data_6TZ8 # _model_server_result.job_id n_gB3Tz1yxXWwSBRk7uZCw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-13 18:56:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6tz8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":300}' # _entry.id 6TZ8 # _exptl.entry_id 6TZ8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6TZ8 _cell.length_a 118.72 _cell.length_b 120.7 _cell.length_c 134.96 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6TZ8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,H,I,J,K,L,M,N,O,X,Y 1 1 D,E,F,P,Q,R,S,T,U,V,W,Z,AA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 K N N ? 7 L N N ? 7 M N N ? 7 N N N ? 7 S N N ? 7 T N N ? 7 U N N ? 7 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 108 A ASP 120 1_555 H FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 110 A HIS 122 1_555 H FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 136 A ASP 148 1_555 H FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 136 A ASP 148 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASN 168 A ASN 180 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc6 A NE2 HIS 217 A HIS 229 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc7 A ND1 HIS 299 A HIS 311 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc8 G O2 SO4 . A SO4 501 1_555 H FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc9 G O4 SO4 . A SO4 501 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc10 B OD1 ASP 34 B ASP 34 1_555 K CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc11 B OD1 ASP 36 B ASP 36 1_555 K CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc12 B OG SER 38 B SER 38 1_555 K CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc13 B O SER 40 B SER 40 1_555 K CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc14 B OE1 GLU 45 B GLU 45 1_555 K CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc ? metalc15 B OE2 GLU 45 B GLU 45 1_555 K CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc16 B OD1 ASP 66 B ASP 66 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc ? metalc17 B OD1 ASP 68 B ASP 68 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? metalc ? metalc18 B OD2 ASP 68 B ASP 68 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.95 ? metalc ? metalc19 B OG SER 70 B SER 70 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc20 B O THR 72 B THR 72 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc21 B OE1 GLU 77 B GLU 77 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc22 B OE2 GLU 77 B GLU 77 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.008 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 103 B ASP 103 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc24 B OD1 ASP 105 B ASP 105 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc25 B OD2 ASP 105 B ASP 105 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc26 B OD1 ASP 107 B ASP 107 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc27 B O TYR 109 B TYR 109 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc28 B OE1 GLU 114 B GLU 114 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc29 B OE2 GLU 114 B GLU 114 1_555 M CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc ? metalc30 B OD1 ASP 144 B ASP 144 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc31 B OD1 ASP 146 B ASP 146 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 148 B ASP 148 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 148 B ASP 148 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc34 B O LYS 150 B LYS 150 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc35 B OE1 GLU 155 B GLU 155 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc36 B OE2 GLU 155 B GLU 155 1_555 N CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? metalc ? metalc37 D OD2 ASP 108 D ASP 120 1_555 Q FE FE . D FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? metalc ? metalc38 D NE2 HIS 110 D HIS 122 1_555 Q FE FE . D FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? metalc ? metalc39 D OD2 ASP 136 D ASP 148 1_555 Q FE FE . D FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc40 D OD2 ASP 136 D ASP 148 1_555 R ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc41 D OD1 ASN 168 D ASN 180 1_555 R ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc42 D NE2 HIS 217 D HIS 229 1_555 R ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc43 D ND1 HIS 299 D HIS 311 1_555 R ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc44 P O4 SO4 . D SO4 500 1_555 Q FE FE . D FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc45 P O2 SO4 . D SO4 500 1_555 R ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc46 E OD1 ASP 34 E ASP 34 1_555 S CA CA . E CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc47 E OD1 ASP 36 E ASP 36 1_555 S CA CA . E CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? metalc ? metalc48 E OG SER 38 E SER 38 1_555 S CA CA . E CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.991 ? metalc ? metalc49 E O SER 40 E SER 40 1_555 S CA CA . E CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc50 E OE1 GLU 45 E GLU 45 1_555 S CA CA . E CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.573 ? metalc ? metalc51 E OE2 GLU 45 E GLU 45 1_555 S CA CA . E CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc52 E OD1 ASP 66 E ASP 66 1_555 T CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? metalc ? metalc53 E OD1 ASP 68 E ASP 68 1_555 T CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.122 ? metalc ? metalc54 E OG SER 70 E SER 70 1_555 T CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc55 E O THR 72 E THR 72 1_555 T CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc56 E OE1 GLU 77 E GLU 77 1_555 T CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc57 E OE2 GLU 77 E GLU 77 1_555 T CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc58 E OD1 ASP 103 E ASP 103 1_555 U CA CA . E CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc59 E OD1 ASP 105 E ASP 105 1_555 U CA CA . E CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? metalc ? metalc60 E OD1 ASP 107 E ASP 107 1_555 U CA CA . E CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc61 E O TYR 109 E TYR 109 1_555 U CA CA . E CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc62 E OE1 GLU 114 E GLU 114 1_555 U CA CA . E CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc63 E OE2 GLU 114 E GLU 114 1_555 U CA CA . E CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc ? metalc64 E OD1 ASP 144 E ASP 144 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc ? metalc65 E OD1 ASP 146 E ASP 146 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc66 E OD1 ASP 148 E ASP 148 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc67 E OD2 ASP 148 E ASP 148 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? metalc ? metalc68 E O LYS 150 E LYS 150 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc69 E OE1 GLU 155 E GLU 155 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc70 E OE2 GLU 155 E GLU 155 1_555 V CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6TZ8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008423 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008285 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00741 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 SO4 A 1 501 501 SO4 SO4 . H 5 FE A 1 502 502 FE FE . I 6 ZN A 1 503 503 ZN ZN . J 4 SO4 A 1 504 504 SO4 SO4 . K 7 CA B 1 300 300 CA CA . L 7 CA B 1 301 301 CA CA . M 7 CA B 1 302 302 CA CA . N 7 CA B 1 303 303 CA CA . O 8 FK5 C 1 200 200 FK5 FK5 . P 4 SO4 D 1 500 500 SO4 SO4 . Q 5 FE D 1 501 501 FE FE . R 6 ZN D 1 502 502 ZN ZN . S 7 CA E 1 300 300 CA CA . T 7 CA E 1 301 301 CA CA . U 7 CA E 1 302 302 CA CA . V 7 CA E 1 303 303 CA CA . W 8 FK5 F 1 200 200 FK5 FK5 . X 9 HOH A 1 601 601 HOH HOH . X 9 HOH A 2 602 602 HOH HOH . X 9 HOH A 3 603 603 HOH HOH . Y 9 HOH B 1 401 401 HOH HOH . Y 9 HOH B 2 402 402 HOH HOH . Z 9 HOH D 1 601 601 HOH HOH . Z 9 HOH D 2 602 602 HOH HOH . AA 9 HOH E 1 401 401 HOH HOH . AA 9 HOH E 2 402 402 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 7 _atom_site.Cartn_x -49.81 _atom_site.Cartn_y 24.329 _atom_site.Cartn_z -14.089 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 67.5 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 300 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 22 _model_server_stats.create_model_time_ms 53 _model_server_stats.query_time_ms 536 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #