data_6V4T
#
_model_server_result.job_id            PftfKfIzM_Nuh7OBo3andg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-18 16:04:52' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6v4t 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":801}' 
#
_entry.id    6V4T 
#
_exptl.entry_id    6V4T 
_exptl.method      'SOLUTION NMR' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              508.74 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "4,4'-(decane-1,10-diyl)bis(9-amino-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b]quinolin-4-ium)" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
#
_chem_comp.formula           'C34 H44 N4 2' 
_chem_comp.formula_weight    508.74 
_chem_comp.id                QOJ 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              "4,4'-(decane-1,10-diyl)bis(9-amino-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b]quinolin-4-ium)" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C3 C2 QOJ doub 205 n y 
C3 C4 QOJ sing 206 n y 
C2 C1 QOJ sing 207 n y 
C4 C6 QOJ doub 208 n y 
C1 C5 QOJ doub 209 n y 
C23 C24 QOJ sing 210 n n 
C23 C22 QOJ sing 211 n n 
C24 C25 QOJ sing 212 n n 
C22 C21 QOJ sing 213 n n 
C16 C15 QOJ doub 214 n y 
C16 C17 QOJ sing 215 n y 
C15 C10 QOJ sing 216 n y 
N3 C14 QOJ sing 217 n n 
C6 C5 QOJ sing 218 n y 
C6 C7 QOJ sing 219 n y 
C5 N1 QOJ sing 220 n y 
C17 C18 QOJ doub 221 n y 
C20 C21 QOJ sing 222 n n 
C20 C19 QOJ sing 223 n n 
C10 C14 QOJ doub 224 n y 
C10 C11 QOJ sing 225 n y 
C14 C13 QOJ sing 226 n y 
C27 C26 QOJ sing 227 n n 
C27 C28 QOJ sing 228 n n 
C25 C26 QOJ sing 229 n n 
C18 C11 QOJ sing 230 n y 
C11 N2 QOJ doub 231 n y 
C13 C34 QOJ sing 232 n n 
C13 C12 QOJ doub 233 n y 
C34 C33 QOJ sing 234 n n 
N2 C12 QOJ sing 235 n y 
N2 C19 QOJ sing 236 n n 
C12 C29 QOJ sing 237 n n 
N4 C7 QOJ sing 238 n n 
C7 C8 QOJ doub 239 n y 
N1 C28 QOJ sing 240 n n 
N1 C9 QOJ doub 241 n y 
C33 C29 QOJ sing 242 n n 
C9 C8 QOJ sing 243 n y 
C9 C30 QOJ sing 244 n n 
C8 C32 QOJ sing 245 n n 
C30 C31 QOJ sing 246 n n 
C32 C31 QOJ sing 247 n n 
C1 H11 QOJ sing 248 n n 
C2 H21 QOJ sing 249 n n 
C3 H31 QOJ sing 250 n n 
N3 HN32 QOJ sing 251 n n 
N3 HN31 QOJ sing 252 n n 
C4 H41 QOJ sing 253 n n 
N4 HN42 QOJ sing 254 n n 
N4 HN41 QOJ sing 255 n n 
C15 H151 QOJ sing 256 n n 
C16 H161 QOJ sing 257 n n 
C17 H171 QOJ sing 258 n n 
C18 H181 QOJ sing 259 n n 
C19 H192 QOJ sing 260 n n 
C19 H191 QOJ sing 261 n n 
C20 H202 QOJ sing 262 n n 
C20 H201 QOJ sing 263 n n 
C21 H212 QOJ sing 264 n n 
C21 H211 QOJ sing 265 n n 
C22 H222 QOJ sing 266 n n 
C22 H221 QOJ sing 267 n n 
C23 H232 QOJ sing 268 n n 
C23 H231 QOJ sing 269 n n 
C24 H241 QOJ sing 270 n n 
C24 H242 QOJ sing 271 n n 
C25 H251 QOJ sing 272 n n 
C25 H252 QOJ sing 273 n n 
C26 H262 QOJ sing 274 n n 
C26 H261 QOJ sing 275 n n 
C27 H271 QOJ sing 276 n n 
C27 H272 QOJ sing 277 n n 
C28 H281 QOJ sing 278 n n 
C28 H282 QOJ sing 279 n n 
C29 H291 QOJ sing 280 n n 
C29 H292 QOJ sing 281 n n 
C30 H301 QOJ sing 282 n n 
C30 H302 QOJ sing 283 n n 
C31 H311 QOJ sing 284 n n 
C31 H312 QOJ sing 285 n n 
C32 H322 QOJ sing 286 n n 
C32 H321 QOJ sing 287 n n 
C33 H332 QOJ sing 288 n n 
C33 H331 QOJ sing 289 n n 
C34 H342 QOJ sing 290 n n 
C34 H341 QOJ sing 291 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6V4T 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 2 QOJ A 1 801 1 QOJ UNL . 
E 2 QOJ B 1 801 1 QOJ UNL . 
F 2 QOJ C 1 801 1 QOJ UNL . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 QOJ . . . F 2 98.905 -0.653 14.794 1 0 ? C1 QOJ 801 C 1 
HETATM 2 N N1 QOJ . . . F 2 97.759 -2.865 14.04 1 0 ? N1 QOJ 801 C 1 
HETATM 3 C C2 QOJ . . . F 2 99.361 0.192 15.875 1 0 ? C2 QOJ 801 C 1 
HETATM 4 N N2 QOJ . . . F 2 101.024 5.838 8.244 1 0 ? N2 QOJ 801 C 1 
HETATM 5 C C3 QOJ . . . F 2 99.208 -0.171 17.255 1 0 ? C3 QOJ 801 C 1 
HETATM 6 N N3 QOJ . . . F 2 99.4 9.525 6.351 1 0 ? N3 QOJ 801 C 1 
HETATM 7 C C4 QOJ . . . F 2 98.594 -1.39 17.628 1 0 ? C4 QOJ 801 C 1 
HETATM 8 N N4 QOJ . . . F 2 97.245 -4.055 18.3 1 0 ? N4 QOJ 801 C 1 
HETATM 9 C C5 QOJ . . . F 2 98.256 -1.934 15.011 1 0 ? C5 QOJ 801 C 1 
HETATM 10 C C6 QOJ . . . F 2 98.081 -2.343 16.524 1 0 ? C6 QOJ 801 C 1 
HETATM 11 C C7 QOJ . . . F 2 97.419 -3.653 16.875 1 0 ? C7 QOJ 801 C 1 
HETATM 12 C C8 QOJ . . . F 2 96.931 -4.554 15.757 1 0 ? C8 QOJ 801 C 1 
HETATM 13 C C9 QOJ . . . F 2 97.11 -4.147 14.391 1 0 ? C9 QOJ 801 C 1 
HETATM 14 C C10 QOJ . . . F 2 100.965 7.446 6.261 1 0 ? C10 QOJ 801 C 1 
HETATM 15 C C11 QOJ . . . F 2 101.532 6.143 6.939 1 0 ? C11 QOJ 801 C 1 
HETATM 16 C C12 QOJ . . . F 2 100.021 6.676 8.951 1 0 ? C12 QOJ 801 C 1 
HETATM 17 C C13 QOJ . . . F 2 99.483 7.866 8.363 1 0 ? C13 QOJ 801 C 1 
HETATM 18 C C14 QOJ . . . F 2 99.944 8.291 6.985 1 0 ? C14 QOJ 801 C 1 
HETATM 19 C C15 QOJ . . . F 2 101.469 7.844 4.858 1 0 ? C15 QOJ 801 C 1 
HETATM 20 C C16 QOJ . . . F 2 102.43 7.033 4.21 1 0 ? C16 QOJ 801 C 1 
HETATM 21 C C17 QOJ . . . F 2 102.935 5.847 4.828 1 0 ? C17 QOJ 801 C 1 
HETATM 22 C C18 QOJ . . . F 2 102.508 5.413 6.138 1 0 ? C18 QOJ 801 C 1 
HETATM 23 C C19 QOJ . . . F 2 101.523 4.643 8.925 1 0 ? C19 QOJ 801 C 1 
HETATM 24 C C20 QOJ . . . F 2 100.788 3.394 8.423 1 0 ? C20 QOJ 801 C 1 
HETATM 25 C C21 QOJ . . . F 2 99.291 3.491 8.748 1 0 ? C21 QOJ 801 C 1 
HETATM 26 C C22 QOJ . . . F 2 98.531 2.364 8.042 1 0 ? C22 QOJ 801 C 1 
HETATM 27 C C23 QOJ . . . F 2 98.664 1.045 8.821 1 0 ? C23 QOJ 801 C 1 
HETATM 28 C C24 QOJ . . . F 2 97.621 0.973 9.956 1 0 ? C24 QOJ 801 C 1 
HETATM 29 C C25 QOJ . . . F 2 97.325 -0.495 10.286 1 0 ? C25 QOJ 801 C 1 
HETATM 30 C C26 QOJ . . . F 2 96.615 -0.6 11.639 1 0 ? C26 QOJ 801 C 1 
HETATM 31 C C27 QOJ . . . F 2 96.538 -2.075 12.061 1 0 ? C27 QOJ 801 C 1 
HETATM 32 C C28 QOJ . . . F 2 97.891 -2.56 12.616 1 0 ? C28 QOJ 801 C 1 
HETATM 33 C C29 QOJ . . . F 2 99.426 6.484 10.265 1 0 ? C29 QOJ 801 C 1 
HETATM 34 C C30 QOJ . . . F 2 96.563 -5.172 13.515 1 0 ? C30 QOJ 801 C 1 
HETATM 35 C C31 QOJ . . . F 2 96.015 -6.281 14.383 1 0 ? C31 QOJ 801 C 1 
HETATM 36 C C32 QOJ . . . F 2 96.273 -5.844 15.803 1 0 ? C32 QOJ 801 C 1 
HETATM 37 C C33 QOJ . . . F 2 98.459 7.62 10.505 1 0 ? C33 QOJ 801 C 1 
HETATM 38 C C34 QOJ . . . F 2 98.529 8.479 9.267 1 0 ? C34 QOJ 801 C 1 
HETATM 39 H H11 QOJ . . . F 2 99.052 -0.311 13.782 1 0 ? H11 QOJ 801 C 1 
HETATM 40 H H21 QOJ . . . F 2 99.836 1.133 15.634 1 0 ? H21 QOJ 801 C 1 
HETATM 41 H H31 QOJ . . . F 2 99.568 0.497 18.024 1 0 ? H31 QOJ 801 C 1 
HETATM 42 H HN32 QOJ . . . F 2 99.702 9.789 5.457 1 0 ? HN32 QOJ 801 C 1 
HETATM 43 H HN31 QOJ . . . F 2 98.738 10.07 6.825 1 0 ? HN31 QOJ 801 C 1 
HETATM 44 H H41 QOJ . . . F 2 98.486 -1.65 18.671 1 0 ? H41 QOJ 801 C 1 
HETATM 45 H HN42 QOJ . . . F 2 97.557 -3.464 19.016 1 0 ? HN42 QOJ 801 C 1 
HETATM 46 H HN41 QOJ . . . F 2 96.816 -4.908 18.519 1 0 ? HN41 QOJ 801 C 1 
HETATM 47 H H151 QOJ . . . F 2 101.085 8.722 4.374 1 0 ? H151 QOJ 801 C 1 
HETATM 48 H H161 QOJ . . . F 2 102.783 7.31 3.227 1 0 ? H161 QOJ 801 C 1 
HETATM 49 H H171 QOJ . . . F 2 103.667 5.256 4.299 1 0 ? H171 QOJ 801 C 1 
HETATM 50 H H181 QOJ . . . F 2 102.912 4.484 6.518 1 0 ? H181 QOJ 801 C 1 
HETATM 51 H H192 QOJ . . . F 2 102.58 4.539 8.726 1 0 ? H192 QOJ 801 C 1 
HETATM 52 H H191 QOJ . . . F 2 101.372 4.739 9.991 1 0 ? H191 QOJ 801 C 1 
HETATM 53 H H202 QOJ . . . F 2 100.918 3.305 7.354 1 0 ? H202 QOJ 801 C 1 
HETATM 54 H H201 QOJ . . . F 2 101.2 2.52 8.906 1 0 ? H201 QOJ 801 C 1 
HETATM 55 H H212 QOJ . . . F 2 99.145 3.414 9.816 1 0 ? H212 QOJ 801 C 1 
HETATM 56 H H211 QOJ . . . F 2 98.908 4.436 8.402 1 0 ? H211 QOJ 801 C 1 
HETATM 57 H H222 QOJ . . . F 2 97.487 2.634 7.963 1 0 ? H222 QOJ 801 C 1 
HETATM 58 H H221 QOJ . . . F 2 98.937 2.231 7.05 1 0 ? H221 QOJ 801 C 1 
HETATM 59 H H232 QOJ . . . F 2 98.507 0.224 8.138 1 0 ? H232 QOJ 801 C 1 
HETATM 60 H H231 QOJ . . . F 2 99.658 0.969 9.242 1 0 ? H231 QOJ 801 C 1 
HETATM 61 H H241 QOJ . . . F 2 96.706 1.456 9.644 1 0 ? H241 QOJ 801 C 1 
HETATM 62 H H242 QOJ . . . F 2 98.009 1.47 10.834 1 0 ? H242 QOJ 801 C 1 
HETATM 63 H H251 QOJ . . . F 2 98.252 -1.049 10.326 1 0 ? H251 QOJ 801 C 1 
HETATM 64 H H252 QOJ . . . F 2 96.693 -0.913 9.517 1 0 ? H252 QOJ 801 C 1 
HETATM 65 H H262 QOJ . . . F 2 97.17 -0.042 12.38 1 0 ? H262 QOJ 801 C 1 
HETATM 66 H H261 QOJ . . . F 2 95.616 -0.198 11.557 1 0 ? H261 QOJ 801 C 1 
HETATM 67 H H271 QOJ . . . F 2 96.271 -2.68 11.205 1 0 ? H271 QOJ 801 C 1 
HETATM 68 H H272 QOJ . . . F 2 95.778 -2.187 12.821 1 0 ? H272 QOJ 801 C 1 
HETATM 69 H H281 QOJ . . . F 2 98.658 -1.814 12.461 1 0 ? H281 QOJ 801 C 1 
HETATM 70 H H282 QOJ . . . F 2 98.178 -3.463 12.097 1 0 ? H282 QOJ 801 C 1 
HETATM 71 H H291 QOJ . . . F 2 100.2 6.478 11.021 1 0 ? H291 QOJ 801 C 1 
HETATM 72 H H292 QOJ . . . F 2 98.889 5.553 10.291 1 0 ? H292 QOJ 801 C 1 
HETATM 73 H H301 QOJ . . . F 2 97.344 -5.55 12.865 1 0 ? H301 QOJ 801 C 1 
HETATM 74 H H302 QOJ . . . F 2 95.768 -4.758 12.918 1 0 ? H302 QOJ 801 C 1 
HETATM 75 H H311 QOJ . . . F 2 96.531 -7.207 14.164 1 0 ? H311 QOJ 801 C 1 
HETATM 76 H H312 QOJ . . . F 2 94.955 -6.4 14.223 1 0 ? H312 QOJ 801 C 1 
HETATM 77 H H322 QOJ . . . F 2 95.347 -5.753 16.337 1 0 ? H322 QOJ 801 C 1 
HETATM 78 H H321 QOJ . . . F 2 96.904 -6.577 16.294 1 0 ? H321 QOJ 801 C 1 
HETATM 79 H H332 QOJ . . . F 2 97.46 7.237 10.624 1 0 ? H332 QOJ 801 C 1 
HETATM 80 H H331 QOJ . . . F 2 98.749 8.18 11.384 1 0 ? H331 QOJ 801 C 1 
HETATM 81 H H342 QOJ . . . F 2 97.566 8.519 8.79 1 0 ? H342 QOJ 801 C 1 
HETATM 82 H H341 QOJ . . . F 2 98.842 9.481 9.536 1 0 ? H341 QOJ 801 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              24 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    54 
_model_server_stats.query_time_ms           3425 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           82 
#