data_6Q82 # _model_server_result.job_id 3c8g3M4GFOe__NUc7yQwdA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-25 20:25:28' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6q82 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":218}' # _entry.id 6Q82 # _exptl.entry_id 6Q82 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6Q82 _cell.length_a 192.99 _cell.length_b 192.99 _cell.length_c 229.17 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6Q82 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 182 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ASN 101 A ASN 102 1_555 A N MSE 102 A MSE 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale2 A C MSE 102 A MSE 103 1_555 A N TYR 103 A TYR 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale3 A C LEU 113 A LEU 114 1_555 A N MSE 114 A MSE 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale4 A C MSE 114 A MSE 115 1_555 A N SER 115 A SER 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale5 A C ASN 136 A ASN 137 1_555 A N MSE 137 A MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale6 A C MSE 137 A MSE 138 1_555 A N ILE 138 A ILE 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale7 A C LEU 151 A LEU 152 1_555 A N MSE 152 A MSE 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale8 A C MSE 152 A MSE 153 1_555 A N SER 153 A SER 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale9 A C SER 212 A SER 213 1_555 A N MSE 213 A MSE 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale10 A C MSE 213 A MSE 214 1_555 A N SER 214 A SER 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale11 A C THR 228 A THR 229 1_555 A N MSE 229 A MSE 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale12 A C MSE 229 A MSE 230 1_555 A N ALA 230 A ALA 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale13 A C ARG 268 A ARG 269 1_555 A N MSE 269 A MSE 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale14 A C MSE 269 A MSE 270 1_555 A N ASP 270 A ASP 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale15 A C LEU 281 A LEU 282 1_555 A N MSE 282 A MSE 283 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale16 A C MSE 282 A MSE 283 1_555 A N TYR 283 A TYR 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale17 A C LEU 312 A LEU 313 1_555 A N MSE 313 A MSE 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale18 A C MSE 313 A MSE 314 1_555 A N SER 314 A SER 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale19 A C TRP 344 A TRP 345 1_555 A N MSE 345 A MSE 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale20 A C MSE 345 A MSE 346 1_555 A N LEU 346 A LEU 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale21 A C TYR 348 A TYR 349 1_555 A N MSE 349 A MSE 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale22 A C MSE 349 A MSE 350 1_555 A N ASN 350 A ASN 351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale23 A C GLN 409 A GLN 410 1_555 A N MSE 410 A MSE 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale24 A C MSE 410 A MSE 411 1_555 A N THR 411 A THR 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale25 A C ARG 426 A ARG 427 1_555 A N MSE 427 A MSE 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale26 A C MSE 427 A MSE 428 1_555 A N VAL 428 A VAL 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale27 A C GLY 520 A GLY 521 1_555 A N MSE 521 A MSE 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale28 A C MSE 521 A MSE 522 1_555 A N GLY 522 A GLY 523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale29 A C GLN 523 A GLN 524 1_555 A N MSE 524 A MSE 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale30 A C MSE 524 A MSE 525 1_555 A N PRO 525 A PRO 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale31 A C THR 545 A THR 546 1_555 A N MSE 546 A MSE 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale32 A C MSE 546 A MSE 547 1_555 A N CYS 547 A CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale33 A C ASP 556 A ASP 557 1_555 A N MSE 557 A MSE 558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale34 A C MSE 557 A MSE 558 1_555 A N THR 558 A THR 559 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale35 A C VAL 658 A VAL 659 1_555 A N MSE 659 A MSE 660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale36 A C MSE 659 A MSE 660 1_555 A N VAL 660 A VAL 661 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale37 A C LEU 679 A LEU 680 1_555 A N MSE 680 A MSE 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale38 A C MSE 680 A MSE 681 1_555 A N HIS 681 A HIS 682 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale39 A C ILE 690 A ILE 691 1_555 A N MSE 691 A MSE 692 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale40 A C MSE 691 A MSE 692 1_555 A N PRO 692 A PRO 693 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale41 A C ILE 803 A ILE 804 1_555 A N MSE 804 A MSE 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale42 A C MSE 804 A MSE 805 1_555 A N CYS 805 A CYS 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale43 A C ASN 847 A ASN 848 1_555 A N MSE 848 A MSE 849 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale44 A C MSE 848 A MSE 849 1_555 A N SER 849 A SER 850 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale45 A C VAL 851 A VAL 852 1_555 A N MSE 852 A MSE 853 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale46 A C MSE 852 A MSE 853 1_555 A N ASN 853 A ASN 854 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale47 A C PHE 893 A PHE 894 1_555 A N MSE 894 A MSE 895 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale48 A C MSE 894 A MSE 895 1_555 A N PHE 895 A PHE 896 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale49 A C GLN 915 A GLN 916 1_555 A N MSE 916 A MSE 917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale50 A C MSE 916 A MSE 917 1_555 A N THR 917 A THR 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale51 A C ILE 997 A ILE 998 1_555 A N MSE 998 A MSE 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale52 A C MSE 998 A MSE 999 1_555 A N TYR 999 A TYR 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? metalc ? metalc1 B OG1 THR 20 B THR 24 1_555 D MG MG . B MG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc2 B OG1 THR 38 B THR 42 1_555 D MG MG . B MG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc ? metalc3 C O3G GTP . B GTP 217 1_555 D MG MG . B MG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc4 C O2B GTP . B GTP 217 1_555 D MG MG . B MG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6Q82 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005182 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.002992 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005983 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004364 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 GTP B 1 217 217 GTP GTP . D 4 MG B 1 218 218 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 50.437 _atom_site.Cartn_y 115.853 _atom_site.Cartn_z 115.042 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 82.51 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 218 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 136 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 294 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #