data_6V4T
#
_model_server_result.job_id            wzJ0iK58SHf2bSqLVzsAZg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-17 12:10:57' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6v4t 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":801}' 
#
_entry.id    6V4T 
#
_exptl.entry_id    6V4T 
_exptl.method      'SOLUTION NMR' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              508.74 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "4,4'-(decane-1,10-diyl)bis(9-amino-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b]quinolin-4-ium)" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
#
_chem_comp.formula           'C34 H44 N4 2' 
_chem_comp.formula_weight    508.74 
_chem_comp.id                QOJ 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              "4,4'-(decane-1,10-diyl)bis(9-amino-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b]quinolin-4-ium)" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C3 C2 QOJ doub 205 n y 
C3 C4 QOJ sing 206 n y 
C2 C1 QOJ sing 207 n y 
C4 C6 QOJ doub 208 n y 
C1 C5 QOJ doub 209 n y 
C23 C24 QOJ sing 210 n n 
C23 C22 QOJ sing 211 n n 
C24 C25 QOJ sing 212 n n 
C22 C21 QOJ sing 213 n n 
C16 C15 QOJ doub 214 n y 
C16 C17 QOJ sing 215 n y 
C15 C10 QOJ sing 216 n y 
N3 C14 QOJ sing 217 n n 
C6 C5 QOJ sing 218 n y 
C6 C7 QOJ sing 219 n y 
C5 N1 QOJ sing 220 n y 
C17 C18 QOJ doub 221 n y 
C20 C21 QOJ sing 222 n n 
C20 C19 QOJ sing 223 n n 
C10 C14 QOJ doub 224 n y 
C10 C11 QOJ sing 225 n y 
C14 C13 QOJ sing 226 n y 
C27 C26 QOJ sing 227 n n 
C27 C28 QOJ sing 228 n n 
C25 C26 QOJ sing 229 n n 
C18 C11 QOJ sing 230 n y 
C11 N2 QOJ doub 231 n y 
C13 C34 QOJ sing 232 n n 
C13 C12 QOJ doub 233 n y 
C34 C33 QOJ sing 234 n n 
N2 C12 QOJ sing 235 n y 
N2 C19 QOJ sing 236 n n 
C12 C29 QOJ sing 237 n n 
N4 C7 QOJ sing 238 n n 
C7 C8 QOJ doub 239 n y 
N1 C28 QOJ sing 240 n n 
N1 C9 QOJ doub 241 n y 
C33 C29 QOJ sing 242 n n 
C9 C8 QOJ sing 243 n y 
C9 C30 QOJ sing 244 n n 
C8 C32 QOJ sing 245 n n 
C30 C31 QOJ sing 246 n n 
C32 C31 QOJ sing 247 n n 
C1 H11 QOJ sing 248 n n 
C2 H21 QOJ sing 249 n n 
C3 H31 QOJ sing 250 n n 
N3 HN32 QOJ sing 251 n n 
N3 HN31 QOJ sing 252 n n 
C4 H41 QOJ sing 253 n n 
N4 HN42 QOJ sing 254 n n 
N4 HN41 QOJ sing 255 n n 
C15 H151 QOJ sing 256 n n 
C16 H161 QOJ sing 257 n n 
C17 H171 QOJ sing 258 n n 
C18 H181 QOJ sing 259 n n 
C19 H192 QOJ sing 260 n n 
C19 H191 QOJ sing 261 n n 
C20 H202 QOJ sing 262 n n 
C20 H201 QOJ sing 263 n n 
C21 H212 QOJ sing 264 n n 
C21 H211 QOJ sing 265 n n 
C22 H222 QOJ sing 266 n n 
C22 H221 QOJ sing 267 n n 
C23 H232 QOJ sing 268 n n 
C23 H231 QOJ sing 269 n n 
C24 H241 QOJ sing 270 n n 
C24 H242 QOJ sing 271 n n 
C25 H251 QOJ sing 272 n n 
C25 H252 QOJ sing 273 n n 
C26 H262 QOJ sing 274 n n 
C26 H261 QOJ sing 275 n n 
C27 H271 QOJ sing 276 n n 
C27 H272 QOJ sing 277 n n 
C28 H281 QOJ sing 278 n n 
C28 H282 QOJ sing 279 n n 
C29 H291 QOJ sing 280 n n 
C29 H292 QOJ sing 281 n n 
C30 H301 QOJ sing 282 n n 
C30 H302 QOJ sing 283 n n 
C31 H311 QOJ sing 284 n n 
C31 H312 QOJ sing 285 n n 
C32 H322 QOJ sing 286 n n 
C32 H321 QOJ sing 287 n n 
C33 H332 QOJ sing 288 n n 
C33 H331 QOJ sing 289 n n 
C34 H342 QOJ sing 290 n n 
C34 H341 QOJ sing 291 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6V4T 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 2 QOJ A 1 801 1 QOJ UNL . 
E 2 QOJ B 1 801 1 QOJ UNL . 
F 2 QOJ C 1 801 1 QOJ UNL . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 QOJ . . . E 2 87.503 -15.404 17.149 1 0 ? C1 QOJ 801 B 1 
HETATM 2 N N1 QOJ . . . E 2 89.029 -13.697 15.925 1 0 ? N1 QOJ 801 B 1 
HETATM 3 C C2 QOJ . . . E 2 86.755 -16.638 17.109 1 0 ? C2 QOJ 801 B 1 
HETATM 4 N N2 QOJ . . . E 2 94.024 -10.931 27.737 1 0 ? N2 QOJ 801 B 1 
HETATM 5 C C3 QOJ . . . E 2 86.694 -17.463 15.938 1 0 ? C3 QOJ 801 B 1 
HETATM 6 N N3 QOJ . . . E 2 95.717 -10.955 31.856 1 0 ? N3 QOJ 801 B 1 
HETATM 7 C C4 QOJ . . . E 2 87.377 -17.103 14.749 1 0 ? C4 QOJ 801 B 1 
HETATM 8 N N4 QOJ . . . E 2 88.903 -16.195 12.246 1 0 ? N4 QOJ 801 B 1 
HETATM 9 C C5 QOJ . . . E 2 88.255 -14.896 16.016 1 0 ? C5 QOJ 801 B 1 
HETATM 10 C C6 QOJ . . . E 2 88.199 -15.792 14.722 1 0 ? C6 QOJ 801 B 1 
HETATM 11 C C7 QOJ . . . E 2 88.943 -15.361 13.48 1 0 ? C7 QOJ 801 B 1 
HETATM 12 C C8 QOJ . . . E 2 89.731 -14.065 13.508 1 0 ? C8 QOJ 801 B 1 
HETATM 13 C C9 QOJ . . . E 2 89.753 -13.28 14.707 1 0 ? C9 QOJ 801 B 1 
HETATM 14 C C10 QOJ . . . E 2 96.027 -11.277 29.29 1 0 ? C10 QOJ 801 B 1 
HETATM 15 C C11 QOJ . . . E 2 95.412 -11.263 27.84 1 0 ? C11 QOJ 801 B 1 
HETATM 16 C C12 QOJ . . . E 2 93.171 -10.609 28.906 1 0 ? C12 QOJ 801 B 1 
HETATM 17 C C13 QOJ . . . E 2 93.692 -10.61 30.243 1 0 ? C13 QOJ 801 B 1 
HETATM 18 C C14 QOJ . . . E 2 95.153 -10.948 30.477 1 0 ? C14 QOJ 801 B 1 
HETATM 19 C C15 QOJ . . . E 2 97.524 -11.629 29.469 1 0 ? C15 QOJ 801 B 1 
HETATM 20 C C16 QOJ . . . E 2 98.304 -11.93 28.324 1 0 ? C16 QOJ 801 B 1 
HETATM 21 C C17 QOJ . . . E 2 97.73 -11.914 27.009 1 0 ? C17 QOJ 801 B 1 
HETATM 22 C C18 QOJ . . . E 2 96.342 -11.594 26.775 1 0 ? C18 QOJ 801 B 1 
HETATM 23 C C19 QOJ . . . E 2 93.411 -10.904 26.403 1 0 ? C19 QOJ 801 B 1 
HETATM 24 C C20 QOJ . . . E 2 93.261 -12.344 25.867 1 0 ? C20 QOJ 801 B 1 
HETATM 25 C C21 QOJ . . . E 2 93.643 -12.414 24.377 1 0 ? C21 QOJ 801 B 1 
HETATM 26 C C22 QOJ . . . E 2 92.491 -11.887 23.518 1 0 ? C22 QOJ 801 B 1 
HETATM 27 C C23 QOJ . . . E 2 92.925 -11.849 22.045 1 0 ? C23 QOJ 801 B 1 
HETATM 28 C C24 QOJ . . . E 2 91.713 -11.55 21.121 1 0 ? C24 QOJ 801 B 1 
HETATM 29 C C25 QOJ . . . E 2 91.59 -12.616 20.02 1 0 ? C25 QOJ 801 B 1 
HETATM 30 C C26 QOJ . . . E 2 90.278 -12.416 19.261 1 0 ? C26 QOJ 801 B 1 
HETATM 31 C C27 QOJ . . . E 2 90.289 -13.249 17.977 1 0 ? C27 QOJ 801 B 1 
HETATM 32 C C28 QOJ . . . E 2 89.114 -12.825 17.096 1 0 ? C28 QOJ 801 B 1 
HETATM 33 C C29 QOJ . . . E 2 91.762 -10.257 28.946 1 0 ? C29 QOJ 801 B 1 
HETATM 34 C C30 QOJ . . . E 2 90.565 -12.094 14.485 1 0 ? C30 QOJ 801 B 1 
HETATM 35 C C31 QOJ . . . E 2 91.076 -12.143 13.066 1 0 ? C31 QOJ 801 B 1 
HETATM 36 C C32 QOJ . . . E 2 90.521 -13.422 12.481 1 0 ? C32 QOJ 801 B 1 
HETATM 37 C C33 QOJ . . . E 2 91.383 -10.025 30.391 1 0 ? C33 QOJ 801 B 1 
HETATM 38 C C34 QOJ . . . E 2 92.647 -10.262 31.184 1 0 ? C34 QOJ 801 B 1 
HETATM 39 H H11 QOJ . . . E 2 87.504 -14.833 18.066 1 0 ? H11 QOJ 801 B 1 
HETATM 40 H H21 QOJ . . . E 2 86.22 -16.952 17.994 1 0 ? H21 QOJ 801 B 1 
HETATM 41 H H31 QOJ . . . E 2 86.117 -18.374 15.961 1 0 ? H31 QOJ 801 B 1 
HETATM 42 H HN32 QOJ . . . E 2 96.662 -11.174 31.998 1 0 ? HN32 QOJ 801 B 1 
HETATM 43 H HN31 QOJ . . . E 2 95.143 -10.741 32.621 1 0 ? HN31 QOJ 801 B 1 
HETATM 44 H H41 QOJ . . . E 2 87.323 -17.736 13.876 1 0 ? H41 QOJ 801 B 1 
HETATM 45 H HN42 QOJ . . . E 2 88.383 -17.025 12.232 1 0 ? HN42 QOJ 801 B 1 
HETATM 46 H HN41 QOJ . . . E 2 89.391 -15.909 11.445 1 0 ? HN41 QOJ 801 B 1 
HETATM 47 H H151 QOJ . . . E 2 97.971 -11.645 30.453 1 0 ? H151 QOJ 801 B 1 
HETATM 48 H H161 QOJ . . . E 2 99.348 -12.177 28.443 1 0 ? H161 QOJ 801 B 1 
HETATM 49 H H171 QOJ . . . E 2 98.358 -12.151 26.164 1 0 ? H171 QOJ 801 B 1 
HETATM 50 H H181 QOJ . . . E 2 95.977 -11.602 25.758 1 0 ? H181 QOJ 801 B 1 
HETATM 51 H H192 QOJ . . . E 2 92.434 -10.439 26.453 1 0 ? H192 QOJ 801 B 1 
HETATM 52 H H191 QOJ . . . E 2 94.042 -10.331 25.74 1 0 ? H191 QOJ 801 B 1 
HETATM 53 H H202 QOJ . . . E 2 93.906 -13.001 26.431 1 0 ? H202 QOJ 801 B 1 
HETATM 54 H H201 QOJ . . . E 2 92.236 -12.664 25.988 1 0 ? H201 QOJ 801 B 1 
HETATM 55 H H212 QOJ . . . E 2 94.524 -11.811 24.206 1 0 ? H212 QOJ 801 B 1 
HETATM 56 H H211 QOJ . . . E 2 93.851 -13.438 24.107 1 0 ? H211 QOJ 801 B 1 
HETATM 57 H H222 QOJ . . . E 2 91.636 -12.54 23.625 1 0 ? H222 QOJ 801 B 1 
HETATM 58 H H221 QOJ . . . E 2 92.227 -10.89 23.839 1 0 ? H221 QOJ 801 B 1 
HETATM 59 H H232 QOJ . . . E 2 93.668 -11.073 21.92 1 0 ? H232 QOJ 801 B 1 
HETATM 60 H H231 QOJ . . . E 2 93.364 -12.803 21.785 1 0 ? H231 QOJ 801 B 1 
HETATM 61 H H241 QOJ . . . E 2 91.856 -10.585 20.66 1 0 ? H241 QOJ 801 B 1 
HETATM 62 H H242 QOJ . . . E 2 90.796 -11.533 21.696 1 0 ? H242 QOJ 801 B 1 
HETATM 63 H H251 QOJ . . . E 2 91.599 -13.598 20.469 1 0 ? H251 QOJ 801 B 1 
HETATM 64 H H252 QOJ . . . E 2 92.422 -12.524 19.336 1 0 ? H252 QOJ 801 B 1 
HETATM 65 H H262 QOJ . . . E 2 89.452 -12.728 19.884 1 0 ? H262 QOJ 801 B 1 
HETATM 66 H H261 QOJ . . . E 2 90.164 -11.372 19.009 1 0 ? H261 QOJ 801 B 1 
HETATM 67 H H271 QOJ . . . E 2 90.196 -14.295 18.221 1 0 ? H271 QOJ 801 B 1 
HETATM 68 H H272 QOJ . . . E 2 91.217 -13.08 17.447 1 0 ? H272 QOJ 801 B 1 
HETATM 69 H H281 QOJ . . . E 2 89.264 -11.805 16.776 1 0 ? H281 QOJ 801 B 1 
HETATM 70 H H282 QOJ . . . E 2 88.198 -12.89 17.663 1 0 ? H282 QOJ 801 B 1 
HETATM 71 H H291 QOJ . . . E 2 91.174 -11.064 28.526 1 0 ? H291 QOJ 801 B 1 
HETATM 72 H H292 QOJ . . . E 2 91.592 -9.357 28.382 1 0 ? H292 QOJ 801 B 1 
HETATM 73 H H301 QOJ . . . E 2 91.391 -12.083 15.185 1 0 ? H301 QOJ 801 B 1 
HETATM 74 H H302 QOJ . . . E 2 89.967 -11.209 14.619 1 0 ? H302 QOJ 801 B 1 
HETATM 75 H H311 QOJ . . . E 2 92.158 -12.151 13.062 1 0 ? H311 QOJ 801 B 1 
HETATM 76 H H312 QOJ . . . E 2 90.709 -11.295 12.509 1 0 ? H312 QOJ 801 B 1 
HETATM 77 H H322 QOJ . . . E 2 89.897 -13.201 11.637 1 0 ? H322 QOJ 801 B 1 
HETATM 78 H H321 QOJ . . . E 2 91.339 -14.061 12.168 1 0 ? H321 QOJ 801 B 1 
HETATM 79 H H332 QOJ . . . E 2 91.049 -9.012 30.531 1 0 ? H332 QOJ 801 B 1 
HETATM 80 H H331 QOJ . . . E 2 90.606 -10.717 30.687 1 0 ? H331 QOJ 801 B 1 
HETATM 81 H H342 QOJ . . . E 2 92.925 -9.367 31.71 1 0 ? H342 QOJ 801 B 1 
HETATM 82 H H341 QOJ . . . E 2 92.484 -11.064 31.894 1 0 ? H341 QOJ 801 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              14 
_model_server_stats.parse_time_ms           6 
_model_server_stats.create_model_time_ms    51 
_model_server_stats.query_time_ms           4176 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           82 
#