data_6UBU
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_model_server_result.job_id            jO12I-aVPyhc9kXBDZC-cA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 05:33:11' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6ubu 
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_model_server_params.name     atom_site 
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_entry.id    6UBU 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GUANINE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_cell.length_c            42.276 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
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_symmetry.Int_Tables_number        5 
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_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
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_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 
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_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
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#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      4 
_struct_asym.id                             L 
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_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
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_struct_conn.ptnr1_symmetry
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_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
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_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
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_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 B G 15 1_555 A N3 C 67 B C 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 B G 15 1_555 A O2 C 67 B C 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 B G 15 1_555 A N4 C 67 B C 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 2 B G 16 1_555 A N3 C 66 B C 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 2 B G 16 1_555 A O2 C 66 B C 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 2 B G 16 1_555 A N4 C 66 B C 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 A 3 B A 17 1_555 A N3 U 65 B U 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N6 A 3 B A 17 1_555 A O4 U 65 B U 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N3 C 4 B C 18 1_555 A N1 G 64 B G 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N4 C 4 B C 18 1_555 A O6 G 64 B G 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O2 C 4 B C 18 1_555 A N2 G 64 B G 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N1 A 5 B A 19 1_555 A N3 U 63 B U 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N6 A 5 B A 19 1_555 A O4 U 63 B U 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N3 U 6 B U 20 1_555 A N1 A 62 B A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A O4 U 6 B U 20 1_555 A N6 A 62 B A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N1 A 7 B A 21 1_555 A N3 U 61 B U 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N6 A 7 B A 21 1_555 A O4 U 61 B U 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N3 U 8 B U 22 1_555 A N1 A 38 B A 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O4 U 8 B U 22 1_555 A N6 A 38 B A 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_10_PAIR hydrog20 A N1 A 9 B A 23 1_555 A N2 G 32 B G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_10_PAIR hydrog21 A N6 A 9 B A 23 1_555 A N3 G 32 B G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N3 U 11 B U 25 1_555 A N1 A 31 B A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A O4 U 11 B U 25 1_555 A N6 A 31 B A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog24 A N4 C 12 B C 26 1_555 A N1 A 30 B A 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N1 G 13 B G 27 1_555 A N3 C 29 B C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N2 G 13 B G 27 1_555 A O2 C 29 B C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A O6 G 13 B G 27 1_555 A N4 C 29 B C 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N3 C 14 B C 28 1_555 A N1 G 28 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N4 C 14 B C 28 1_555 A O6 G 28 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A O2 C 14 B C 28 1_555 A N2 G 28 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N1 G 15 B G 29 1_555 A N3 C 27 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N2 G 15 B G 29 1_555 A O2 C 27 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A O6 G 15 B G 29 1_555 A N4 C 27 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A N3 U 16 B U 30 1_555 A N1 A 26 B A 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A O4 U 16 B U 30 1_555 A N6 A 26 B A 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N1 G 17 B G 31 1_555 A N3 C 25 B C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N2 G 17 B G 31 1_555 A O2 C 25 B C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A O6 G 17 B G 31 1_555 A N4 C 25 B C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_5_PAIR hydrog39 A N1 A 19 B A 33 1_555 A N6 A 52 B A 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_5_PAIR hydrog40 A N6 A 19 B A 33 1_555 A N7 A 52 B A 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog41 A O2 U 20 B U 34 1_555 A N2 G 23 B G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog42 A N3 U 20 B U 34 1_555 A N7 A 51 B A 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog43 A O2 U 20 B U 34 1_555 A N6 A 51 B A 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_5_PAIR hydrog44 A N6 A 21 B A 35 1_555 A N1 A 50 B A 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_5_PAIR hydrog45 A N7 A 21 B A 35 1_555 A N6 A 50 B A 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N1 G 23 B G 37 1_555 A N3 C 47 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N2 G 23 B G 37 1_555 A O2 C 47 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A O6 G 23 B G 37 1_555 A N4 C 47 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A N1 G 24 B G 38 1_555 A N3 C 46 B C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A N2 G 24 B G 38 1_555 A O2 C 46 B C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A O6 G 24 B G 38 1_555 A N4 C 46 B C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_10_PAIR hydrog52 A N2 G 24 B G 38 1_555 A N1 A 52 B A 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_10_PAIR hydrog53 A N3 G 24 B G 38 1_555 A N6 A 52 B A 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A N1 G 32 B G 46 1_555 A N3 C 39 B C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog55 A N2 G 32 B G 46 1_555 A O2 C 39 B C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog56 A O6 G 32 B G 46 1_555 A N4 C 39 B C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'U-U MISPAIR' hydrog57 A N3 U 33 B U 47 1_555 A O4 U 37 B U 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'U-A PAIR' hydrog58 A N3 U 35 B U 49 1_555 A N3 A 62 B A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog59 A N4 C 36 B C 50 1_555 A O2 U 61 B U 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A N3 C 40 B C 54 1_555 A N1 G 58 B G 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N4 C 40 B C 54 1_555 A O6 G 58 B G 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A O2 C 40 B C 54 1_555 A N2 G 58 B G 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog63 A N1 G 41 B G 55 1_555 A N3 C 57 B C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A N2 G 41 B G 55 1_555 A O2 C 57 B C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A O6 G 41 B G 55 1_555 A N4 C 57 B C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog66 A N1 G 42 B G 56 1_555 A N3 C 56 B C 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog67 A N2 G 42 B G 56 1_555 A O2 C 56 B C 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog68 A O6 G 42 B G 56 1_555 A N4 C 56 B C 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog69 A N1 G 43 B G 57 1_555 A O2 U 55 B U 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog70 A O6 G 43 B G 57 1_555 A N3 U 55 B U 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A N3 C 44 B C 58 1_555 A N1 G 54 B G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A N4 C 44 B C 58 1_555 A O6 G 54 B G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog73 A O2 C 44 B C 58 1_555 A N2 G 54 B G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog74 A N1 A 45 B A 59 1_555 A N3 U 53 B U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N6 A 45 B A 59 1_555 A O4 U 53 B U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog76 A O2 C 47 B C 61 1_555 A N6 A 51 B A 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C5 H5 N5 O' 
_chem_comp.formula_weight    151.126 
_chem_comp.id                GUN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GUANINE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N9 C8 GUN sing 122 n y 
N9 C4 GUN sing 123 n y 
N9 HN9 GUN sing 124 n n 
C8 N7 GUN doub 125 n y 
C8 H8 GUN sing 126 n n 
N7 C5 GUN sing 127 n y 
C5 C6 GUN sing 128 n n 
C5 C4 GUN doub 129 n y 
C6 O6 GUN doub 130 n n 
C6 N1 GUN sing 131 n n 
N1 C2 GUN sing 132 n n 
N1 HN1 GUN sing 133 n n 
C2 N2 GUN sing 134 n n 
C2 N3 GUN doub 135 n n 
N2 HN21 GUN sing 136 n n 
N2 HN22 GUN sing 137 n n 
N3 C4 GUN sing 138 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6UBU 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007566 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000114 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.028361 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.023657 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
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