data_6RIQ # _model_server_result.job_id AS-veJkJxbTDGyT21nUuxg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 23:25:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6riq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":301}' # _entry.id 6RIQ # _exptl.entry_id 6RIQ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 11 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6RIQ _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6RIQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 22-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 22 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 W N N ? 3 Y N N ? 3 AA N N ? 3 CA N N ? 3 EA N N ? 3 GA N N ? 3 IA N N ? 3 KA N N ? 3 MA N N ? 3 OA N N ? 3 QA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 C N LYS 16 C LYS 16 1_555 X O2B ATP . C ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc1 C OG1 THR 17 C THR 17 1_555 W MG MG . C MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? covale ? covale2 D N LYS 16 D LYS 16 1_555 Z O2B ATP . D ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc2 D OG1 THR 17 D THR 17 1_555 Y MG MG . D MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? covale ? covale3 G N LYS 16 G LYS 16 1_555 BA O2B ATP . G ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc3 G OG1 THR 17 G THR 17 1_555 AA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? covale ? covale4 J N LYS 16 J LYS 16 1_555 DA O2B ATP . J ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? metalc ? metalc4 J OG1 THR 17 J THR 17 1_555 CA MG MG . J MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? covale ? covale5 K N LYS 16 K LYS 16 1_555 FA O2B ATP . K ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? metalc ? metalc5 K OG1 THR 17 K THR 17 1_555 EA MG MG . K MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? covale ? covale6 M N LYS 16 M LYS 16 1_555 HA O2B ATP . M ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc6 M OG1 THR 17 M THR 17 1_555 GA MG MG . M MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? covale ? covale7 N N LYS 16 N LYS 16 1_555 JA O2B ATP . N ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? metalc ? metalc7 N OG1 THR 17 N THR 17 1_555 IA MG MG . N MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? covale ? covale8 Q N LYS 16 Q LYS 16 1_555 LA O2B ATP . Q ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc8 Q OG1 THR 17 Q THR 17 1_555 KA MG MG . Q MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? covale ? covale9 R N LYS 16 R LYS 16 1_555 NA O2B ATP . R ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc9 R OG1 THR 17 R THR 17 1_555 MA MG MG . R MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? covale ? covale10 U N LYS 16 U LYS 16 1_555 PA O2B ATP . U ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? metalc ? metalc10 U OG1 THR 17 U THR 17 1_555 OA MG MG . U MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? covale ? covale11 V N LYS 16 V LYS 16 1_555 RA O2B ATP . V ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? metalc ? metalc11 V OG1 THR 17 V THR 17 1_555 QA MG MG . V MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? metalc ? metalc12 W MG MG . C MG 301 1_555 X O1B ATP . C ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc13 W MG MG . C MG 301 1_555 X O1G ATP . C ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc14 Y MG MG . D MG 301 1_555 Z O1G ATP . D ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc15 Y MG MG . D MG 301 1_555 Z O1B ATP . D ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc16 AA MG MG . G MG 301 1_555 BA O1G ATP . G ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc17 AA MG MG . G MG 301 1_555 BA O1B ATP . G ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc18 CA MG MG . J MG 301 1_555 DA O1G ATP . J ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc19 CA MG MG . J MG 301 1_555 DA O1B ATP . J ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc20 EA MG MG . K MG 301 1_555 FA O1G ATP . K ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc21 EA MG MG . K MG 301 1_555 FA O1B ATP . K ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc ? metalc22 GA MG MG . M MG 301 1_555 HA O1G ATP . M ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc23 GA MG MG . M MG 301 1_555 HA O1B ATP . M ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc24 IA MG MG . N MG 301 1_555 JA O1G ATP . N ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc25 IA MG MG . N MG 301 1_555 JA O1B ATP . N ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc ? metalc26 KA MG MG . Q MG 301 1_555 LA O1G ATP . Q ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc27 KA MG MG . Q MG 301 1_555 LA O1B ATP . Q ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc28 MA MG MG . R MG 301 1_555 NA O1G ATP . R ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc29 MA MG MG . R MG 301 1_555 NA O1B ATP . R ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc ? metalc30 OA MG MG . U MG 301 1_555 PA O1B ATP . U ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc31 OA MG MG . U MG 301 1_555 PA O1G ATP . U ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc32 QA MG MG . V MG 301 1_555 RA O1G ATP . V ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc33 QA MG MG . V MG 301 1_555 RA O1B ATP . V ATP 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6RIQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code W 3 MG C 1 301 700 MG MG . X 4 ATP C 1 302 800 ATP ATP . Y 3 MG D 1 301 700 MG MG . Z 4 ATP D 1 302 800 ATP ATP . AA 3 MG G 1 301 700 MG MG . BA 4 ATP G 1 302 800 ATP ATP . CA 3 MG J 1 301 700 MG MG . DA 4 ATP J 1 302 800 ATP ATP . EA 3 MG K 1 301 700 MG MG . FA 4 ATP K 1 302 800 ATP ATP . GA 3 MG M 1 301 700 MG MG . HA 4 ATP M 1 302 800 ATP ATP . IA 3 MG N 1 301 700 MG MG . JA 4 ATP N 1 302 800 ATP ATP . KA 3 MG Q 1 301 700 MG MG . LA 4 ATP Q 1 302 800 ATP ATP . MA 3 MG R 1 301 700 MG MG . NA 4 ATP R 1 302 800 ATP ATP . OA 3 MG U 1 301 700 MG MG . PA 4 ATP U 1 302 800 ATP ATP . QA 3 MG V 1 301 700 MG MG . RA 4 ATP V 1 302 800 ATP ATP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id KA _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 172.389 _atom_site.Cartn_y 191.843 _atom_site.Cartn_z 194.119 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 17.13 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 301 _atom_site.auth_asym_id Q _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 106 _model_server_stats.query_time_ms 416 _model_server_stats.encode_time_ms 67 _model_server_stats.element_count 1 #