data_6UUB # _model_server_result.job_id dBpUy1wLa3L9xOCK4wlnlA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 20:35:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6uub # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":1503}' # _entry.id 6UUB # _exptl.entry_id 6UUB _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6UUB _cell.length_a 132.942 _cell.length_b 154.992 _cell.length_c 233.253 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6UUB _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 I N N ? 8 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C OE1 GLU 813 CCC GLU 813 1_555 I MG MG . CCC MG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc2 I MG MG . CCC MG 1401 1_555 M O1B UTP . DDD UTP 1504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc ? metalc3 D SG CYS 72 DDD CYS 72 1_555 J ZN ZN . DDD ZN 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc4 D SG CYS 85 DDD CYS 85 1_555 J ZN ZN . DDD ZN 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc5 D SG CYS 88 DDD CYS 88 1_555 J ZN ZN . DDD ZN 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc6 D OD1 ASP 460 DDD ASP 460 1_555 L MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc7 D OD2 ASP 460 DDD ASP 460 1_555 L MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc8 D OD1 ASP 462 DDD ASP 462 1_555 L MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.964 ? metalc ? metalc9 D OD2 ASP 462 DDD ASP 462 1_555 L MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc10 D OD1 ASP 464 DDD ASP 464 1_555 L MG MG . DDD MG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc11 D SG CYS 814 DDD CYS 814 1_555 K ZN ZN . DDD ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc12 D SG CYS 895 DDD CYS 895 1_555 K ZN ZN . DDD ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog1 G N1 DA 19 111 DA 28 1_555 H N3 DT 33 222 DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog2 G O2 DC 20 111 DC 29 1_555 H N2 DG 32 222 DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 G N1 DG 21 111 DG 30 1_555 H N3 DC 31 222 DC 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 G N2 DG 21 111 DG 30 1_555 H O2 DC 31 222 DC 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 G O6 DG 21 111 DG 30 1_555 H N4 DC 31 222 DC 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 G N3 DT 22 111 DT 31 1_555 H N1 DA 30 222 DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 G O4 DT 22 111 DT 31 1_555 H N6 DA 30 222 DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 G N1 DA 23 111 DA 32 1_555 H N3 DT 29 222 DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 G N6 DA 23 111 DA 32 1_555 H O4 DT 29 222 DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 G N3 DT 24 111 DT 33 1_555 H N1 DA 28 222 DA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 G O4 DT 24 111 DT 33 1_555 H N6 DA 28 222 DA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_3_PAIR hydrog12 G N1 DG 25 111 DG 34 1_555 H O6 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_3_PAIR hydrog13 G O6 DG 25 111 DG 34 1_555 H N1 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 G N3 DC 26 111 DC 35 1_555 H N1 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G N4 DC 26 111 DC 35 1_555 H O6 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 G O2 DC 26 111 DC 35 1_555 H N2 DG 26 222 DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 G N3 DT 27 111 DT 36 1_555 H N1 DA 25 222 DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 G O4 DT 27 111 DT 36 1_555 H N6 DA 25 222 DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog19 G N3 DT 41 111 DT 50 1_555 H N1 DA 11 222 DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 G N3 DC 42 111 DC 51 1_555 H N1 DG 10 222 DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 G N4 DC 42 111 DC 51 1_555 H O6 DG 10 222 DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 G O2 DC 42 111 DC 51 1_555 H N2 DG 10 222 DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog23 G N2 DG 44 111 DG 53 1_555 H O2 DC 8 222 DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 G N1 DA 45 111 DA 54 1_555 H N3 DT 7 222 DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 G N6 DA 45 111 DA 54 1_555 H O4 DT 7 222 DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog26 G N3 DC 46 111 DC 55 1_555 H N2 DG 6 222 DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog27 G N1 DG 47 111 DG 56 1_555 H O2 DC 5 222 DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog28 G N2 DG 47 111 DG 56 1_555 H N3 DC 5 222 DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog29 G N3 DC 48 111 DC 57 1_555 H N2 DG 4 222 DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog30 G N2 DG 49 111 DG 58 1_555 H O2 DC 3 222 DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog31 G N1 DG 50 111 DG 59 1_555 H O2 DC 2 222 DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6UUB _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007522 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006452 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004287 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 8 MG CCC 1 1401 1504 MG MG . J 9 ZN DDD 1 1501 1501 ZN ZN . K 9 ZN DDD 1 1502 1502 ZN ZN . L 8 MG DDD 1 1503 1503 MG MG . M 10 UTP DDD 1 1504 501 UTP UTP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id L _atom_site.label_entity_id 8 _atom_site.Cartn_x 28.923 _atom_site.Cartn_y -2.709 _atom_site.Cartn_z -17.126 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 125.7 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1503 _atom_site.auth_asym_id DDD _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 154 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 41 _model_server_stats.query_time_ms 326 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 1 #