data_6TF2 # _model_server_result.job_id dJVgo2KT9G6ewWBczNccOw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 23:17:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6tf2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":108}' # _entry.id 6TF2 # _exptl.entry_id 6TF2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 79.904 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'BROMIDE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6TF2 _cell.length_a 57.41 _cell.length_b 59.03 _cell.length_c 190.98 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6TF2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall 'I 2 2' _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 I N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C5 C 42 A C 42 1_555 H BR BR . A BR 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.954 ? covale ? covale2 A C5 C 45 A C 45 1_555 I BR BR . A BR 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? metalc ? metalc1 A OP2 A 8 A A 8 1_555 B MG MG . A MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? metalc ? metalc2 A OP1 A 8 A A 8 1_555 F MG MG . A MG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc3 A OP2 C 9 A C 9 1_555 B MG MG . A MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? metalc ? metalc4 A OP2 A 11 A A 11 1_555 C MG MG . A MG 102 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc5 A O2 C 15 A C 15 1_555 G NA NA . A NA 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc6 A OP1 U 17 A U 17 1_555 C MG MG . A MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc7 A O6 G 47 A G 47 1_555 E MG MG . A MG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc8 C MG MG . A MG 102 1_555 K O HOH . A HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? metalc ? metalc9 D MG MG . A MG 103 1_555 K O HOH . A HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? metalc ? metalc10 E MG MG . A MG 104 1_555 K O HOH . A HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc11 F MG MG . A MG 105 1_555 J O1G ATP . A ATP 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc12 F MG MG . A MG 105 1_555 J O1B ATP . A ATP 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc13 F MG MG . A MG 105 1_555 J O1A ATP . A ATP 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? metalc ? metalc14 F MG MG . A MG 105 1_555 K O HOH . A HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 A G 1 1_555 A N3 C 52 A C 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 A G 1 1_555 A O2 C 52 A C 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 A G 1 1_555 A N4 C 52 A C 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 2 A G 2 1_555 A N3 C 51 A C 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 2 A G 2 1_555 A O2 C 51 A C 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 2 A G 2 1_555 A N4 C 51 A C 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 C 3 A C 3 1_555 A N1 G 50 A G 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N4 C 3 A C 3 1_555 A O6 G 50 A G 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O2 C 3 A C 3 1_555 A N2 G 50 A G 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N3 U 4 A U 4 1_555 A N1 A 49 A A 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O4 U 4 A U 4 1_555 A N6 A 49 A A 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog12 A N3 U 5 A U 5 1_555 A O6 G 48 A G 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog13 A O2 U 5 A U 5 1_555 A N1 G 48 A G 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N3 C 6 A C 6 1_555 A N1 G 47 A G 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N4 C 6 A C 6 1_555 A O6 G 47 A G 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O2 C 6 A C 6 1_555 A N2 G 47 A G 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 A 7 A A 7 1_555 A N3 U 46 A U 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N6 A 7 A A 7 1_555 A O4 U 46 A U 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N3 C 13 A C 13 1_555 A N1 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N4 C 13 A C 13 1_555 A O6 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O2 C 13 A C 13 1_555 A N2 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N3 C 14 A C 14 1_555 A N1 G 36 A G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N4 C 14 A C 14 1_555 A O6 G 36 A G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A O2 C 14 A C 14 1_555 A N2 G 36 A G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N1 G 16 A G 16 1_555 A N3 C 45 A C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N2 G 16 A G 16 1_555 A O2 C 45 A C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A O6 G 16 A G 16 1_555 A N4 C 45 A C 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N3 U 17 A U 17 1_555 A N1 A 44 A A 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A O4 U 17 A U 17 1_555 A N6 A 44 A A 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N1 A 18 A A 18 1_555 A N3 U 43 A U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N6 A 18 A A 18 1_555 A O4 U 43 A U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N1 G 19 A G 19 1_555 A N3 C 42 A C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N2 G 19 A G 19 1_555 A O2 C 42 A C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O6 G 19 A G 19 1_555 A N4 C 42 A C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog35 A N1 G 20 A G 20 1_555 A O2 U 41 A U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog36 A O6 G 20 A G 20 1_555 A N3 U 41 A U 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N3 U 21 A U 21 1_555 A N1 A 40 A A 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A O4 U 21 A U 21 1_555 A N6 A 40 A A 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N3 U 22 A U 22 1_555 A N1 A 39 A A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A O4 U 22 A U 22 1_555 A N6 A 39 A A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A N1 G 23 A G 23 1_555 A N3 C 37 A C 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N2 G 23 A G 23 1_555 A O2 C 37 A C 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O6 G 23 A G 23 1_555 A N4 C 37 A C 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog44 A N1 G 24 A G 24 1_555 A N1 A 35 A A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog45 A O6 G 24 A G 24 1_555 A N6 A 35 A A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N1 G 25 A G 25 1_555 A N3 C 34 A C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N2 G 25 A G 25 1_555 A O2 C 34 A C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A O6 G 25 A G 25 1_555 A N4 C 34 A C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A N3 C 26 A C 26 1_555 A N1 G 33 A G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A N4 C 26 A C 26 1_555 A O6 G 33 A G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A O2 C 26 A C 26 1_555 A N2 G 33 A G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A N3 C 27 A C 27 1_555 A N1 G 32 A G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A N4 C 27 A C 27 1_555 A O6 G 32 A G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A O2 C 27 A C 27 1_555 A N2 G 32 A G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog55 A N2 G 28 A G 28 1_555 A N7 A 31 A A 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Br -1' _chem_comp.formula_weight 79.904 _chem_comp.id BR _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'BROMIDE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6TF2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.017419 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016941 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005236 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MG A 1 101 1 MG MG . C 2 MG A 1 102 2 MG MG . D 2 MG A 1 103 3 MG MG . E 2 MG A 1 104 4 MG MG . F 2 MG A 1 105 5 MG MG . G 3 NA A 1 106 1 NA NA . H 4 BR A 1 107 1 BR BR . I 4 BR A 1 108 2 BR BR . J 5 ATP A 1 109 1 ATP ATP . K 6 HOH A 1 201 2 HOH HOH . K 6 HOH A 2 202 3 HOH HOH . K 6 HOH A 3 203 4 HOH HOH . K 6 HOH A 4 204 1 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol BR _atom_site.label_atom_id BR _atom_site.label_comp_id BR _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id I _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 10.46 _atom_site.Cartn_y 3.578 _atom_site.Cartn_z 16.046 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 113.01 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id BR _atom_site.auth_comp_id BR _atom_site.auth_seq_id 108 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 256 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #