data_6P62 # _model_server_result.job_id IDTOTcePK5uELgPMOTfhpA _model_server_result.datetime_utc '2025-08-31 23:01:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6p62 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":718}' # _entry.id 6P62 # _exptl.entry_id 6P62 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 27 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 5 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 6 ? 5 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 7 ? 5 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 8 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 10 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 I 1 NAG A 1156 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG A 1157 NAG 5 n K NAG 1 J 1 NAG A 1234 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG A 1235 NAG 5 n K BMA 3 J 3 BMA A 1236 BMA 5 n K MAN 4 J 4 MAN A 1238 MAN 5 n K MAN 5 J 5 MAN A 1239 MAN 5 n K MAN 6 J 6 MAN A 1240 MAN 5 n K MAN 7 J 7 MAN A 1237 MAN 6 n L NAG 1 K 1 NAG A 1262 NAG 6 n L NAG 2 K 2 NAG A 1263 NAG 6 n L BMA 3 K 3 BMA A 1264 BMA 6 n L MAN 4 K 4 MAN A 1265 MAN 4 n M NAG 1 M 1 NAG A 1276 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG A 1277 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG A 1363 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG A 1364 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG A 1386 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG A 1387 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG B 1156 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG B 1157 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1234 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1235 NAG 5 n Q BMA 3 Q 3 BMA B 1236 BMA 5 n Q MAN 4 Q 4 MAN B 1238 MAN 5 n Q MAN 5 Q 5 MAN B 1239 MAN 5 n Q MAN 6 Q 6 MAN B 1240 MAN 5 n Q MAN 7 Q 7 MAN B 1237 MAN 6 n R NAG 1 R 1 NAG B 1262 NAG 6 n R NAG 2 R 2 NAG B 1263 NAG 6 n R BMA 3 R 3 BMA B 1264 BMA 6 n R MAN 4 R 4 MAN B 1265 MAN 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 1276 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 1277 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG B 1363 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG B 1364 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG B 1386 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG B 1387 NAG 4 n V NAG 1 V 1 NAG E 1156 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG E 1157 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG E 1234 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG E 1235 NAG 5 n W BMA 3 W 3 BMA E 1236 BMA 5 n W MAN 4 W 4 MAN E 1238 MAN 5 n W MAN 5 W 5 MAN E 1239 MAN 5 n W MAN 6 W 6 MAN E 1240 MAN 5 n W MAN 7 W 7 MAN E 1237 MAN 6 n X NAG 1 X 1 NAG E 1262 NAG 6 n X NAG 2 X 2 NAG E 1263 NAG 6 n X BMA 3 X 3 BMA E 1264 BMA 6 n X MAN 4 X 4 MAN E 1265 MAN 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG E 1276 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG E 1277 NAG 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG E 1363 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG E 1364 NAG 4 n AA NAG 1 a 1 NAG E 1386 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG E 1387 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 113 A CYS 119 1_555 A SG CYS 199 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 120 A CYS 126 1_555 A SG CYS 190 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 125 A CYS 131 1_555 A SG CYS 143 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 195 A CYS 201 1_555 A SG CYS 425 A CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 212 A CYS 218 1_555 A SG CYS 241 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 222 A CYS 228 1_555 A SG CYS 233 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 290 A CYS 296 1_555 A SG CYS 324 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 371 A CYS 378 1_555 A SG CYS 437 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 378 A CYS 385 1_555 A SG CYS 410 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 596 A CYS 598 1_555 A SG CYS 602 A CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 21 H CYS 22 1_555 B SG CYS 95 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 35 H CYS 35 1_555 B SG CYS 50 H CYS 50 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 23 L CYS 23 1_555 C SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 113 B CYS 119 1_555 D SG CYS 199 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 120 B CYS 126 1_555 D SG CYS 190 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 125 B CYS 131 1_555 D SG CYS 143 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 195 B CYS 201 1_555 D SG CYS 425 B CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 212 B CYS 218 1_555 D SG CYS 241 B CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 222 B CYS 228 1_555 D SG CYS 233 B CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 290 B CYS 296 1_555 D SG CYS 324 B CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf21 D SG CYS 371 B CYS 378 1_555 D SG CYS 437 B CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 378 B CYS 385 1_555 D SG CYS 410 B CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 596 B CYS 598 1_555 D SG CYS 602 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 21 C CYS 22 1_555 E SG CYS 95 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 35 C CYS 35 1_555 E SG CYS 50 C CYS 50 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 23 D CYS 23 1_555 F SG CYS 88 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 113 E CYS 119 1_555 G SG CYS 199 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 120 E CYS 126 1_555 G SG CYS 190 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 125 E CYS 131 1_555 G SG CYS 143 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 195 E CYS 201 1_555 G SG CYS 425 E CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 212 E CYS 218 1_555 G SG CYS 241 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? disulf ? disulf32 G SG CYS 222 E CYS 228 1_555 G SG CYS 233 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf33 G SG CYS 290 E CYS 296 1_555 G SG CYS 324 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf34 G SG CYS 371 E CYS 378 1_555 G SG CYS 437 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 G SG CYS 378 E CYS 385 1_555 G SG CYS 410 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf36 G SG CYS 596 E CYS 598 1_555 G SG CYS 602 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 H SG CYS 21 F CYS 22 1_555 H SG CYS 95 F CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf38 H SG CYS 35 F CYS 35 1_555 H SG CYS 50 F CYS 50 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf39 I SG CYS 23 G CYS 23 1_555 I SG CYS 88 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 127 A ASN 133 1_555 GA C1 NAG . A NAG 721 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 142 A ASN 156 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 146 A ASN 160 1_555 BA C1 NAG . A NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 191 A ASN 197 1_555 CA C1 NAG . A NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.383 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 228 A ASN 234 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 256 A ASN 262 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 270 A ASN 276 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 289 A ASN 295 1_555 DA C1 NAG . A NAG 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 295 A ASN 301 1_555 EA C1 NAG . A NAG 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 325 A ASN 332 1_555 FA C1 NAG . A NAG 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 332 A ASN 339 1_555 HA C1 NAG . A NAG 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 356 A ASN 363 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 379 A ASN 386 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 385 A ASN 392 1_555 IA C1 NAG . A NAG 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 440 A ASN 448 1_555 JA C1 NAG . A NAG 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 127 B ASN 133 1_555 PA C1 NAG . B NAG 721 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 142 B ASN 156 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 146 B ASN 160 1_555 KA C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 191 B ASN 197 1_555 LA C1 NAG . B NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 228 B ASN 234 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 256 B ASN 262 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 270 B ASN 276 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 289 B ASN 295 1_555 MA C1 NAG . B NAG 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 295 B ASN 301 1_555 NA C1 NAG . B NAG 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 325 B ASN 332 1_555 OA C1 NAG . B NAG 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 332 B ASN 339 1_555 QA C1 NAG . B NAG 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 356 B ASN 363 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 379 B ASN 386 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 385 B ASN 392 1_555 RA C1 NAG . B NAG 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 440 B ASN 448 1_555 SA C1 NAG . B NAG 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale31 G ND2 ASN 127 E ASN 133 1_555 YA C1 NAG . E NAG 721 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale32 G ND2 ASN 142 E ASN 156 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 146 E ASN 160 1_555 TA C1 NAG . E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale34 G ND2 ASN 191 E ASN 197 1_555 UA C1 NAG . E NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? covale ? covale35 G ND2 ASN 228 E ASN 234 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 256 E ASN 262 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale37 G ND2 ASN 270 E ASN 276 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale38 G ND2 ASN 289 E ASN 295 1_555 VA C1 NAG . E NAG 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale39 G ND2 ASN 295 E ASN 301 1_555 WA C1 NAG . E NAG 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale40 G ND2 ASN 325 E ASN 332 1_555 XA C1 NAG . E NAG 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale41 G ND2 ASN 332 E ASN 339 1_555 ZA C1 NAG . E NAG 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale42 G ND2 ASN 356 E ASN 363 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale43 G ND2 ASN 379 E ASN 386 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 385 E ASN 392 1_555 AB C1 NAG . E NAG 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 440 E ASN 448 1_555 BB C1 NAG . E NAG 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale46 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale47 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale48 K O4 NAG . J NAG 2 1_555 K C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale49 K O3 BMA . J BMA 3 1_555 K C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale50 K O6 BMA . J BMA 3 1_555 K C1 MAN . J MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale51 K O2 MAN . J MAN 4 1_555 K C1 MAN . J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale52 K O2 MAN . J MAN 5 1_555 K C1 MAN . J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale53 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale54 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale55 L O3 BMA . K BMA 3 1_555 L C1 MAN . K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale56 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale57 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale58 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale59 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale60 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale61 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale62 Q O3 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale63 Q O6 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale64 Q O2 MAN . Q MAN 4 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale65 Q O2 MAN . Q MAN 5 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale66 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale67 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale68 R O3 BMA . R BMA 3 1_555 R C1 MAN . R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale69 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale70 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale71 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale72 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale73 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale74 W O4 NAG . W NAG 2 1_555 W C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale75 W O3 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale76 W O6 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? covale ? covale77 W O2 MAN . W MAN 4 1_555 W C1 MAN . W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale78 W O2 MAN . W MAN 5 1_555 W C1 MAN . W MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale79 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale80 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale81 X O3 BMA . X BMA 3 1_555 X C1 MAN . X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale82 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale83 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale84 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6P62 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code BA 7 NAG A 1 703 1160 NAG NAG . CA 7 NAG A 1 704 1197 NAG NAG . DA 7 NAG A 1 718 1295 NAG NAG . EA 7 NAG A 1 719 1301 NAG NAG . FA 7 NAG A 1 720 1332 NAG NAG . GA 7 NAG A 1 721 1333 NAG NAG . HA 7 NAG A 1 722 1339 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 727 1392 NAG NAG . JA 7 NAG A 1 728 1448 NAG NAG . KA 7 NAG B 1 703 1160 NAG NAG . LA 7 NAG B 1 704 1197 NAG NAG . MA 7 NAG B 1 718 1295 NAG NAG . NA 7 NAG B 1 719 1301 NAG NAG . OA 7 NAG B 1 720 1332 NAG NAG . PA 7 NAG B 1 721 1333 NAG NAG . QA 7 NAG B 1 722 1339 NAG NAG . RA 7 NAG B 1 727 1392 NAG NAG . SA 7 NAG B 1 728 1448 NAG NAG . TA 7 NAG E 1 703 1160 NAG NAG . UA 7 NAG E 1 704 1197 NAG NAG . VA 7 NAG E 1 718 1295 NAG NAG . WA 7 NAG E 1 719 1301 NAG NAG . XA 7 NAG E 1 720 1332 NAG NAG . YA 7 NAG E 1 721 1333 NAG NAG . ZA 7 NAG E 1 722 1339 NAG NAG . AB 7 NAG E 1 727 1392 NAG NAG . BB 7 NAG E 1 728 1448 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . DA 7 186.751 122.447 134.81 1 47.68 ? C1 NAG 718 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . DA 7 187.601 121.243 134.535 1 51.42 ? C2 NAG 718 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . DA 7 188.673 121.157 135.54 1 51.6 ? C3 NAG 718 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . DA 7 189.524 122.466 135.503 1 54.53 ? C4 NAG 718 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . DA 7 188.569 123.643 135.813 1 52.15 ? C5 NAG 718 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . DA 7 189.32 124.927 135.951 1 56.6 ? C6 NAG 718 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . DA 7 186.319 119.343 133.677 1 45.81 ? C7 NAG 718 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . DA 7 185.443 118.177 134.012 1 43.04 ? C8 NAG 718 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . DA 7 186.771 120.052 134.685 1 46.93 ? N2 NAG 718 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . DA 7 189.493 119.996 135.26 1 53.29 ? O3 NAG 718 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . DA 7 190.526 122.431 136.466 1 58.39 ? O4 NAG 718 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . DA 7 187.576 123.747 134.807 1 49.17 ? O5 NAG 718 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . DA 7 190.257 124.79 137.008 1 62.08 ? O6 NAG 718 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . DA 7 186.608 119.638 132.512 1 45.89 ? O7 NAG 718 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 471 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 14 #