data_6QL4 # _model_server_result.job_id elw2I0fMMXTtzaPHGvTwKQ _model_server_result.datetime_utc '2025-02-05 06:08:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ql4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 6QL4 # _exptl.entry_id 6QL4 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 62.068 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-ETHANEDIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6QL4 _cell.length_a 147.4 _cell.length_b 147.4 _cell.length_c 344.68 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6QL4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 91 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 2 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C 1 1 B,D 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 812 A CYS 812 1_555 A SG CYS 821 A CYS 821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 812 B CYS 812 1_555 B SG CYS 821 B CYS 821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A C MSE 227 A MSE 227 1_555 A N MSE 228 A MSE 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale2 A C MSE 228 A MSE 228 1_555 A N PHE 229 A PHE 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale3 A C LYS 233 A LYS 233 1_555 A N MSE 234 A MSE 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale4 A C MSE 234 A MSE 234 1_555 A N ILE 235 A ILE 235 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale5 A C ASN 283 A ASN 283 1_555 A N MSE 284 A MSE 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale6 A C MSE 284 A MSE 284 1_555 A N ILE 285 A ILE 285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale7 A C LYS 428 A LYS 428 1_555 A N MSE 429 A MSE 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale8 A C MSE 429 A MSE 429 1_555 A N ASP 430 A ASP 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale9 A C VAL 502 A VAL 502 1_555 A N MSE 503 A MSE 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale10 A C MSE 503 A MSE 503 1_555 A N THR 504 A THR 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale11 A C GLN 516 A GLN 516 1_555 A N MSE 517 A MSE 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale12 A C MSE 517 A MSE 517 1_555 A N SER 518 A SER 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale13 A C PRO 547 A PRO 547 1_555 A N MSE 548 A MSE 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale14 A C MSE 548 A MSE 548 1_555 A N SER 549 A SER 549 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale15 A C ALA 737 A ALA 737 1_555 A N MSE 738 A MSE 738 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale16 A C MSE 738 A MSE 738 1_555 A N LYS 739 A LYS 739 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale17 A C VAL 754 A VAL 754 1_555 A N MSE 755 A MSE 755 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale18 A C MSE 755 A MSE 755 1_555 A N SER 756 A SER 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale19 A C GLU 844 A GLU 844 1_555 A N MSE 845 A MSE 845 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale20 A C MSE 845 A MSE 845 1_555 A N LEU 846 A LEU 846 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale21 A C HIS 864 A HIS 864 1_555 A N MSE 865 A MSE 865 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale22 A C MSE 865 A MSE 865 1_555 A N HIS 866 A HIS 866 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale23 B C ASN 226 B ASN 226 1_555 B N MSE 227 B MSE 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale24 B C MSE 227 B MSE 227 1_555 B N MSE 228 B MSE 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale25 B C MSE 228 B MSE 228 1_555 B N PHE 229 B PHE 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale26 B C LYS 233 B LYS 233 1_555 B N MSE 234 B MSE 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale27 B C MSE 234 B MSE 234 1_555 B N ILE 235 B ILE 235 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale28 B C ASN 283 B ASN 283 1_555 B N MSE 284 B MSE 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale29 B C MSE 284 B MSE 284 1_555 B N ILE 285 B ILE 285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale30 B C LYS 428 B LYS 428 1_555 B N MSE 429 B MSE 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale31 B C MSE 429 B MSE 429 1_555 B N ASP 430 B ASP 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale32 B C VAL 502 B VAL 502 1_555 B N MSE 503 B MSE 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale33 B C MSE 503 B MSE 503 1_555 B N THR 504 B THR 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale34 B C GLN 516 B GLN 516 1_555 B N MSE 517 B MSE 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale35 B C MSE 517 B MSE 517 1_555 B N SER 518 B SER 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale36 B C PRO 547 B PRO 547 1_555 B N MSE 548 B MSE 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale37 B C MSE 548 B MSE 548 1_555 B N SER 549 B SER 549 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale38 B C ALA 737 B ALA 737 1_555 B N MSE 738 B MSE 738 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale39 B C MSE 738 B MSE 738 1_555 B N LYS 739 B LYS 739 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale40 B C VAL 754 B VAL 754 1_555 B N MSE 755 B MSE 755 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale41 B C MSE 755 B MSE 755 1_555 B N SER 756 B SER 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale42 B C GLU 844 B GLU 844 1_555 B N MSE 845 B MSE 845 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale43 B C MSE 845 B MSE 845 1_555 B N LEU 846 B LEU 846 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale44 B C HIS 864 B HIS 864 1_555 B N MSE 865 B MSE 865 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale45 B C MSE 865 B MSE 865 1_555 B N HIS 866 B HIS 866 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? # _chem_comp.formula 'C2 H6 O2' _chem_comp.formula_weight 62.068 _chem_comp.id EDO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-ETHANEDIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'ETHYLENE GLYCOL' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 EDO sing 83 n n C1 C2 EDO sing 84 n n C1 H11 EDO sing 85 n n C1 H12 EDO sing 86 n n O1 HO1 EDO sing 87 n n C2 O2 EDO sing 88 n n C2 H21 EDO sing 89 n n C2 H22 EDO sing 90 n n O2 HO2 EDO sing 91 n n # _atom_sites.entry_id 6QL4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006784 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006784 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.002901 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 EDO A 1 1001 2 EDO EDO . D 2 EDO B 1 1001 1 EDO EDO . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EDO . . . D 2 -28.544 42.881 0.676 1 97.52 ? C1 EDO 1001 B 1 HETATM 2 O O1 EDO . . . D 2 -29.17 41.62 0.915 1 97.52 ? O1 EDO 1001 B 1 HETATM 3 C C2 EDO . . . D 2 -29.051 43.904 1.694 1 97.52 ? C2 EDO 1001 B 1 HETATM 4 O O2 EDO . . . D 2 -28.735 43.459 3.014 1 97.52 ? O2 EDO 1001 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 26 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 272 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 4 #