data_6PZ8 # _model_server_result.job_id 8DVi4ET8wyvuI0Mr3GdGAQ _model_server_result.datetime_utc '2025-09-03 13:14:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6pz8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":801}' # _entry.id 6PZ8 # _exptl.entry_id 6PZ8 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 18 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 7 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 1402 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG A 1403 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 1404 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 1405 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG A 1406 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG A 1407 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG A 1408 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG A 1409 NAG 6 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 421 NAG 6 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 422 NAG 6 n Q BMA 3 Q 3 BMA B 423 BMA 5 n R NAG 1 R 1 NAG B 441 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG B 442 NAG 7 n S NAG 1 S 1 NAG B 451 NAG 7 n S NAG 2 S 2 NAG B 452 NAG 7 n S BMA 3 S 3 BMA B 453 BMA 7 n S MAN 4 S 4 MAN B 454 MAN 7 n S MAN 5 S 5 MAN B 455 MAN 5 n T NAG 1 T 1 NAG B 461 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG B 462 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG E 1402 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG E 1403 NAG 5 n V NAG 1 V 1 NAG E 1404 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG E 1405 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG E 1406 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG E 1407 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG E 1408 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG E 1409 NAG 6 n Y NAG 1 Y 1 NAG J 421 NAG 6 n Y NAG 2 Y 2 NAG J 422 NAG 6 n Y BMA 3 Y 3 BMA J 423 BMA 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG J 441 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG J 442 NAG 7 n AA NAG 1 a 1 NAG J 451 NAG 7 n AA NAG 2 a 2 NAG J 452 NAG 7 n AA BMA 3 a 3 BMA J 453 BMA 7 n AA MAN 4 a 4 MAN J 454 MAN 7 n AA MAN 5 a 5 MAN J 455 MAN 5 n BA NAG 1 b 1 NAG J 461 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG J 462 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG I 1402 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG I 1403 NAG 5 n DA NAG 1 d 1 NAG I 1404 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG I 1405 NAG 5 n EA NAG 1 e 1 NAG I 1406 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG I 1407 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG I 1408 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG I 1409 NAG 6 n GA NAG 1 g 1 NAG F 421 NAG 6 n GA NAG 2 g 2 NAG F 422 NAG 6 n GA BMA 3 g 3 BMA F 423 BMA 5 n HA NAG 1 h 1 NAG F 441 NAG 5 n HA NAG 2 h 2 NAG F 442 NAG 7 n IA NAG 1 i 1 NAG F 451 NAG 7 n IA NAG 2 i 2 NAG F 452 NAG 7 n IA BMA 3 i 3 BMA F 453 BMA 7 n IA MAN 4 i 4 MAN F 454 MAN 7 n IA MAN 5 i 5 MAN F 455 MAN 5 n JA NAG 1 j 1 NAG F 461 NAG 5 n JA NAG 2 j 2 NAG F 462 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 55 A CYS 806 1_555 A SG CYS 77 A CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 161 A CYS 912 1_555 A SG CYS 174 A CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 405 A CYS 1156 1_555 A SG CYS 413 A CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 13 B CYS 30 1_555 B SG CYS 178 B CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 159 B CYS 176 1_555 B SG CYS 197 B CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 168 B CYS 185 1_555 B SG CYS 220 B CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 322 B CYS 339 1_555 B SG CYS 332 B CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 586 B CYS 603 1_555 B SG CYS 637 B CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 603 B CYS 620 1_555 B SG CYS 633 B CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 662 B CYS 679 1_555 B SG CYS 696 B CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 710 B CYS 727 1_555 B SG CYS 719 B CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 22 H CYS 22 1_555 C SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 D SG CYS 23 L CYS 23 1_555 D SG CYS 92 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 55 E CYS 806 1_555 E SG CYS 77 E CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 161 E CYS 912 1_555 E SG CYS 174 E CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 405 E CYS 1156 1_555 E SG CYS 413 E CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf17 F SG CYS 13 J CYS 30 1_555 F SG CYS 178 J CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 159 J CYS 176 1_555 F SG CYS 197 J CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf19 F SG CYS 168 J CYS 185 1_555 F SG CYS 220 J CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 322 J CYS 339 1_555 F SG CYS 332 J CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 586 J CYS 603 1_555 F SG CYS 637 J CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 603 J CYS 620 1_555 F SG CYS 633 J CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 662 J CYS 679 1_555 F SG CYS 696 J CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 710 J CYS 727 1_555 F SG CYS 719 J CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 22 C CYS 22 1_555 G SG CYS 96 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 H SG CYS 23 G CYS 23 1_555 H SG CYS 92 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 55 I CYS 806 1_555 I SG CYS 77 I CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 161 I CYS 912 1_555 I SG CYS 174 I CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 405 I CYS 1156 1_555 I SG CYS 413 I CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 13 F CYS 30 1_555 J SG CYS 178 F CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf31 J SG CYS 159 F CYS 176 1_555 J SG CYS 197 F CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf32 J SG CYS 168 F CYS 185 1_555 J SG CYS 220 F CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 J SG CYS 322 F CYS 339 1_555 J SG CYS 332 F CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf34 J SG CYS 586 F CYS 603 1_555 J SG CYS 637 F CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf35 J SG CYS 603 F CYS 620 1_555 J SG CYS 633 F CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf36 J SG CYS 662 F CYS 679 1_555 J SG CYS 696 F CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf37 J SG CYS 710 F CYS 727 1_555 J SG CYS 719 F CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 22 D CYS 22 1_555 K SG CYS 96 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf39 L SG CYS 23 K CYS 23 1_555 L SG CYS 92 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 23 A ASN 774 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 34 A ASN 785 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 119 A ASN 870 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 425 A ASN 1176 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 462 A ASN 1213 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale6 B ND2 ASN 49 B ASN 66 1_555 NA C1 NAG . B NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 108 B ASN 125 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale8 B ND2 ASN 138 B ASN 155 1_555 OA C1 NAG . B NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 149 B ASN 166 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 205 B ASN 222 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 219 B ASN 236 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 227 B ASN 244 1_555 PA C1 NAG . B NAG 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 602 B ASN 619 1_555 MA C1 NAG . B NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 702 B ASN 719 1_555 LA C1 NAG . B NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale15 E ND2 ASN 23 E ASN 774 1_555 QA C1 NAG . E NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale16 E ND2 ASN 34 E ASN 785 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale17 E ND2 ASN 119 E ASN 870 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 425 E ASN 1176 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 462 E ASN 1213 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale20 F ND2 ASN 49 J ASN 66 1_555 TA C1 NAG . J NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 108 J ASN 125 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 138 J ASN 155 1_555 UA C1 NAG . J NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale23 F ND2 ASN 149 J ASN 166 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale24 F ND2 ASN 205 J ASN 222 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale25 F ND2 ASN 219 J ASN 236 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale26 F ND2 ASN 227 J ASN 244 1_555 VA C1 NAG . J NAG 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale27 F ND2 ASN 602 J ASN 619 1_555 SA C1 NAG . J NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale28 F ND2 ASN 702 J ASN 719 1_555 RA C1 NAG . J NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale29 I ND2 ASN 23 I ASN 774 1_555 WA C1 NAG . I NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale30 I ND2 ASN 34 I ASN 785 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale31 I ND2 ASN 119 I ASN 870 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale32 I ND2 ASN 425 I ASN 1176 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale33 I ND2 ASN 462 I ASN 1213 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale34 J ND2 ASN 49 F ASN 66 1_555 ZA C1 NAG . F NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale35 J ND2 ASN 108 F ASN 125 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale36 J ND2 ASN 138 F ASN 155 1_555 AB C1 NAG . F NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale37 J ND2 ASN 149 F ASN 166 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale38 J ND2 ASN 205 F ASN 222 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale39 J ND2 ASN 219 F ASN 236 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale40 J ND2 ASN 227 F ASN 244 1_555 BB C1 NAG . F NAG 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale41 J ND2 ASN 602 F ASN 619 1_555 YA C1 NAG . F NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale42 J ND2 ASN 702 F ASN 719 1_555 XA C1 NAG . F NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale43 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale44 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale45 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale46 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale47 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale48 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale49 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale50 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale51 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale52 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale53 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale54 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale55 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale56 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale57 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale58 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale59 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale60 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale61 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale62 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale63 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale64 AA O3 BMA . a BMA 3 1_555 AA C1 MAN . a MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale65 AA O6 BMA . a BMA 3 1_555 AA C1 MAN . a MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale66 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale67 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale68 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale69 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale70 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale71 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale72 GA O4 NAG . g NAG 2 1_555 GA C1 BMA . g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale73 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale74 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale75 IA O4 NAG . i NAG 2 1_555 IA C1 BMA . i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale76 IA O3 BMA . i BMA 3 1_555 IA C1 MAN . i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale77 IA O6 BMA . i BMA 3 1_555 IA C1 MAN . i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale78 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6PZ8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code KA 8 NAG A 1 1401 1401 NAG NAG . LA 8 NAG B 1 801 1402 NAG NAG . MA 8 NAG B 1 802 1405 NAG NAG . NA 8 NAG B 1 803 401 NAG NAG . OA 8 NAG B 1 807 431 NAG NAG . PA 8 NAG B 1 817 471 NAG NAG . QA 8 NAG E 1 1401 1401 NAG NAG . RA 8 NAG J 1 801 1402 NAG NAG . SA 8 NAG J 1 802 1405 NAG NAG . TA 8 NAG J 1 803 401 NAG NAG . UA 8 NAG J 1 807 431 NAG NAG . VA 8 NAG J 1 817 471 NAG NAG . WA 8 NAG I 1 1401 1401 NAG NAG . XA 8 NAG F 1 801 1402 NAG NAG . YA 8 NAG F 1 802 1405 NAG NAG . ZA 8 NAG F 1 803 401 NAG NAG . AB 8 NAG F 1 807 431 NAG NAG . BB 8 NAG F 1 817 471 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . LA 8 178.772 223.21 148.174 1 191.91 ? C1 NAG 801 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . LA 8 177.518 222.91 149.04 1 200.26 ? C2 NAG 801 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . LA 8 176.374 222.605 148.067 1 202.16 ? C3 NAG 801 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . LA 8 176.166 223.834 147.177 1 200.64 ? C4 NAG 801 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . LA 8 177.454 224.098 146.399 1 192.9 ? C5 NAG 801 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . LA 8 177.312 225.318 145.529 1 184.79 ? C6 NAG 801 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . LA 8 178.06 221.906 151.208 1 204.28 ? C7 NAG 801 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . LA 8 178.241 220.67 152.039 1 210.24 ? C8 NAG 801 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . LA 8 177.747 221.763 149.925 1 199.55 ? N2 NAG 801 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . LA 8 175.172 222.309 148.785 1 202.99 ? O3 NAG 801 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . LA 8 175.099 223.598 146.269 1 200.01 ? O4 NAG 801 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . LA 8 178.544 224.33 147.315 1 188.4 ? O5 NAG 801 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . LA 8 176.151 225.231 144.717 1 186.3 ? O6 NAG 801 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . LA 8 178.196 223.037 151.693 1 200.2 ? O7 NAG 801 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 18 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 39 _model_server_stats.query_time_ms 330 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #