data_6RUR # _model_server_result.job_id x170P7oVh2xQYn9RMjp7Ug _model_server_result.datetime_utc '2024-10-13 16:29:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6rur # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QA","auth_seq_id":511}' # _entry.id 6RUR # _exptl.entry_id 6RUR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 180.156 _entity.id 10 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description alpha-D-mannopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 18 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 112.91 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6RUR _cell.length_a 634.87 _cell.length_b 121.98 _cell.length_c 264.42 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6RUR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 10 AA N N ? 10 BA N N ? 10 CA N N ? 10 DA N N ? 10 EA N N ? 10 FA N N ? 10 GA N N ? 10 HA N N ? 10 IA N N ? 10 JA N N ? 10 KA N N ? 10 LA N N ? 10 MA N N ? 10 NA N N ? 10 OA N N ? 10 PA N N ? 10 QA N N ? 10 RA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 BGC FUC C1 O1 . O3 HO3 . sing 2 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 8 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n M FUC 1 C 1 FUC U 1027 FUC 7 n M BGC 2 C 2 BGC U 1028 BGC 7 n N FUC 1 D 1 FUC V 1036 FUC 7 n N BGC 2 D 2 BGC V 1037 BGC 8 n O NAG 1 E 1 NAG V 1043 NAG 8 n O NAG 2 E 2 NAG V 1044 NAG 8 n O FUC 3 E 3 FUC V 1042 FUC 7 n P FUC 1 F 1 FUC X 1027 FUC 7 n P BGC 2 F 2 BGC X 1028 BGC 7 n Q FUC 1 I 1 FUC Y 1036 FUC 7 n Q BGC 2 I 2 BGC Y 1037 BGC 8 n R NAG 1 K 1 NAG Y 1043 NAG 8 n R NAG 2 K 2 NAG Y 1044 NAG 8 n R FUC 3 K 3 FUC Y 1042 FUC 9 n S NAG 1 M 1 NAG A 2001 NAG 9 n S NAG 2 M 2 NAG A 2002 NAG 9 n T NAG 1 O 1 NAG B 2001 NAG 9 n T NAG 2 O 2 NAG B 2002 NAG 9 n U NAG 1 P 1 NAG G 2001 NAG 9 n U NAG 2 P 2 NAG G 2002 NAG 9 n V NAG 1 R 1 NAG H 2001 NAG 9 n V NAG 2 R 2 NAG H 2002 NAG 9 n W NAG 1 S 1 NAG J 2001 NAG 9 n W NAG 2 S 2 NAG J 2002 NAG 9 n X NAG 1 T 1 NAG J 2011 NAG 9 n X NAG 2 T 2 NAG J 2012 NAG 9 n Y NAG 1 W 1 NAG L 2001 NAG 9 n Y NAG 2 W 2 NAG L 2002 NAG 9 n Z NAG 1 Z 1 NAG L 2011 NAG 9 n Z NAG 2 Z 2 NAG L 2012 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 5 U CYS 32 1_555 A SG CYS 29 U CYS 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 16 U CYS 43 1_555 A SG CYS 45 U CYS 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 30 U CYS 57 1_555 A SG CYS 48 U CYS 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 62 U CYS 89 1_555 A SG CYS 100 U CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 66 U CYS 93 1_555 A SG CYS 106 U CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 77 U CYS 104 1_555 A SG CYS 84 U CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 15 V CYS 269 1_555 B SG CYS 52 V CYS 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 19 V CYS 273 1_555 B SG CYS 58 V CYS 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 30 V CYS 284 1_555 B SG CYS 42 V CYS 296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 73 V CYS 327 1_555 B SG CYS 116 V CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 83 V CYS 337 1_555 B SG CYS 122 V CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 96 V CYS 350 1_555 B SG CYS 106 V CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 137 V CYS 391 1_555 B SG CYS 201 V CYS 455 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 141 V CYS 395 1_555 B SG CYS 207 V CYS 461 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 153 V CYS 407 1_555 B SG CYS 185 V CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 5 X CYS 32 1_555 C SG CYS 29 X CYS 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 16 X CYS 43 1_555 C SG CYS 45 X CYS 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 30 X CYS 57 1_555 C SG CYS 48 X CYS 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 62 X CYS 89 1_555 C SG CYS 100 X CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 66 X CYS 93 1_555 C SG CYS 106 X CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 77 X CYS 104 1_555 C SG CYS 84 X CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 15 Y CYS 269 1_555 D SG CYS 52 Y CYS 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 19 Y CYS 273 1_555 D SG CYS 58 Y CYS 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 30 Y CYS 284 1_555 D SG CYS 42 Y CYS 296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 73 Y CYS 327 1_555 D SG CYS 116 Y CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 83 Y CYS 337 1_555 D SG CYS 122 Y CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 96 Y CYS 350 1_555 D SG CYS 106 Y CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 137 Y CYS 391 1_555 D SG CYS 201 Y CYS 455 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 141 Y CYS 395 1_555 D SG CYS 207 Y CYS 461 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 153 Y CYS 407 1_555 D SG CYS 185 Y CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 537 A CYS 537 1_555 F SG CYS 68 B CYS 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 605 A CYS 605 1_555 E SG CYS 640 A CYS 640 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 F SG CYS 125 B CYS 851 1_555 F SG CYS 765 B CYS 1491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 F SG CYS 353 B CYS 1079 1_555 F SG CYS 410 B CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 F SG CYS 610 B CYS 1336 1_555 F SG CYS 741 B CYS 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf36 F SG CYS 641 B CYS 1367 1_555 F SG CYS 710 B CYS 1436 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf37 F SG CYS 758 B CYS 1484 1_555 F SG CYS 763 B CYS 1489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf38 F SG CYS 770 B CYS 1496 1_555 F SG CYS 842 B CYS 1568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 F SG CYS 789 B CYS 1515 1_555 F SG CYS 913 B CYS 1639 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf40 F SG CYS 889 B CYS 1615 1_555 F SG CYS 898 B CYS 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf41 G SG CYS 537 G CYS 537 1_555 H SG CYS 68 H CYS 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf42 G SG CYS 605 G CYS 605 1_555 G SG CYS 640 G CYS 640 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf43 H SG CYS 125 H CYS 851 1_555 H SG CYS 765 H CYS 1491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf44 H SG CYS 353 H CYS 1079 1_555 H SG CYS 410 H CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf45 H SG CYS 610 H CYS 1336 1_555 H SG CYS 741 H CYS 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf46 H SG CYS 641 H CYS 1367 1_555 H SG CYS 710 H CYS 1436 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf47 H SG CYS 758 H CYS 1484 1_555 H SG CYS 763 H CYS 1489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf48 H SG CYS 770 H CYS 1496 1_555 H SG CYS 842 H CYS 1568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf49 H SG CYS 789 H CYS 1515 1_555 H SG CYS 913 H CYS 1639 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf50 H SG CYS 889 H CYS 1615 1_555 H SG CYS 898 H CYS 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf51 I SG CYS 219 J CYS 453 1_555 I SG CYS 337 J CYS 571 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf52 I SG CYS 252 J CYS 486 1_555 I SG CYS 268 J CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf53 I SG CYS 340 J CYS 574 1_555 I SG CYS 356 J CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf54 I SG CYS 397 J CYS 631 1_555 I SG CYS 423 J CYS 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf55 I SG CYS 436 J CYS 670 1_555 I SG CYS 466 J CYS 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf56 J SG CYS 219 L CYS 453 1_555 J SG CYS 337 L CYS 571 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf57 J SG CYS 252 L CYS 486 1_555 J SG CYS 268 L CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf58 J SG CYS 340 L CYS 574 1_555 J SG CYS 356 L CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf59 J SG CYS 397 L CYS 631 1_555 J SG CYS 423 L CYS 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf60 J SG CYS 436 L CYS 670 1_555 J SG CYS 466 L CYS 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? covale ? covale1 A CD1 TRP 56 U TRP 83 1_555 AA C1 MAN . U MAN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale2 A CD1 TRP 59 U TRP 86 1_555 BA C1 MAN . U MAN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale3 A OG1 THR 65 U THR 92 1_555 M C1 FUC . C FUC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 B CD1 TRP 6 V TRP 260 1_555 HA C1 MAN . V MAN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale5 B CD1 TRP 9 V TRP 263 1_555 IA C1 MAN . V MAN 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale6 B OG1 THR 18 V THR 272 1_555 N C1 FUC . D FUC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 B CD1 TRP 67 V TRP 321 1_555 CA C1 MAN . V MAN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale8 B CD1 TRP 70 V TRP 324 1_555 DA C1 MAN . V MAN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale9 B CD1 TRP 128 V TRP 382 1_555 EA C1 MAN . V MAN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale10 B CD1 TRP 131 V TRP 385 1_555 GA C1 MAN . V MAN 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale11 B CD1 TRP 134 V TRP 388 1_555 FA C1 MAN . V MAN 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 174 V ASN 428 1_555 O C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale13 C CD1 TRP 56 X TRP 83 1_555 JA C1 MAN . X MAN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale14 C CD1 TRP 59 X TRP 86 1_555 KA C1 MAN . X MAN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale15 C OG1 THR 65 X THR 92 1_555 P C1 FUC . F FUC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale16 D CD1 TRP 6 Y TRP 260 1_555 QA C1 MAN . Y MAN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale17 D CD1 TRP 9 Y TRP 263 1_555 RA C1 MAN . Y MAN 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale18 D OG1 THR 18 Y THR 272 1_555 Q C1 FUC . I FUC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 D CD1 TRP 67 Y TRP 321 1_555 LA C1 MAN . Y MAN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale20 D CD1 TRP 70 Y TRP 324 1_555 MA C1 MAN . Y MAN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale21 D CD1 TRP 128 Y TRP 382 1_555 NA C1 MAN . Y MAN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale22 D CD1 TRP 131 Y TRP 385 1_555 PA C1 MAN . Y MAN 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale23 D CD1 TRP 134 Y TRP 388 1_555 OA C1 MAN . Y MAN 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 174 Y ASN 428 1_555 R C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 63 A ASN 63 1_555 S C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale26 F ND2 ASN 191 B ASN 917 1_555 T C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale27 G ND2 ASN 63 G ASN 63 1_555 U C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale28 H ND2 ASN 191 H ASN 917 1_555 V C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale29 I ND2 ASN 26 J ASN 260 1_555 W C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale30 I ND2 ASN 119 J ASN 353 1_555 X C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale31 J ND2 ASN 26 L ASN 260 1_555 Y C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale32 J ND2 ASN 119 L ASN 353 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 M O3 FUC . C FUC 1 1_555 M C1 BGC . C BGC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale34 N O3 FUC . D FUC 1 1_555 N C1 BGC . D BGC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale35 O O4 NAG . E NAG 1 1_555 O C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale36 O O6 NAG . E NAG 1 1_555 O C1 FUC . E FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale37 P O3 FUC . F FUC 1 1_555 P C1 BGC . F BGC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale38 Q O3 FUC . I FUC 1 1_555 Q C1 BGC . I BGC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 R O4 NAG . K NAG 1 1_555 R C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale40 R O6 NAG . K NAG 1 1_555 R C1 FUC . K FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale41 S O4 NAG . M NAG 1 1_555 S C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale42 T O4 NAG . O NAG 1 1_555 T C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale43 U O4 NAG . P NAG 1 1_555 U C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale44 V O4 NAG . R NAG 1 1_555 V C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale45 W O4 NAG . S NAG 1 1_555 W C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 X O4 NAG . T NAG 1 1_555 X C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale47 Y O4 NAG . W NAG 1 1_555 Y C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale48 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? metalc ? metalc1 F O ASN 915 B ASN 1641 1_555 SA MG MG . B MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? metalc ? metalc2 F OXT ASN 915 B ASN 1641 1_555 SA MG MG . B MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc3 SA MG MG . B MG 2003 1_555 J OG SER 19 L SER 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc4 SA MG MG . B MG 2003 1_555 J OG SER 21 L SER 255 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc5 SA MG MG . B MG 2003 1_555 J OG1 THR 94 L THR 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc6 H OXT ASN 915 H ASN 1641 1_555 TA MG MG . H MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? metalc ? metalc7 TA MG MG . H MG 2003 1_555 I OG SER 19 J SER 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc8 TA MG MG . H MG 2003 1_555 I OG SER 21 J SER 255 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc9 TA MG MG . H MG 2003 1_555 I OG1 THR 94 J THR 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? # _chem_comp.formula 'C6 H12 O6' _chem_comp.formula_weight 180.156 _chem_comp.id MAN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name alpha-D-mannopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, alpha linking' _chem_comp.pdbx_synonyms alpha-D-mannose;D-mannose;mannose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 MAN sing 263 n n C1 O1 MAN sing 264 n n C1 O5 MAN sing 265 n n C1 H1 MAN sing 266 n n C2 C3 MAN sing 267 n n C2 O2 MAN sing 268 n n C2 H2 MAN sing 269 n n C3 C4 MAN sing 270 n n C3 O3 MAN sing 271 n n C3 H3 MAN sing 272 n n C4 C5 MAN sing 273 n n C4 O4 MAN sing 274 n n C4 H4 MAN sing 275 n n C5 C6 MAN sing 276 n n C5 O5 MAN sing 277 n n C5 H5 MAN sing 278 n n C6 O6 MAN sing 279 n n C6 H61 MAN sing 280 n n C6 H62 MAN sing 281 n n O1 HO1 MAN sing 282 n n O2 HO2 MAN sing 283 n n O3 HO3 MAN sing 284 n n O4 HO4 MAN sing 285 n n O6 HO6 MAN sing 286 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version MAN DManpa 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 MAN a-D-mannopyranose 'COMMON NAME' GMML 1 MAN a-D-Manp 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 MAN Man 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6RUR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.001575 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000666 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008198 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004106 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code AA 10 MAN U 1 301 1025 MAN MAN . BA 10 MAN U 1 302 1026 MAN MAN . CA 10 MAN V 1 503 1038 MAN MAN . DA 10 MAN V 1 504 1039 MAN MAN . EA 10 MAN V 1 505 1040 MAN MAN . FA 10 MAN V 1 509 1046 MAN MAN . GA 10 MAN V 1 510 1048 MAN MAN . HA 10 MAN V 1 511 1096 MAN MAN . IA 10 MAN V 1 512 1097 MAN MAN . JA 10 MAN X 1 301 1025 MAN MAN . KA 10 MAN X 1 302 1026 MAN MAN . LA 10 MAN Y 1 503 1038 MAN MAN . MA 10 MAN Y 1 504 1039 MAN MAN . NA 10 MAN Y 1 505 1040 MAN MAN . OA 10 MAN Y 1 509 1046 MAN MAN . PA 10 MAN Y 1 510 1048 MAN MAN . QA 10 MAN Y 1 511 1096 MAN MAN . RA 10 MAN Y 1 512 1097 MAN MAN . SA 11 MG B 1 2003 1742 MG MG . TA 11 MG H 1 2003 1742 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 MAN . . . QA 10 -223.844 -26.994 161.589 1 474.69 ? C1 MAN 511 Y 1 HETATM 2 C C2 MAN . . . QA 10 -224.564 -27.304 162.917 1 474.88 ? C2 MAN 511 Y 1 HETATM 3 C C3 MAN . . . QA 10 -224.081 -28.618 163.532 1 479.95 ? C3 MAN 511 Y 1 HETATM 4 C C4 MAN . . . QA 10 -222.541 -28.698 163.577 1 483.53 ? C4 MAN 511 Y 1 HETATM 5 C C5 MAN . . . QA 10 -221.914 -28.385 162.196 1 482.96 ? C5 MAN 511 Y 1 HETATM 6 C C6 MAN . . . QA 10 -222.088 -29.492 161.161 1 485.7 ? C6 MAN 511 Y 1 HETATM 7 O O2 MAN . . . QA 10 -225.974 -27.466 162.724 1 472.86 ? O2 MAN 511 Y 1 HETATM 8 O O3 MAN . . . QA 10 -224.654 -29.762 162.892 1 482.09 ? O3 MAN 511 Y 1 HETATM 9 O O4 MAN . . . QA 10 -222.046 -27.782 164.543 1 483.01 ? O4 MAN 511 Y 1 HETATM 10 O O5 MAN . . . QA 10 -222.444 -27.155 161.629 1 477.83 ? O5 MAN 511 Y 1 HETATM 11 O O6 MAN . . . QA 10 -221.611 -29.01 159.908 1 485.22 ? O6 MAN 511 Y 1 # _model_server_stats.io_time_ms 80 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 57 _model_server_stats.query_time_ms 280 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 11 #