data_6UX4 # _model_server_result.job_id gvJIyrqQ4Nk99e7FTEPkTg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 23:02:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ux4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":402}' # _entry.id 6UX4 # _exptl.entry_id 6UX4 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6UX4 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6UX4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 184 A ASP 184 1_555 I CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.085 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 210 A GLU 210 1_555 I CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 212 A GLU 212 1_555 I CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc ? metalc4 A O ARG 241 A ARG 241 1_555 J CA CA . A CA 402 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc5 A O ARG 241 A ARG 241 1_555 J CA CA . A CA 402 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc6 A O ASP 245 A ASP 245 1_555 J CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 248 A GLU 248 1_555 J CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 248 A GLU 248 1_555 J CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.92 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 266 A GLU 266 1_555 L CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 266 A GLU 266 1_555 L CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc11 A O GLY 290 A GLY 290 1_555 K CA CA . A CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 305 A ASP 305 1_555 N CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 305 A ASP 305 1_555 N CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc14 A OE2 GLU 326 A GLU 326 1_555 K CA CA . A CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc15 I CA CA . A CA 401 1_555 GA O HOH . A HOH 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.161 ? metalc ? metalc16 J CA CA . A CA 402 1_555 B OE1 GLU 266 E GLU 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc17 J CA CA . A CA 402 1_555 B OE2 GLU 266 E GLU 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.12 ? metalc ? metalc18 K CA CA . A CA 403 1_555 B OD1 ASP 305 E ASP 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc ? metalc19 K CA CA . A CA 403 1_555 B OD2 ASP 305 E ASP 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc20 L CA CA . A CA 404 1_555 B O ARG 241 E ARG 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc21 L CA CA . A CA 404 1_555 B O ASP 245 E ASP 245 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc22 L CA CA . A CA 404 1_555 B OE1 GLU 248 E GLU 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 184 E ASP 184 1_555 M CA CA . E CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc24 B OD2 ASP 184 E ASP 184 1_555 M CA CA . E CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc ? metalc25 B OE2 GLU 210 E GLU 210 1_555 M CA CA . E CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? metalc ? metalc26 B OE2 GLU 212 E GLU 212 1_555 M CA CA . E CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc27 B O GLY 290 E GLY 290 1_555 N CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc28 B OE2 GLU 326 E GLU 326 1_555 N CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc29 E OD1 ASP 184 C ASP 184 1_555 U CA CA . C CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.134 ? metalc ? metalc30 E OD2 ASP 184 C ASP 184 1_555 U CA CA . C CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.089 ? metalc ? metalc31 E OE2 GLU 210 C GLU 210 1_555 U CA CA . C CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc32 E OE2 GLU 212 C GLU 212 1_555 U CA CA . C CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.884 ? metalc ? metalc33 E O ARG 241 C ARG 241 1_555 V CA CA . C CA 402 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc34 E O ARG 241 C ARG 241 1_555 V CA CA . C CA 402 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc35 E O ASP 245 C ASP 245 1_555 V CA CA . C CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc36 E OE1 GLU 248 C GLU 248 1_555 V CA CA . C CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc37 E OE2 GLU 248 C GLU 248 1_555 V CA CA . C CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.1 ? metalc ? metalc38 E OE1 GLU 266 C GLU 266 1_555 X CA CA . C CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc39 E OE2 GLU 266 C GLU 266 1_555 X CA CA . C CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.76 ? metalc ? metalc40 E O GLY 290 C GLY 290 1_555 W CA CA . C CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc41 E OD1 ASP 305 C ASP 305 1_555 Z CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc ? metalc42 E OD2 ASP 305 C ASP 305 1_555 Z CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc43 E OE1 GLU 326 C GLU 326 1_555 W CA CA . C CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.141 ? metalc ? metalc44 E OE2 GLU 326 C GLU 326 1_555 W CA CA . C CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc45 V CA CA . C CA 402 1_555 F OE1 GLU 266 G GLU 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc46 W CA CA . C CA 403 1_555 F OD1 ASP 305 G ASP 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc47 W CA CA . C CA 403 1_555 F OD2 ASP 305 G ASP 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc48 X CA CA . C CA 404 1_555 F O ARG 241 G ARG 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc49 X CA CA . C CA 404 1_555 F O ASP 245 G ASP 245 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? metalc ? metalc50 X CA CA . C CA 404 1_555 F OE1 GLU 248 G GLU 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc51 F OD1 ASP 184 G ASP 184 1_555 Y CA CA . G CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc52 F OD2 ASP 184 G ASP 184 1_555 Y CA CA . G CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc53 F OE2 GLU 210 G GLU 210 1_555 Y CA CA . G CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc54 F OE2 GLU 212 G GLU 212 1_555 Y CA CA . G CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? metalc ? metalc55 F O GLY 290 G GLY 290 1_555 Z CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc56 F OE1 GLU 326 G GLU 326 1_555 Z CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.047 ? metalc ? metalc57 F OE2 GLU 326 G GLU 326 1_555 Z CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc58 G O GLY 290 D GLY 290 1_555 FA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc59 G OE2 GLU 326 D GLU 326 1_555 FA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? metalc ? metalc60 H OD1 ASP 305 H ASP 305 1_555 FA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc61 H OD2 ASP 305 H ASP 305 1_555 FA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6UX4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 2 CA A 1 401 401 CA CA . J 2 CA A 1 402 402 CA CA . K 2 CA A 1 403 403 CA CA . L 2 CA A 1 404 402 CA CA . M 2 CA E 1 401 401 CA CA . N 2 CA E 1 402 403 CA CA . O 2 CA B 1 401 401 CA CA . P 2 CA B 1 402 402 CA CA . Q 2 CA B 1 403 403 CA CA . R 2 CA B 1 404 402 CA CA . S 2 CA B 1 405 403 CA CA . T 2 CA F 1 401 401 CA CA . U 2 CA C 1 401 401 CA CA . V 2 CA C 1 402 402 CA CA . W 2 CA C 1 403 403 CA CA . X 2 CA C 1 404 402 CA CA . Y 2 CA G 1 401 401 CA CA . Z 2 CA G 1 402 403 CA CA . AA 2 CA D 1 401 401 CA CA . BA 2 CA D 1 402 402 CA CA . CA 2 CA D 1 403 403 CA CA . DA 2 CA D 1 404 402 CA CA . EA 2 CA H 1 401 401 CA CA . FA 2 CA H 1 402 403 CA CA . GA 3 HOH A 1 501 404 HOH HOH . HA 3 HOH B 1 501 404 HOH HOH . IA 3 HOH F 1 501 404 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Z _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 159.422 _atom_site.Cartn_y 79.659 _atom_site.Cartn_z 156.115 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 79.53 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id G _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 260 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #