data_6OYV
#
_model_server_result.job_id            5Wmrj8s31A9MG5xuA-Yang 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-17 06:21:27' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6oyv 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":601}' 
#
_entry.id    6OYV 
#
_exptl.entry_id    6OYV 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              272.382 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ESTRADIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6OYV 
_cell.length_a            162.362 
_cell.length_b            162.362 
_cell.length_c            95.694 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6OYV 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        79 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'I 4' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D 1 1 
B,E,F 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 E N N 
#
_chem_comp.formula           'C18 H24 O2' 
_chem_comp.formula_weight    272.382 
_chem_comp.id                EST 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              ESTRADIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 EST doub 83 n y 
C1 C10 EST sing 84 n y 
C1 H1 EST sing 85 n n 
C2 C3 EST sing 86 n y 
C2 H2 EST sing 87 n n 
C3 O3 EST sing 88 n n 
C3 C4 EST doub 89 n y 
O3 HO3 EST sing 90 n n 
C4 C5 EST sing 91 n y 
C4 H4 EST sing 92 n n 
C5 C6 EST sing 93 n n 
C5 C10 EST doub 94 n y 
C6 C7 EST sing 95 n n 
C6 H61 EST sing 96 n n 
C6 H62 EST sing 97 n n 
C7 C8 EST sing 98 n n 
C7 H71 EST sing 99 n n 
C7 H72 EST sing 100 n n 
C8 C9 EST sing 101 n n 
C8 C14 EST sing 102 n n 
C8 H8 EST sing 103 n n 
C9 C10 EST sing 104 n n 
C9 C11 EST sing 105 n n 
C9 H9 EST sing 106 n n 
C11 C12 EST sing 107 n n 
C11 H111 EST sing 108 n n 
C11 H112 EST sing 109 n n 
C12 C13 EST sing 110 n n 
C12 H121 EST sing 111 n n 
C12 H122 EST sing 112 n n 
C13 C14 EST sing 113 n n 
C13 C17 EST sing 114 n n 
C13 C18 EST sing 115 n n 
C14 C15 EST sing 116 n n 
C14 H14 EST sing 117 n n 
C15 C16 EST sing 118 n n 
C15 H151 EST sing 119 n n 
C15 H152 EST sing 120 n n 
C16 C17 EST sing 121 n n 
C16 H161 EST sing 122 n n 
C16 H162 EST sing 123 n n 
C17 O17 EST sing 124 n n 
C17 H17 EST sing 125 n n 
O17 HO7 EST sing 126 n n 
C18 H181 EST sing 127 n n 
C18 H182 EST sing 128 n n 
C18 H183 EST sing 129 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6OYV 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006159 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006159 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.01045 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 EST A 1 601 602 EST EST . 
D 3 HEM A 1 602 601 HEM HEM . 
E 2 EST B 1 601 602 EST EST . 
F 3 HEM B 1 602 601 HEM HEM . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 EST . . . C 2 -36.337 10.291 -4.335 1 109.1 ? C1 EST 601 A 1 
HETATM 2 C C2 EST . . . C 2 -36.244 8.923 -4.137 1 104.66 ? C2 EST 601 A 1 
HETATM 3 C C3 EST . . . C 2 -37.011 8.35 -3.128 1 101.4 ? C3 EST 601 A 1 
HETATM 4 O O3 EST . . . C 2 -36.929 6.998 -2.923 1 100.52 ? O3 EST 601 A 1 
HETATM 5 C C4 EST . . . C 2 -37.856 9.103 -2.324 1 103.32 ? C4 EST 601 A 1 
HETATM 6 C C5 EST . . . C 2 -37.939 10.48 -2.534 1 107.43 ? C5 EST 601 A 1 
HETATM 7 C C6 EST . . . C 2 -38.864 11.253 -1.646 1 107.79 ? C6 EST 601 A 1 
HETATM 8 C C7 EST . . . C 2 -38.614 12.747 -1.728 1 112.48 ? C7 EST 601 A 1 
HETATM 9 C C8 EST . . . C 2 -38.558 13.108 -3.199 1 107.32 ? C8 EST 601 A 1 
HETATM 10 C C9 EST . . . C 2 -37.249 12.562 -3.791 1 106.15 ? C9 EST 601 A 1 
HETATM 11 C C10 EST . . . C 2 -37.18 11.077 -3.545 1 107.97 ? C10 EST 601 A 1 
HETATM 12 C C11 EST . . . C 2 -37.118 12.923 -5.286 1 106.52 ? C11 EST 601 A 1 
HETATM 13 C C12 EST . . . C 2 -37.304 14.431 -5.544 1 106.91 ? C12 EST 601 A 1 
HETATM 14 C C13 EST . . . C 2 -38.622 14.902 -4.941 1 107.27 ? C13 EST 601 A 1 
HETATM 15 C C14 EST . . . C 2 -38.581 14.61 -3.422 1 107.1 ? C14 EST 601 A 1 
HETATM 16 C C15 EST . . . C 2 -39.768 15.395 -2.868 1 113.15 ? C15 EST 601 A 1 
HETATM 17 C C16 EST . . . C 2 -39.867 16.627 -3.777 1 114.39 ? C16 EST 601 A 1 
HETATM 18 C C17 EST . . . C 2 -38.816 16.427 -4.909 1 111.06 ? C17 EST 601 A 1 
HETATM 19 O O17 EST . . . C 2 -39.263 16.86 -6.149 1 116.17 ? O17 EST 601 A 1 
HETATM 20 C C18 EST . . . C 2 -39.811 14.243 -5.652 1 109.34 ? C18 EST 601 A 1 
HETATM 21 H H1 EST . . . C 2 -35.83 10.689 -5.006 1 131.11 ? H1 EST 601 A 1 
HETATM 22 H H2 EST . . . C 2 -35.684 8.402 -4.666 1 125.79 ? H2 EST 601 A 1 
HETATM 23 H HO3 EST . . . C 2 -36.137 6.867 -2.648 1 120.82 ? HO3 EST 601 A 1 
HETATM 24 H H4 EST . . . C 2 -38.359 8.698 -1.655 1 124.18 ? H4 EST 601 A 1 
HETATM 25 H H61 EST . . . C 2 -39.79 11.067 -1.869 1 129.54 ? H61 EST 601 A 1 
HETATM 26 H H62 EST . . . C 2 -38.779 10.961 -0.725 1 129.54 ? H62 EST 601 A 1 
HETATM 27 H H71 EST . . . C 2 -37.793 12.994 -1.275 1 135.17 ? H71 EST 601 A 1 
HETATM 28 H H72 EST . . . C 2 -39.306 13.248 -1.27 1 135.17 ? H72 EST 601 A 1 
HETATM 29 H H8 EST . . . C 2 -39.31 12.697 -3.652 1 128.98 ? H8 EST 601 A 1 
HETATM 30 H H9 EST . . . C 2 -36.489 12.956 -3.335 1 127.57 ? H9 EST 601 A 1 
HETATM 31 H H111 EST . . . C 2 -36.258 12.63 -5.625 1 128.03 ? H111 EST 601 A 1 
HETATM 32 H H112 EST . . . C 2 -37.758 12.414 -5.808 1 128.03 ? H112 EST 601 A 1 
HETATM 33 H H121 EST . . . C 2 -36.561 14.936 -5.177 1 128.49 ? H121 EST 601 A 1 
HETATM 34 H H122 EST . . . C 2 -37.274 14.624 -6.494 1 128.49 ? H122 EST 601 A 1 
HETATM 35 H H14 EST . . . C 2 -37.769 14.975 -3.038 1 128.71 ? H14 EST 601 A 1 
HETATM 36 H H151 EST . . . C 2 -39.646 15.638 -1.937 1 135.97 ? H151 EST 601 A 1 
HETATM 37 H H152 EST . . . C 2 -40.586 14.875 -2.869 1 135.97 ? H152 EST 601 A 1 
HETATM 38 H H161 EST . . . C 2 -40.762 16.729 -4.135 1 137.47 ? H161 EST 601 A 1 
HETATM 39 H H162 EST . . . C 2 -39.706 17.445 -3.28 1 137.47 ? H162 EST 601 A 1 
HETATM 40 H H17 EST . . . C 2 -37.984 16.868 -4.676 1 133.47 ? H17 EST 601 A 1 
HETATM 41 H HO7 EST . . . C 2 -39.767 17.53 -6.014 1 139.6 ? HO7 EST 601 A 1 
HETATM 42 H H181 EST . . . C 2 -39.891 14.524 -6.578 1 131.4 ? H181 EST 601 A 1 
HETATM 43 H H182 EST . . . C 2 -40.658 14.454 -5.23 1 131.4 ? H182 EST 601 A 1 
HETATM 44 H H183 EST . . . C 2 -39.746 13.276 -5.665 1 131.4 ? H183 EST 601 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              18 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    28 
_model_server_stats.query_time_ms           299 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           44 
#