data_6P3S # _model_server_result.job_id BM0lAZcGyyT51lFZqqNLaQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-20 13:12:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6p3s # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"HA","auth_seq_id":301}' # _entry.id 6P3S # _exptl.entry_id 6P3S _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 12 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6P3S _cell.length_a 135.48 _cell.length_b 187.225 _cell.length_c 342.366 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6P3S _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 2 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? trimeric 3 author_defined_assembly 1 ? trimeric 3 author_defined_assembly 2 ? trimeric 3 author_defined_assembly 3 ? trimeric 3 author_defined_assembly 4 ? trimeric 3 author_defined_assembly 5 ? trimeric 3 author_defined_assembly 6 ? trimeric 3 author_defined_assembly 7 ? trimeric 3 author_defined_assembly 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,L,CA,GA 1 1 C,D,E,Y 2 1 F,G,H,Z,AA 3 1 I,J,K,BA 4 1 M,N,O,DA,HA 5 1 P,Q,R,EA,IA 6 1 S,T,U,JA 7 1 V,W,X,FA,KA 8 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 12 GA N N ? 12 HA N N ? 12 IA N N ? 12 JA N N ? 12 KA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 3 2 MAN NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 4 3 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 4 5 4 NDG MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 5 ? 4 6 5 GAL NDG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 4 7 6 SIA GAL C2 O2 . O6 HO6 . sing 7 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 5 4 3 BMA BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 10 ? 5 5 4 NAG BMA C1 O1 . O2 HO2 . sing 11 ? 5 6 5 GAL NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 12 ? 5 7 6 SIA GAL C2 O2 . O6 HO6 . sing 13 ? 6 2 1 MAN NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 14 ? 6 3 2 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 15 ? 6 4 3 NDG MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 16 ? 6 5 4 GLA NDG C1 O1 . O4 HO4 . sing 17 ? 6 6 5 SIA GLA C2 O2 . O6 HO6 . sing 18 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 19 ? 7 3 2 MAN NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 20 ? 7 4 3 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 21 ? 7 5 4 NAG MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 22 ? 7 6 5 GLA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 23 ? 7 7 6 SIA GLA C2 O2 . O6 HO6 . sing 24 ? 8 2 1 BMA BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 25 ? 8 3 2 NDG BMA C1 O1 . O2 HO2 . sing 26 ? 8 4 3 GAL NDG C1 O1 . O4 HO4 . sing 27 ? 8 5 4 SIA GAL C2 O2 . O6 HO6 . sing 28 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 29 ? 9 3 2 MAN NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 30 ? 9 4 3 BMA MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 31 ? 9 5 4 NDG BMA C1 O1 . O2 HO2 . sing 32 ? 9 6 5 GAL NDG C1 O1 . O4 HO4 . sing 33 ? 9 7 6 SIA GAL C2 O2 . O6 HO6 . sing 34 ? 10 2 1 BMA MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 35 ? 10 3 2 NDG BMA C1 O1 . O2 HO2 . sing 36 ? 10 4 3 GAL NDG C1 O1 . O4 HO4 . sing 37 ? 10 5 4 SIA GAL C2 O2 . O6 HO6 . sing 38 ? 11 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 39 ? 11 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 40 ? 11 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 41 ? 11 5 4 NDG MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 42 ? 11 6 5 GAL NDG C1 O1 . O4 HO4 . sing 43 ? 11 7 6 SIA GAL C2 O2 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG E 307 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG E 306 NAG 4 n Y MAN 3 Y 3 MAN E 305 MAN 4 n Y MAN 4 Y 4 MAN E 304 MAN 4 n Y NDG 5 Y 5 NDG E 303 NDG 4 n Y GAL 6 Y 6 GAL E 302 GAL 4 n Y SIA 7 Y 7 SIA E 301 SIA 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG H 307 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG H 306 NAG 5 n Z BMA 3 Z 3 BMA H 305 BMA 5 n Z BMA 4 Z 4 BMA H 304 BMA 5 n Z NAG 5 Z 5 NAG H 303 NAG 5 n Z GAL 6 Z 6 GAL H 302 GAL 5 n Z SIA 7 Z 7 SIA H 301 SIA 6 n AA NAG 1 a 1 NAG H 313 NAG 6 n AA MAN 2 a 2 MAN H 312 MAN 6 n AA MAN 3 a 3 MAN H 311 MAN 6 n AA NDG 4 a 4 NDG H 310 NDG 6 n AA GLA 5 a 5 GLA H 309 GLA 6 n AA SIA 6 a 6 SIA H 308 SIA 7 n BA NAG 1 b 1 NAG K 307 NAG 7 n BA NAG 2 b 2 NAG K 306 NAG 7 n BA MAN 3 b 3 MAN K 305 MAN 7 n BA MAN 4 b 4 MAN K 304 MAN 7 n BA NAG 5 b 5 NAG K 303 NAG 7 n BA GLA 6 b 6 GLA K 302 GLA 7 n BA SIA 7 b 7 SIA K 301 SIA 8 n CA BMA 1 c 1 BMA L 305 BMA 8 n CA BMA 2 c 2 BMA L 304 BMA 8 n CA NDG 3 c 3 NDG L 303 NDG 8 n CA GAL 4 c 4 GAL L 302 GAL 8 n CA SIA 5 c 5 SIA L 301 SIA 9 n DA NAG 1 d 1 NAG O 308 NAG 9 n DA NAG 2 d 2 NAG O 307 NAG 9 n DA MAN 3 d 3 MAN O 306 MAN 9 n DA BMA 4 d 4 BMA O 305 BMA 9 n DA NDG 5 d 5 NDG O 304 NDG 9 n DA GAL 6 d 6 GAL O 303 GAL 9 n DA SIA 7 d 7 SIA O 302 SIA 10 n EA MAN 1 e 1 MAN R 306 MAN 10 n EA BMA 2 e 2 BMA R 305 BMA 10 n EA NDG 3 e 3 NDG R 304 NDG 10 n EA GAL 4 e 4 GAL R 303 GAL 10 n EA SIA 5 e 5 SIA R 302 SIA 11 n FA NAG 1 f 1 NAG X 308 NAG 11 n FA NAG 2 f 2 NAG X 307 NAG 11 n FA BMA 3 f 3 BMA X 306 BMA 11 n FA MAN 4 f 4 MAN X 305 MAN 11 n FA NDG 5 f 5 NDG X 304 NDG 11 n FA GAL 6 f 6 GAL X 303 GAL 11 n FA SIA 7 f 7 SIA X 302 SIA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 96 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 156 A CYS 156 1_555 A SG CYS 212 A CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 23 B CYS 23 1_555 B SG CYS 88 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 136 B CYS 136 1_555 B SG CYS 196 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 D SG CYS 23 D CYS 23 1_555 D SG CYS 88 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 E SG CYS 7 E CYS 64 1_555 E SG CYS 19 E CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf7 E SG CYS 42 E CYS 99 1_555 E SG CYS 87 E CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf8 F SG CYS 22 F CYS 22 1_555 F SG CYS 96 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 F SG CYS 156 F CYS 156 1_555 F SG CYS 212 F CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 G SG CYS 23 G CYS 23 1_555 G SG CYS 88 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 G SG CYS 136 G CYS 136 1_555 G SG CYS 196 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 H SG CYS 7 H CYS 64 1_555 H SG CYS 19 H CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 H SG CYS 42 H CYS 99 1_555 H SG CYS 87 H CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf14 I SG CYS 22 I CYS 22 1_555 I SG CYS 96 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 I SG CYS 156 I CYS 156 1_555 I SG CYS 212 I CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 J SG CYS 23 J CYS 23 1_555 J SG CYS 88 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf17 K SG CYS 7 K CYS 64 1_555 K SG CYS 19 K CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf18 K SG CYS 42 K CYS 99 1_555 K SG CYS 87 K CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf19 L SG CYS 42 L CYS 99 1_555 L SG CYS 87 L CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf20 M SG CYS 22 M CYS 25 1_555 M SG CYS 96 M CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf21 M SG CYS 156 M CYS 159 1_555 M SG CYS 212 M CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 N SG CYS 23 N CYS 23 1_555 N SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 N SG CYS 136 N CYS 136 1_555 N SG CYS 196 N CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 O SG CYS 7 O CYS 64 1_555 O SG CYS 19 O CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 O SG CYS 42 O CYS 99 1_555 O SG CYS 87 O CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf26 P SG CYS 22 P CYS 25 1_555 P SG CYS 96 P CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf27 P SG CYS 156 P CYS 159 1_555 P SG CYS 212 P CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf28 Q SG CYS 23 Q CYS 23 1_555 Q SG CYS 88 Q CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf29 Q SG CYS 136 Q CYS 136 1_555 Q SG CYS 196 Q CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf30 R SG CYS 7 R CYS 64 1_555 R SG CYS 19 R CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf31 R SG CYS 42 R CYS 99 1_555 R SG CYS 87 R CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf32 S SG CYS 22 S CYS 25 1_555 S SG CYS 96 S CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 S SG CYS 156 S CYS 159 1_555 S SG CYS 212 S CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 T SG CYS 23 T CYS 23 1_555 T SG CYS 88 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf35 T SG CYS 136 T CYS 136 1_555 T SG CYS 196 T CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 U SG CYS 7 U CYS 64 1_555 U SG CYS 19 U CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 U SG CYS 42 U CYS 99 1_555 U SG CYS 87 U CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf38 V SG CYS 156 V CYS 159 1_555 V SG CYS 212 V CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 X SG CYS 7 X CYS 64 1_555 X SG CYS 19 X CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 X SG CYS 42 X CYS 99 1_555 X SG CYS 87 X CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 E ND2 ASN 106 E ASN 163 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale2 H ND2 ASN 106 H ASN 163 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale3 K ND2 ASN 106 K ASN 163 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale4 O ND2 ASN 117 O ASN 174 1_555 HA C1 NAG . O NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 R ND2 ASN 117 R ASN 174 1_555 IA C1 NAG . R NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 U ND2 ASN 117 U ASN 174 1_555 JA C1 NAG . U NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale7 X ND2 ASN 117 X ASN 174 1_555 KA C1 NAG . X NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale8 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale9 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale10 Y O6 MAN . Y MAN 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale11 Y O2 MAN . Y MAN 4 1_555 Y C1 NDG . Y NDG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale12 Y O4 NDG . Y NDG 5 1_555 Y C1 GAL . Y GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale13 Y O6 GAL . Y GAL 6 1_555 Y C2 SIA . Y SIA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale14 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale15 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale16 Z O6 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale17 Z O2 BMA . Z BMA 4 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale18 Z O4 NAG . Z NAG 5 1_555 Z C1 GAL . Z GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale19 Z O6 GAL . Z GAL 6 1_555 Z C2 SIA . Z SIA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale20 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 MAN . a MAN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale21 AA O6 MAN . a MAN 2 1_555 AA C1 MAN . a MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale22 AA O2 MAN . a MAN 3 1_555 AA C1 NDG . a NDG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale23 AA O4 NDG . a NDG 4 1_555 AA C1 GLA . a GLA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale24 AA O6 GLA . a GLA 5 1_555 AA C2 SIA . a SIA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale25 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale26 BA O4 NAG . b NAG 2 1_555 BA C1 MAN . b MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale27 BA O6 MAN . b MAN 3 1_555 BA C1 MAN . b MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale28 BA O2 MAN . b MAN 4 1_555 BA C1 NAG . b NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale29 BA O4 NAG . b NAG 5 1_555 BA C1 GLA . b GLA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale30 BA O6 GLA . b GLA 6 1_555 BA C2 SIA . b SIA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale31 CA O6 BMA . c BMA 1 1_555 CA C1 BMA . c BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale32 CA O2 BMA . c BMA 2 1_555 CA C1 NDG . c NDG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 CA O4 NDG . c NDG 3 1_555 CA C1 GAL . c GAL 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale34 CA O6 GAL . c GAL 4 1_555 CA C2 SIA . c SIA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale35 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale36 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 MAN . d MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale37 DA O6 MAN . d MAN 3 1_555 DA C1 BMA . d BMA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale38 DA O2 BMA . d BMA 4 1_555 DA C1 NDG . d NDG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale39 DA O4 NDG . d NDG 5 1_555 DA C1 GAL . d GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale40 DA O6 GAL . d GAL 6 1_555 DA C2 SIA . d SIA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale41 EA O6 MAN . e MAN 1 1_555 EA C1 BMA . e BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale42 EA O2 BMA . e BMA 2 1_555 EA C1 NDG . e NDG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale43 EA O4 NDG . e NDG 3 1_555 EA C1 GAL . e GAL 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale44 EA O6 GAL . e GAL 4 1_555 EA C2 SIA . e SIA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale45 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale46 FA O4 NAG . f NAG 2 1_555 FA C1 BMA . f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale47 FA O6 BMA . f BMA 3 1_555 FA C1 MAN . f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale48 FA O2 MAN . f MAN 4 1_555 FA C1 NDG . f NDG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale49 FA O4 NDG . f NDG 5 1_555 FA C1 GAL . f GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale50 FA O6 GAL . f GAL 6 1_555 FA C2 SIA . f SIA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 331 n n C1 O1 NAG sing 332 n n C1 O5 NAG sing 333 n n C1 H1 NAG sing 334 n n C2 C3 NAG sing 335 n n C2 N2 NAG sing 336 n n C2 H2 NAG sing 337 n n C3 C4 NAG sing 338 n n C3 O3 NAG sing 339 n n C3 H3 NAG sing 340 n n C4 C5 NAG sing 341 n n C4 O4 NAG sing 342 n n C4 H4 NAG sing 343 n n C5 C6 NAG sing 344 n n C5 O5 NAG sing 345 n n C5 H5 NAG sing 346 n n C6 O6 NAG sing 347 n n C6 H61 NAG sing 348 n n C6 H62 NAG sing 349 n n C7 C8 NAG sing 350 n n C7 N2 NAG sing 351 n n C7 O7 NAG doub 352 n n C8 H81 NAG sing 353 n n C8 H82 NAG sing 354 n n C8 H83 NAG sing 355 n n N2 HN2 NAG sing 356 n n O1 HO1 NAG sing 357 n n O3 HO3 NAG sing 358 n n O4 HO4 NAG sing 359 n n O6 HO6 NAG sing 360 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6P3S _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007381 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005341 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.002921 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code GA 12 NAG L 1 306 307 NAG NAG . HA 12 NAG O 1 301 301 NAG NAG . IA 12 NAG R 1 301 301 NAG NAG . JA 12 NAG U 1 301 301 NAG NAG . KA 12 NAG X 1 301 301 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . HA 12 -15.207 -0.406 -71.31 1 65.44 ? C1 NAG 301 O 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . HA 12 -16.617 0.191 -71.364 1 58.87 ? C2 NAG 301 O 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . HA 12 -17.582 -0.781 -72.038 1 65.05 ? C3 NAG 301 O 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . HA 12 -17.055 -1.189 -73.407 1 73.08 ? C4 NAG 301 O 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . HA 12 -15.648 -1.76 -73.27 1 68.49 ? C5 NAG 301 O 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . HA 12 -15.013 -2.086 -74.602 1 58.22 ? C6 NAG 301 O 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . HA 12 -16.97 1.762 -69.51 1 56.88 ? C7 NAG 301 O 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . HA 12 -17.521 1.942 -68.128 1 50.57 ? C8 NAG 301 O 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . HA 12 -17.091 0.538 -70.034 1 52.95 ? N2 NAG 301 O 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . HA 12 -18.857 -0.164 -72.175 1 67.02 ? O3 NAG 301 O 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . HA 12 -17.908 -2.167 -73.99 1 75.76 ? O4 NAG 301 O 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . HA 12 -14.795 -0.797 -72.633 1 73.61 ? O5 NAG 301 O 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . HA 12 -14.999 -0.954 -75.461 1 34.89 ? O6 NAG 301 O 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . HA 12 -16.439 2.682 -70.124 1 65.66 ? O7 NAG 301 O 1 # _model_server_stats.io_time_ms 68 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 56 _model_server_stats.query_time_ms 287 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #