data_6U9H # _model_server_result.job_id KWNj8AG8hCIYFcxEO68VWw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 18:29:49' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6u9h # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":701}' # _entry.id 6U9H # _exptl.entry_id 6U9H _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6U9H _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6U9H _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 Q N N ? 3 T N N ? 3 W N N ? 3 Z N N ? 3 CA N N ? 3 FA N N ? 3 IA N N ? 3 LA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A N ASP 454 A ASP 538 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 454 A ASP 538 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? metalc ? metalc3 Q MG MG . A MG 701 1_555 S O2A TPP . A TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc ? metalc4 Q MG MG . A MG 701 1_555 S O3A TPP . A TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc5 Q MG MG . A MG 701 1_555 S O2B TPP . A TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc6 Q MG MG . A MG 701 1_555 S O1B TPP . A TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc7 B O HIS 483 B HIS 567 1_555 T MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc8 T MG MG . B MG 701 1_555 V O1B TPP . B TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? metalc ? metalc9 T MG MG . B MG 701 1_555 V O1A TPP . B TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? metalc ? metalc10 T MG MG . B MG 701 1_555 V O3B TPP . B TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.926 ? metalc ? metalc11 T MG MG . B MG 701 1_555 V O3A TPP . B TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? metalc ? metalc12 E N ASP 454 H ASP 538 1_555 W MG MG . H MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc13 E OD1 ASP 454 H ASP 538 1_555 W MG MG . H MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? metalc ? metalc14 W MG MG . H MG 701 1_555 Y O2A TPP . H TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc15 W MG MG . H MG 701 1_555 Y O2B TPP . H TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc16 W MG MG . H MG 701 1_555 Y O1B TPP . H TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc17 W MG MG . H MG 701 1_555 Y O3A TPP . H TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc18 F O HIS 483 I HIS 567 1_555 Z MG MG . I MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? metalc ? metalc19 Z MG MG . I MG 701 1_555 BA O1B TPP . I TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc20 Z MG MG . I MG 701 1_555 BA O1A TPP . I TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc21 Z MG MG . I MG 701 1_555 BA O3A TPP . I TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc22 Z MG MG . I MG 701 1_555 BA O3B TPP . I TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc ? metalc23 I N ASP 454 L ASP 538 1_555 CA MG MG . L MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? metalc ? metalc24 I OD1 ASP 454 L ASP 538 1_555 CA MG MG . L MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? metalc ? metalc25 CA MG MG . L MG 701 1_555 EA O3A TPP . L TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc26 CA MG MG . L MG 701 1_555 EA O1B TPP . L TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc27 CA MG MG . L MG 701 1_555 EA O2B TPP . L TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc28 CA MG MG . L MG 701 1_555 EA O2A TPP . L TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc29 J O HIS 483 M HIS 567 1_555 FA MG MG . M MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc30 FA MG MG . M MG 701 1_555 HA O1A TPP . M TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc31 FA MG MG . M MG 701 1_555 HA O1B TPP . M TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? metalc ? metalc32 FA MG MG . M MG 701 1_555 HA O3A TPP . M TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc33 FA MG MG . M MG 701 1_555 HA O3B TPP . M TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc ? metalc34 M N ASP 454 P ASP 538 1_555 IA MG MG . P MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc35 M OD1 ASP 454 P ASP 538 1_555 IA MG MG . P MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc36 IA MG MG . P MG 701 1_555 KA O2B TPP . P TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc37 IA MG MG . P MG 701 1_555 KA O2A TPP . P TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc ? metalc38 IA MG MG . P MG 701 1_555 KA O3A TPP . P TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? metalc ? metalc39 IA MG MG . P MG 701 1_555 KA O1B TPP . P TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? metalc ? metalc40 N O HIS 483 Q HIS 567 1_555 LA MG MG . Q MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc41 LA MG MG . Q MG 701 1_555 NA O1A TPP . Q TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc42 LA MG MG . Q MG 701 1_555 NA O1B TPP . Q TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc43 LA MG MG . Q MG 701 1_555 NA O3A TPP . Q TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? metalc ? metalc44 LA MG MG . Q MG 701 1_555 NA O3B TPP . Q TPP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.887 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6U9H _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 3 MG A 1 701 22 MG MG . R 4 FAD A 1 702 722 FAD FAD . S 5 TPP A 1 703 724 TPP TPP . T 3 MG B 1 701 21 MG MG . U 4 FAD B 1 702 721 FAD FAD . V 5 TPP B 1 703 723 TPP TPP . W 3 MG H 1 701 24 MG MG . X 4 FAD H 1 702 724 FAD FAD . Y 5 TPP H 1 703 726 TPP TPP . Z 3 MG I 1 701 23 MG MG . AA 4 FAD I 1 702 723 FAD FAD . BA 5 TPP I 1 703 725 TPP TPP . CA 3 MG L 1 701 26 MG MG . DA 4 FAD L 1 702 726 FAD FAD . EA 5 TPP L 1 703 728 TPP TPP . FA 3 MG M 1 701 25 MG MG . GA 4 FAD M 1 702 725 FAD FAD . HA 5 TPP M 1 703 727 TPP TPP . IA 3 MG P 1 701 28 MG MG . JA 4 FAD P 1 702 728 FAD FAD . KA 5 TPP P 1 703 730 TPP TPP . LA 3 MG Q 1 701 27 MG MG . MA 4 FAD Q 1 702 727 FAD FAD . NA 5 TPP Q 1 703 729 TPP TPP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id CA _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 129.572 _atom_site.Cartn_y 161.799 _atom_site.Cartn_z 199.863 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 88.68 _atom_site.pdbx_formal_charge 0 _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 701 _atom_site.auth_asym_id L _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 109 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 63 _model_server_stats.query_time_ms 297 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #