data_6PAW # _model_server_result.job_id koHdPXRjMjor_KUUhVJYrA _model_server_result.datetime_utc '2025-02-05 16:55:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6paw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":201}' # _entry.id 6PAW # _exptl.entry_id 6PAW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6PAW _cell.length_a 89.44 _cell.length_b 95.88 _cell.length_c 263.3 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6PAW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,I,J,K,L 1 1 B,H,P,Q 2 1 D,G,O 3 1 E,F,M,N 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C OD1 ASP 21 D ASP 21 1_555 I CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.143 ? metalc ? metalc2 C OD1 ASP 23 D ASP 23 1_555 I CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc ? metalc3 C OD1 ASP 25 D ASP 25 1_555 I CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc4 C OD2 ASP 25 D ASP 25 1_555 I CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.183 ? metalc ? metalc5 C OE1 GLU 32 D GLU 32 1_555 I CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc ? metalc6 C OE2 GLU 32 D GLU 32 1_555 I CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? metalc ? metalc7 C OD1 ASP 57 D ASP 57 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.017 ? metalc ? metalc8 C OD1 ASP 59 D ASP 59 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASN 61 D ASN 61 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc10 C O THR 63 D THR 63 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc11 C OE1 GLU 68 D GLU 68 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc12 C OE2 GLU 68 D GLU 68 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc13 C OD1 ASP 94 D ASP 94 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.168 ? metalc ? metalc14 C OD1 ASP 96 D ASP 96 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? metalc ? metalc15 C OD2 ASP 96 D ASP 96 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc ? metalc16 C OD1 ASN 98 D ASN 98 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc17 C O TYR 100 D TYR 100 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc18 C OE1 GLU 105 D GLU 105 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? metalc ? metalc19 C OE2 GLU 105 D GLU 105 1_555 K CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc20 C OD1 ASP 130 D ASP 130 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? metalc ? metalc21 C OD1 ASP 132 D ASP 132 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? metalc ? metalc22 C OD2 ASP 132 D ASP 132 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc23 C OD1 ASP 134 D ASP 134 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc24 C O GLN 136 D GLN 136 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc25 C OD1 ASN 138 D ASN 138 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.047 ? metalc ? metalc26 C OE1 GLU 141 D GLU 141 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc27 C OE2 GLU 141 D GLU 141 1_555 L CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc28 F OD2 ASP 96 G ASP 96 1_555 M CA CA . G CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc ? metalc29 F OD1 ASN 98 G ASN 98 1_555 M CA CA . G CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? metalc ? metalc30 F O TYR 100 G TYR 100 1_555 M CA CA . G CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc31 F OE2 GLU 105 G GLU 105 1_555 M CA CA . G CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.978 ? metalc ? metalc32 F OD1 ASP 130 G ASP 130 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? metalc ? metalc33 F OD1 ASP 132 G ASP 132 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc ? metalc34 F OD2 ASP 132 G ASP 132 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? metalc ? metalc35 F OD1 ASP 134 G ASP 134 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc36 F O GLN 136 G GLN 136 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc37 F OE1 GLU 141 G GLU 141 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc38 F OE2 GLU 141 G GLU 141 1_555 N CA CA . G CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.978 ? metalc ? metalc39 G OD1 ASP 130 H ASP 130 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc40 G OD1 ASP 132 H ASP 132 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc41 G OD1 ASP 134 H ASP 134 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc42 G OD2 ASP 134 H ASP 134 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc43 G O GLN 136 H GLN 136 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc44 G OE1 GLU 141 H GLU 141 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc45 G OE2 GLU 141 H GLU 141 1_555 O CA CA . H CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc46 H OD1 ASP 94 C ASP 94 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc ? metalc47 H OD1 ASP 96 C ASP 96 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc48 H OD2 ASP 96 C ASP 96 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc49 H OD1 ASN 98 C ASN 98 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc50 H O TYR 100 C TYR 100 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc51 H OE1 GLU 105 C GLU 105 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.115 ? metalc ? metalc52 H OE2 GLU 105 C GLU 105 1_555 P CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc53 H OD1 ASP 130 C ASP 130 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.165 ? metalc ? metalc54 H OD1 ASP 132 C ASP 132 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc55 H OD2 ASP 132 C ASP 132 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc56 H OD1 ASP 134 C ASP 134 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc57 H OD2 ASP 134 C ASP 134 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? metalc ? metalc58 H O GLN 136 C GLN 136 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.174 ? metalc ? metalc59 H OE2 GLU 141 C GLU 141 1_555 Q CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6PAW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011181 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01043 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003798 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 CA D 1 201 152 CA CA . J 3 CA D 1 202 153 CA CA . K 3 CA D 1 203 154 CA CA . L 3 CA D 1 204 155 CA CA . M 3 CA G 1 201 154 CA CA . N 3 CA G 1 202 155 CA CA . O 3 CA H 1 201 155 CA CA . P 3 CA C 1 201 154 CA CA . Q 3 CA C 1 202 155 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id I _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -48.542 _atom_site.Cartn_y -5.691 _atom_site.Cartn_z -58.945 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 59.67 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 318 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #