data_6UB9 # _model_server_result.job_id jZ0LtsHEb1PWIE5tUaLPmQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-09 01:57:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ub9 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":503}' # _entry.id 6UB9 # _exptl.entry_id 6UB9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 132.905 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6UB9 _cell.length_a 135.373 _cell.length_b 159.619 _cell.length_c 164.932 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6UB9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,SA,TA,UA,VA 1 1 E,F,G,H,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,WA,XA,YA,ZA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 N N N ? 7 Y N N ? 7 EA N N ? 7 NA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B O GLY 246 B GLY 246 1_555 N CS CS . B CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.353 ? metalc ? metalc2 B O ALA 282 B ALA 282 1_555 N CS CS . B CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.455 ? metalc ? metalc3 B OG1 THR 284 B THR 284 1_555 N CS CS . B CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.195 ? metalc ? metalc4 B O TYR 320 B TYR 320 1_555 N CS CS . B CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.206 ? metalc ? metalc5 B O GLY 322 B GLY 322 1_555 N CS CS . B CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.185 ? metalc ? metalc6 N CS CS . B CS 503 1_555 TA O HOH . B HOH 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.457 ? metalc ? metalc7 D O GLY 246 D GLY 246 1_555 Y CS CS . D CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.15 ? metalc ? metalc8 D O ALA 282 D ALA 282 1_555 Y CS CS . D CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.298 ? metalc ? metalc9 D OG1 THR 284 D THR 284 1_555 Y CS CS . D CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc ? metalc10 D O TYR 320 D TYR 320 1_555 Y CS CS . D CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.015 ? metalc ? metalc11 D O GLY 322 D GLY 322 1_555 Y CS CS . D CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.104 ? metalc ? metalc12 Y CS CS . D CS 503 1_555 VA O HOH . D HOH 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.016 ? metalc ? metalc13 Y CS CS . D CS 503 1_555 VA O HOH . D HOH 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.212 ? metalc ? metalc14 F O GLY 246 F GLY 246 1_555 EA CS CS . F CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.319 ? metalc ? metalc15 F O ALA 282 F ALA 282 1_555 EA CS CS . F CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.352 ? metalc ? metalc16 F OG1 THR 284 F THR 284 1_555 EA CS CS . F CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.12 ? metalc ? metalc17 F O TYR 320 F TYR 320 1_555 EA CS CS . F CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.185 ? metalc ? metalc18 F O GLY 322 F GLY 322 1_555 EA CS CS . F CS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.229 ? metalc ? metalc19 EA CS CS . F CS 503 1_555 XA O HOH . F HOH 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.451 ? metalc ? metalc20 H O GLY 246 H GLY 246 1_555 NA CS CS . H CS 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.155 ? metalc ? metalc21 H O ALA 282 H ALA 282 1_555 NA CS CS . H CS 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.408 ? metalc ? metalc22 H OG1 THR 284 H THR 284 1_555 NA CS CS . H CS 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? metalc ? metalc23 H O TYR 320 H TYR 320 1_555 NA CS CS . H CS 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.179 ? metalc ? metalc24 H O GLY 322 H GLY 322 1_555 NA CS CS . H CS 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.17 ? metalc ? metalc25 NA CS CS . H CS 504 1_555 ZA O HOH . H HOH 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.326 ? # _chem_comp.formula 'Cs 1' _chem_comp.formula_weight 132.905 _chem_comp.id CS _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6UB9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007387 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006265 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006063 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 FMT A 1 501 501 FMT FMT . J 4 MLA A 1 502 502 MLA MLA . K 3 FMT A 1 503 503 FMT FMT . L 5 P1T B 1 501 501 P1T P1T . M 6 H9V B 1 502 502 H9V H9V . N 7 CS B 1 503 503 CS CS . O 3 FMT B 1 504 504 FMT FMT . P 3 FMT B 1 505 505 FMT FMT . Q 3 FMT B 1 506 506 FMT FMT . R 8 ACT B 1 507 507 ACT ACT . S 3 FMT B 1 508 508 FMT FMT . T 3 FMT B 1 509 509 FMT FMT . U 4 MLA C 1 501 501 MLA MLA . V 3 FMT C 1 502 502 FMT FMT . W 5 P1T D 1 501 501 P1T P1T . X 6 H9V D 1 502 502 H9V H9V . Y 7 CS D 1 503 503 CS CS . Z 9 PGE D 1 504 504 PGE PGE . AA 3 FMT E 1 501 501 FMT FMT . BA 4 MLA E 1 502 502 MLA MLA . CA 5 P1T F 1 501 501 P1T P1T . DA 6 H9V F 1 502 502 H9V H9V . EA 7 CS F 1 503 503 CS CS . FA 3 FMT F 1 504 504 FMT FMT . GA 3 FMT F 1 505 505 FMT FMT . HA 4 MLA F 1 506 506 MLA MLA . IA 9 PGE F 1 507 507 PGE PGE . JA 4 MLA G 1 501 501 MLA MLA . KA 3 FMT H 1 501 508 FMT FMT . LA 5 P1T H 1 502 501 P1T P1T . MA 6 H9V H 1 503 502 H9V H9V . NA 7 CS H 1 504 503 CS CS . OA 3 FMT H 1 505 504 FMT FMT . PA 10 EDO H 1 506 505 EDO EDO . QA 3 FMT H 1 507 506 FMT FMT . RA 3 FMT H 1 508 507 FMT FMT . SA 11 HOH A 1 601 601 HOH HOH . SA 11 HOH A 2 602 602 HOH HOH . SA 11 HOH A 3 603 603 HOH HOH . SA 11 HOH A 4 604 605 HOH HOH . SA 11 HOH A 5 605 604 HOH HOH . SA 11 HOH A 6 606 606 HOH HOH . SA 11 HOH A 7 607 608 HOH HOH . SA 11 HOH A 8 608 609 HOH HOH . TA 11 HOH B 1 601 601 HOH HOH . TA 11 HOH B 2 602 602 HOH HOH . TA 11 HOH B 3 603 605 HOH HOH . TA 11 HOH B 4 604 603 HOH HOH . TA 11 HOH B 5 605 609 HOH HOH . TA 11 HOH B 6 606 606 HOH HOH . TA 11 HOH B 7 607 604 HOH HOH . TA 11 HOH B 8 608 608 HOH HOH . TA 11 HOH B 9 609 611 HOH HOH . TA 11 HOH B 10 610 610 HOH HOH . TA 11 HOH B 11 611 607 HOH HOH . TA 11 HOH B 12 612 615 HOH HOH . TA 11 HOH B 13 613 612 HOH HOH . TA 11 HOH B 14 614 616 HOH HOH . TA 11 HOH B 15 615 613 HOH HOH . TA 11 HOH B 16 616 617 HOH HOH . TA 11 HOH B 17 617 620 HOH HOH . TA 11 HOH B 18 618 614 HOH HOH . TA 11 HOH B 19 619 618 HOH HOH . TA 11 HOH B 20 620 619 HOH HOH . TA 11 HOH B 21 621 632 HOH HOH . TA 11 HOH B 22 622 625 HOH HOH . TA 11 HOH B 23 623 621 HOH HOH . TA 11 HOH B 24 624 622 HOH HOH . TA 11 HOH B 25 625 626 HOH HOH . TA 11 HOH B 26 626 628 HOH HOH . TA 11 HOH B 27 627 627 HOH HOH . TA 11 HOH B 28 628 623 HOH HOH . TA 11 HOH B 29 629 607 HOH HOH . TA 11 HOH B 30 630 633 HOH HOH . TA 11 HOH B 31 631 624 HOH HOH . TA 11 HOH B 32 632 630 HOH HOH . TA 11 HOH B 33 633 635 HOH HOH . TA 11 HOH B 34 634 631 HOH HOH . TA 11 HOH B 35 635 634 HOH HOH . TA 11 HOH B 36 636 629 HOH HOH . TA 11 HOH B 37 637 637 HOH HOH . TA 11 HOH B 38 638 636 HOH HOH . TA 11 HOH B 39 639 638 HOH HOH . TA 11 HOH B 40 640 639 HOH HOH . UA 11 HOH C 1 601 601 HOH HOH . UA 11 HOH C 2 602 602 HOH HOH . UA 11 HOH C 3 603 603 HOH HOH . UA 11 HOH C 4 604 604 HOH HOH . UA 11 HOH C 5 605 605 HOH HOH . UA 11 HOH C 6 606 606 HOH HOH . VA 11 HOH D 1 601 601 HOH HOH . VA 11 HOH D 2 602 602 HOH HOH . VA 11 HOH D 3 603 604 HOH HOH . VA 11 HOH D 4 604 603 HOH HOH . VA 11 HOH D 5 605 605 HOH HOH . VA 11 HOH D 6 606 606 HOH HOH . VA 11 HOH D 7 607 607 HOH HOH . VA 11 HOH D 8 608 608 HOH HOH . VA 11 HOH D 9 609 611 HOH HOH . VA 11 HOH D 10 610 610 HOH HOH . VA 11 HOH D 11 611 612 HOH HOH . VA 11 HOH D 12 612 609 HOH HOH . VA 11 HOH D 13 613 614 HOH HOH . VA 11 HOH D 14 614 617 HOH HOH . VA 11 HOH D 15 615 615 HOH HOH . VA 11 HOH D 16 616 620 HOH HOH . VA 11 HOH D 17 617 623 HOH HOH . VA 11 HOH D 18 618 616 HOH HOH . VA 11 HOH D 19 619 613 HOH HOH . VA 11 HOH D 20 620 619 HOH HOH . VA 11 HOH D 21 621 624 HOH HOH . VA 11 HOH D 22 622 621 HOH HOH . VA 11 HOH D 23 623 622 HOH HOH . VA 11 HOH D 24 624 618 HOH HOH . VA 11 HOH D 25 625 631 HOH HOH . VA 11 HOH D 26 626 628 HOH HOH . VA 11 HOH D 27 627 627 HOH HOH . VA 11 HOH D 28 628 625 HOH HOH . VA 11 HOH D 29 629 629 HOH HOH . VA 11 HOH D 30 630 630 HOH HOH . VA 11 HOH D 31 631 632 HOH HOH . VA 11 HOH D 32 632 633 HOH HOH . VA 11 HOH D 33 633 626 HOH HOH . VA 11 HOH D 34 634 635 HOH HOH . VA 11 HOH D 35 635 636 HOH HOH . VA 11 HOH D 36 636 634 HOH HOH . VA 11 HOH D 37 637 637 HOH HOH . VA 11 HOH D 38 638 638 HOH HOH . VA 11 HOH D 39 639 639 HOH HOH . VA 11 HOH D 40 640 640 HOH HOH . WA 11 HOH E 1 601 602 HOH HOH . WA 11 HOH E 2 602 601 HOH HOH . XA 11 HOH F 1 601 601 HOH HOH . XA 11 HOH F 2 602 602 HOH HOH . XA 11 HOH F 3 603 603 HOH HOH . XA 11 HOH F 4 604 605 HOH HOH . XA 11 HOH F 5 605 604 HOH HOH . XA 11 HOH F 6 606 608 HOH HOH . XA 11 HOH F 7 607 607 HOH HOH . XA 11 HOH F 8 608 610 HOH HOH . XA 11 HOH F 9 609 606 HOH HOH . XA 11 HOH F 10 610 609 HOH HOH . XA 11 HOH F 11 611 611 HOH HOH . XA 11 HOH F 12 612 615 HOH HOH . XA 11 HOH F 13 613 612 HOH HOH . XA 11 HOH F 14 614 613 HOH HOH . XA 11 HOH F 15 615 614 HOH HOH . XA 11 HOH F 16 616 618 HOH HOH . XA 11 HOH F 17 617 616 HOH HOH . XA 11 HOH F 18 618 620 HOH HOH . XA 11 HOH F 19 619 617 HOH HOH . XA 11 HOH F 20 620 619 HOH HOH . XA 11 HOH F 21 621 621 HOH HOH . XA 11 HOH F 22 622 622 HOH HOH . XA 11 HOH F 23 623 624 HOH HOH . XA 11 HOH F 24 624 623 HOH HOH . XA 11 HOH F 25 625 625 HOH HOH . YA 11 HOH G 1 601 603 HOH HOH . YA 11 HOH G 2 602 601 HOH HOH . YA 11 HOH G 3 603 602 HOH HOH . YA 11 HOH G 4 604 605 HOH HOH . YA 11 HOH G 5 605 606 HOH HOH . YA 11 HOH G 6 606 604 HOH HOH . YA 11 HOH G 7 607 608 HOH HOH . YA 11 HOH G 8 608 607 HOH HOH . YA 11 HOH G 9 609 609 HOH HOH . YA 11 HOH G 10 610 610 HOH HOH . YA 11 HOH G 11 611 611 HOH HOH . ZA 11 HOH H 1 601 601 HOH HOH . ZA 11 HOH H 2 602 602 HOH HOH . ZA 11 HOH H 3 603 603 HOH HOH . ZA 11 HOH H 4 604 604 HOH HOH . ZA 11 HOH H 5 605 605 HOH HOH . ZA 11 HOH H 6 606 606 HOH HOH . ZA 11 HOH H 7 607 607 HOH HOH . ZA 11 HOH H 8 608 608 HOH HOH . ZA 11 HOH H 9 609 610 HOH HOH . ZA 11 HOH H 10 610 615 HOH HOH . ZA 11 HOH H 11 611 616 HOH HOH . ZA 11 HOH H 12 612 612 HOH HOH . ZA 11 HOH H 13 613 618 HOH HOH . ZA 11 HOH H 14 614 619 HOH HOH . ZA 11 HOH H 15 615 613 HOH HOH . ZA 11 HOH H 16 616 609 HOH HOH . ZA 11 HOH H 17 617 617 HOH HOH . ZA 11 HOH H 18 618 624 HOH HOH . ZA 11 HOH H 19 619 622 HOH HOH . ZA 11 HOH H 20 620 614 HOH HOH . ZA 11 HOH H 21 621 623 HOH HOH . ZA 11 HOH H 22 622 620 HOH HOH . ZA 11 HOH H 23 623 611 HOH HOH . ZA 11 HOH H 24 624 627 HOH HOH . ZA 11 HOH H 25 625 621 HOH HOH . ZA 11 HOH H 26 626 628 HOH HOH . ZA 11 HOH H 27 627 625 HOH HOH . ZA 11 HOH H 28 628 630 HOH HOH . ZA 11 HOH H 29 629 629 HOH HOH . ZA 11 HOH H 30 630 626 HOH HOH . ZA 11 HOH H 31 631 631 HOH HOH . ZA 11 HOH H 32 632 633 HOH HOH . ZA 11 HOH H 33 633 634 HOH HOH . ZA 11 HOH H 34 634 632 HOH HOH . ZA 11 HOH H 35 635 636 HOH HOH . ZA 11 HOH H 36 636 635 HOH HOH . ZA 11 HOH H 37 637 637 HOH HOH . ZA 11 HOH H 38 638 638 HOH HOH . ZA 11 HOH H 39 639 639 HOH HOH . ZA 11 HOH H 40 640 640 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CS _atom_site.label_atom_id CS _atom_site.label_comp_id CS _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Y _atom_site.label_entity_id 7 _atom_site.Cartn_x 23.536 _atom_site.Cartn_y -31.194 _atom_site.Cartn_z 48.074 _atom_site.occupancy 0.5 _atom_site.B_iso_or_equiv 47.58 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CS _atom_site.auth_comp_id CS _atom_site.auth_seq_id 503 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 43 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 311 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #