data_6UU8 # _model_server_result.job_id jQ4iawKuZHjfPFphLn2Gfw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 19:29:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6uu8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":1502}' # _entry.id 6UU8 # _exptl.entry_id 6UU8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 10 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6UU8 _cell.length_a 133.46 _cell.length_b 154.504 _cell.length_c 235.697 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6UU8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 10 K N N ? 10 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 D SG CYS 888 DDD CYS 888 1_555 D SG CYS 895 DDD CYS 895 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.573 ? disulf ? disulf2 D SG CYS 888 DDD CYS 888 1_555 D SG CYS 898 DDD CYS 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? disulf ? disulf3 D SG CYS 895 DDD CYS 895 1_555 D SG CYS 898 DDD CYS 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? covale ? covale1 I O3' GTP 1 333 GTP 14 1_555 I P A 2 333 A 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? metalc ? metalc1 D SG CYS 72 DDD CYS 72 1_555 K ZN ZN . DDD ZN 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc2 D SG CYS 85 DDD CYS 85 1_555 K ZN ZN . DDD ZN 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? metalc ? metalc3 D SG CYS 88 DDD CYS 88 1_555 K ZN ZN . DDD ZN 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc4 D OD1 ASP 460 DDD ASP 460 1_555 M MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc5 D OD1 ASP 462 DDD ASP 462 1_555 M MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? metalc ? metalc6 D SG CYS 814 DDD CYS 814 1_555 L ZN ZN . DDD ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? metalc ? metalc7 D SG CYS 898 DDD CYS 898 1_555 L ZN ZN . DDD ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc8 M MG MG . DDD MG 1503 1_555 I O3' G 7 333 G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog1 G N3 DC 16 111 DC 25 1_555 H N2 DG 36 222 DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog2 G O2 DC 16 111 DC 25 1_555 H N1 DG 36 222 DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 G N3 DT 17 111 DT 26 1_555 H N1 DA 35 222 DA 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 G O4 DT 17 111 DT 26 1_555 H N6 DA 35 222 DA 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog5 G O2 DC 18 111 DC 27 1_555 H N2 DG 34 222 DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog6 G O2 DC 20 111 DC 29 1_555 H N2 DG 32 222 DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog7 G N2 DG 21 111 DG 30 1_555 H O2 DC 31 222 DC 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog8 G N3 DT 22 111 DT 31 1_555 H N1 DA 30 222 DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 G N1 DA 23 111 DA 32 1_555 H N3 DT 29 222 DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 G N6 DA 23 111 DA 32 1_555 H O4 DT 29 222 DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 G N3 DT 24 111 DT 33 1_555 H N1 DA 28 222 DA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 G O4 DT 24 111 DT 33 1_555 H N6 DA 28 222 DA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog13 G N2 DG 25 111 DG 34 1_555 H O2 DC 27 222 DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 G N3 DC 26 111 DC 35 1_555 H N1 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G N4 DC 26 111 DC 35 1_555 H O6 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 G O2 DC 26 111 DC 35 1_555 H N2 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 G N3 DT 27 111 DT 36 1_555 H N1 DA 25 222 DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 G O4 DT 27 111 DT 36 1_555 H N6 DA 25 222 DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 G N1 DG 47 111 DG 56 1_555 H N3 DC 5 222 DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 G N2 DG 47 111 DG 56 1_555 H O2 DC 5 222 DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 G O6 DG 47 111 DG 56 1_555 H N4 DC 5 222 DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog22 G O2 DC 48 111 DC 57 1_555 H N2 DG 4 222 DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 G N1 DG 49 111 DG 58 1_555 H N3 DC 3 222 DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 G N2 DG 49 111 DG 58 1_555 H O2 DC 3 222 DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 G O6 DG 49 111 DG 58 1_555 H N4 DC 3 222 DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 G N1 DG 50 111 DG 59 1_555 H N3 DC 2 222 DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 G N2 DG 50 111 DG 59 1_555 H O2 DC 2 222 DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 G O6 DG 50 111 DG 59 1_555 H N4 DC 2 222 DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-G PAIR' hydrog29 H O2 DC 8 222 DC 10 1_555 I N2 G 7 333 G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-U PAIR' hydrog30 H N1 DA 9 222 DA 11 1_555 I N3 U 6 333 U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog31 H N1 DG 10 222 DG 12 1_555 I O2 C 5 333 C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog32 H N2 DG 10 222 DG 12 1_555 I N3 C 5 333 C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-U PAIR' hydrog33 H N1 DA 11 222 DA 13 1_555 I N3 U 4 333 U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-G PAIR' hydrog34 H N3 DC 12 222 DC 14 1_555 I N1 G 3 333 G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-A PAIR' hydrog35 H N3 DT 13 222 DT 15 1_555 I N1 A 2 333 A 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 H N3 DC 14 222 DC 16 1_555 I N1 GTP 1 333 GTP 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 H N4 DC 14 222 DC 16 1_555 I O6 GTP 1 333 GTP 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 H O2 DC 14 222 DC 16 1_555 I N2 GTP 1 333 GTP 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6UU8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007493 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006472 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004243 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 9 MG CCC 1 1401 1504 MG MG . K 10 ZN DDD 1 1501 1501 ZN ZN . L 10 ZN DDD 1 1502 1502 ZN ZN . M 9 MG DDD 1 1503 1503 MG MG . N 11 DPO DDD 1 1504 101 DPO DPO . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id L _atom_site.label_entity_id 10 _atom_site.Cartn_x 10.234 _atom_site.Cartn_y -15.158 _atom_site.Cartn_z -53.828 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 269.16 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1502 _atom_site.auth_asym_id DDD _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 36 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 42 _model_server_stats.query_time_ms 323 _model_server_stats.encode_time_ms 14 _model_server_stats.element_count 1 #