data_6VEP # _model_server_result.job_id bmIoVoMwXfZwMV1lZUVj2Q _model_server_result.datetime_utc '2024-10-25 20:19:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6vep # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"RA","auth_seq_id":416}' # _entry.id 6VEP # _exptl.entry_id 6VEP _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 13 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90.27 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6VEP _cell.length_a 100.03 _cell.length_b 130.12 _cell.length_c 148.18 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6VEP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? hexameric 6 author_defined_assembly 1 ? hexameric 6 author_defined_assembly 2 ? hexameric 6 author_defined_assembly 3 ? hexameric 6 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,Y,Z,AA,KA,LA,SA,TA 1 1 G,H,I,J,K,L,BA,CA,DA,MA,NA,UA,VA,WA 2 1 M,N,O,P,Q,R,EA,FA,OA,PA,QA,XA,YA,ZA,AB 3 1 S,T,U,V,W,X,GA,HA,IA,JA,RA,BB,CB 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 KA N N ? 13 LA N N ? 13 MA N N ? 13 NA N N ? 13 OA N N ? 13 PA N N ? 13 QA N N ? 13 RA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 7 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 3 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 8 4 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 10 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 10 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 10 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 10 ? 10 5 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 11 ? 11 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 12 ? 11 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 13 ? 12 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 14 ? 12 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 15 ? 12 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 16 ? 12 5 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n Y NAG 1 Y 1 NAG E 402 NAG 7 n Y NAG 2 Y 2 NAG E 403 NAG 7 n Y FUC 3 Y 3 FUC E 401 FUC 8 n Z NAG 1 Z 1 NAG E 405 NAG 8 n Z NAG 2 Z 2 NAG E 406 NAG 8 n Z BMA 3 Z 3 BMA E 407 BMA 8 n Z FUC 4 Z 4 FUC E 404 FUC 8 n AA NAG 1 a 1 NAG E 411 NAG 8 n AA NAG 2 a 2 NAG E 412 NAG 8 n AA BMA 3 a 3 BMA E 413 BMA 8 n AA FUC 4 a 4 FUC E 410 FUC 9 n BA NAG 1 b 1 NAG K 401 NAG 9 n BA NAG 2 b 2 NAG K 402 NAG 7 n CA NAG 1 c 1 NAG K 403 NAG 7 n CA NAG 2 c 2 NAG K 404 NAG 7 n CA FUC 3 c 3 FUC K 405 FUC 10 n DA NAG 1 d 1 NAG K 409 NAG 10 n DA NAG 2 d 2 NAG K 410 NAG 10 n DA BMA 3 d 3 BMA K 411 BMA 10 n DA MAN 4 d 4 MAN K 412 MAN 10 n DA FUC 5 d 5 FUC K 408 FUC 11 n EA NAG 1 e 1 NAG Q 402 NAG 11 n EA NAG 2 e 2 NAG Q 403 NAG 11 n EA BMA 3 e 3 BMA Q 404 BMA 8 n FA NAG 1 f 1 NAG Q 408 NAG 8 n FA NAG 2 f 2 NAG Q 409 NAG 8 n FA BMA 3 f 3 BMA Q 410 BMA 8 n FA FUC 4 f 4 FUC Q 407 FUC 8 n GA NAG 1 g 1 NAG W 401 NAG 8 n GA NAG 2 g 2 NAG W 402 NAG 8 n GA BMA 3 g 3 BMA W 403 BMA 8 n GA FUC 4 g 4 FUC W 404 FUC 9 n HA NAG 1 h 1 NAG W 405 NAG 9 n HA NAG 2 h 2 NAG W 406 NAG 12 n IA NAG 1 i 1 NAG W 408 NAG 12 n IA NAG 2 i 2 NAG W 409 NAG 12 n IA BMA 3 i 3 BMA W 410 BMA 12 n IA MAN 4 i 4 MAN W 411 MAN 12 n IA FUC 5 i 5 FUC W 407 FUC 8 n JA NAG 1 j 1 NAG W 413 NAG 8 n JA NAG 2 j 2 NAG W 414 NAG 8 n JA BMA 3 j 3 BMA W 415 BMA 8 n JA FUC 4 j 4 FUC W 412 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 6 A CYS 6 1_555 A SG CYS 11 A CYS 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 7 A CYS 7 1_555 B SG CYS 7 B CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 20 A CYS 20 1_555 B SG CYS 19 B CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 22 C CYS 22 1_555 C SG CYS 95 C CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf5 D SG CYS 26 D CYS 23 1_555 D SG CYS 97 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? disulf ? disulf6 E SG CYS 8 E CYS 8 1_555 E SG CYS 26 E CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf7 E SG CYS 126 E CYS 126 1_555 E SG CYS 155 E CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf8 E SG CYS 159 E CYS 159 1_555 E SG CYS 182 E CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 169 E CYS 169 1_555 E SG CYS 188 E CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf10 E SG CYS 192 E CYS 192 1_555 E SG CYS 201 E CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf11 E SG CYS 196 E CYS 196 1_555 E SG CYS 207 E CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 208 E CYS 208 1_555 E SG CYS 216 E CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 212 E CYS 212 1_555 E SG CYS 225 E CYS 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 228 E CYS 228 1_555 E SG CYS 237 E CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 241 E CYS 241 1_555 E SG CYS 253 E CYS 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 259 E CYS 259 1_555 E SG CYS 284 E CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 266 E CYS 266 1_555 E SG CYS 274 E CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 288 E CYS 288 1_555 E SG CYS 301 E CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 304 E CYS 304 1_555 E SG CYS 308 E CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 6 G CYS 6 1_555 G SG CYS 11 G CYS 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 7 G CYS 7 1_555 H SG CYS 7 H CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 20 G CYS 20 1_555 H SG CYS 19 H CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf23 I SG CYS 22 I CYS 22 1_555 I SG CYS 95 I CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf24 J SG CYS 26 J CYS 23 1_555 J SG CYS 97 J CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf25 K SG CYS 8 K CYS 8 1_555 K SG CYS 26 K CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf26 K SG CYS 126 K CYS 126 1_555 K SG CYS 155 K CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf27 K SG CYS 159 K CYS 159 1_555 K SG CYS 182 K CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf28 K SG CYS 169 K CYS 169 1_555 K SG CYS 188 K CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf29 K SG CYS 192 K CYS 192 1_555 K SG CYS 201 K CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf30 K SG CYS 196 K CYS 196 1_555 K SG CYS 207 K CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 208 K CYS 208 1_555 K SG CYS 216 K CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 212 K CYS 212 1_555 K SG CYS 225 K CYS 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 228 K CYS 228 1_555 K SG CYS 237 K CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 241 K CYS 241 1_555 K SG CYS 253 K CYS 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 259 K CYS 259 1_555 K SG CYS 284 K CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf36 K SG CYS 266 K CYS 266 1_555 K SG CYS 274 K CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 288 K CYS 288 1_555 K SG CYS 301 K CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 304 K CYS 304 1_555 K SG CYS 308 K CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf39 M SG CYS 6 M CYS 6 1_555 M SG CYS 11 M CYS 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf40 M SG CYS 7 M CYS 7 1_555 N SG CYS 7 N CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf41 M SG CYS 20 M CYS 20 1_555 N SG CYS 19 N CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf42 O SG CYS 22 O CYS 22 1_555 O SG CYS 95 O CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf43 P SG CYS 26 P CYS 23 1_555 P SG CYS 97 P CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf44 Q SG CYS 8 Q CYS 8 1_555 Q SG CYS 26 Q CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf45 Q SG CYS 126 Q CYS 126 1_555 Q SG CYS 155 Q CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf46 Q SG CYS 159 Q CYS 159 1_555 Q SG CYS 182 Q CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf47 Q SG CYS 169 Q CYS 169 1_555 Q SG CYS 188 Q CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf48 Q SG CYS 192 Q CYS 192 1_555 Q SG CYS 201 Q CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf49 Q SG CYS 196 Q CYS 196 1_555 Q SG CYS 207 Q CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf50 Q SG CYS 208 Q CYS 208 1_555 Q SG CYS 216 Q CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf51 Q SG CYS 212 Q CYS 212 1_555 Q SG CYS 225 Q CYS 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf52 Q SG CYS 228 Q CYS 228 1_555 Q SG CYS 237 Q CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf53 Q SG CYS 241 Q CYS 241 1_555 Q SG CYS 253 Q CYS 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf54 Q SG CYS 259 Q CYS 259 1_555 Q SG CYS 284 Q CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf55 Q SG CYS 266 Q CYS 266 1_555 Q SG CYS 274 Q CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf56 Q SG CYS 288 Q CYS 288 1_555 Q SG CYS 301 Q CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf57 Q SG CYS 304 Q CYS 304 1_555 Q SG CYS 308 Q CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf58 S SG CYS 6 S CYS 6 1_555 S SG CYS 11 S CYS 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf59 S SG CYS 7 S CYS 7 1_555 T SG CYS 7 T CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf60 S SG CYS 20 S CYS 20 1_555 T SG CYS 19 T CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf61 U SG CYS 22 U CYS 22 1_555 U SG CYS 95 U CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf62 V SG CYS 26 V CYS 23 1_555 V SG CYS 97 V CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf63 W SG CYS 8 W CYS 8 1_555 W SG CYS 26 W CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf64 W SG CYS 126 W CYS 126 1_555 W SG CYS 155 W CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf65 W SG CYS 159 W CYS 159 1_555 W SG CYS 182 W CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf66 W SG CYS 169 W CYS 169 1_555 W SG CYS 188 W CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf67 W SG CYS 192 W CYS 192 1_555 W SG CYS 201 W CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf68 W SG CYS 196 W CYS 196 1_555 W SG CYS 207 W CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf69 W SG CYS 208 W CYS 208 1_555 W SG CYS 216 W CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf70 W SG CYS 212 W CYS 212 1_555 W SG CYS 225 W CYS 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf71 W SG CYS 228 W CYS 228 1_555 W SG CYS 237 W CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf72 W SG CYS 241 W CYS 241 1_555 W SG CYS 253 W CYS 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf73 W SG CYS 259 W CYS 259 1_555 W SG CYS 284 W CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf74 W SG CYS 266 W CYS 266 1_555 W SG CYS 274 W CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf75 W SG CYS 288 W CYS 288 1_555 W SG CYS 301 W CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf76 W SG CYS 304 W CYS 304 1_555 W SG CYS 308 W CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? covale ? covale1 E ND2 ASN 16 E ASN 16 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 E ND2 ASN 25 E ASN 25 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale3 E ND2 ASN 111 E ASN 111 1_555 KA C1 NAG . E NAG 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 E ND2 ASN 215 E ASN 215 1_555 LA C1 NAG . E NAG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 E ND2 ASN 255 E ASN 255 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale6 K ND2 ASN 16 K ASN 16 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale7 K ND2 ASN 25 K ASN 25 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale8 K ND2 ASN 111 K ASN 111 1_555 MA C1 NAG . K NAG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale9 K ND2 ASN 215 K ASN 215 1_555 NA C1 NAG . K NAG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale10 K ND2 ASN 255 K ASN 255 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 Q ND2 ASN 16 Q ASN 16 1_555 OA C1 NAG . Q NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 Q ND2 ASN 25 Q ASN 25 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale13 Q ND2 ASN 111 Q ASN 111 1_555 PA C1 NAG . Q NAG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale14 Q ND2 ASN 215 Q ASN 215 1_555 QA C1 NAG . Q NAG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 Q ND2 ASN 255 Q ASN 255 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale16 W ND2 ASN 16 W ASN 16 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale17 W ND2 ASN 25 W ASN 25 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale18 W ND2 ASN 111 W ASN 111 1_555 RA C1 NAG . W NAG 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 W ND2 ASN 215 W ASN 215 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale20 W ND2 ASN 255 W ASN 255 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale21 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale22 Y O6 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 FUC . Y FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale23 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale24 Z O6 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 FUC . Z FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale25 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale27 AA O6 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 FUC . a FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? covale ? covale28 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale29 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale30 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale31 CA O6 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 FUC . c FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale32 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale33 DA O6 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 FUC . d FUC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.39 ? covale ? covale34 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale35 DA O6 BMA . d BMA 3 1_555 DA C1 MAN . d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale36 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale37 EA O4 NAG . e NAG 2 1_555 EA C1 BMA . e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale38 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale39 FA O6 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 FUC . f FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? covale ? covale40 FA O4 NAG . f NAG 2 1_555 FA C1 BMA . f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale41 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale42 GA O6 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 FUC . g FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale43 GA O4 NAG . g NAG 2 1_555 GA C1 BMA . g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale44 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale45 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale46 IA O6 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 FUC . i FUC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? covale ? covale47 IA O4 NAG . i NAG 2 1_555 IA C1 BMA . i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale48 IA O3 BMA . i BMA 3 1_555 IA C1 MAN . i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale49 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale50 JA O6 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 FUC . j FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale51 JA O4 NAG . j NAG 2 1_555 JA C1 BMA . j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 308 n n C1 O1 NAG sing 309 n n C1 O5 NAG sing 310 n n C1 H1 NAG sing 311 n n C2 C3 NAG sing 312 n n C2 N2 NAG sing 313 n n C2 H2 NAG sing 314 n n C3 C4 NAG sing 315 n n C3 O3 NAG sing 316 n n C3 H3 NAG sing 317 n n C4 C5 NAG sing 318 n n C4 O4 NAG sing 319 n n C4 H4 NAG sing 320 n n C5 C6 NAG sing 321 n n C5 O5 NAG sing 322 n n C5 H5 NAG sing 323 n n C6 O6 NAG sing 324 n n C6 H61 NAG sing 325 n n C6 H62 NAG sing 326 n n C7 C8 NAG sing 327 n n C7 N2 NAG sing 328 n n C7 O7 NAG doub 329 n n C8 H81 NAG sing 330 n n C8 H82 NAG sing 331 n n C8 H83 NAG sing 332 n n N2 HN2 NAG sing 333 n n O1 HO1 NAG sing 334 n n O3 HO3 NAG sing 335 n n O4 HO4 NAG sing 336 n n O6 HO6 NAG sing 337 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6VEP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009997 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000047 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007685 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006749 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code KA 13 NAG E 1 408 408 NAG NAG . LA 13 NAG E 1 409 409 NAG NAG . MA 13 NAG K 1 406 406 NAG NAG . NA 13 NAG K 1 407 407 NAG NAG . OA 13 NAG Q 1 401 401 NAG NAG . PA 13 NAG Q 1 405 405 NAG NAG . QA 13 NAG Q 1 406 406 NAG NAG . RA 13 NAG W 1 416 416 NAG NAG . SA 14 HOH C 1 201 201 HOH HOH . SA 14 HOH C 2 202 202 HOH HOH . SA 14 HOH C 3 203 203 HOH HOH . SA 14 HOH C 4 204 204 HOH HOH . TA 14 HOH E 1 501 501 HOH HOH . TA 14 HOH E 2 502 502 HOH HOH . TA 14 HOH E 3 503 503 HOH HOH . UA 14 HOH I 1 201 201 HOH HOH . VA 14 HOH J 1 201 201 HOH HOH . WA 14 HOH K 1 501 501 HOH HOH . XA 14 HOH O 1 201 201 HOH HOH . XA 14 HOH O 2 202 202 HOH HOH . YA 14 HOH P 1 201 201 HOH HOH . ZA 14 HOH Q 1 501 501 HOH HOH . AB 14 HOH R 1 801 801 HOH HOH . BB 14 HOH V 1 201 201 HOH HOH . BB 14 HOH V 2 202 202 HOH HOH . CB 14 HOH W 1 501 501 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . RA 13 -33.883 -5.834 -57.036 1 77.94 ? C1 NAG 416 W 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . RA 13 -35.206 -6.07 -56.31 1 78.89 ? C2 NAG 416 W 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . RA 13 -35.993 -4.76 -56.392 1 80.86 ? C3 NAG 416 W 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . RA 13 -35.254 -3.664 -55.616 1 80.69 ? C4 NAG 416 W 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . RA 13 -33.782 -3.594 -56.031 1 85.65 ? C5 NAG 416 W 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . RA 13 -32.927 -2.828 -55.05 1 91 ? C6 NAG 416 W 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . RA 13 -36.067 -8.358 -56.187 1 83.78 ? C7 NAG 416 W 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . RA 13 -35.019 -9.403 -56.434 1 80.71 ? C8 NAG 416 W 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . RA 13 -35.926 -7.204 -56.867 1 80.75 ? N2 NAG 416 W 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . RA 13 -37.281 -4.924 -55.812 1 83.29 ? O3 NAG 416 W 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . RA 13 -35.883 -2.385 -55.742 1 74.91 ? O4 NAG 416 W 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . RA 13 -33.186 -4.911 -56.172 1 82.97 ? O5 NAG 416 W 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . RA 13 -31.644 -2.582 -55.609 1 95.77 ? O6 NAG 416 W 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . RA 13 -36.919 -8.499 -55.323 1 90.01 ? O7 NAG 416 W 1 # _model_server_stats.io_time_ms 109 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 20 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 14 #