data_6UT5
#
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 16:27:41' 
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_model_server_result.query_name        ligand 
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#
_model_server_params.name     atom_site 
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#
_entry.id    6UT5 
#
_exptl.entry_id    6UT5 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            6UT5 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6UT5 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    heptameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      7 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 I N N 
? 4 K N N 
? 4 M N N 
? 4 O N N 
? 4 Q N N 
? 4 S N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG1 THR 222 A THR 222 1_555 I MG MG . A MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 356 A ASP 356 1_555 I MG MG . A MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? 
metalc ? metalc3 H O3G GSP . A GSP 701 1_555 I MG MG . A MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? 
metalc ? metalc4 H O2B GSP . A GSP 701 1_555 I MG MG . A MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? 
metalc ? metalc5 I MG MG . A MG 702 1_555 T O HOH . A HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? 
metalc ? metalc6 I MG MG . A MG 702 1_555 T O HOH . A HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc7 B OG1 THR 222 B THR 222 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? 
metalc ? metalc8 B OD1 ASP 356 B ASP 356 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc9 J O2G GSP . B GSP 701 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc10 J O1B GSP . B GSP 701 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? 
metalc ? metalc11 K MG MG . B MG 702 1_555 U O HOH . B HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? 
metalc ? metalc12 K MG MG . B MG 702 1_555 U O HOH . B HOH 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? 
metalc ? metalc13 C OG1 THR 222 C THR 222 1_555 M MG MG . C MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? 
metalc ? metalc14 C OD2 ASP 356 C ASP 356 1_555 M MG MG . C MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? 
metalc ? metalc15 L O2G GSP . C GSP 701 1_555 M MG MG . C MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? 
metalc ? metalc16 L O2B GSP . C GSP 701 1_555 M MG MG . C MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? 
metalc ? metalc17 M MG MG . C MG 702 1_555 V O HOH . C HOH 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? 
metalc ? metalc18 M MG MG . C MG 702 1_555 V O HOH . C HOH 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? 
metalc ? metalc19 D OG1 THR 222 D THR 222 1_555 O MG MG . D MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc20 N O2G GSP . D GSP 701 1_555 O MG MG . D MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc21 N O1B GSP . D GSP 701 1_555 O MG MG . D MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc22 O MG MG . D MG 702 1_555 W O HOH . D HOH 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? 
metalc ? metalc23 O MG MG . D MG 702 1_555 W O HOH . D HOH 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? 
metalc ? metalc24 O MG MG . D MG 702 1_555 W O HOH . D HOH 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? 
metalc ? metalc25 E OG1 THR 222 E THR 222 1_555 Q MG MG . E MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? 
metalc ? metalc26 P O3G GSP . E GSP 701 1_555 Q MG MG . E MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc27 P O1B GSP . E GSP 701 1_555 Q MG MG . E MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc28 Q MG MG . E MG 702 1_555 X O HOH . E HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc29 Q MG MG . E MG 702 1_555 X O HOH . E HOH 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc30 Q MG MG . E MG 702 1_555 X O HOH . E HOH 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? 
metalc ? metalc31 F OG1 THR 222 F THR 222 1_555 S MG MG . F MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? 
metalc ? metalc32 R O1B GDP . F GDP 701 1_555 S MG MG . F MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? 
metalc ? metalc33 S MG MG . F MG 702 1_555 Y O HOH . F HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? 
metalc ? metalc34 S MG MG . F MG 702 1_555 Y O HOH . F HOH 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6UT5 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
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_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
H 3 GSP A 1 701 701 GSP GSP . 
I 4 MG A 1 702 801 MG MG . 
J 3 GSP B 1 701 701 GSP GSP . 
K 4 MG B 1 702 801 MG MG . 
L 3 GSP C 1 701 701 GSP GSP . 
M 4 MG C 1 702 801 MG MG . 
N 3 GSP D 1 701 701 GSP GSP . 
O 4 MG D 1 702 801 MG MG . 
P 3 GSP E 1 701 701 GSP GSP . 
Q 4 MG E 1 702 801 MG MG . 
R 5 GDP F 1 701 701 GDP GDP . 
S 4 MG F 1 702 801 MG MG . 
T 6 HOH A 1 801 902 HOH HOH . 
T 6 HOH A 2 802 901 HOH HOH . 
T 6 HOH A 3 803 903 HOH HOH . 
U 6 HOH B 1 801 902 HOH HOH . 
U 6 HOH B 2 802 904 HOH HOH . 
U 6 HOH B 3 803 903 HOH HOH . 
U 6 HOH B 4 804 901 HOH HOH . 
V 6 HOH C 1 901 901 HOH HOH . 
V 6 HOH C 2 902 903 HOH HOH . 
V 6 HOH C 3 903 905 HOH HOH . 
V 6 HOH C 4 904 904 HOH HOH . 
V 6 HOH C 5 905 902 HOH HOH . 
W 6 HOH D 1 801 904 HOH HOH . 
W 6 HOH D 2 802 907 HOH HOH . 
W 6 HOH D 3 803 905 HOH HOH . 
W 6 HOH D 4 804 903 HOH HOH . 
W 6 HOH D 5 805 901 HOH HOH . 
W 6 HOH D 6 806 906 HOH HOH . 
W 6 HOH D 7 807 902 HOH HOH . 
X 6 HOH E 1 801 903 HOH HOH . 
X 6 HOH E 2 802 904 HOH HOH . 
X 6 HOH E 3 803 901 HOH HOH . 
X 6 HOH E 4 804 902 HOH HOH . 
X 6 HOH E 5 805 906 HOH HOH . 
X 6 HOH E 6 806 905 HOH HOH . 
Y 6 HOH F 1 801 903 HOH HOH . 
Y 6 HOH F 2 802 901 HOH HOH . 
Y 6 HOH F 3 803 902 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         I 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               205.996 
_atom_site.Cartn_y               228.978 
_atom_site.Cartn_z               193.079 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        48.77 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           702 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              44 
_model_server_stats.parse_time_ms           26 
_model_server_stats.create_model_time_ms    27 
_model_server_stats.query_time_ms           304 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#