data_6P1L # _model_server_result.job_id CLvZpRWx3oPPeEyeoC9EJA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 22:22:29' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6p1l # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":1103}' # _entry.id 6P1L # _exptl.entry_id 6P1L _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 383.396 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 101.18 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6P1L _cell.length_a 72.6 _cell.length_b 103.15 _cell.length_c 87.1 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6P1L _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,F,G,J,K,L,P 1 1 B,D,H,I,M,N,O,Q,R 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 G N N ? 4 L N N ? 4 O N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASN 147 A ASN 842 1_555 E MG MG . A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 160 A ASP 855 1_555 E MG MG . A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? metalc ? metalc3 E MG MG . A MG 1101 1_555 F O2A ANP . A ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.877 ? metalc ? metalc4 E MG MG . A MG 1101 1_555 F O3G ANP . A ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc5 E MG MG . A MG 1101 1_555 F O1B ANP . A ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? metalc ? metalc6 E MG MG . A MG 1101 1_555 P O HOH . A HOH 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASN 147 B ASN 842 1_555 H MG MG . B MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? metalc ? metalc8 B OD2 ASP 160 B ASP 855 1_555 H MG MG . B MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.831 ? metalc ? metalc9 H MG MG . B MG 1101 1_555 I O1G ANP . B ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc10 H MG MG . B MG 1101 1_555 I O2A ANP . B ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.926 ? metalc ? metalc11 H MG MG . B MG 1101 1_555 I O1B ANP . B ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc12 H MG MG . B MG 1101 1_555 Q O HOH . B HOH 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc13 C OD1 ASN 147 C ASN 842 1_555 J MG MG . C MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? metalc ? metalc14 C OD2 ASP 160 C ASP 855 1_555 J MG MG . C MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.88 ? metalc ? metalc15 J MG MG . C MG 1101 1_555 K O1G ANP . C ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc16 J MG MG . C MG 1101 1_555 K O1B ANP . C ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? metalc ? metalc17 J MG MG . C MG 1101 1_555 K O2A ANP . C ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASN 147 D ASN 842 1_555 M MG MG . D MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc19 D OD2 ASP 160 D ASP 855 1_555 M MG MG . D MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.838 ? metalc ? metalc20 M MG MG . D MG 1101 1_555 N O1B ANP . D ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc21 M MG MG . D MG 1101 1_555 N O2A ANP . D ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? metalc ? metalc22 M MG MG . D MG 1101 1_555 N O1G ANP . D ANP 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc23 M MG MG . D MG 1101 1_555 R O HOH . D HOH 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? # _chem_comp.formula 'C19 H14 F N3 O3 S' _chem_comp.formula_weight 383.396 _chem_comp.id 9LL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O01 C02 9LL sing 1 n n C03 C02 9LL doub 2 n y C03 C04 9LL sing 3 n y C02 C08 9LL sing 4 n y O27 C19 9LL doub 5 n n C04 C05 9LL doub 6 n y C19 N18 9LL sing 7 n n C19 C20 9LL sing 8 n n C08 C09 9LL sing 9 n n C08 C07 9LL doub 10 n y C09 N18 9LL sing 11 n n C09 C10 9LL sing 12 n n C21 C20 9LL doub 13 n y C21 C22 9LL sing 14 n y N18 C26 9LL sing 15 n n C20 C25 9LL sing 16 n y C22 C23 9LL doub 17 n y C26 C25 9LL sing 18 n n C25 C24 9LL doub 19 n y C05 C07 9LL sing 20 n y C05 F06 9LL sing 21 n n C23 C24 9LL sing 22 n y N11 C10 9LL sing 23 n n N11 C12 9LL sing 24 n n C10 O17 9LL doub 25 n n C12 N13 9LL doub 26 n y C12 S16 9LL sing 27 n y N13 C14 9LL sing 28 n y C14 C15 9LL doub 29 n y S16 C15 9LL sing 30 n y C15 H1 9LL sing 31 n n C21 H2 9LL sing 32 n n C22 H3 9LL sing 33 n n C24 H4 9LL sing 34 n n C26 H5 9LL sing 35 n n C26 H6 9LL sing 36 n n C03 H7 9LL sing 37 n n C04 H8 9LL sing 38 n n C07 H9 9LL sing 39 n n C09 H10 9LL sing 40 n n C14 H11 9LL sing 41 n n C23 H12 9LL sing 42 n n N11 H13 9LL sing 43 n n O01 H14 9LL sing 44 n n # _atom_sites.entry_id 6P1L _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013774 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002722 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009695 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011703 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 MG A 1 1101 1101 MG MG . F 3 ANP A 1 1102 1102 ANP ANP . G 4 9LL A 1 1103 1201 9LL EAI . H 2 MG B 1 1101 1101 MG MG . I 3 ANP B 1 1102 1102 ANP ANP . J 2 MG C 1 1101 1101 MG MG . K 3 ANP C 1 1102 1102 ANP ANP . L 4 9LL C 1 1103 1201 9LL EAI . M 2 MG D 1 1101 1101 MG MG . N 3 ANP D 1 1102 1102 ANP ANP . O 4 9LL D 1 1103 1201 9LL EAI . P 5 HOH A 1 1201 12 HOH HOH . P 5 HOH A 2 1202 6 HOH HOH . P 5 HOH A 3 1203 7 HOH HOH . P 5 HOH A 4 1204 5 HOH HOH . P 5 HOH A 5 1205 4 HOH HOH . Q 5 HOH B 1 1201 2 HOH HOH . Q 5 HOH B 2 1202 1 HOH HOH . Q 5 HOH B 3 1203 10 HOH HOH . Q 5 HOH B 4 1204 9 HOH HOH . R 5 HOH D 1 1201 3 HOH HOH . R 5 HOH D 2 1202 8 HOH HOH . R 5 HOH D 3 1203 13 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C10 9LL . . . G 4 2.336 30.97 29.181 1 45.77 ? C10 9LL 1103 A 1 HETATM 2 C C15 9LL . . . G 4 -0.752 28.64 26.636 1 45.61 ? C15 9LL 1103 A 1 HETATM 3 C C20 9LL . . . G 4 2.922 35.276 30.202 1 33.73 ? C20 9LL 1103 A 1 HETATM 4 C C21 9LL . . . G 4 2.327 36.652 30.582 1 33.47 ? C21 9LL 1103 A 1 HETATM 5 C C22 9LL . . . G 4 2.913 37.912 29.97 1 54.35 ? C22 9LL 1103 A 1 HETATM 6 C C24 9LL . . . G 4 4.645 36.446 28.634 1 47.27 ? C24 9LL 1103 A 1 HETATM 7 C C26 9LL . . . G 4 4.385 33.694 29.106 1 32.07 ? C26 9LL 1103 A 1 HETATM 8 C C02 9LL . . . G 4 5.965 30.993 30.613 1 32.31 ? C02 9LL 1103 A 1 HETATM 9 C C03 9LL . . . G 4 7.239 30.251 30.234 1 36.98 ? C03 9LL 1103 A 1 HETATM 10 C C04 9LL . . . G 4 7.264 29.309 29.036 1 31.7 ? C04 9LL 1103 A 1 HETATM 11 C C05 9LL . . . G 4 5.999 29.102 28.219 1 36.77 ? C05 9LL 1103 A 1 HETATM 12 C C07 9LL . . . G 4 4.721 29.836 28.599 1 39.08 ? C07 9LL 1103 A 1 HETATM 13 C C08 9LL . . . G 4 4.701 30.787 29.792 1 33.65 ? C08 9LL 1103 A 1 HETATM 14 C C09 9LL . . . G 4 3.393 31.489 30.145 1 49.25 ? C09 9LL 1103 A 1 HETATM 15 C C12 9LL . . . G 4 0.665 29.138 28.587 1 38.36 ? C12 9LL 1103 A 1 HETATM 16 C C14 9LL . . . G 4 -1.107 27.738 27.7 1 38.45 ? C14 9LL 1103 A 1 HETATM 17 C C19 9LL . . . G 4 2.549 33.872 30.648 1 40.91 ? C19 9LL 1103 A 1 HETATM 18 C C23 9LL . . . G 4 4.072 37.808 28.996 1 54.33 ? C23 9LL 1103 A 1 HETATM 19 C C25 9LL . . . G 4 4.037 35.17 29.268 1 38.95 ? C25 9LL 1103 A 1 HETATM 20 F F06 9LL . . . G 4 6.012 28.264 27.149 1 44.18 ? F06 9LL 1103 A 1 HETATM 21 N N11 9LL . . . G 4 1.669 29.714 29.463 1 31.83 ? N11 9LL 1103 A 1 HETATM 22 N N13 9LL . . . G 4 -0.199 28.064 28.936 1 32.67 ? N13 9LL 1103 A 1 HETATM 23 N N18 9LL . . . G 4 3.459 32.923 29.971 1 46.23 ? N18 9LL 1103 A 1 HETATM 24 O O01 9LL . . . G 4 5.963 31.853 31.714 1 41.12 ? O01 9LL 1103 A 1 HETATM 25 O O17 9LL . . . G 4 2.087 31.606 28.213 1 51.31 ? O17 9LL 1103 A 1 HETATM 26 O O27 9LL . . . G 4 1.687 33.581 31.405 1 46.43 ? O27 9LL 1103 A 1 HETATM 27 S S16 9LL . . . G 4 0.36 29.537 27.13 1 66.6 ? S16 9LL 1103 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 304 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 27 #