data_6QXP # _model_server_result.job_id 2vIUAHdLPJoR4TP0IjSnAg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 11:03:32' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6qxp # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"HA","auth_seq_id":405}' # _entry.id 6QXP # _exptl.entry_id 6QXP _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 13 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6QXP _cell.length_a 119.988 _cell.length_b 119.988 _cell.length_c 305.736 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6QXP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 76 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 ? dimeric 2 author_defined_assembly 3 ? dimeric 2 author_defined_assembly 4 ? dimeric 2 author_defined_assembly 5 ? dimeric 2 author_defined_assembly 6 ? dimeric 2 author_defined_assembly 7 ? dimeric 2 author_defined_assembly 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,I,Q,R,GA,HA,IA 1 1 B,J,S 2 1 C,K,T,U,V,W 3 1 D,L,X,Y,JA,KA 4 1 E,M,Z,AA,LA,MA,NA 5 1 F,N,BA,OA,PA 6 1 G,O,CA,DA,EA,QA,RA 7 1 H,P,FA,SA 8 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 4 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 6 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1173 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1174 NAG 3 n Q BMA 3 Q 3 BMA A 1175 BMA 3 n R NAG 1 R 1 NAG A 1320 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG A 1321 NAG 3 n R BMA 3 R 3 BMA A 1322 BMA 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 1173 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 1174 NAG 4 n S BMA 3 S 3 BMA B 1175 BMA 4 n S MAN 4 S 4 MAN B 1176 MAN 3 n T NAG 1 T 1 NAG C 1173 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG C 1174 NAG 3 n T BMA 3 T 3 BMA C 1175 BMA 5 n U NAG 1 U 1 NAG C 1255 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG C 1256 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG C 1320 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG C 1321 NAG 3 n V BMA 3 V 3 BMA C 1322 BMA 5 n W NAG 1 W 1 NAG C 1346 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG C 1347 NAG 3 n X NAG 1 X 1 NAG D 1173 NAG 3 n X NAG 2 X 2 NAG D 1174 NAG 3 n X BMA 3 X 3 BMA D 1175 BMA 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG D 1346 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG D 1347 NAG 6 n Z NAG 1 Z 1 NAG E 1173 NAG 6 n Z NAG 2 Z 2 NAG E 1174 NAG 6 n Z BMA 3 Z 3 BMA E 1175 BMA 6 n Z MAN 4 Z 4 MAN E 1176 MAN 3 n AA NAG 1 a 1 NAG E 1320 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG E 1321 NAG 3 n AA BMA 3 a 3 BMA E 1322 BMA 6 n BA NAG 1 b 1 NAG F 1173 NAG 6 n BA NAG 2 b 2 NAG F 1174 NAG 6 n BA BMA 3 b 3 BMA F 1175 BMA 6 n BA MAN 4 b 4 MAN F 1176 MAN 5 n CA NAG 1 c 1 NAG G 1173 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG G 1174 NAG 5 n DA NAG 1 d 1 NAG G 1255 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG G 1256 NAG 5 n EA NAG 1 e 1 NAG G 1320 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG G 1321 NAG 3 n FA NAG 1 f 1 NAG H 1173 NAG 3 n FA NAG 2 f 2 NAG H 1174 NAG 3 n FA BMA 3 f 3 BMA H 1175 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 56 A CYS 84 1_555 A SG CYS 63 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 110 A CYS 138 1_555 B SG CYS 110 B CYS 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 206 A CYS 234 1_555 A SG CYS 351 A CYS 379 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 231 A CYS 259 1_555 A SG CYS 346 A CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 285 A CYS 313 1_555 A SG CYS 307 A CYS 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 323 A CYS 351 1_555 A SG CYS 336 A CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 56 B CYS 84 1_555 B SG CYS 63 B CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 206 B CYS 234 1_555 B SG CYS 351 B CYS 379 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 231 B CYS 259 1_555 B SG CYS 346 B CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 285 B CYS 313 1_555 B SG CYS 307 B CYS 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 323 B CYS 351 1_555 B SG CYS 336 B CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 56 C CYS 84 1_555 C SG CYS 63 C CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 110 C CYS 138 1_555 D SG CYS 110 D CYS 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 206 C CYS 234 1_555 C SG CYS 351 C CYS 379 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 231 C CYS 259 1_555 C SG CYS 346 C CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 285 C CYS 313 1_555 C SG CYS 307 C CYS 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 323 C CYS 351 1_555 C SG CYS 336 C CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 56 D CYS 84 1_555 D SG CYS 63 D CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 206 D CYS 234 1_555 D SG CYS 351 D CYS 379 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 231 D CYS 259 1_555 D SG CYS 346 D CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf21 D SG CYS 285 D CYS 313 1_555 D SG CYS 307 D CYS 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 323 D CYS 351 1_555 D SG CYS 336 D CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 E SG CYS 56 E CYS 84 1_555 E SG CYS 63 E CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 110 E CYS 138 1_555 F SG CYS 110 F CYS 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 206 E CYS 234 1_555 E SG CYS 351 E CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf26 E SG CYS 231 E CYS 259 1_555 E SG CYS 346 E CYS 373 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 285 E CYS 313 1_555 E SG CYS 307 E CYS 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf28 E SG CYS 323 E CYS 351 1_555 E SG CYS 336 E CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf29 F SG CYS 56 F CYS 84 1_555 F SG CYS 63 F CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 F SG CYS 206 F CYS 234 1_555 F SG CYS 351 F CYS 379 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf31 F SG CYS 231 F CYS 259 1_555 F SG CYS 346 F CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf32 F SG CYS 323 F CYS 351 1_555 F SG CYS 336 F CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 G SG CYS 56 G CYS 84 1_555 G SG CYS 63 G CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 G SG CYS 110 G CYS 138 1_555 H SG CYS 110 H CYS 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 G SG CYS 206 G CYS 234 1_555 G SG CYS 351 G CYS 379 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf36 G SG CYS 231 G CYS 259 1_555 G SG CYS 346 G CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf37 G SG CYS 285 G CYS 313 1_555 G SG CYS 307 G CYS 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf38 G SG CYS 323 G CYS 351 1_555 G SG CYS 336 G CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf39 H SG CYS 56 H CYS 84 1_555 H SG CYS 63 H CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 H SG CYS 231 H CYS 259 1_555 H SG CYS 346 H CYS 374 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf41 H SG CYS 323 H CYS 351 1_555 H SG CYS 336 H CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf42 I SG CYS 25 I CYS 1076 1_555 I SG CYS 35 I CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf43 I SG CYS 48 I CYS 1099 1_555 I SG CYS 54 I CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf44 J SG CYS 25 J CYS 1076 1_555 J SG CYS 35 J CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf45 K SG CYS 25 K CYS 1076 1_555 K SG CYS 35 K CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf46 K SG CYS 48 K CYS 1099 1_555 K SG CYS 54 K CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf47 L SG CYS 25 L CYS 1076 1_555 L SG CYS 35 L CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf48 L SG CYS 48 L CYS 1099 1_555 L SG CYS 54 L CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf49 M SG CYS 25 M CYS 1076 1_555 M SG CYS 35 M CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf50 M SG CYS 48 M CYS 1099 1_555 M SG CYS 54 M CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf51 N SG CYS 25 N CYS 1076 1_555 N SG CYS 35 N CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf52 N SG CYS 48 N CYS 1099 1_555 N SG CYS 54 N CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf53 O SG CYS 25 O CYS 1076 1_555 O SG CYS 35 O CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf54 O SG CYS 48 O CYS 1099 1_555 O SG CYS 54 O CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf55 P SG CYS 25 P CYS 1076 1_555 P SG CYS 35 P CYS 1086 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf56 P SG CYS 48 P CYS 1099 1_555 P SG CYS 54 P CYS 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 45 A ASN 73 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 227 A ASN 255 1_555 GA C1 NAG . A NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 241 A ASN 269 1_555 HA C1 NAG . A NAG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 292 A ASN 320 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 318 A ASN 346 1_555 IA C1 NAG . A NAG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale6 B ND2 ASN 45 B ASN 73 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 45 C ASN 73 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 227 C ASN 255 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 292 C ASN 320 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 318 C ASN 346 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale11 D ND2 ASN 45 D ASN 73 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 D ND2 ASN 227 D ASN 255 1_555 JA C1 NAG . D NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale13 D ND2 ASN 241 D ASN 269 1_555 KA C1 NAG . D NAG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 D ND2 ASN 318 D ASN 346 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale15 E ND2 ASN 45 E ASN 73 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 E ND2 ASN 227 E ASN 255 1_555 LA C1 NAG . E NAG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 E ND2 ASN 241 E ASN 269 1_555 MA C1 NAG . E NAG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 292 E ASN 320 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 318 E ASN 346 1_555 NA C1 NAG . E NAG 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale20 F ND2 ASN 45 F ASN 73 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 227 F ASN 255 1_555 OA C1 NAG . F NAG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 318 F ASN 346 1_555 PA C1 NAG . F NAG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale23 G ND2 ASN 45 G ASN 73 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale24 G ND2 ASN 227 G ASN 255 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale25 G ND2 ASN 241 G ASN 269 1_555 QA C1 NAG . G NAG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale26 G ND2 ASN 292 G ASN 320 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale27 G ND2 ASN 318 G ASN 346 1_555 RA C1 NAG . G NAG 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 H ND2 ASN 45 H ASN 73 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 H ND2 ASN 318 H ASN 346 1_555 SA C1 NAG . H NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale30 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale32 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale33 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale34 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale35 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale36 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale37 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale38 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale39 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale41 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale42 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale44 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale45 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale46 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale47 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale48 Z O6 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale49 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale50 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale51 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale52 BA O4 NAG . b NAG 2 1_555 BA C1 BMA . b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale53 BA O6 BMA . b BMA 3 1_555 BA C1 MAN . b MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale54 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale55 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale57 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale58 FA O4 NAG . f NAG 2 1_555 FA C1 BMA . f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6QXP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008334 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008334 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003271 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code GA 7 NAG A 1 404 1255 NAG NAG . HA 7 NAG A 1 405 1269 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 409 1346 NAG NAG . JA 7 NAG D 1 404 1255 NAG NAG . KA 7 NAG D 1 405 1269 NAG NAG . LA 7 NAG E 1 405 1255 NAG NAG . MA 7 NAG E 1 406 1269 NAG NAG . NA 7 NAG E 1 410 1346 NAG NAG . OA 7 NAG F 1 405 1255 NAG NAG . PA 7 NAG F 1 406 1346 NAG NAG . QA 7 NAG G 1 405 1269 NAG NAG . RA 7 NAG G 1 408 1346 NAG NAG . SA 7 NAG H 1 404 1346 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . HA 7 89.398 39.225 8.32 1 92.59 ? C1 NAG 405 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . HA 7 89.194 38.434 9.616 1 97.71 ? C2 NAG 405 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . HA 7 89.694 39.236 10.813 1 103.21 ? C3 NAG 405 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . HA 7 91.146 39.639 10.598 1 108.71 ? C4 NAG 405 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . HA 7 91.297 40.384 9.272 1 100.87 ? C5 NAG 405 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . HA 7 92.736 40.712 8.946 1 95.79 ? C6 NAG 405 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . HA 7 86.779 38.879 9.933 1 99.17 ? C7 NAG 405 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . HA 7 85.432 38.246 10.115 1 86.04 ? C8 NAG 405 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . HA 7 87.807 38.031 9.799 1 102.46 ? N2 NAG 405 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . HA 7 89.568 38.459 11.998 1 107.08 ? O3 NAG 405 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . HA 7 91.588 40.472 11.664 1 112.93 ? O4 NAG 405 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . HA 7 90.793 39.587 8.187 1 93.2 ? O5 NAG 405 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . HA 7 93.488 40.962 10.126 1 87.11 ? O6 NAG 405 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . HA 7 86.924 40.099 9.906 1 101.66 ? O7 NAG 405 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 57 _model_server_stats.parse_time_ms 17 _model_server_stats.create_model_time_ms 28 _model_server_stats.query_time_ms 267 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #