data_6UGC # _model_server_result.job_id 6cY-v5EehAIgPEjAFW1j7w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 06:07:49' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ugc # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"HA","auth_seq_id":101}' # _entry.id 6UGC # _exptl.entry_id 6UGC _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 22 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6UGC _cell.length_a 51.03 _cell.length_b 51.03 _cell.length_c 36.02 _cell.Z_PDB 66 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6UGC _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 159 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 3 1 c' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 ? monomeric 1 author_defined_assembly 5 ? monomeric 1 author_defined_assembly 6 ? monomeric 1 author_defined_assembly 7 ? monomeric 1 author_defined_assembly 8 ? trimeric 3 author_defined_assembly 9 ? trimeric 3 author_defined_assembly 10 ? trimeric 3 author_defined_assembly 11 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,L,M,N,O,NA 1 1 B,P,Q,R,S,OA 2 1 C,T,PA 3 1 D,U,V,W,QA 4 1 E,X,Y,Z,AA,BA,CA,RA 5 1 F,DA,EA,FA,SA 6 1 G,GA,TA 7 1 H,HA,IA,JA,UA 8 1 I,KA,VA 9 1,2,5 J,LA,WA 10 1,3,6 K,MA,XA 11 1,4,7 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_665 -y+1,x-y+1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 25.515 44.193276 0 3 'crystal symmetry operation' 2_655 -y+1,x-y,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 51.03 0 0 4 'crystal symmetry operation' 2_765 -y+2,x-y+1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 76.545 44.193276 0 5 'crystal symmetry operation' 3_565 -x+y,-x+1,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 -25.515 44.193276 0 6 'crystal symmetry operation' 3_665 -x+y+1,-x+1,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 25.515 44.193276 0 7 'crystal symmetry operation' 3_675 -x+y+1,-x+2,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 0 88.386553 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 GA N N ? 2 HA N N ? 2 IA N N ? 2 KA N N ? 2 LA N N ? 2 MA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A N PRO 1 A PRO 1 1_555 A C ASP 9 A ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.314 sing covale ? covale2 B N PRO 1 B PRO 1 1_555 B C ASP 9 B ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 sing covale ? covale3 C N PRO 1 C PRO 1 1_555 C C ASP 9 C ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 sing covale ? covale4 D N PRO 1 D PRO 1 1_555 D C ASP 9 D ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 sing covale ? covale5 E N PRO 1 E PRO 1 1_555 E C ASP 9 E ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 sing covale ? covale6 F N PRO 1 F PRO 1 1_555 F C ASP 9 F ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 sing covale ? covale7 G N PRO 1 G PRO 1 1_555 G C ASP 9 G ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 sing covale ? covale8 H N PRO 1 H PRO 1 1_555 H C ASP 9 H ASP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 sing covale ? covale9 I N PRO 1 I PRO 1 1_555 I C ASP 3 I ASP 3 2_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 sing covale ? covale10 J N PRO 1 J PRO 1 1_555 J C ASP 3 J ASP 3 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 sing covale ? covale11 K N PRO 1 K PRO 1 1_555 K C ASP 3 K ASP 3 3_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 sing metalc ? metalc1 A O ASP 2 A ASP 2 1_555 M NA NA . A NA 102 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 2 A ASP 2 1_555 O CD CD . A CD 104 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 2 A ASP 2 1_555 O CD CD . A CD 104 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc4 A O ASP 3 A ASP 3 1_555 L NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 3 A ASP 3 1_555 N NA NA . A NA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 3 A ASP 3 1_555 N NA NA . A NA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc7 A O ASP 5 A ASP 5 1_555 BA NA NA . E NA 105 2_665 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc8 A O ASP 6 A ASP 6 1_555 L NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 6 A ASP 6 1_555 S CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 6 A ASP 6 1_555 S CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc11 A O ASP 9 A ASP 9 1_555 L NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 9 A ASP 9 1_555 O CD CD . A CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc13 L NA NA . A NA 101 1_555 K OD1 ASP 2 K ASP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc14 L NA NA . A NA 101 1_555 XA O HOH . K HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc15 L NA NA . A NA 101 1_555 XA O HOH . K HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc16 M NA NA . A NA 102 1_555 NA O HOH . A HOH 207 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc ? metalc17 M NA NA . A NA 102 1_555 NA O HOH . A HOH 210 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc ? metalc18 M NA NA . A NA 102 1_555 NA O HOH . A HOH 210 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? metalc ? metalc19 M NA NA . A NA 102 1_555 NA O HOH . A HOH 211 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc20 M NA NA . A NA 102 1_555 NA O HOH . A HOH 211 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc21 M NA NA . A NA 102 2_655 F O ASP 5 F ASP 5 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc22 M NA NA . A NA 102 1_555 SA O HOH . F HOH 209 3_665 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? metalc ? metalc23 M NA NA . A NA 102 1_555 UA O HOH . H HOH 206 3_665 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc24 N NA NA . A NA 103 1_555 PA O HOH . C HOH 205 4_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? metalc ? metalc25 N NA NA . A NA 103 1_555 QA O HOH . D HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.954 ? metalc ? metalc26 O CD CD . A CD 104 1_555 C OD2 ASP 3 C ASP 3 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc27 O CD CD . A CD 104 1_555 C OD1 ASP 5 C ASP 5 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc28 O CD CD . A CD 104 1_555 D OD1 ASP 6 D ASP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc29 O CD CD . A CD 104 1_555 D OD2 ASP 6 D ASP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc30 NA O HOH . A HOH 212 3_565 BA NA NA . E NA 105 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc31 B OD1 ASP 2 B ASP 2 1_555 S CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? metalc ? metalc32 B OD2 ASP 2 B ASP 2 1_555 S CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc33 B O ASP 3 B ASP 3 1_555 P NA NA . B NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc34 B OD1 ASP 3 B ASP 3 1_555 R NA NA . B NA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.919 ? metalc ? metalc35 B OD2 ASP 3 B ASP 3 1_555 R NA NA . B NA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc36 B O ASP 6 B ASP 6 1_555 P NA NA . B NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc37 B OD1 ASP 6 B ASP 6 1_555 W CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc ? metalc38 B OD2 ASP 6 B ASP 6 1_555 W CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc39 B O ASP 9 B ASP 9 1_555 P NA NA . B NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc40 B OD2 ASP 9 B ASP 9 1_555 S CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc41 P NA NA . B NA 101 1_555 OA O HOH . B HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc42 P NA NA . B NA 101 1_555 OA O HOH . B HOH 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc43 P NA NA . B NA 101 1_555 OA O HOH . B HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc44 Q NA NA . B NA 102 1_555 QA O HOH . D HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.907 ? metalc ? metalc45 R NA NA . B NA 103 1_555 OA O HOH . B HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc46 R NA NA . B NA 103 1_555 PA O HOH . C HOH 204 4_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? metalc ? metalc47 S CD CD . B CD 104 1_555 C OD2 ASP 6 C ASP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc48 S CD CD . B CD 104 1_555 C OD1 ASP 8 C ASP 8 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc49 OA O HOH . B HOH 201 3_565 BA NA NA . E NA 105 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc50 OA O HOH . B HOH 201 3_565 BA NA NA . E NA 105 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc51 OA O HOH . B HOH 208 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc52 OA O HOH . B HOH 208 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc53 OA O HOH . B HOH 208 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? metalc ? metalc54 C O ASP 3 C ASP 3 1_555 T NA NA . C NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc55 C O ASP 6 C ASP 6 1_555 T NA NA . C NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc56 C O ASP 9 C ASP 9 1_555 T NA NA . C NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc57 C OD2 ASP 9 C ASP 9 1_555 W CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc58 T NA NA . C NA 101 1_555 PA O HOH . C HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc59 T NA NA . C NA 101 1_555 PA O HOH . C HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc60 T NA NA . C NA 101 1_555 PA O HOH . C HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc61 PA O HOH . C HOH 201 5_564 BA NA NA . E NA 105 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc62 PA O HOH . C HOH 203 4_554 V NA NA . D NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc ? metalc63 D OD1 ASP 2 D ASP 2 1_555 W CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc64 D OD2 ASP 2 D ASP 2 1_555 W CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc65 D O ASP 2 D ASP 2 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc66 D O ASP 3 D ASP 3 1_555 U NA NA . D NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? metalc ? metalc67 D OD1 ASP 3 D ASP 3 1_555 V NA NA . D NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc ? metalc68 D OD2 ASP 3 D ASP 3 1_555 V NA NA . D NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc69 D O ASP 6 D ASP 6 1_555 U NA NA . D NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc70 D O ASP 9 D ASP 9 1_555 U NA NA . D NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc71 D OD2 ASP 9 D ASP 9 1_555 W CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc72 U NA NA . D NA 101 1_555 QA O HOH . D HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc73 U NA NA . D NA 101 1_555 QA O HOH . D HOH 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc74 U NA NA . D NA 101 1_555 QA O HOH . D HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc75 V NA NA . D NA 102 1_555 QA O HOH . D HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.953 ? metalc ? metalc76 QA O HOH . D HOH 210 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc77 QA O HOH . D HOH 212 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc78 QA O HOH . D HOH 212 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc79 QA O HOH . D HOH 213 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc80 QA O HOH . D HOH 213 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc81 E O ASP 2 E ASP 2 1_555 BA NA NA . E NA 105 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc82 E OD1 ASP 2 E ASP 2 1_555 CA CD CD . E CD 106 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc ? metalc83 E OD1 ASP 2 E ASP 2 1_555 CA CD CD . E CD 106 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc84 E OD2 ASP 2 E ASP 2 1_555 CA CD CD . E CD 106 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc85 E O ASP 3 E ASP 3 1_555 X NA NA . E NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc86 E OD1 ASP 3 E ASP 3 1_555 AA NA NA . E NA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc87 E OD2 ASP 3 E ASP 3 1_555 AA NA NA . E NA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc88 E O ASP 5 E ASP 5 1_555 Z NA NA . E NA 103 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc89 E O ASP 6 E ASP 6 1_555 X NA NA . E NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc90 E OD1 ASP 6 E ASP 6 1_555 FA CD CD . F CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc91 E OD2 ASP 6 E ASP 6 1_555 FA CD CD . F CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc92 E O ASP 9 E ASP 9 1_555 X NA NA . E NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc93 E OD2 ASP 9 E ASP 9 1_555 CA CD CD . E CD 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc94 X NA NA . E NA 101 1_555 I OD1 ASP 2 I ASP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc95 X NA NA . E NA 101 1_555 VA O HOH . I HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc96 X NA NA . E NA 101 1_555 VA O HOH . I HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc97 Z NA NA . E NA 103 1_555 RA O HOH . E HOH 210 1_555 ? C ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc98 Z NA NA . E NA 103 1_555 F O ASP 2 F ASP 2 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc99 Z NA NA . E NA 103 1_555 SA O HOH . F HOH 208 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc100 Z NA NA . E NA 103 1_555 SA O HOH . F HOH 208 1_555 ? C ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc101 Z NA NA . E NA 103 1_555 SA O HOH . F HOH 211 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? metalc ? metalc102 AA NA NA . E NA 104 1_555 TA O HOH . G HOH 205 4_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? metalc ? metalc103 BA NA NA . E NA 105 1_555 RA O HOH . E HOH 203 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc104 BA NA NA . E NA 105 1_555 RA O HOH . E HOH 208 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? metalc ? metalc105 BA NA NA . E NA 105 1_555 RA O HOH . E HOH 208 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? metalc ? metalc106 BA NA NA . E NA 105 1_555 RA O HOH . E HOH 212 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? metalc ? metalc107 BA NA NA . E NA 105 1_555 RA O HOH . E HOH 212 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.194 ? metalc ? metalc108 CA CD CD . E CD 106 1_555 G OD2 ASP 3 G ASP 3 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc109 CA CD CD . E CD 106 1_555 G OD2 ASP 3 G ASP 3 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc110 CA CD CD . E CD 106 1_555 G OD1 ASP 5 G ASP 5 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc111 CA CD CD . E CD 106 1_555 H OD2 ASP 6 H ASP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc112 F OD1 ASP 2 F ASP 2 1_555 FA CD CD . F CD 103 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc113 F OD2 ASP 2 F ASP 2 1_555 FA CD CD . F CD 103 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc114 F O ASP 3 F ASP 3 1_555 DA NA NA . F NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc115 F OD1 ASP 3 F ASP 3 1_555 EA NA NA . F NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? metalc ? metalc116 F OD2 ASP 3 F ASP 3 1_555 EA NA NA . F NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc117 F O ASP 6 F ASP 6 1_555 DA NA NA . F NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc118 F OD1 ASP 6 F ASP 6 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? metalc ? metalc119 F OD2 ASP 6 F ASP 6 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc120 F OD1 ASP 8 F ASP 8 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc121 F O ASP 9 F ASP 9 1_555 DA NA NA . F NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc122 F OD2 ASP 9 F ASP 9 1_555 FA CD CD . F CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc123 DA NA NA . F NA 101 1_555 J OD1 ASP 2 J ASP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc124 DA NA NA . F NA 101 1_555 WA O HOH . J HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc125 DA NA NA . F NA 101 1_555 WA O HOH . J HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc126 EA NA NA . F NA 102 1_555 TA O HOH . G HOH 204 4_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc127 FA CD CD . F CD 103 1_555 G OD2 ASP 6 G ASP 6 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc128 FA CD CD . F CD 103 1_555 G OD1 ASP 8 G ASP 8 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? metalc ? metalc129 G O ASP 3 G ASP 3 1_555 GA NA NA . G NA 101 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc130 G O ASP 3 G ASP 3 1_555 GA NA NA . G NA 101 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc131 G O ASP 6 G ASP 6 1_555 GA NA NA . G NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc132 G O ASP 9 G ASP 9 1_555 GA NA NA . G NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc133 G OD2 ASP 9 G ASP 9 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc134 GA NA NA . G NA 101 1_555 TA O HOH . G HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc135 GA NA NA . G NA 101 1_555 TA O HOH . G HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? metalc ? metalc136 GA NA NA . G NA 101 1_555 TA O HOH . G HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc137 TA O HOH . G HOH 203 4_555 IA NA NA . H NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.851 ? metalc ? metalc138 H OD1 ASP 2 H ASP 2 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc139 H OD2 ASP 2 H ASP 2 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc140 H O ASP 3 H ASP 3 1_555 HA NA NA . H NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc141 H OD1 ASP 3 H ASP 3 1_555 IA NA NA . H NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.852 ? metalc ? metalc142 H OD2 ASP 3 H ASP 3 1_555 IA NA NA . H NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc143 H O ASP 6 H ASP 6 1_555 HA NA NA . H NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc144 H O ASP 9 H ASP 9 1_555 HA NA NA . H NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc145 H OD2 ASP 9 H ASP 9 1_555 JA CD CD . H CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc146 HA NA NA . H NA 101 1_555 UA O HOH . H HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc147 HA NA NA . H NA 101 1_555 UA O HOH . H HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc148 HA NA NA . H NA 101 1_555 UA O HOH . H HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc149 IA NA NA . H NA 102 1_555 UA O HOH . H HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc150 I O ASP 3 I ASP 3 1_555 KA NA NA . I NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc151 I O ASP 3 I ASP 3 1_555 KA NA NA . I NA 101 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc152 KA NA NA . I NA 101 1_555 VA O HOH . I HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc153 KA NA NA . I NA 101 1_555 VA O HOH . I HOH 208 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc154 J O ASP 3 J ASP 3 1_555 LA NA NA . J NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc155 J O ASP 3 J ASP 3 1_555 LA NA NA . J NA 101 3_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc156 LA NA NA . J NA 101 1_555 WA O HOH . J HOH 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc157 LA NA NA . J NA 101 1_555 WA O HOH . J HOH 206 3_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc158 K O ASP 3 K ASP 3 1_555 MA NA NA . K NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc159 K O ASP 3 K ASP 3 1_555 MA NA NA . K NA 101 3_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc160 MA NA NA . K NA 101 1_555 XA O HOH . K HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc161 MA NA NA . K NA 101 1_555 XA O HOH . K HOH 208 3_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6UGC _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019596 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.011314 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.022628 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.027762 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code L 2 NA A 1 101 1 NA NA . M 2 NA A 1 102 14 NA NA . N 2 NA A 1 103 16 NA NA . O 3 CD A 1 104 27 CD CD . P 2 NA B 1 101 2 NA NA . Q 2 NA B 1 102 11 NA NA . R 2 NA B 1 103 15 NA NA . S 3 CD B 1 104 23 CD CD . T 2 NA C 1 101 3 NA NA . U 2 NA D 1 101 4 NA NA . V 2 NA D 1 102 17 NA NA . W 3 CD D 1 103 25 CD CD . X 2 NA E 1 101 5 NA NA . Y 2 NA E 1 102 10 NA NA . Z 2 NA E 1 103 18 NA NA . AA 2 NA E 1 104 21 NA NA . BA 2 NA E 1 105 22 NA NA . CA 3 CD E 1 106 26 CD CD . DA 2 NA F 1 101 6 NA NA . EA 2 NA F 1 102 20 NA NA . FA 3 CD F 1 103 24 CD CD . GA 2 NA G 1 101 7 NA NA . HA 2 NA H 1 101 8 NA NA . IA 2 NA H 1 102 19 NA NA . JA 3 CD H 1 103 28 CD CD . KA 2 NA I 1 101 9 NA NA . LA 2 NA J 1 101 12 NA NA . MA 2 NA K 1 101 13 NA NA . NA 4 HOH A 1 201 117 HOH HOH . NA 4 HOH A 2 202 37 HOH HOH . NA 4 HOH A 3 203 50 HOH HOH . NA 4 HOH A 4 204 38 HOH HOH . NA 4 HOH A 5 205 90 HOH HOH . NA 4 HOH A 6 206 123 HOH HOH . NA 4 HOH A 7 207 131 HOH HOH . NA 4 HOH A 8 208 71 HOH HOH . NA 4 HOH A 9 209 46 HOH HOH . NA 4 HOH A 10 210 101 HOH HOH . NA 4 HOH A 11 211 80 HOH HOH . NA 4 HOH A 12 212 115 HOH HOH . OA 4 HOH B 1 201 74 HOH HOH . OA 4 HOH B 2 202 134 HOH HOH . OA 4 HOH B 3 203 40 HOH HOH . OA 4 HOH B 4 204 36 HOH HOH . OA 4 HOH B 5 205 67 HOH HOH . OA 4 HOH B 6 206 83 HOH HOH . OA 4 HOH B 7 207 119 HOH HOH . OA 4 HOH B 8 208 79 HOH HOH . OA 4 HOH B 9 209 87 HOH HOH . OA 4 HOH B 10 210 54 HOH HOH . OA 4 HOH B 11 211 102 HOH HOH . OA 4 HOH B 12 212 82 HOH HOH . PA 4 HOH C 1 201 128 HOH HOH . PA 4 HOH C 2 202 64 HOH HOH . PA 4 HOH C 3 203 53 HOH HOH . PA 4 HOH C 4 204 52 HOH HOH . PA 4 HOH C 5 205 51 HOH HOH . QA 4 HOH D 1 201 39 HOH HOH . QA 4 HOH D 2 202 86 HOH HOH . QA 4 HOH D 3 203 35 HOH HOH . QA 4 HOH D 4 204 116 HOH HOH . QA 4 HOH D 5 205 48 HOH HOH . QA 4 HOH D 6 206 118 HOH HOH . QA 4 HOH D 7 207 69 HOH HOH . QA 4 HOH D 8 208 112 HOH HOH . QA 4 HOH D 9 209 44 HOH HOH . QA 4 HOH D 10 210 94 HOH HOH . QA 4 HOH D 11 211 68 HOH HOH . QA 4 HOH D 12 212 97 HOH HOH . QA 4 HOH D 13 213 121 HOH HOH . QA 4 HOH D 14 214 129 HOH HOH . QA 4 HOH D 15 215 88 HOH HOH . QA 4 HOH D 16 216 84 HOH HOH . RA 4 HOH E 1 201 31 HOH HOH . RA 4 HOH E 2 202 33 HOH HOH . RA 4 HOH E 3 203 78 HOH HOH . RA 4 HOH E 4 204 30 HOH HOH . RA 4 HOH E 5 205 111 HOH HOH . RA 4 HOH E 6 206 72 HOH HOH . RA 4 HOH E 7 207 91 HOH HOH . RA 4 HOH E 8 208 122 HOH HOH . RA 4 HOH E 9 209 124 HOH HOH . RA 4 HOH E 10 210 120 HOH HOH . RA 4 HOH E 11 211 130 HOH HOH . RA 4 HOH E 12 212 105 HOH HOH . SA 4 HOH F 1 201 34 HOH HOH . SA 4 HOH F 2 202 32 HOH HOH . SA 4 HOH F 3 203 81 HOH HOH . SA 4 HOH F 4 204 104 HOH HOH . SA 4 HOH F 5 205 63 HOH HOH . SA 4 HOH F 6 206 126 HOH HOH . SA 4 HOH F 7 207 92 HOH HOH . SA 4 HOH F 8 208 77 HOH HOH . SA 4 HOH F 9 209 132 HOH HOH . SA 4 HOH F 10 210 110 HOH HOH . SA 4 HOH F 11 211 114 HOH HOH . SA 4 HOH F 12 212 133 HOH HOH . TA 4 HOH G 1 201 29 HOH HOH . TA 4 HOH G 2 202 75 HOH HOH . TA 4 HOH G 3 203 59 HOH HOH . TA 4 HOH G 4 204 57 HOH HOH . TA 4 HOH G 5 205 58 HOH HOH . UA 4 HOH H 1 201 49 HOH HOH . UA 4 HOH H 2 202 70 HOH HOH . UA 4 HOH H 3 203 100 HOH HOH . UA 4 HOH H 4 204 61 HOH HOH . UA 4 HOH H 5 205 60 HOH HOH . UA 4 HOH H 6 206 89 HOH HOH . UA 4 HOH H 7 207 125 HOH HOH . UA 4 HOH H 8 208 85 HOH HOH . VA 4 HOH I 1 201 109 HOH HOH . VA 4 HOH I 2 202 113 HOH HOH . VA 4 HOH I 3 203 65 HOH HOH . VA 4 HOH I 4 204 76 HOH HOH . VA 4 HOH I 5 205 56 HOH HOH . VA 4 HOH I 6 206 43 HOH HOH . VA 4 HOH I 7 207 103 HOH HOH . VA 4 HOH I 8 208 62 HOH HOH . WA 4 HOH J 1 201 96 HOH HOH . WA 4 HOH J 2 202 47 HOH HOH . WA 4 HOH J 3 203 42 HOH HOH . WA 4 HOH J 4 204 73 HOH HOH . WA 4 HOH J 5 205 107 HOH HOH . WA 4 HOH J 6 206 95 HOH HOH . WA 4 HOH J 7 207 108 HOH HOH . XA 4 HOH K 1 201 93 HOH HOH . XA 4 HOH K 2 202 99 HOH HOH . XA 4 HOH K 3 203 98 HOH HOH . XA 4 HOH K 4 204 66 HOH HOH . XA 4 HOH K 5 205 45 HOH HOH . XA 4 HOH K 6 206 41 HOH HOH . XA 4 HOH K 7 207 106 HOH HOH . XA 4 HOH K 8 208 55 HOH HOH . XA 4 HOH K 9 209 127 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id HA _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 4.467 _atom_site.Cartn_y 6.683 _atom_site.Cartn_z 6.38 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 5.16 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 101 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 336 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 1 #