data_6QPH
#
_model_server_result.job_id            AIuLSo1SQh-xuXvIc9ijlw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-02-27 09:22:58' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6qph 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":505}' 
#
_entry.id    6QPH 
#
_exptl.entry_id    6QPH 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              536.873 
_entity.id                          14 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            BETA-CAROTENE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    23 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          91.73 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6QPH 
_cell.length_a            158.881 
_cell.length_b            100.506 
_cell.length_c            191.04 
_cell.Z_PDB               2 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6QPH 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    undecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      11 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 14 N N N 
? 14 O N N 
? 14 LA N N 
? 14 HB N N 
? 14 IB N N 
? 14 ZB N N 
? 14 AC N N 
? 14 NE N N 
? 14 OE N N 
? 14 PE N N 
? 14 QE N N 
? 14 RE N N 
? 14 SE N N 
? 14 MG N N 
? 14 NG N N 
? 14 OG N N 
? 14 PG N N 
? 14 QG N N 
? 14 RG N N 
? 14 AH N N 
? 14 CH N N 
? 14 DH N N 
? 14 EH N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 J SG CYS 8 F CYS 85 1_555 J SG CYS 63 F CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
metalc ? metalc1 A O PHE 6 1 PHE 37 1_555 X MG CHL . 1 CHL 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 44 1 GLU 75 1_555 S MG CLA . 1 CLA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? 
metalc ? metalc3 V MG CLA . 1 CLA 607 1_555 DA O4 LHG . 1 LHG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? 
metalc ? metalc4 B O TRP 6 2 TRP 67 1_555 UA MG CHL . 2 CHL 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? 
metalc ? metalc5 B O GLY 206 2 GLY 267 1_555 ZA MG CLA . 2 CLA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? 
metalc ? metalc6 D O TRP 5 4 TRP 127 1_555 JC MG CLA . 4 CLA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.966 ? 
metalc ? metalc7 D OE2 GLU 44 4 GLU 166 1_555 EC MG CLA . 4 CLA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? 
metalc ? metalc8 D OE2 GLU 157 4 GLU 279 1_555 BC MG CLA . 4 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? 
metalc ? metalc9 E OE1 GLN 112 A GLN 124 1_555 CD MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? 
metalc ? metalc10 E SG CYS 563 A CYS 575 1_555 ME FE1 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc11 E SG CYS 572 A CYS 584 1_555 ME FE4 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc12 XC O1A CLA . A CLA 1102 1_555 ED MG CLA . A CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? 
metalc ? metalc13 ME FE2 SF4 . A SF4 3001 1_555 F SG CYS 559 B CYS 560 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? 
metalc ? metalc14 ME FE3 SF4 . A SF4 3001 1_555 F SG CYS 568 B CYS 569 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc15 F OD2 ASP 93 B ASP 94 1_555 DF MG CLA . B CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? 
metalc ? metalc16 F OE1 GLN 467 B GLN 468 1_555 CG MG CLA . B CLA 1231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? 
metalc ? metalc17 F O ILE 501 B ILE 502 1_555 VG CA CA . B CA 6000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc18 F O ASN 503 B ASN 504 1_555 VG CA CA . B CA 6000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? 
metalc ? metalc19 F OD1 ASN 506 B ASN 507 1_555 VG CA CA . B CA 6000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.137 ? 
metalc ? metalc20 F O LEU 508 B LEU 509 1_555 VG CA CA . B CA 6000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? 
metalc ? metalc21 KG MG CLA . B CLA 1240 1_555 SG O5 LHG . B LHG 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.937 ? 
metalc ? metalc22 G SG CYS 10 C CYS 11 1_555 XG FE2 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc23 G SG CYS 13 C CYS 14 1_555 XG FE1 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc24 G SG CYS 16 C CYS 17 1_555 XG FE4 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc25 G SG CYS 20 C CYS 21 1_555 WG FE1 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc26 G SG CYS 47 C CYS 48 1_555 WG FE4 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
metalc ? metalc27 G SG CYS 50 C CYS 51 1_555 WG FE3 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
metalc ? metalc28 G SG CYS 53 C CYS 54 1_555 WG FE2 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc29 G SG CYS 57 C CYS 58 1_555 XG FE3 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
#
_chem_comp.formula           'C40 H56' 
_chem_comp.formula_weight    536.873 
_chem_comp.id                BCR 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              BETA-CAROTENE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 BCR sing 70 n n 
C1 C6 BCR sing 71 n n 
C1 C31 BCR sing 72 n n 
C1 C32 BCR sing 73 n n 
C2 C3 BCR sing 74 n n 
C2 HC21 BCR sing 75 n n 
C2 HC22 BCR sing 76 n n 
C3 C4 BCR sing 77 n n 
C3 HC31 BCR sing 78 n n 
C3 HC32 BCR sing 79 n n 
C4 C5 BCR sing 80 n n 
C4 HC41 BCR sing 81 n n 
C4 HC42 BCR sing 82 n n 
C5 C6 BCR doub 83 n n 
C5 C33 BCR sing 84 n n 
C6 C7 BCR sing 85 n n 
C7 C8 BCR doub 86 e n 
C7 HC7 BCR sing 87 n n 
C8 C9 BCR sing 88 n n 
C8 HC8 BCR sing 89 n n 
C9 C10 BCR doub 90 e n 
C9 C34 BCR sing 91 n n 
C10 C11 BCR sing 92 n n 
C10 H10C BCR sing 93 n n 
C11 C12 BCR doub 94 e n 
C11 H11C BCR sing 95 n n 
C33 H331 BCR sing 96 n n 
C33 H332 BCR sing 97 n n 
C33 H333 BCR sing 98 n n 
C31 H311 BCR sing 99 n n 
C31 H312 BCR sing 100 n n 
C31 H313 BCR sing 101 n n 
C32 H321 BCR sing 102 n n 
C32 H322 BCR sing 103 n n 
C32 H323 BCR sing 104 n n 
C34 H341 BCR sing 105 n n 
C34 H342 BCR sing 106 n n 
C34 H343 BCR sing 107 n n 
C12 C13 BCR sing 108 n n 
C12 H12C BCR sing 109 n n 
C13 C14 BCR doub 110 e n 
C13 C35 BCR sing 111 n n 
C14 C15 BCR sing 112 n n 
C14 H14C BCR sing 113 n n 
C15 C16 BCR doub 114 e n 
C15 H15C BCR sing 115 n n 
C16 C17 BCR sing 116 n n 
C16 H16C BCR sing 117 n n 
C17 C18 BCR doub 118 e n 
C17 H17C BCR sing 119 n n 
C18 C19 BCR sing 120 n n 
C18 C36 BCR sing 121 n n 
C19 C20 BCR doub 122 e n 
C19 H19C BCR sing 123 n n 
C20 C21 BCR sing 124 n n 
C20 H20C BCR sing 125 n n 
C21 C22 BCR doub 126 e n 
C21 H21C BCR sing 127 n n 
C22 C23 BCR sing 128 n n 
C22 C37 BCR sing 129 n n 
C23 C24 BCR doub 130 e n 
C23 H23C BCR sing 131 n n 
C24 C25 BCR sing 132 n n 
C24 H24C BCR sing 133 n n 
C25 C26 BCR doub 134 n n 
C25 C30 BCR sing 135 n n 
C26 C27 BCR sing 136 n n 
C26 C38 BCR sing 137 n n 
C27 C28 BCR sing 138 n n 
C27 H271 BCR sing 139 n n 
C27 H272 BCR sing 140 n n 
C28 C29 BCR sing 141 n n 
C28 H281 BCR sing 142 n n 
C28 H282 BCR sing 143 n n 
C29 C30 BCR sing 144 n n 
C29 H291 BCR sing 145 n n 
C29 H292 BCR sing 146 n n 
C30 C39 BCR sing 147 n n 
C30 C40 BCR sing 148 n n 
C35 H351 BCR sing 149 n n 
C35 H352 BCR sing 150 n n 
C35 H353 BCR sing 151 n n 
C36 H361 BCR sing 152 n n 
C36 H362 BCR sing 153 n n 
C36 H363 BCR sing 154 n n 
C37 H371 BCR sing 155 n n 
C37 H372 BCR sing 156 n n 
C37 H373 BCR sing 157 n n 
C38 H381 BCR sing 158 n n 
C38 H382 BCR sing 159 n n 
C38 H383 BCR sing 160 n n 
C39 H391 BCR sing 161 n n 
C39 H392 BCR sing 162 n n 
C39 H393 BCR sing 163 n n 
C40 H401 BCR sing 164 n n 
C40 H402 BCR sing 165 n n 
C40 H403 BCR sing 166 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6QPH 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006294 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.00019 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00995 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005237 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
L 12 LUT 1 1 501 501 LUT LUT . 
M 13 XAT 1 1 502 502 XAT XAT . 
N 14 BCR 1 1 503 503 BCR BCR . 
O 14 BCR 1 1 505 505 BCR BCR . 
P 15 CLA 1 1 601 601 CLA CLA . 
Q 15 CLA 1 1 602 602 CLA CLA . 
R 15 CLA 1 1 603 603 CLA CLA . 
S 15 CLA 1 1 604 604 CLA CLA . 
T 15 CLA 1 1 605 605 CLA CLA . 
U 15 CLA 1 1 606 606 CLA CLA . 
V 15 CLA 1 1 607 607 CLA CLA . 
W 15 CLA 1 1 608 608 CLA CLA . 
X 16 CHL 1 1 609 609 CHL CHL . 
Y 16 CHL 1 1 610 610 CHL CHL . 
Z 15 CLA 1 1 611 611 CLA CLA . 
AA 15 CLA 1 1 612 612 CLA CLA . 
BA 15 CLA 1 1 613 613 CLA CLA . 
CA 15 CLA 1 1 615 615 CLA CLA . 
DA 17 LHG 1 1 801 801 LHG LHG . 
EA 18 LMG 1 1 802 802 LMG LMG . 
FA 18 LMG 1 1 803 803 LMG LMG . 
GA 19 SQD 1 1 811 811 SQD SQD . 
HA 20 CAC 1 1 901 901 CAC CAC . 
IA 20 CAC 1 1 902 902 CAC CAC . 
JA 12 LUT 2 1 501 501 LUT LUT . 
KA 13 XAT 2 1 502 502 XAT XAT . 
LA 14 BCR 2 1 503 503 BCR BCR . 
MA 15 CLA 2 1 601 601 CLA CLA . 
NA 15 CLA 2 1 602 602 CLA CLA . 
OA 15 CLA 2 1 603 603 CLA CLA . 
PA 15 CLA 2 1 604 604 CLA CLA . 
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