data_6UM7 # _model_server_result.job_id NIVYpIZ4WqvKDGkoyVPyfg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 20:20:16' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6um7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":621}' # _entry.id 6UM7 # _exptl.entry_id 6UM7 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6UM7 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6UM7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 6 ? 6 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 7 ? 6 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 L 1 NAG A 601 NAG 5 n M NAG 2 L 2 NAG A 602 NAG 5 n M BMA 3 L 3 BMA A 603 BMA 5 n N NAG 1 M 1 NAG A 604 NAG 5 n N NAG 2 M 2 NAG A 605 NAG 5 n N BMA 3 M 3 BMA A 606 BMA 6 n O NAG 1 N 1 NAG A 607 NAG 6 n O NAG 2 N 2 NAG A 608 NAG 6 n O BMA 3 N 3 BMA A 609 BMA 6 n O MAN 4 N 4 MAN A 610 MAN 6 n O MAN 5 N 5 MAN A 612 MAN 6 n O MAN 6 N 6 MAN A 611 MAN 5 n P NAG 1 O 1 NAG A 613 NAG 5 n P NAG 2 O 2 NAG A 614 NAG 5 n P BMA 3 O 3 BMA A 615 BMA 5 n Q NAG 1 P 1 NAG A 616 NAG 5 n Q NAG 2 P 2 NAG A 617 NAG 5 n Q BMA 3 P 3 BMA A 618 BMA 5 n R NAG 1 Q 1 NAG E 601 NAG 5 n R NAG 2 Q 2 NAG E 602 NAG 5 n R BMA 3 Q 3 BMA E 603 BMA 5 n S NAG 1 R 1 NAG E 604 NAG 5 n S NAG 2 R 2 NAG E 605 NAG 5 n S BMA 3 R 3 BMA E 606 BMA 6 n T NAG 1 S 1 NAG E 607 NAG 6 n T NAG 2 S 2 NAG E 608 NAG 6 n T BMA 3 S 3 BMA E 609 BMA 6 n T MAN 4 S 4 MAN E 610 MAN 6 n T MAN 5 S 5 MAN E 612 MAN 6 n T MAN 6 S 6 MAN E 611 MAN 5 n U NAG 1 T 1 NAG E 613 NAG 5 n U NAG 2 T 2 NAG E 614 NAG 5 n U BMA 3 T 3 BMA E 615 BMA 5 n V NAG 1 U 1 NAG E 616 NAG 5 n V NAG 2 U 2 NAG E 617 NAG 5 n V BMA 3 U 3 BMA E 618 BMA 5 n W NAG 1 V 1 NAG I 601 NAG 5 n W NAG 2 V 2 NAG I 602 NAG 5 n W BMA 3 V 3 BMA I 603 BMA 5 n X NAG 1 W 1 NAG I 604 NAG 5 n X NAG 2 W 2 NAG I 605 NAG 5 n X BMA 3 W 3 BMA I 606 BMA 6 n Y NAG 1 X 1 NAG I 607 NAG 6 n Y NAG 2 X 2 NAG I 608 NAG 6 n Y BMA 3 X 3 BMA I 609 BMA 6 n Y MAN 4 X 4 MAN I 610 MAN 6 n Y MAN 5 X 5 MAN I 612 MAN 6 n Y MAN 6 X 6 MAN I 611 MAN 5 n Z NAG 1 Y 1 NAG I 613 NAG 5 n Z NAG 2 Y 2 NAG I 614 NAG 5 n Z BMA 3 Y 3 BMA I 615 BMA 5 n AA NAG 1 Z 1 NAG I 616 NAG 5 n AA NAG 2 Z 2 NAG I 617 NAG 5 n AA BMA 3 Z 3 BMA I 618 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 24 A CYS 54 1_555 A SG CYS 44 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 89 A CYS 119 1_555 A SG CYS 167 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 163 A CYS 201 1_555 A SG CYS 391 A CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 180 A CYS 218 1_555 A SG CYS 209 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 190 A CYS 228 1_555 A SG CYS 201 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 258 A CYS 296 1_555 A SG CYS 292 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.981 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 338 A CYS 378 1_555 A SG CYS 403 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 345 A CYS 385 1_555 A SG CYS 376 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 95 H CYS 598 1_555 B SG CYS 101 H CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 41 J CYS 22 1_555 C SG CYS 115 J CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 41 K CYS 22 1_555 D SG CYS 109 K CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 95 D CYS 598 1_555 E SG CYS 101 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf13 F SG CYS 24 E CYS 54 1_555 F SG CYS 44 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? disulf ? disulf14 F SG CYS 89 E CYS 119 1_555 F SG CYS 167 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? disulf ? disulf15 F SG CYS 163 E CYS 201 1_555 F SG CYS 391 E CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 180 E CYS 218 1_555 F SG CYS 209 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf17 F SG CYS 190 E CYS 228 1_555 F SG CYS 201 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 258 E CYS 296 1_555 F SG CYS 292 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? disulf ? disulf19 F SG CYS 338 E CYS 378 1_555 F SG CYS 403 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 345 E CYS 385 1_555 F SG CYS 376 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 41 F CYS 22 1_555 G SG CYS 115 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? disulf ? disulf22 H SG CYS 41 G CYS 22 1_555 H SG CYS 109 G CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf23 I SG CYS 95 1 CYS 598 1_555 I SG CYS 101 1 CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? disulf ? disulf24 J SG CYS 41 B CYS 22 1_555 J SG CYS 115 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf25 K SG CYS 41 C CYS 22 1_555 K SG CYS 109 C CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf26 L SG CYS 24 I CYS 54 1_555 L SG CYS 44 I CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? disulf ? disulf27 L SG CYS 89 I CYS 119 1_555 L SG CYS 167 I CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? disulf ? disulf28 L SG CYS 163 I CYS 201 1_555 L SG CYS 391 I CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? disulf ? disulf29 L SG CYS 180 I CYS 218 1_555 L SG CYS 209 I CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf30 L SG CYS 190 I CYS 228 1_555 L SG CYS 201 I CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf31 L SG CYS 258 I CYS 296 1_555 L SG CYS 292 I CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? disulf ? disulf32 L SG CYS 338 I CYS 378 1_555 L SG CYS 403 I CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? disulf ? disulf33 L SG CYS 345 I CYS 385 1_555 L SG CYS 376 I CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 A ASN 88 1_555 GA C1 NAG . A NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 116 A ASN 154 1_555 P C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 120 A ASN 158 1_555 EA C1 NAG . A NAG 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 159 A ASN 197 1_555 DA C1 NAG . A NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 196 A ASN 234 1_555 FA C1 NAG . A NAG 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 203 A ASN 241 1_555 HA C1 NAG . A NAG 625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.552 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 224 A ASN 262 1_555 M C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 263 A ASN 301 1_555 N C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 293 A ASN 332 1_555 O C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 300 A ASN 339 1_555 IA C1 NAG . A NAG 626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.653 sing covale ? covale11 A ND2 ASN 322 A ASN 362 1_555 CA C1 NAG . A NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 346 A ASN 386 1_555 BA C1 NAG . A NAG 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 352 A ASN 392 1_555 Q C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale14 F ND2 ASN 58 E ASN 88 1_555 OA C1 NAG . E NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 F ND2 ASN 116 E ASN 154 1_555 U C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale16 F ND2 ASN 120 E ASN 158 1_555 MA C1 NAG . E NAG 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale17 F ND2 ASN 159 E ASN 197 1_555 LA C1 NAG . E NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale18 F ND2 ASN 196 E ASN 234 1_555 NA C1 NAG . E NAG 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 F ND2 ASN 203 E ASN 241 1_555 PA C1 NAG . E NAG 625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.552 ? covale ? covale20 F ND2 ASN 224 E ASN 262 1_555 R C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 263 E ASN 301 1_555 S C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 293 E ASN 332 1_555 T C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 F ND2 ASN 300 E ASN 339 1_555 QA C1 NAG . E NAG 626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.652 sing covale ? covale24 F ND2 ASN 322 E ASN 362 1_555 KA C1 NAG . E NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 F ND2 ASN 346 E ASN 386 1_555 JA C1 NAG . E NAG 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale26 F ND2 ASN 352 E ASN 392 1_555 V C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale27 L ND2 ASN 58 I ASN 88 1_555 WA C1 NAG . I NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale28 L ND2 ASN 116 I ASN 154 1_555 Z C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale29 L ND2 ASN 120 I ASN 158 1_555 UA C1 NAG . I NAG 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale30 L ND2 ASN 159 I ASN 197 1_555 TA C1 NAG . I NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 L ND2 ASN 196 I ASN 234 1_555 VA C1 NAG . I NAG 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale32 L ND2 ASN 203 I ASN 241 1_555 XA C1 NAG . I NAG 625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.554 ? covale ? covale33 L ND2 ASN 224 I ASN 262 1_555 W C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale34 L ND2 ASN 263 I ASN 301 1_555 X C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale35 L ND2 ASN 293 I ASN 332 1_555 Y C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 L ND2 ASN 300 I ASN 339 1_555 YA C1 NAG . I NAG 626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.653 sing covale ? covale37 L ND2 ASN 322 I ASN 362 1_555 SA C1 NAG . I NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale38 L ND2 ASN 346 I ASN 386 1_555 RA C1 NAG . I NAG 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale39 L ND2 ASN 352 I ASN 392 1_555 AA C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale40 M O4 NAG . L NAG 1 1_555 M C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale41 M O4 NAG . L NAG 2 1_555 M C1 BMA . L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale42 N O4 NAG . M NAG 1 1_555 N C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale43 N O4 NAG . M NAG 2 1_555 N C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale44 O O4 NAG . N NAG 1 1_555 O C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale45 O O4 NAG . N NAG 2 1_555 O C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale46 O O3 BMA . N BMA 3 1_555 O C1 MAN . N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale47 O O6 BMA . N BMA 3 1_555 O C1 MAN . N MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale48 O O2 MAN . N MAN 4 1_555 O C1 MAN . N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale49 P O4 NAG . O NAG 1 1_555 P C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale50 P O4 NAG . O NAG 2 1_555 P C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale51 Q O4 NAG . P NAG 1 1_555 Q C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale52 Q O4 NAG . P NAG 2 1_555 Q C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale53 R O4 NAG . Q NAG 1 1_555 R C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale54 R O4 NAG . Q NAG 2 1_555 R C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale55 S O4 NAG . R NAG 1 1_555 S C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale56 S O4 NAG . R NAG 2 1_555 S C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale57 T O4 NAG . S NAG 1 1_555 T C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale58 T O4 NAG . S NAG 2 1_555 T C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale59 T O3 BMA . S BMA 3 1_555 T C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale60 T O6 BMA . S BMA 3 1_555 T C1 MAN . S MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale61 T O2 MAN . S MAN 4 1_555 T C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale62 U O4 NAG . T NAG 1 1_555 U C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale63 U O4 NAG . T NAG 2 1_555 U C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale64 V O4 NAG . U NAG 1 1_555 V C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale65 V O4 NAG . U NAG 2 1_555 V C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale66 W O4 NAG . V NAG 1 1_555 W C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale67 W O4 NAG . V NAG 2 1_555 W C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale68 X O4 NAG . W NAG 1 1_555 X C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale69 X O4 NAG . W NAG 2 1_555 X C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale70 Y O4 NAG . X NAG 1 1_555 Y C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale71 Y O4 NAG . X NAG 2 1_555 Y C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale72 Y O3 BMA . X BMA 3 1_555 Y C1 MAN . X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale73 Y O6 BMA . X BMA 3 1_555 Y C1 MAN . X MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale74 Y O2 MAN . X MAN 4 1_555 Y C1 MAN . X MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale75 Z O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale76 Z O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale77 AA O4 NAG . Z NAG 1 1_555 AA C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale78 AA O4 NAG . Z NAG 2 1_555 AA C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6UM7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code BA 7 NAG A 1 619 619 NAG NAG . CA 7 NAG A 1 620 620 NAG NAG . DA 7 NAG A 1 621 621 NAG NAG . EA 7 NAG A 1 622 622 NAG NAG . FA 7 NAG A 1 623 623 NAG NAG . GA 7 NAG A 1 624 624 NAG NAG . HA 7 NAG A 1 625 625 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 626 626 NAG NAG . JA 7 NAG E 1 619 619 NAG NAG . KA 7 NAG E 1 620 620 NAG NAG . LA 7 NAG E 1 621 621 NAG NAG . MA 7 NAG E 1 622 622 NAG NAG . NA 7 NAG E 1 623 623 NAG NAG . OA 7 NAG E 1 624 624 NAG NAG . PA 7 NAG E 1 625 625 NAG NAG . QA 7 NAG E 1 626 626 NAG NAG . RA 7 NAG I 1 619 619 NAG NAG . SA 7 NAG I 1 620 620 NAG NAG . TA 7 NAG I 1 621 621 NAG NAG . UA 7 NAG I 1 622 622 NAG NAG . VA 7 NAG I 1 623 623 NAG NAG . WA 7 NAG I 1 624 624 NAG NAG . XA 7 NAG I 1 625 625 NAG NAG . YA 7 NAG I 1 626 626 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . DA 7 154.37 186.332 184.512 1 131.13 ? C1 NAG 621 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . DA 7 153.128 186.094 183.669 1 131.13 ? C2 NAG 621 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . DA 7 152.603 187.409 183.13 1 131.13 ? C3 NAG 621 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . DA 7 152.313 188.329 184.298 1 131.13 ? C4 NAG 621 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . DA 7 153.578 188.504 185.12 1 131.13 ? C5 NAG 621 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . DA 7 153.274 189.375 186.329 1 131.13 ? C6 NAG 621 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . DA 7 153.008 183.94 182.613 1 131.13 ? C7 NAG 621 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . DA 7 152.906 183.241 181.288 1 131.13 ? C8 NAG 621 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . DA 7 153.422 185.198 182.575 1 131.13 ? N2 NAG 621 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . DA 7 151.401 187.167 182.395 1 131.13 ? O3 NAG 621 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . DA 7 151.876 189.603 183.817 1 131.13 ? O4 NAG 621 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . DA 7 154.04 187.232 185.568 1 131.13 ? O5 NAG 621 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . DA 7 152.065 188.905 186.93 1 131.13 ? O6 NAG 621 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . DA 7 152.724 183.392 183.666 1 131.13 ? O7 NAG 621 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 79 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 24 _model_server_stats.query_time_ms 273 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #