 A ASN 241 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 278 A ASN 262 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 292 A ASN 276 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 311 A ASN 295 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 347 A ASN 332 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 354 A ASN 339 1_555 RA C1 NAG . A NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 376 A ASN 362 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 400 A ASN 386 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 406 A ASN 392 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 424 A ASN 413 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 459 A ASN 448 1_555 SA C1 NAG . A NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale13 F ND2 ASN 250 D ASN 234 1_555 TA C1 NAG . D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? covale ? covale14 F ND2 ASN 257 D ASN 241 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale15 F ND2 ASN 278 D ASN 262 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale16 F ND2 ASN 292 D ASN 276 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale17 F ND2 ASN 311 D ASN 295 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale18 F ND2 ASN 347 D ASN 332 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale19 F ND2 ASN 354 D ASN 339 1_555 UA C1 NAG . D NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale20 F ND2 ASN 376 D ASN 362 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 400 D ASN 386 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 406 D ASN 392 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale23 F ND2 ASN 424 D ASN 413 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale24 F ND2 ASN 459 D ASN 448 1_555 VA C1 NAG . D NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale25 K ND2 ASN 250 E ASN 234 1_555 WA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale26 K ND2 ASN 257 E ASN 241 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale27 K ND2 ASN 278 E ASN 262 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale28 K ND2 ASN 292 E ASN 276 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale29 K ND2 ASN 311 E ASN 295 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale30 K ND2 ASN 347 E ASN 332 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale31 K ND2 ASN 354 E ASN 339 1_555 XA C1 NAG . E NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale32 K ND2 ASN 376 E ASN 362 1_555 MA C1 NAG . m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale33 K ND2 ASN 400 E ASN 386 1_555 NA C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale34 K ND2 ASN 406 E ASN 392 1_555 OA C1 NAG . o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale35 K ND2 ASN 424 E ASN 413 1_555 PA C1 NAG . p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale36 K ND2 ASN 459 E ASN 448 1_555 YA C1 NAG . E NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale37 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? covale ? covale38 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale39 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale40 Q O3 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale41 Q O2 MAN . Q MAN 4 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale42 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale43 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale44 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale45 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale46 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale47 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale48 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale49 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? covale ? covale50 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale51 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale52 Z O3 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale53 Z O2 MAN . Z MAN 4 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale54 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale55 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale56 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale57 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale58 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale59 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale60 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale61 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale62 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale63 IA O4 NAG . i NAG 2 1_555 IA C1 BMA . i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale64 IA O3 BMA . i BMA 3 1_555 IA C1 MAN . i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale65 IA O2 MAN . i MAN 4 1_555 IA C1 MAN . i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale66 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale67 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale68 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale69 MA O4 NAG . m NAG 1 1_555 MA C1 NAG . m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale70 NA O4 NAG . n NAG 1 1_555 NA C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale71 OA O4 NAG . o NAG 1 1_555 OA C1 NAG . o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale72 PA O4 NAG . p NAG 1 1_555 PA C1 NAG . p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6OPQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code QA 8 NAG A 1 601 1234 NAG NAG . RA 8 NAG A 1 615 1339 NAG NAG . SA 8 NAG A 1 624 1448 NAG NAG . TA 8 NAG D 1 601 1234 NAG NAG . UA 8 NAG D 1 615 1339 NAG NAG . VA 8 NAG D 1 624 1448 NAG NAG . WA 8 NAG E 1 601 1234 NAG NAG . XA 8 NAG E 1 615 1339 NAG NAG . YA 8 NAG E 1 624 1448 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . WA 8 104.459 139.469 170.345 1 83.11 ? C1 NAG 601 E 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . WA 8 105.266 139.99 171.5 1 82.9 ? C2 NAG 601 E 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . WA 8 104.285 140.373 172.556 1 83.74 ? C3 NAG 601 E 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . WA 8 103.367 141.499 171.969 1 83.59 ? C4 NAG 601 E 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . WA 8 102.591 140.961 170.74 1 84.73 ? C5 NAG 601 E 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . WA 8 101.763 142.043 170.103 1 82.7 ? C6 NAG 601 E 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . WA 8 107.124 139.264 172.869 1 84.15 ? C7 NAG 601 E 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . WA 8 108.126 138.221 173.239 1 81.46 ? C8 NAG 601 E 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . WA 8 106.22 138.981 171.957 1 85.37 ? N2 NAG 601 E 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . WA 8 104.92 140.817 173.775 1 87.96 ? O3 NAG 601 E 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . WA 8 102.476 141.916 172.95 1 85.38 ? O4 NAG 601 E 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . WA 8 103.524 140.547 169.759 1 80.09 ? O5 NAG 601 E 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . WA 8 101.038 142.78 171.078 1 93.04 ? O6 NAG 601 E 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . WA 8 107.127 140.361 173.403 1 85.24 ? O7 NAG 601 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 40 _model_server_stats.query_time_ms 246 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #