data_6U59 # _model_server_result.job_id ZT_UK6VyB7NmYeLat72N0w _model_server_result.datetime_utc '2024-10-11 02:19:11' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6u59 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"TB","auth_seq_id":601}' # _entry.id 6U59 # _exptl.entry_id 6U59 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 30 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N ? 8 QB N N ? 8 RB N N ? 8 SB N N ? 8 TB N N ? 8 UB N N ? 8 VB N N ? 8 WB N N ? 8 XB N N ? 8 YB N N ? 8 ZB N N ? 8 AC N N ? 8 BC N N ? 8 CC N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 1156 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG A 1157 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 1160 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 1161 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG A 1234 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG A 1235 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG A 1266 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG A 1267 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1295 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1296 NAG 6 n R NAG 1 R 1 NAG A 1332 NAG 6 n R NAG 2 R 2 NAG A 1333 NAG 6 n R BMA 3 R 3 BMA A 1334 BMA 5 n S NAG 1 S 1 NAG A 1362 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG A 1363 NAG 5 n T NAG 1 T 1 NAG A 1386 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG A 1387 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG A 1392 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG A 2280 NAG 5 n V NAG 1 V 1 NAG A 1448 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG A 1449 NAG 7 n W NAG 1 W 1 NAG A 2262 NAG 7 n W NAG 2 W 2 NAG A 2263 NAG 7 n W BMA 3 W 3 BMA A 2264 BMA 7 n W MAN 4 W 4 MAN A 2265 MAN 5 n X NAG 1 X 1 NAG A 2275 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG A 2276 NAG 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG A 2277 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG A 2278 NAG 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1156 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1157 NAG 5 n AA NAG 1 a 1 NAG C 1160 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG C 1161 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG C 1234 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG C 1235 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG C 1266 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG C 1267 NAG 5 n DA NAG 1 d 1 NAG C 1295 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG C 1296 NAG 6 n EA NAG 1 e 1 NAG C 1332 NAG 6 n EA NAG 2 e 2 NAG C 1333 NAG 6 n EA BMA 3 e 3 BMA C 1334 BMA 5 n FA NAG 1 f 1 NAG C 1362 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG C 1363 NAG 5 n GA NAG 1 g 1 NAG C 1386 NAG 5 n GA NAG 2 g 2 NAG C 1387 NAG 5 n HA NAG 1 h 1 NAG C 1392 NAG 5 n HA NAG 2 h 2 NAG C 2280 NAG 5 n IA NAG 1 i 1 NAG C 1448 NAG 5 n IA NAG 2 i 2 NAG C 1449 NAG 7 n JA NAG 1 j 1 NAG C 2262 NAG 7 n JA NAG 2 j 2 NAG C 2263 NAG 7 n JA BMA 3 j 3 BMA C 2264 BMA 7 n JA MAN 4 j 4 MAN C 2265 MAN 5 n KA NAG 1 k 1 NAG C 2275 NAG 5 n KA NAG 2 k 2 NAG C 2276 NAG 5 n LA NAG 1 l 1 NAG C 2277 NAG 5 n LA NAG 2 l 2 NAG C 2278 NAG 5 n MA NAG 1 m 1 NAG G 1156 NAG 5 n MA NAG 2 m 2 NAG G 1157 NAG 5 n NA NAG 1 n 1 NAG G 1160 NAG 5 n NA NAG 2 n 2 NAG G 1161 NAG 5 n OA NAG 1 o 1 NAG G 1234 NAG 5 n OA NAG 2 o 2 NAG G 1235 NAG 5 n PA NAG 1 p 1 NAG G 1266 NAG 5 n PA NAG 2 p 2 NAG G 1267 NAG 5 n QA NAG 1 q 1 NAG G 1295 NAG 5 n QA NAG 2 q 2 NAG G 1296 NAG 6 n RA NAG 1 r 1 NAG G 1332 NAG 6 n RA NAG 2 r 2 NAG G 1333 NAG 6 n RA BMA 3 r 3 BMA G 1334 BMA 5 n SA NAG 1 s 1 NAG G 1362 NAG 5 n SA NAG 2 s 2 NAG G 1363 NAG 5 n TA NAG 1 t 1 NAG G 1386 NAG 5 n TA NAG 2 t 2 NAG G 1387 NAG 5 n UA NAG 1 u 1 NAG G 1392 NAG 5 n UA NAG 2 u 2 NAG G 2280 NAG 5 n VA NAG 1 v 1 NAG G 1448 NAG 5 n VA NAG 2 v 2 NAG G 1449 NAG 7 n WA NAG 1 w 1 NAG G 2262 NAG 7 n WA NAG 2 w 2 NAG G 2263 NAG 7 n WA BMA 3 w 3 BMA G 2264 BMA 7 n WA MAN 4 w 4 MAN G 2265 MAN 5 n XA NAG 1 x 1 NAG G 2275 NAG 5 n XA NAG 2 x 2 NAG G 2276 NAG 5 n YA NAG 1 y 1 NAG G 2277 NAG 5 n YA NAG 2 y 2 NAG G 2278 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 124 A CYS 119 1_555 A SG CYS 221 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 131 A CYS 126 1_555 A SG CYS 212 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 136 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 234 A CYS 218 1_555 A SG CYS 263 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 244 A CYS 228 1_555 A SG CYS 255 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 312 A CYS 296 1_555 A SG CYS 346 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 392 A CYS 378 1_555 A SG CYS 456 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 399 A CYS 385 1_555 A SG CYS 429 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 512 A CYS 501 1_555 B SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 87 B CYS 598 1_555 B SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 19 H CYS 22 1_555 D SG CYS 91 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 124 C CYS 119 1_555 E SG CYS 221 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 131 C CYS 126 1_555 E SG CYS 212 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 136 C CYS 131 1_555 E SG CYS 166 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 234 C CYS 218 1_555 E SG CYS 263 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 244 C CYS 228 1_555 E SG CYS 255 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 312 C CYS 296 1_555 E SG CYS 346 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 392 C CYS 378 1_555 E SG CYS 456 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 399 C CYS 385 1_555 E SG CYS 429 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 512 C CYS 501 1_555 F SG CYS 94 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 87 D CYS 598 1_555 F SG CYS 93 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 H SG CYS 19 F CYS 22 1_555 H SG CYS 91 F CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf23 I SG CYS 124 G CYS 119 1_555 I SG CYS 221 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? disulf ? disulf24 I SG CYS 131 G CYS 126 1_555 I SG CYS 212 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 136 G CYS 131 1_555 I SG CYS 166 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 234 G CYS 218 1_555 I SG CYS 263 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 244 G CYS 228 1_555 I SG CYS 255 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 312 G CYS 296 1_555 I SG CYS 346 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 392 G CYS 378 1_555 I SG CYS 456 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 399 G CYS 385 1_555 I SG CYS 429 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 512 G CYS 501 1_555 J SG CYS 94 I CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf32 J SG CYS 87 I CYS 598 1_555 J SG CYS 93 I CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf33 L SG CYS 19 K CYS 22 1_555 L SG CYS 91 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 93 A ASN 88 1_555 ZA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 165 A ASN 156 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 169 A ASN 160 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 213 A ASN 197 1_555 AB C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 250 A ASN 234 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 257 A ASN 241 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 278 A ASN 262 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 292 A ASN 276 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 311 A ASN 295 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 317 A ASN 301 1_555 BB C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 347 A ASN 332 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 354 A ASN 339 1_555 CB C1 NAG . A NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 370 A ASN 355 1_555 DB C1 NAG . A NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 376 A ASN 362 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 400 A ASN 386 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 406 A ASN 392 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 410 A ASN 396 1_555 EB C1 NAG . A NAG 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 424 A ASN 413 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale19 A ND2 ASN 459 A ASN 448 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 IB C1 NAG . B NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 105 B ASN 616 1_555 FB C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 114 B ASN 625 1_555 GB C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 HB C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 93 C ASN 88 1_555 JB C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 165 C ASN 156 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 169 C ASN 160 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 213 C ASN 197 1_555 KB C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 250 C ASN 234 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 257 C ASN 241 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 278 C ASN 262 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 292 C ASN 276 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 311 C ASN 295 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 317 C ASN 301 1_555 LB C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 347 C ASN 332 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 354 C ASN 339 1_555 MB C1 NAG . C NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 370 C ASN 355 1_555 NB C1 NAG . C NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 376 C ASN 362 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 400 C ASN 386 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale39 E ND2 ASN 406 C ASN 392 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale40 E ND2 ASN 410 C ASN 396 1_555 OB C1 NAG . C NAG 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale41 E ND2 ASN 424 C ASN 413 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale42 E ND2 ASN 459 C ASN 448 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale43 F ND2 ASN 100 D ASN 611 1_555 SB C1 NAG . D NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale44 F ND2 ASN 105 D ASN 616 1_555 PB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale45 F ND2 ASN 114 D ASN 625 1_555 QB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale46 F ND2 ASN 126 D ASN 637 1_555 RB C1 NAG . D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale47 I ND2 ASN 93 G ASN 88 1_555 TB C1 NAG . G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale48 I ND2 ASN 165 G ASN 156 1_555 MA C1 NAG . m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale49 I ND2 ASN 169 G ASN 160 1_555 NA C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale50 I ND2 ASN 213 G ASN 197 1_555 UB C1 NAG . G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale51 I ND2 ASN 250 G ASN 234 1_555 OA C1 NAG . o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale52 I ND2 ASN 257 G ASN 241 1_555 XA C1 NAG . x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale53 I ND2 ASN 278 G ASN 262 1_555 WA C1 NAG . w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale54 I ND2 ASN 292 G ASN 276 1_555 PA C1 NAG . p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale55 I ND2 ASN 311 G ASN 295 1_555 QA C1 NAG . q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale56 I ND2 ASN 317 G ASN 301 1_555 VB C1 NAG . G NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale57 I ND2 ASN 347 G ASN 332 1_555 RA C1 NAG . r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale58 I ND2 ASN 354 G ASN 339 1_555 WB C1 NAG . G NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale59 I ND2 ASN 370 G ASN 355 1_555 XB C1 NAG . G NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale60 I ND2 ASN 376 G ASN 362 1_555 SA C1 NAG . s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale61 I ND2 ASN 400 G ASN 386 1_555 TA C1 NAG . t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale62 I ND2 ASN 406 G ASN 392 1_555 UA C1 NAG . u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? covale ? covale63 I ND2 ASN 410 G ASN 396 1_555 YB C1 NAG . G NAG 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale64 I ND2 ASN 424 G ASN 413 1_555 YA C1 NAG . y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale65 I ND2 ASN 459 G ASN 448 1_555 VA C1 NAG . v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale66 J ND2 ASN 100 I ASN 611 1_555 CC C1 NAG . I NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale67 J ND2 ASN 105 I ASN 616 1_555 ZB C1 NAG . I NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale68 J ND2 ASN 114 I ASN 625 1_555 AC C1 NAG . I NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale69 J ND2 ASN 126 I ASN 637 1_555 BC C1 NAG . I NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale70 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale71 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale72 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale73 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale74 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale75 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale76 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale77 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale78 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale79 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale80 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale81 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale82 W O4 NAG . W NAG 2 1_555 W C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale83 W O3 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale84 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale85 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale86 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale87 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale88 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale89 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale90 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale91 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale92 EA O4 NAG . e NAG 2 1_555 EA C1 BMA . e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale93 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale94 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale95 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale96 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale97 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale98 JA O4 NAG . j NAG 2 1_555 JA C1 BMA . j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale99 JA O3 BMA . j BMA 3 1_555 JA C1 MAN . j MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale100 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale101 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale102 MA O4 NAG . m NAG 1 1_555 MA C1 NAG . m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale103 NA O4 NAG . n NAG 1 1_555 NA C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale104 OA O4 NAG . o NAG 1 1_555 OA C1 NAG . o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale105 PA O4 NAG . p NAG 1 1_555 PA C1 NAG . p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale106 QA O4 NAG . q NAG 1 1_555 QA C1 NAG . q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale107 RA O4 NAG . r NAG 1 1_555 RA C1 NAG . r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale108 RA O4 NAG . r NAG 2 1_555 RA C1 BMA . r BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale109 SA O4 NAG . s NAG 1 1_555 SA C1 NAG . s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale110 TA O4 NAG . t NAG 1 1_555 TA C1 NAG . t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale111 UA O4 NAG . u NAG 1 1_555 UA C1 NAG . u NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale112 VA O4 NAG . v NAG 1 1_555 VA C1 NAG . v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale113 WA O4 NAG . w NAG 1 1_555 WA C1 NAG . w NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale114 WA O4 NAG . w NAG 2 1_555 WA C1 BMA . w BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale115 WA O3 BMA . w BMA 3 1_555 WA C1 MAN . w MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale116 XA O4 NAG . x NAG 1 1_555 XA C1 NAG . x NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale117 YA O4 NAG . y NAG 1 1_555 YA C1 NAG . y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6U59 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code ZA 8 NAG A 1 601 1088 NAG NAG . AB 8 NAG A 1 606 1178 NAG NAG . BB 8 NAG A 1 613 1301 NAG NAG . CB 8 NAG A 1 614 1319 NAG NAG . DB 8 NAG A 1 618 1356 NAG NAG . EB 8 NAG A 1 635 2279 NAG NAG . FB 8 NAG B 1 701 701 NAG NAG . GB 8 NAG B 1 702 702 NAG NAG . HB 8 NAG B 1 703 708 NAG NAG . IB 8 NAG B 1 704 709 NAG NAG . JB 8 NAG C 1 601 1088 NAG NAG . KB 8 NAG C 1 606 1178 NAG NAG . LB 8 NAG C 1 613 1301 NAG NAG . MB 8 NAG C 1 614 1319 NAG NAG . NB 8 NAG C 1 618 1356 NAG NAG . OB 8 NAG C 1 635 2279 NAG NAG . PB 8 NAG D 1 701 701 NAG NAG . QB 8 NAG D 1 702 702 NAG NAG . RB 8 NAG D 1 703 708 NAG NAG . SB 8 NAG D 1 704 709 NAG NAG . TB 8 NAG G 1 601 1088 NAG NAG . UB 8 NAG G 1 606 1178 NAG NAG . VB 8 NAG G 1 613 1301 NAG NAG . WB 8 NAG G 1 614 1319 NAG NAG . XB 8 NAG G 1 618 1356 NAG NAG . YB 8 NAG G 1 635 2279 NAG NAG . ZB 8 NAG I 1 701 701 NAG NAG . AC 8 NAG I 1 702 702 NAG NAG . BC 8 NAG I 1 703 708 NAG NAG . CC 8 NAG I 1 704 709 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . TB 8 183.986 151.253 122.953 1 89.21 ? C1 NAG 601 G 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . TB 8 183.065 150.164 122.322 1 88.97 ? C2 NAG 601 G 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . TB 8 183.935 149.389 121.317 1 94.16 ? C3 NAG 601 G 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . TB 8 184.44 150.375 120.268 1 96.19 ? C4 NAG 601 G 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . TB 8 185.268 151.445 120.964 1 96.57 ? C5 NAG 601 G 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . TB 8 185.775 152.448 119.962 1 95.88 ? C6 NAG 601 G 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . TB 8 181.574 148.457 123.158 1 91.68 ? C7 NAG 601 G 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . TB 8 181.075 147.704 124.337 1 87.78 ? C8 NAG 601 G 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . TB 8 182.556 149.296 123.365 1 87.08 ? N2 NAG 601 G 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . TB 8 183.186 148.365 120.661 1 95.15 ? O3 NAG 601 G 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . TB 8 185.245 149.691 119.318 1 94.36 ? O4 NAG 601 G 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . TB 8 184.472 152.144 121.947 1 93.04 ? O5 NAG 601 G 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . TB 8 186.455 151.793 118.902 1 95.48 ? O6 NAG 601 G 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . TB 8 181.099 148.286 122.032 1 92.4 ? O7 NAG 601 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 25 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 36 _model_server_stats.query_time_ms 309 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #