data_6UNP
#
_model_server_result.job_id            9Jx8IJxuZ96VgxFd13vZGw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-30 06:00:56' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6unp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"EA","auth_seq_id":616}' 
#
_entry.id    6UNP 
#
_exptl.entry_id    6UNP 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            6UNP 
_cell.length_a            138.497 
_cell.length_b            138.497 
_cell.length_c            109.992 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6UNP 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        154 
_symmetry.space_group_name_Hall    'P 32 2"' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 32 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,FA 1 1 
B,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,GA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 O N N 
? 5 DA N N 
? 5 EA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C LEU 121 A LEU 287 1_555 A N CAS 122 A CAS 288 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale2 A C CAS 122 A CAS 288 1_555 A N LYS 123 A LYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale3 A C ASP 230 A ASP 396 1_555 A N CAS 231 A CAS 397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? 
covale ? covale4 A C CAS 231 A CAS 397 1_555 A N GLU 232 A GLU 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale5 A C GLN 329 A GLN 495 1_555 A N CAS 330 A CAS 496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale6 A C CAS 330 A CAS 496 1_555 A N ALA 331 A ALA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale7 B C LEU 121 B LEU 287 1_555 B N CAS 122 B CAS 288 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale8 B C CAS 122 B CAS 288 1_555 B N LYS 123 B LYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale9 B C ASP 230 B ASP 396 1_555 B N CAS 231 B CAS 397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale10 B C CAS 231 B CAS 397 1_555 B N GLU 232 B GLU 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale11 B C GLN 329 B GLN 495 1_555 B N CAS 330 B CAS 496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale12 B C CAS 330 B CAS 496 1_555 B N ALA 331 B ALA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
metalc ? metalc1 A O ALA 69 A ALA 235 1_555 J MG MG . A MG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASN 172 A ASN 338 1_555 E MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 185 A ASP 351 1_555 E MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
metalc ? metalc4 A O ARG 215 A ARG 381 1_555 H MG MG . A MG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? 
metalc ? metalc5 A O MET 217 A MET 383 1_555 H MG MG . A MG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? 
metalc ? metalc6 A OH TYR 241 A TYR 407 1_555 H MG MG . A MG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 333 A GLU 499 1_555 I MG MG . A MG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc8 C O2B ADP . A ADP 601 1_555 E MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
metalc ? metalc9 C O1A ADP . A ADP 601 1_555 E MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? 
metalc ? metalc10 C O2B ADP . A ADP 601 1_555 K MG MG . A MG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? 
metalc ? metalc11 E MG MG . A MG 603 1_555 FA O HOH . A HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.887 ? 
metalc ? metalc12 E MG MG . A MG 603 1_555 FA O HOH . A HOH 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc13 K MG MG . A MG 609 1_555 M O1 SO4 . A SO4 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? 
metalc ? metalc14 K MG MG . A MG 609 1_555 FA O HOH . A HOH 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.933 ? 
metalc ? metalc15 FA O HOH . A HOH 702 1_555 AA MG MG . B MG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? 
metalc ? metalc16 B O PRO 60 B PRO 226 1_555 R MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.812 ? 
metalc ? metalc17 B OE2 GLU 77 B GLU 243 1_555 T MG MG . B MG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc18 B OH TYR 81 B TYR 247 1_555 T MG MG . B MG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc19 B OH TYR 115 B TYR 281 1_555 AA MG MG . B MG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? 
metalc ? metalc20 B OG SER 130 B SER 296 1_555 V MG MG . B MG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? 
metalc ? metalc21 B OG SER 135 B SER 301 1_555 X MG MG . B MG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? 
metalc ? metalc22 B OE1 GLU 152 B GLU 318 1_555 Y MG MG . B MG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc23 B OD1 ASN 172 B ASN 338 1_555 Q MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? 
metalc ? metalc24 B OD2 ASP 185 B ASP 351 1_555 Q MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? 
metalc ? metalc25 B OE2 GLU 232 B GLU 398 1_555 Y MG MG . B MG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc26 B O ILE 250 B ILE 416 1_555 X MG MG . B MG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? 
metalc ? metalc27 P O1B ADP . B ADP 601 1_555 Q MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? 
metalc ? metalc28 P O1A ADP . B ADP 601 1_555 Q MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.953 ? 
metalc ? metalc29 Q MG MG . B MG 602 1_555 GA O HOH . B HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
metalc ? metalc30 Q MG MG . B MG 602 1_555 GA O HOH . B HOH 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.932 ? 
metalc ? metalc31 R MG MG . B MG 603 1_555 GA O HOH . B HOH 731 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? 
metalc ? metalc32 T MG MG . B MG 605 1_555 GA O HOH . B HOH 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? 
metalc ? metalc33 U MG MG . B MG 606 1_555 GA O HOH . B HOH 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? 
metalc ? metalc34 Z MG MG . B MG 611 1_555 GA O HOH . B HOH 743 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc35 AA MG MG . B MG 612 1_555 GA O HOH . B HOH 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.975 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 148 n n 
C1 C2 EDO sing 149 n n 
C1 H11 EDO sing 150 n n 
C1 H12 EDO sing 151 n n 
O1 HO1 EDO sing 152 n n 
C2 O2 EDO sing 153 n n 
C2 H21 EDO sing 154 n n 
C2 H22 EDO sing 155 n n 
O2 HO2 EDO sing 156 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6UNP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.00722 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004169 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008337 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009092 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 ADP A 1 601 1 ADP ADP . 
D 2 ADP A 1 602 3 ADP ADP . 
E 3 MG A 1 603 1 MG MG . 
F 3 MG A 1 604 3 MG MG . 
G 3 MG A 1 605 4 MG MG . 
H 3 MG A 1 606 6 MG MG . 
I 3 MG A 1 607 7 MG MG . 
J 3 MG A 1 608 19 MG MG . 
K 3 MG A 1 609 23 MG MG . 
L 4 SO4 A 1 610 2 SO4 SO4 . 
M 4 SO4 A 1 611 3 SO4 SO4 . 
N 4 SO4 A 1 612 5 SO4 SO4 . 
O 5 EDO A 1 613 1 EDO EDO . 
P 2 ADP B 1 601 2 ADP ADP . 
Q 3 MG B 1 602 2 MG MG . 
R 3 MG B 1 603 8 MG MG . 
S 3 MG B 1 604 9 MG MG . 
T 3 MG B 1 605 10 MG MG . 
U 3 MG B 1 606 13 MG MG . 
V 3 MG B 1 607 14 MG MG . 
W 3 MG B 1 608 15 MG MG . 
X 3 MG B 1 609 16 MG MG . 
Y 3 MG B 1 610 18 MG MG . 
Z 3 MG B 1 611 20 MG MG . 
AA 3 MG B 1 612 21 MG MG . 
BA 4 SO4 B 1 613 1 SO4 SO4 . 
CA 4 SO4 B 1 614 6 SO4 SO4 . 
DA 5 EDO B 1 615 2 EDO EDO . 
EA 5 EDO B 1 616 3 EDO EDO . 
FA 6 HOH A 1 701 17 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 2 702 14 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 3 703 9 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 4 704 27 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 5 705 5 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 6 706 64 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 7 707 56 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 8 708 87 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 9 709 12 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 10 710 19 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 11 711 55 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 12 712 57 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 13 713 59 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 14 714 53 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 15 715 7 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 16 716 16 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 17 717 2 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 18 718 28 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 19 719 21 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 20 720 93 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 21 721 66 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 22 722 6 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 23 723 8 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 24 724 20 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 25 725 84 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 26 726 1 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 27 727 58 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 28 728 22 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 29 729 69 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 30 730 10 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 31 731 25 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 32 732 52 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 33 733 13 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 34 734 18 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 35 735 3 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 36 736 11 HOH HOH . 
FA 6 HOH A 37 737 49 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 1 701 74 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 2 702 46 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 3 703 32 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 4 704 90 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 5 705 45 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 6 706 54 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 7 707 71 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 8 708 35 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 9 709 91 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 10 710 42 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 11 711 85 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 12 712 86 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 13 713 92 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 14 714 51 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 15 715 98 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 16 716 68 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 17 717 39 HOH HOH . 
GA 6 HOH B 18 718 38 HOH HOH . 
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